Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3N4KT73

Protein Details
Accession A0A3N4KT73    Localization Confidence High Confidence Score 16.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
476-524PSFKRFKVLEEIKRKRNEQKEKEKAENQRQMERQKDMKRKEEENRRAAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
136-142AKKKKLP
487-518IKRKRNEQKEKEKAENQRQMERQKDMKRKEEE
Subcellular Location(s) nucl 18, mito 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MSTSTSTSSKTPPLHSRIKLNPVNNTAPRTYTGKHLPPGQQRSVGSGTKTRPPPLPSPTPNSNGSGGNNGGAANGASNANTGPGTRISERRRTTHKPGEFANLAKGKGRGGSVDDKGKGIGAEEEGESIVVRGVPAKKKKLPRGPFVTTTSSILEKYRGQPPSIIIHLHPQHFRFEGQDGSFSYGSPMKAFLEYLKSEIIPHEVVEEFRDAGTKFYDGCLIVQIHDHRSATITSSSKKNDNKDIPYSIHNRSLWLTPSPFVPFKEPPCTRSGASSGESENNKENPSNTKEDKDPKDVKTEKKTRIFTTVLHPSAMTLHGDMAVLASTPVPVRSISFSRQQPLSAAGTPTSATMTIPPTPTMNARAKYTTVITEKTAAQFEASVLLATSPALLLTPAKDPEHCQKIINTLRNPLNSFPLPPPKSRKRTTAELAADEAQAAEEERVLLIMDERHFSSSHAQPESAVGDGVGGGGGFEPSFKRFKVLEEIKRKRNEQKEKEKAENQRQMERQKDMKRKEEENRRAAASRSSQQGSPVLAQGPMAM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.62
3 0.67
4 0.67
5 0.73
6 0.72
7 0.68
8 0.69
9 0.66
10 0.71
11 0.66
12 0.63
13 0.55
14 0.5
15 0.48
16 0.44
17 0.39
18 0.38
19 0.42
20 0.44
21 0.47
22 0.53
23 0.58
24 0.63
25 0.7
26 0.67
27 0.64
28 0.57
29 0.58
30 0.56
31 0.5
32 0.44
33 0.42
34 0.41
35 0.44
36 0.48
37 0.47
38 0.48
39 0.5
40 0.54
41 0.55
42 0.62
43 0.59
44 0.62
45 0.64
46 0.63
47 0.6
48 0.55
49 0.5
50 0.42
51 0.37
52 0.34
53 0.28
54 0.24
55 0.21
56 0.18
57 0.15
58 0.12
59 0.11
60 0.07
61 0.07
62 0.07
63 0.06
64 0.07
65 0.07
66 0.08
67 0.08
68 0.08
69 0.09
70 0.11
71 0.16
72 0.19
73 0.28
74 0.33
75 0.43
76 0.47
77 0.52
78 0.59
79 0.62
80 0.69
81 0.7
82 0.7
83 0.64
84 0.63
85 0.64
86 0.58
87 0.51
88 0.5
89 0.43
90 0.38
91 0.36
92 0.34
93 0.27
94 0.26
95 0.25
96 0.18
97 0.19
98 0.25
99 0.27
100 0.33
101 0.33
102 0.31
103 0.3
104 0.29
105 0.24
106 0.19
107 0.15
108 0.1
109 0.1
110 0.1
111 0.1
112 0.09
113 0.09
114 0.08
115 0.07
116 0.06
117 0.05
118 0.05
119 0.09
120 0.14
121 0.23
122 0.3
123 0.38
124 0.46
125 0.55
126 0.66
127 0.72
128 0.74
129 0.76
130 0.77
131 0.76
132 0.74
133 0.69
134 0.64
135 0.55
136 0.49
137 0.41
138 0.33
139 0.27
140 0.23
141 0.21
142 0.19
143 0.22
144 0.27
145 0.27
146 0.27
147 0.28
148 0.3
149 0.32
150 0.3
151 0.28
152 0.21
153 0.27
154 0.3
155 0.33
156 0.33
157 0.29
158 0.3
159 0.3
160 0.3
161 0.24
162 0.21
163 0.21
164 0.19
165 0.2
166 0.18
167 0.21
168 0.2
169 0.18
170 0.18
171 0.17
172 0.17
173 0.14
174 0.15
175 0.11
176 0.11
177 0.12
178 0.11
179 0.13
180 0.14
181 0.15
182 0.15
183 0.14
184 0.14
185 0.14
186 0.15
187 0.11
188 0.1
189 0.11
190 0.1
191 0.1
192 0.11
193 0.11
194 0.09
195 0.08
196 0.1
197 0.09
198 0.09
199 0.1
200 0.09
201 0.09
202 0.09
203 0.11
204 0.09
205 0.09
206 0.11
207 0.11
208 0.1
209 0.13
210 0.14
211 0.15
212 0.17
213 0.17
214 0.14
215 0.15
216 0.15
217 0.14
218 0.17
219 0.16
220 0.17
221 0.21
222 0.24
223 0.29
224 0.34
225 0.36
226 0.4
227 0.44
228 0.47
229 0.47
230 0.48
231 0.42
232 0.43
233 0.44
234 0.38
235 0.37
236 0.32
237 0.29
238 0.27
239 0.27
240 0.24
241 0.22
242 0.2
243 0.14
244 0.16
245 0.18
246 0.18
247 0.17
248 0.19
249 0.2
250 0.23
251 0.32
252 0.31
253 0.31
254 0.32
255 0.34
256 0.29
257 0.28
258 0.27
259 0.2
260 0.21
261 0.19
262 0.18
263 0.2
264 0.2
265 0.2
266 0.2
267 0.19
268 0.18
269 0.18
270 0.18
271 0.19
272 0.23
273 0.27
274 0.27
275 0.28
276 0.32
277 0.4
278 0.43
279 0.46
280 0.48
281 0.43
282 0.51
283 0.54
284 0.56
285 0.58
286 0.62
287 0.62
288 0.64
289 0.66
290 0.59
291 0.59
292 0.53
293 0.45
294 0.43
295 0.43
296 0.36
297 0.32
298 0.3
299 0.24
300 0.23
301 0.22
302 0.16
303 0.07
304 0.07
305 0.07
306 0.07
307 0.06
308 0.05
309 0.04
310 0.04
311 0.04
312 0.03
313 0.04
314 0.04
315 0.04
316 0.05
317 0.05
318 0.06
319 0.1
320 0.13
321 0.15
322 0.23
323 0.25
324 0.28
325 0.28
326 0.28
327 0.25
328 0.25
329 0.25
330 0.2
331 0.18
332 0.15
333 0.15
334 0.15
335 0.14
336 0.11
337 0.08
338 0.07
339 0.08
340 0.1
341 0.12
342 0.13
343 0.13
344 0.13
345 0.15
346 0.16
347 0.21
348 0.25
349 0.24
350 0.26
351 0.27
352 0.27
353 0.28
354 0.27
355 0.26
356 0.23
357 0.22
358 0.21
359 0.22
360 0.22
361 0.23
362 0.22
363 0.17
364 0.14
365 0.13
366 0.12
367 0.11
368 0.1
369 0.07
370 0.06
371 0.06
372 0.06
373 0.05
374 0.05
375 0.03
376 0.03
377 0.03
378 0.04
379 0.04
380 0.06
381 0.09
382 0.12
383 0.13
384 0.14
385 0.18
386 0.27
387 0.33
388 0.32
389 0.31
390 0.3
391 0.39
392 0.46
393 0.5
394 0.44
395 0.45
396 0.49
397 0.51
398 0.52
399 0.44
400 0.42
401 0.35
402 0.36
403 0.34
404 0.4
405 0.39
406 0.43
407 0.52
408 0.56
409 0.64
410 0.66
411 0.68
412 0.64
413 0.7
414 0.69
415 0.69
416 0.63
417 0.56
418 0.54
419 0.47
420 0.4
421 0.31
422 0.25
423 0.15
424 0.11
425 0.09
426 0.06
427 0.05
428 0.05
429 0.05
430 0.05
431 0.05
432 0.05
433 0.06
434 0.1
435 0.11
436 0.13
437 0.14
438 0.15
439 0.16
440 0.17
441 0.22
442 0.24
443 0.3
444 0.3
445 0.29
446 0.28
447 0.3
448 0.3
449 0.24
450 0.18
451 0.11
452 0.09
453 0.08
454 0.08
455 0.05
456 0.04
457 0.03
458 0.03
459 0.04
460 0.03
461 0.05
462 0.06
463 0.1
464 0.13
465 0.13
466 0.18
467 0.18
468 0.23
469 0.33
470 0.41
471 0.48
472 0.57
473 0.66
474 0.71
475 0.78
476 0.81
477 0.8
478 0.81
479 0.82
480 0.81
481 0.83
482 0.85
483 0.85
484 0.89
485 0.87
486 0.87
487 0.87
488 0.85
489 0.78
490 0.77
491 0.77
492 0.76
493 0.74
494 0.72
495 0.7
496 0.71
497 0.76
498 0.75
499 0.77
500 0.76
501 0.78
502 0.81
503 0.82
504 0.83
505 0.8
506 0.77
507 0.72
508 0.67
509 0.61
510 0.58
511 0.54
512 0.5
513 0.49
514 0.47
515 0.43
516 0.44
517 0.45
518 0.41
519 0.36
520 0.33
521 0.27
522 0.24