Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4P9Z0F6

Protein Details
Accession A0A4P9Z0F6    Localization Confidence High Confidence Score 16.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
401-423EAGWTVKTNRRPRRVPPRDPSTQHydrophilic
504-523GGSYQERRKHHEKNEQDHLDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
104-127AGRARMGRTGRSSRRGGGRDKQRA
180-219RGKGHRNGAGGAGAGAAGGHHRPGGNRRLLLGRGQGHGPR
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 13.5, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045180  La_dom_prot  
IPR006630  La_HTH  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF05383  La  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50961  HTH_LA  
CDD cd07323  LAM  
Amino Acid Sequences MVDSRLPSAPSADQTEAQSAARAPAPAPSTPAEPAKAGVNPWKTTGKPTVAAAPESTAPPAAAHTEGKGKWIRMAVDIKHKQPAGHSGYRAGTSSEKDEAAGGAGRARMGRTGRSSRRGGGRDKQRARSTASTSTSSTPRSTRADGGERAKPTASTTSQHAKPAAGTNHADTGVRGQSARGKGHRNGAGGAGAGAAGGHHRPGGNRRLLLGRGQGHGPRHGGARHYGAGAGDASGDIATAYGTAYPCVPGYPAVAADPASADADTIKHYLRAQIEYYFSIENLCRDIYLRSHMDDEGYVAIDVLAAFNRIKNLAQPTSMILESLSSSECVEVKGQLIRKRDDWKTWLLPEKMKIATPITSTAASPAQPTATATEHSQTTVQPSSENDSSTVEPSSSKTENEAGWTVKTNRRPRRVPPRDPSTQQQQQQQRTNGTATSPANGQQHQKHRQVDDEHVFTFDDDAAWPEQASGRVQRYEASSDEEGEGNTTAATAAAAAAAKDVPNGGSYQERRKHHEKNEQDHLDALLVGDSDYEDGYDDEDYSSYKYNPHYDYYLEGDWGDDEELDDDT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.32
3 0.3
4 0.27
5 0.25
6 0.2
7 0.2
8 0.2
9 0.18
10 0.15
11 0.19
12 0.22
13 0.21
14 0.24
15 0.24
16 0.24
17 0.27
18 0.31
19 0.27
20 0.25
21 0.25
22 0.26
23 0.25
24 0.25
25 0.3
26 0.33
27 0.32
28 0.36
29 0.4
30 0.37
31 0.42
32 0.46
33 0.43
34 0.39
35 0.39
36 0.43
37 0.4
38 0.41
39 0.35
40 0.3
41 0.27
42 0.25
43 0.24
44 0.17
45 0.14
46 0.13
47 0.13
48 0.13
49 0.14
50 0.14
51 0.15
52 0.22
53 0.21
54 0.27
55 0.3
56 0.29
57 0.3
58 0.33
59 0.32
60 0.32
61 0.38
62 0.37
63 0.44
64 0.49
65 0.48
66 0.51
67 0.51
68 0.45
69 0.41
70 0.46
71 0.43
72 0.43
73 0.42
74 0.4
75 0.41
76 0.41
77 0.39
78 0.32
79 0.26
80 0.23
81 0.25
82 0.23
83 0.2
84 0.19
85 0.19
86 0.17
87 0.15
88 0.14
89 0.11
90 0.1
91 0.11
92 0.11
93 0.12
94 0.12
95 0.15
96 0.16
97 0.2
98 0.26
99 0.36
100 0.42
101 0.49
102 0.51
103 0.53
104 0.6
105 0.6
106 0.6
107 0.59
108 0.63
109 0.67
110 0.72
111 0.75
112 0.72
113 0.7
114 0.7
115 0.67
116 0.62
117 0.59
118 0.55
119 0.48
120 0.45
121 0.45
122 0.41
123 0.37
124 0.35
125 0.28
126 0.3
127 0.31
128 0.32
129 0.32
130 0.35
131 0.39
132 0.42
133 0.45
134 0.46
135 0.42
136 0.41
137 0.37
138 0.32
139 0.28
140 0.28
141 0.25
142 0.21
143 0.25
144 0.31
145 0.33
146 0.36
147 0.35
148 0.29
149 0.29
150 0.34
151 0.31
152 0.27
153 0.26
154 0.24
155 0.25
156 0.25
157 0.23
158 0.16
159 0.18
160 0.15
161 0.14
162 0.13
163 0.12
164 0.17
165 0.22
166 0.27
167 0.28
168 0.32
169 0.35
170 0.43
171 0.46
172 0.41
173 0.37
174 0.33
175 0.29
176 0.22
177 0.19
178 0.11
179 0.07
180 0.05
181 0.04
182 0.03
183 0.03
184 0.04
185 0.04
186 0.05
187 0.05
188 0.08
189 0.13
190 0.21
191 0.25
192 0.25
193 0.27
194 0.29
195 0.3
196 0.31
197 0.31
198 0.26
199 0.23
200 0.25
201 0.26
202 0.25
203 0.26
204 0.25
205 0.2
206 0.2
207 0.2
208 0.19
209 0.19
210 0.2
211 0.18
212 0.17
213 0.17
214 0.14
215 0.13
216 0.12
217 0.09
218 0.06
219 0.05
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.03
224 0.03
225 0.02
226 0.02
227 0.03
228 0.04
229 0.04
230 0.05
231 0.05
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.05
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.07
242 0.07
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.04
250 0.05
251 0.06
252 0.07
253 0.07
254 0.08
255 0.08
256 0.12
257 0.14
258 0.15
259 0.15
260 0.16
261 0.17
262 0.16
263 0.18
264 0.14
265 0.12
266 0.12
267 0.11
268 0.09
269 0.09
270 0.08
271 0.07
272 0.07
273 0.09
274 0.08
275 0.12
276 0.13
277 0.13
278 0.14
279 0.14
280 0.14
281 0.13
282 0.12
283 0.08
284 0.08
285 0.06
286 0.05
287 0.05
288 0.04
289 0.04
290 0.04
291 0.03
292 0.04
293 0.04
294 0.05
295 0.05
296 0.06
297 0.06
298 0.09
299 0.14
300 0.14
301 0.15
302 0.15
303 0.16
304 0.17
305 0.17
306 0.14
307 0.09
308 0.08
309 0.08
310 0.08
311 0.07
312 0.05
313 0.06
314 0.06
315 0.06
316 0.07
317 0.07
318 0.07
319 0.08
320 0.11
321 0.16
322 0.2
323 0.25
324 0.26
325 0.3
326 0.37
327 0.39
328 0.4
329 0.39
330 0.41
331 0.42
332 0.44
333 0.47
334 0.43
335 0.42
336 0.4
337 0.41
338 0.35
339 0.31
340 0.28
341 0.22
342 0.21
343 0.2
344 0.2
345 0.17
346 0.16
347 0.15
348 0.15
349 0.15
350 0.13
351 0.13
352 0.11
353 0.09
354 0.09
355 0.1
356 0.1
357 0.1
358 0.11
359 0.11
360 0.13
361 0.13
362 0.14
363 0.14
364 0.12
365 0.15
366 0.16
367 0.15
368 0.14
369 0.15
370 0.2
371 0.21
372 0.21
373 0.18
374 0.18
375 0.19
376 0.19
377 0.18
378 0.13
379 0.12
380 0.13
381 0.17
382 0.16
383 0.16
384 0.17
385 0.19
386 0.19
387 0.22
388 0.22
389 0.18
390 0.18
391 0.22
392 0.25
393 0.28
394 0.37
395 0.44
396 0.51
397 0.59
398 0.63
399 0.69
400 0.76
401 0.81
402 0.82
403 0.82
404 0.8
405 0.8
406 0.78
407 0.74
408 0.73
409 0.7
410 0.65
411 0.64
412 0.65
413 0.66
414 0.69
415 0.68
416 0.62
417 0.56
418 0.53
419 0.45
420 0.37
421 0.34
422 0.26
423 0.23
424 0.2
425 0.22
426 0.24
427 0.26
428 0.31
429 0.33
430 0.42
431 0.49
432 0.56
433 0.57
434 0.56
435 0.61
436 0.59
437 0.6
438 0.57
439 0.52
440 0.44
441 0.39
442 0.37
443 0.3
444 0.27
445 0.18
446 0.11
447 0.08
448 0.1
449 0.1
450 0.1
451 0.1
452 0.09
453 0.11
454 0.12
455 0.15
456 0.19
457 0.22
458 0.23
459 0.24
460 0.26
461 0.27
462 0.29
463 0.27
464 0.27
465 0.24
466 0.24
467 0.25
468 0.23
469 0.2
470 0.18
471 0.17
472 0.11
473 0.1
474 0.08
475 0.06
476 0.06
477 0.06
478 0.04
479 0.04
480 0.04
481 0.05
482 0.05
483 0.06
484 0.06
485 0.06
486 0.07
487 0.07
488 0.07
489 0.07
490 0.08
491 0.09
492 0.17
493 0.22
494 0.32
495 0.39
496 0.44
497 0.51
498 0.6
499 0.68
500 0.7
501 0.76
502 0.76
503 0.77
504 0.84
505 0.8
506 0.72
507 0.63
508 0.54
509 0.44
510 0.33
511 0.24
512 0.14
513 0.1
514 0.08
515 0.07
516 0.06
517 0.06
518 0.06
519 0.06
520 0.06
521 0.06
522 0.07
523 0.08
524 0.08
525 0.08
526 0.09
527 0.1
528 0.11
529 0.14
530 0.14
531 0.18
532 0.22
533 0.29
534 0.32
535 0.35
536 0.36
537 0.34
538 0.37
539 0.39
540 0.36
541 0.29
542 0.26
543 0.22
544 0.2
545 0.19
546 0.16
547 0.1
548 0.09