Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4P9YYW7

Protein Details
Accession A0A4P9YYW7    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
252-272DDGASKQTRKSKAKGKRTRANHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
259-272TRKSKAKGKRTRAN
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 12.5, cyto 11.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR039770  Rpf2  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0000470  P:maturation of LSU-rRNA  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MAHQVVNDALTDLYLLKKPQAIHFTKKNDIRPFEDETPLEFLSQKNDASLFAVGSHSKKRPHNIVLGRMFDHHLLDMIEIGLDRFVSMNDYKAGMKPCMVFNGDLFDQQEEYIKLKNLLLDFFQGEKADAVNLEGLEHVMVVTAGPMPAPNKMGRVFLRVYTEMGPSMDFTIRRTQFAPDELMKQALRVPAEIKKKKVKNVEHDELGDQFGRIHMERQDFGQLQTRKMKGLKRRADDEDDDDSSASDDAEDDDGASKQTRKSKAKGKRTRAN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.13
3 0.14
4 0.18
5 0.2
6 0.27
7 0.36
8 0.4
9 0.46
10 0.54
11 0.59
12 0.65
13 0.69
14 0.71
15 0.7
16 0.69
17 0.67
18 0.62
19 0.63
20 0.58
21 0.56
22 0.48
23 0.42
24 0.42
25 0.35
26 0.31
27 0.24
28 0.21
29 0.2
30 0.22
31 0.19
32 0.15
33 0.15
34 0.15
35 0.16
36 0.16
37 0.12
38 0.1
39 0.12
40 0.13
41 0.15
42 0.21
43 0.24
44 0.3
45 0.35
46 0.42
47 0.48
48 0.51
49 0.58
50 0.58
51 0.63
52 0.62
53 0.59
54 0.53
55 0.46
56 0.43
57 0.34
58 0.28
59 0.18
60 0.13
61 0.11
62 0.1
63 0.08
64 0.07
65 0.06
66 0.05
67 0.05
68 0.04
69 0.04
70 0.04
71 0.04
72 0.04
73 0.07
74 0.07
75 0.09
76 0.1
77 0.11
78 0.12
79 0.15
80 0.18
81 0.15
82 0.17
83 0.17
84 0.17
85 0.18
86 0.19
87 0.16
88 0.13
89 0.18
90 0.16
91 0.15
92 0.15
93 0.13
94 0.12
95 0.11
96 0.13
97 0.09
98 0.1
99 0.11
100 0.11
101 0.12
102 0.12
103 0.14
104 0.13
105 0.12
106 0.12
107 0.11
108 0.12
109 0.11
110 0.11
111 0.09
112 0.09
113 0.08
114 0.08
115 0.06
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.03
126 0.02
127 0.02
128 0.02
129 0.02
130 0.03
131 0.03
132 0.03
133 0.04
134 0.04
135 0.05
136 0.07
137 0.08
138 0.1
139 0.11
140 0.16
141 0.16
142 0.19
143 0.19
144 0.2
145 0.23
146 0.21
147 0.22
148 0.19
149 0.19
150 0.16
151 0.15
152 0.13
153 0.09
154 0.1
155 0.11
156 0.1
157 0.11
158 0.2
159 0.2
160 0.22
161 0.22
162 0.23
163 0.23
164 0.25
165 0.28
166 0.2
167 0.22
168 0.22
169 0.24
170 0.21
171 0.19
172 0.2
173 0.18
174 0.17
175 0.15
176 0.17
177 0.21
178 0.32
179 0.36
180 0.4
181 0.47
182 0.52
183 0.59
184 0.66
185 0.68
186 0.68
187 0.73
188 0.74
189 0.67
190 0.64
191 0.58
192 0.49
193 0.42
194 0.31
195 0.21
196 0.14
197 0.12
198 0.13
199 0.12
200 0.14
201 0.16
202 0.2
203 0.2
204 0.22
205 0.28
206 0.26
207 0.27
208 0.34
209 0.32
210 0.34
211 0.41
212 0.4
213 0.38
214 0.43
215 0.48
216 0.49
217 0.58
218 0.62
219 0.61
220 0.67
221 0.69
222 0.7
223 0.67
224 0.63
225 0.59
226 0.51
227 0.44
228 0.37
229 0.31
230 0.25
231 0.2
232 0.14
233 0.08
234 0.06
235 0.07
236 0.08
237 0.08
238 0.08
239 0.09
240 0.1
241 0.11
242 0.14
243 0.16
244 0.2
245 0.29
246 0.38
247 0.44
248 0.52
249 0.61
250 0.69
251 0.77
252 0.83