FuNGI

K1VDL3

Protein Details

Accession

K1VDL3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
230-257	AKAKEKEKIKAQKERKRRQKLVRAAVAG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
130-147	RGRGGIRGRGRGGMRGGR
226-250	GKAAAKAKEKEKIKAQKERKRRQKL
415-435	KKEEKPKLAAAAAGRKKPTPP

Subcellular Location(s)

mito 25

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MPGQRLRPTKPTRPRASLVAAAAASESPSTSAPAAGQQPLFLDPDADDEADEKHDAMEDTKEDTREPAPAATPAPALTQAQAPTQPTASASSSQVQGARTEPVKMKFKPKMPIRRAVQEDVKTDVATSSRGRGGIRGRGRGGMRGGRGGSAAVSTIAAGPFGGNRPTSRRVVAPPPPSRGMETVAVEVYSDNEDGSRPGVIDIDAVSGLSESAPTSVYRARDLDGGKAAAKAKEKEKIKAQKERKRRQKLVRAAVAGDVPGDVFVKAEPVSPSRPGAPLPTTADDDMNMEREGDSMIPADQTQDRDEAGRRVRALTSVTDISTVSGTPDVNEAQRVDLSESEDEEFEEDLGGDFILVPGGEHPEDKLFTFQFPHMFPKFKPPPEPVVDVDGAAEGAAGAGGAAAGATGAGAEAEKKEEKPKLAAAAAGRKKPTPPPTGRIGSLVVLKSGKVKMVMGSGDSAVVMDVSPGVSPSFLQTLVHVDQKSKTLAVAGEVHKSYVVTPDVDRLLDELFINGGETPGDREKRALRQVKMERGVKMELD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.79
2	0.75
3	0.72
4	0.67
5	0.57
6	0.51
7	0.41
8	0.33
9	0.3
10	0.23
11	0.17
12	0.12
13	0.1
14	0.07
15	0.08
16	0.1
17	0.1
18	0.1
19	0.1
20	0.15
21	0.19
22	0.21
23	0.21
24	0.19
25	0.21
26	0.22
27	0.23
28	0.17
29	0.15
30	0.11
31	0.15
32	0.17
33	0.15
34	0.14
35	0.13
36	0.14
37	0.15
38	0.15
39	0.11
40	0.1
41	0.11
42	0.12
43	0.13
44	0.15
45	0.14
46	0.19
47	0.22
48	0.22
49	0.21
50	0.24
51	0.23
52	0.23
53	0.23
54	0.2
55	0.19
56	0.2
57	0.21
58	0.2
59	0.19
60	0.17
61	0.16
62	0.16
63	0.15
64	0.14
65	0.16
66	0.16
67	0.18
68	0.2
69	0.2
70	0.2
71	0.2
72	0.19
73	0.17
74	0.19
75	0.19
76	0.19
77	0.19
78	0.2
79	0.21
80	0.22
81	0.23
82	0.2
83	0.19
84	0.19
85	0.21
86	0.2
87	0.23
88	0.27
89	0.32
90	0.39
91	0.41
92	0.49
93	0.52
94	0.58
95	0.63
96	0.68
97	0.72
98	0.7
99	0.76
100	0.72
101	0.74
102	0.73
103	0.7
104	0.68
105	0.62
106	0.57
107	0.52
108	0.47
109	0.37
110	0.32
111	0.26
112	0.19
113	0.17
114	0.16
115	0.15
116	0.16
117	0.18
118	0.18
119	0.21
120	0.26
121	0.32
122	0.36
123	0.38
124	0.38
125	0.42
126	0.42
127	0.41
128	0.41
129	0.37
130	0.32
131	0.31
132	0.3
133	0.25
134	0.24
135	0.2
136	0.15
137	0.11
138	0.09
139	0.06
140	0.05
141	0.05
142	0.06
143	0.06
144	0.05
145	0.05
146	0.05
147	0.06
148	0.07
149	0.09
150	0.09
151	0.11
152	0.17
153	0.21
154	0.24
155	0.24
156	0.26
157	0.29
158	0.37
159	0.43
160	0.47
161	0.49
162	0.52
163	0.53
164	0.51
165	0.48
166	0.41
167	0.36
168	0.29
169	0.25
170	0.21
171	0.18
172	0.16
173	0.14
174	0.13
175	0.11
176	0.08
177	0.07
178	0.06
179	0.06
180	0.06
181	0.07
182	0.07
183	0.06
184	0.05
185	0.06
186	0.06
187	0.06
188	0.06
189	0.06
190	0.06
191	0.06
192	0.05
193	0.05
194	0.04
195	0.04
196	0.04
197	0.04
198	0.03
199	0.04
200	0.05
201	0.05
202	0.07
203	0.1
204	0.11
205	0.12
206	0.13
207	0.14
208	0.17
209	0.18
210	0.18
211	0.17
212	0.17
213	0.16
214	0.18
215	0.18
216	0.17
217	0.2
218	0.21
219	0.22
220	0.28
221	0.3
222	0.32
223	0.4
224	0.47
225	0.51
226	0.58
227	0.66
228	0.67
229	0.76
230	0.83
231	0.84
232	0.85
233	0.87
234	0.87
235	0.87
236	0.88
237	0.86
238	0.81
239	0.71
240	0.61
241	0.52
242	0.42
243	0.31
244	0.21
245	0.12
246	0.06
247	0.05
248	0.05
249	0.04
250	0.03
251	0.03
252	0.05
253	0.05
254	0.07
255	0.07
256	0.09
257	0.11
258	0.13
259	0.14
260	0.13
261	0.14
262	0.13
263	0.15
264	0.14
265	0.15
266	0.17
267	0.18
268	0.18
269	0.18
270	0.17
271	0.15
272	0.15
273	0.13
274	0.11
275	0.09
276	0.08
277	0.07
278	0.08
279	0.08
280	0.06
281	0.06
282	0.05
283	0.05
284	0.05
285	0.05
286	0.07
287	0.08
288	0.09
289	0.1
290	0.1
291	0.1
292	0.12
293	0.13
294	0.17
295	0.19
296	0.2
297	0.2
298	0.21
299	0.21
300	0.21
301	0.21
302	0.16
303	0.16
304	0.15
305	0.14
306	0.13
307	0.13
308	0.12
309	0.11
310	0.1
311	0.07
312	0.07
313	0.07
314	0.06
315	0.08
316	0.08
317	0.08
318	0.1
319	0.1
320	0.09
321	0.1
322	0.11
323	0.1
324	0.1
325	0.12
326	0.11
327	0.12
328	0.12
329	0.11
330	0.11
331	0.1
332	0.09
333	0.07
334	0.06
335	0.05
336	0.05
337	0.05
338	0.05
339	0.03
340	0.03
341	0.03
342	0.03
343	0.03
344	0.03
345	0.03
346	0.06
347	0.06
348	0.06
349	0.07
350	0.09
351	0.1
352	0.11
353	0.13
354	0.12
355	0.12
356	0.15
357	0.16
358	0.17
359	0.18
360	0.25
361	0.25
362	0.27
363	0.27
364	0.36
365	0.42
366	0.43
367	0.48
368	0.45
369	0.5
370	0.51
371	0.55
372	0.46
373	0.42
374	0.38
375	0.32
376	0.28
377	0.2
378	0.15
379	0.11
380	0.09
381	0.03
382	0.03
383	0.02
384	0.02
385	0.02
386	0.02
387	0.02
388	0.02
389	0.01
390	0.01
391	0.01
392	0.01
393	0.01
394	0.01
395	0.02
396	0.02
397	0.02
398	0.03
399	0.04
400	0.08
401	0.1
402	0.12
403	0.18
404	0.23
405	0.25
406	0.28
407	0.31
408	0.32
409	0.31
410	0.32
411	0.3
412	0.37
413	0.4
414	0.41
415	0.4
416	0.37
417	0.4
418	0.45
419	0.49
420	0.49
421	0.5
422	0.5
423	0.57
424	0.59
425	0.57
426	0.51
427	0.44
428	0.36
429	0.34
430	0.3
431	0.24
432	0.2
433	0.19
434	0.21
435	0.2
436	0.2
437	0.16
438	0.17
439	0.16
440	0.19
441	0.2
442	0.16
443	0.17
444	0.15
445	0.14
446	0.13
447	0.11
448	0.07
449	0.07
450	0.05
451	0.04
452	0.04
453	0.04
454	0.04
455	0.05
456	0.05
457	0.05
458	0.06
459	0.08
460	0.1
461	0.1
462	0.1
463	0.1
464	0.16
465	0.19
466	0.24
467	0.23
468	0.23
469	0.25
470	0.28
471	0.3
472	0.24
473	0.22
474	0.18
475	0.18
476	0.19
477	0.25
478	0.23
479	0.27
480	0.27
481	0.27
482	0.25
483	0.25
484	0.22
485	0.2
486	0.2
487	0.16
488	0.17
489	0.22
490	0.23
491	0.23
492	0.22
493	0.18
494	0.17
495	0.16
496	0.15
497	0.11
498	0.09
499	0.09
500	0.09
501	0.08
502	0.08
503	0.07
504	0.07
505	0.12
506	0.2
507	0.23
508	0.23
509	0.28
510	0.35
511	0.44
512	0.54
513	0.58
514	0.54
515	0.62
516	0.7
517	0.75
518	0.78
519	0.74
520	0.67
521	0.62

K1VDL3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer