FuNGI

A0A4P9YX99

Protein Details

Accession

A0A4P9YX99

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
271-293	HLDRHFKQNRRLKERTRKVISRC	Basic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 9, cyto 8, mito 6, pero 2, cysk 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045154 PCF11-like
Gene Ontology	GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000993 F:RNA polymerase II complex binding GO:0006379 P:mRNA cleavage GO:0006378 P:mRNA polyadenylation GO:0006369 P:termination of RNA polymerase II transcription

Amino Acid Sequences

MDEIHIALPRASQLWNEHVSGADGATDAQCTSAAAHMRARNLTALLGGLTPEHLRLMQEIQATLTMKQQQLAQQPNHPVLTNVVNVLTQLLAMVPTLQLNPTVIAGIQQTLAMQRSSTPPLGGGGSGGGRSMPAASVLSTMPAAASSPSSIASLIGKLSGGPALAPPSSMPAMPAAAPVPAAAMGMTAPAGQINPAMIASLIGQLSSVPGLSSTVGGTTSRQAALALTQEGIQRACPGLFEIVYGQLGLRCGQCGLRFSDDERGQARMSAHLDRHFKQNRRLKERTRKVISRCWFVRDEDWVHSRLVTNEDENVISPPEDEKLPCPICQEKFEEFWCDEEEEWMLRNAVMVNGKIYHATCHIDASMAVEEPPSSNASSNANSPAPSGVLGKRKFDKQLDETSTMGGSMGSATTTTTTTGMGGANDAAQHHALPQHDTKKMAVTIQMVR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.24
2	0.27
3	0.28
4	0.27
5	0.25
6	0.26
7	0.23
8	0.19
9	0.13
10	0.1
11	0.09
12	0.09
13	0.09
14	0.07
15	0.07
16	0.07
17	0.07
18	0.08
19	0.12
20	0.15
21	0.16
22	0.23
23	0.26
24	0.3
25	0.31
26	0.32
27	0.29
28	0.27
29	0.25
30	0.19
31	0.16
32	0.12
33	0.11
34	0.1
35	0.08
36	0.09
37	0.09
38	0.09
39	0.09
40	0.09
41	0.09
42	0.11
43	0.14
44	0.16
45	0.17
46	0.17
47	0.17
48	0.2
49	0.21
50	0.19
51	0.22
52	0.24
53	0.23
54	0.24
55	0.26
56	0.29
57	0.36
58	0.44
59	0.42
60	0.43
61	0.47
62	0.5
63	0.48
64	0.42
65	0.34
66	0.29
67	0.29
68	0.24
69	0.19
70	0.16
71	0.14
72	0.14
73	0.14
74	0.11
75	0.06
76	0.05
77	0.05
78	0.04
79	0.04
80	0.05
81	0.04
82	0.05
83	0.06
84	0.06
85	0.07
86	0.07
87	0.08
88	0.08
89	0.08
90	0.07
91	0.07
92	0.08
93	0.08
94	0.07
95	0.07
96	0.07
97	0.09
98	0.1
99	0.09
100	0.08
101	0.1
102	0.13
103	0.17
104	0.18
105	0.16
106	0.15
107	0.16
108	0.17
109	0.15
110	0.11
111	0.08
112	0.08
113	0.07
114	0.07
115	0.05
116	0.05
117	0.05
118	0.05
119	0.04
120	0.05
121	0.05
122	0.05
123	0.07
124	0.07
125	0.08
126	0.07
127	0.07
128	0.06
129	0.05
130	0.06
131	0.05
132	0.05
133	0.05
134	0.05
135	0.06
136	0.07
137	0.07
138	0.07
139	0.07
140	0.07
141	0.07
142	0.07
143	0.06
144	0.05
145	0.06
146	0.06
147	0.05
148	0.04
149	0.05
150	0.07
151	0.07
152	0.07
153	0.07
154	0.09
155	0.1
156	0.1
157	0.09
158	0.08
159	0.09
160	0.08
161	0.09
162	0.07
163	0.06
164	0.06
165	0.06
166	0.05
167	0.04
168	0.04
169	0.03
170	0.03
171	0.03
172	0.03
173	0.03
174	0.03
175	0.03
176	0.03
177	0.03
178	0.03
179	0.03
180	0.03
181	0.04
182	0.03
183	0.04
184	0.03
185	0.04
186	0.04
187	0.06
188	0.05
189	0.05
190	0.05
191	0.05
192	0.05
193	0.05
194	0.04
195	0.03
196	0.03
197	0.03
198	0.04
199	0.04
200	0.04
201	0.04
202	0.05
203	0.05
204	0.06
205	0.06
206	0.07
207	0.07
208	0.07
209	0.07
210	0.07
211	0.07
212	0.08
213	0.07
214	0.06
215	0.07
216	0.08
217	0.09
218	0.09
219	0.08
220	0.08
221	0.08
222	0.07
223	0.06
224	0.06
225	0.06
226	0.06
227	0.06
228	0.06
229	0.06
230	0.06
231	0.06
232	0.05
233	0.05
234	0.06
235	0.07
236	0.06
237	0.06
238	0.07
239	0.08
240	0.1
241	0.11
242	0.13
243	0.15
244	0.16
245	0.17
246	0.25
247	0.25
248	0.26
249	0.25
250	0.25
251	0.22
252	0.24
253	0.23
254	0.17
255	0.19
256	0.2
257	0.21
258	0.25
259	0.29
260	0.28
261	0.38
262	0.43
263	0.45
264	0.52
265	0.57
266	0.62
267	0.66
268	0.73
269	0.73
270	0.77
271	0.82
272	0.83
273	0.83
274	0.8
275	0.77
276	0.78
277	0.73
278	0.71
279	0.63
280	0.57
281	0.51
282	0.46
283	0.42
284	0.39
285	0.36
286	0.32
287	0.32
288	0.29
289	0.27
290	0.25
291	0.24
292	0.2
293	0.2
294	0.17
295	0.15
296	0.15
297	0.16
298	0.15
299	0.15
300	0.14
301	0.12
302	0.1
303	0.09
304	0.09
305	0.09
306	0.1
307	0.11
308	0.11
309	0.19
310	0.21
311	0.21
312	0.25
313	0.3
314	0.32
315	0.35
316	0.39
317	0.33
318	0.35
319	0.36
320	0.36
321	0.3
322	0.29
323	0.27
324	0.23
325	0.2
326	0.18
327	0.17
328	0.13
329	0.14
330	0.13
331	0.11
332	0.09
333	0.1
334	0.09
335	0.11
336	0.13
337	0.12
338	0.13
339	0.14
340	0.14
341	0.15
342	0.15
343	0.14
344	0.14
345	0.17
346	0.16
347	0.16
348	0.16
349	0.15
350	0.15
351	0.16
352	0.14
353	0.12
354	0.11
355	0.1
356	0.1
357	0.1
358	0.12
359	0.11
360	0.1
361	0.11
362	0.12
363	0.16
364	0.18
365	0.19
366	0.22
367	0.22
368	0.21
369	0.21
370	0.21
371	0.17
372	0.17
373	0.18
374	0.19
375	0.27
376	0.29
377	0.35
378	0.39
379	0.44
380	0.5
381	0.52
382	0.55
383	0.52
384	0.6
385	0.6
386	0.58
387	0.54
388	0.47
389	0.42
390	0.33
391	0.27
392	0.16
393	0.1
394	0.07
395	0.06
396	0.05
397	0.05
398	0.06
399	0.07
400	0.08
401	0.09
402	0.09
403	0.09
404	0.09
405	0.1
406	0.11
407	0.1
408	0.1
409	0.1
410	0.1
411	0.1
412	0.11
413	0.11
414	0.11
415	0.11
416	0.12
417	0.15
418	0.16
419	0.2
420	0.28
421	0.34
422	0.37
423	0.39
424	0.38
425	0.42
426	0.42
427	0.39
428	0.36

A0A4P9YX99

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer