Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3N4KSA5

Protein Details
Accession A0A3N4KSA5    Localization Confidence High Confidence Score 23.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-23RTKMRGPGRGSEKKDKFRATKBasic
39-77EPAEGEDKKKAKKEKKDKKEKKEKKEKKDKKPAPEAAESBasic
116-138LPEPPSKKALRKLKKHPDLADKLBasic
358-380EEELAKRQRKRRFLGTRQIKMEYHydrophilic
382-405EDSSVRYKKRFGKERPEGEKEGKRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-18GPGRGSEKKDK
46-72KKKAKKEKKDKKEKKEKKEKKDKKPAP
122-131KKALRKLKKH
363-369KRQRKRR
387-425RYKKRFGKERPEGEKEGKRGERVEVEEREPRQKRAPRKE
Subcellular Location(s) nucl 17, mito 7, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034226  Nop13/Rnp24_RRM2  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12397  RRM2_Nop13p_fungi  
Amino Acid Sequences MSRTKMRGPGRGSEKKDKFRATKLVEKLAAAENTTAGEEPAEGEDKKKAKKEKKDKKEKKEKKEKKDKKPAPEAAESAAPAESEAPPTAAPEDASSPSKKRKRDTTTSEIEIDVTLPEPPSKKALRKLKKHPDLADKLIKPSPVAAPGTTPKPAEEFPEHSSQARSKWGIWIGNLGFSTTRPQLEEFLTRPPSTIQRIEVTRINLPTDPHTKRNRGFAYIDFANQKALDYALTLTETLFLGRKVLIKNANDFSGRGSGTNPDGSGGPVKLGPNLASKPPSKILFVGNLDFATTDEDLKSHFAFAGPIQKIRLATFEDTGKCKGFGFVDFEDIDSVKRAMLGLSAEEEAAKAGLEGKEEEELAKRQRKRRFLGTRQIKMEYGEDSSVRYKKRFGKERPEGEKEGKRGERVEVEEREPRQKRAPRKED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.77
2 0.79
3 0.83
4 0.83
5 0.79
6 0.78
7 0.8
8 0.76
9 0.76
10 0.73
11 0.73
12 0.65
13 0.59
14 0.54
15 0.5
16 0.43
17 0.35
18 0.29
19 0.2
20 0.19
21 0.2
22 0.16
23 0.1
24 0.09
25 0.08
26 0.08
27 0.1
28 0.13
29 0.12
30 0.14
31 0.21
32 0.27
33 0.34
34 0.41
35 0.49
36 0.55
37 0.66
38 0.76
39 0.8
40 0.85
41 0.91
42 0.94
43 0.95
44 0.96
45 0.96
46 0.96
47 0.96
48 0.95
49 0.95
50 0.96
51 0.95
52 0.95
53 0.96
54 0.93
55 0.92
56 0.92
57 0.89
58 0.85
59 0.8
60 0.7
61 0.61
62 0.55
63 0.44
64 0.34
65 0.26
66 0.18
67 0.13
68 0.12
69 0.1
70 0.1
71 0.1
72 0.1
73 0.1
74 0.11
75 0.12
76 0.11
77 0.1
78 0.09
79 0.12
80 0.14
81 0.18
82 0.2
83 0.24
84 0.34
85 0.4
86 0.46
87 0.5
88 0.58
89 0.64
90 0.71
91 0.75
92 0.73
93 0.74
94 0.72
95 0.65
96 0.55
97 0.46
98 0.36
99 0.27
100 0.18
101 0.11
102 0.08
103 0.07
104 0.1
105 0.11
106 0.12
107 0.18
108 0.23
109 0.28
110 0.37
111 0.48
112 0.55
113 0.64
114 0.74
115 0.79
116 0.83
117 0.84
118 0.81
119 0.81
120 0.77
121 0.74
122 0.72
123 0.62
124 0.57
125 0.52
126 0.45
127 0.35
128 0.31
129 0.26
130 0.2
131 0.2
132 0.16
133 0.17
134 0.2
135 0.23
136 0.23
137 0.21
138 0.17
139 0.19
140 0.19
141 0.21
142 0.22
143 0.23
144 0.25
145 0.3
146 0.31
147 0.29
148 0.31
149 0.28
150 0.26
151 0.26
152 0.24
153 0.19
154 0.22
155 0.25
156 0.24
157 0.23
158 0.26
159 0.21
160 0.22
161 0.22
162 0.18
163 0.14
164 0.13
165 0.16
166 0.12
167 0.13
168 0.11
169 0.12
170 0.14
171 0.16
172 0.19
173 0.17
174 0.21
175 0.24
176 0.23
177 0.23
178 0.22
179 0.24
180 0.24
181 0.25
182 0.21
183 0.22
184 0.23
185 0.25
186 0.27
187 0.25
188 0.24
189 0.23
190 0.22
191 0.19
192 0.19
193 0.21
194 0.26
195 0.27
196 0.32
197 0.37
198 0.42
199 0.42
200 0.5
201 0.48
202 0.43
203 0.42
204 0.35
205 0.35
206 0.3
207 0.3
208 0.22
209 0.2
210 0.18
211 0.16
212 0.14
213 0.08
214 0.08
215 0.06
216 0.05
217 0.06
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.06
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.05
227 0.06
228 0.07
229 0.1
230 0.1
231 0.15
232 0.2
233 0.21
234 0.26
235 0.27
236 0.28
237 0.25
238 0.24
239 0.22
240 0.2
241 0.18
242 0.14
243 0.13
244 0.13
245 0.14
246 0.15
247 0.13
248 0.1
249 0.1
250 0.11
251 0.12
252 0.1
253 0.09
254 0.1
255 0.1
256 0.1
257 0.11
258 0.12
259 0.14
260 0.16
261 0.18
262 0.2
263 0.21
264 0.24
265 0.28
266 0.28
267 0.25
268 0.25
269 0.24
270 0.26
271 0.27
272 0.25
273 0.21
274 0.19
275 0.18
276 0.16
277 0.14
278 0.11
279 0.09
280 0.09
281 0.08
282 0.08
283 0.09
284 0.11
285 0.11
286 0.09
287 0.09
288 0.08
289 0.09
290 0.11
291 0.19
292 0.18
293 0.19
294 0.2
295 0.22
296 0.22
297 0.22
298 0.23
299 0.18
300 0.18
301 0.19
302 0.24
303 0.25
304 0.27
305 0.29
306 0.27
307 0.24
308 0.22
309 0.22
310 0.18
311 0.18
312 0.21
313 0.19
314 0.21
315 0.21
316 0.21
317 0.2
318 0.19
319 0.17
320 0.13
321 0.12
322 0.08
323 0.09
324 0.08
325 0.07
326 0.09
327 0.09
328 0.08
329 0.1
330 0.1
331 0.1
332 0.1
333 0.09
334 0.08
335 0.07
336 0.06
337 0.04
338 0.08
339 0.08
340 0.1
341 0.11
342 0.12
343 0.13
344 0.13
345 0.15
346 0.15
347 0.19
348 0.26
349 0.34
350 0.41
351 0.48
352 0.57
353 0.65
354 0.69
355 0.75
356 0.77
357 0.79
358 0.82
359 0.85
360 0.85
361 0.81
362 0.77
363 0.67
364 0.58
365 0.5
366 0.41
367 0.33
368 0.27
369 0.22
370 0.22
371 0.28
372 0.31
373 0.33
374 0.33
375 0.38
376 0.45
377 0.55
378 0.63
379 0.66
380 0.72
381 0.78
382 0.87
383 0.88
384 0.86
385 0.82
386 0.8
387 0.78
388 0.72
389 0.71
390 0.65
391 0.6
392 0.55
393 0.54
394 0.52
395 0.5
396 0.54
397 0.49
398 0.49
399 0.53
400 0.55
401 0.6
402 0.57
403 0.57
404 0.58
405 0.62
406 0.68