FuNGI

A0A3N4KPU5

Protein Details

Accession

A0A3N4KPU5

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
27-49	NDNPLVQRQKRPRPAPGIRPSAA	Hydrophilic
202-221	GGAQKQKKNAFQKKTQQVYK	Hydrophilic
567-588	ESGAESRKKPKKSQAPKLGTST	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
405-424	KEKKKLEAVRRKHGKKVKKA
572-579	SRKKPKKS

Subcellular Location(s)

nucl 15.5, mito_nucl 12.333, mito 8, cyto_mito 6.333

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MASPASTAVAAGLNDAPRPVARRRPVNDNPLVQRQKRPRPAPGIRPSAAAIAGGATAIAPRHASTSTPTPPTAPAVVAPAASASTATTAAAPVKQEEEIQWQEYKLTTTKASLMKDLRYHVMRMQSKRIVNPLDSQEFTRPIKLHRRDPRAPLQGAKEEAAANAVAAAHKAAEEEEKAKNQAEQDKKDADKAAALEKIAPYGGAQKQKKNAFQKKTQQVYKSNDAEKKLRYEEFFPWFIEDFDNKNTWVGQLESSLSKGVFAMFVLDDGAFKMVPIEKWYKFTEKNKFKTMTSEEAEVVMKQNAKPPRWLMNRTEEKERERRTLEENARATKKLFTRKGDRLPKAETDADDLDFDDDQFADDEEAPIMEGEEHENKEIENRIKKEQLSANFFDARGEREYEEEEKEKKKLEAVRRKHGKKVKKALMNREGNYTYETDSDADPYASTDDDSDDEEEEARKQEEAKKAEEARKVEAAEKEALEKLVAEKAAEKAAAAAAAKAATTTPAAATAAAAAATPSTPAAAPSDTKTAKPVVSKKATQAPGTSTPLPTAGPKLKRSGSPNLSGIESGAESRKKPKKSQAPKLGTSTLPVGTDKKSIVKLKVPPENLQQISSSEPSPSPPSVAGMTAKKRKNDGNATADEKSGEMSDGPGSKKQRIKLLSGGRSLSPSAAASRQGSPAPPAPAGADAAFITDEEIKSLLSSNPGGVTLKFIADKFKSRVRNDEVKARLVSSIKRLTVSNDKKTYHLKKDV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.14
2	0.14
3	0.15
4	0.15
5	0.2
6	0.25
7	0.32
8	0.4
9	0.5
10	0.54
11	0.63
12	0.7
13	0.75
14	0.77
15	0.75
16	0.73
17	0.74
18	0.79
19	0.73
20	0.74
21	0.74
22	0.77
23	0.79
24	0.79
25	0.78
26	0.8
27	0.85
28	0.86
29	0.85
30	0.83
31	0.73
32	0.69
33	0.6
34	0.51
35	0.42
36	0.31
37	0.21
38	0.12
39	0.11
40	0.08
41	0.07
42	0.04
43	0.05
44	0.05
45	0.06
46	0.06
47	0.07
48	0.1
49	0.1
50	0.12
51	0.16
52	0.24
53	0.3
54	0.33
55	0.33
56	0.33
57	0.34
58	0.37
59	0.33
60	0.26
61	0.2
62	0.2
63	0.2
64	0.18
65	0.16
66	0.12
67	0.11
68	0.1
69	0.09
70	0.06
71	0.06
72	0.06
73	0.07
74	0.07
75	0.08
76	0.09
77	0.11
78	0.12
79	0.12
80	0.14
81	0.14
82	0.15
83	0.16
84	0.22
85	0.24
86	0.26
87	0.26
88	0.25
89	0.25
90	0.25
91	0.26
92	0.2
93	0.2
94	0.19
95	0.19
96	0.25
97	0.29
98	0.3
99	0.34
100	0.36
101	0.38
102	0.4
103	0.42
104	0.42
105	0.39
106	0.39
107	0.36
108	0.42
109	0.44
110	0.45
111	0.51
112	0.51
113	0.53
114	0.54
115	0.58
116	0.52
117	0.46
118	0.48
119	0.46
120	0.44
121	0.42
122	0.41
123	0.38
124	0.39
125	0.38
126	0.37
127	0.32
128	0.34
129	0.43
130	0.48
131	0.54
132	0.59
133	0.67
134	0.68
135	0.74
136	0.78
137	0.76
138	0.72
139	0.66
140	0.62
141	0.58
142	0.53
143	0.46
144	0.38
145	0.29
146	0.26
147	0.22
148	0.16
149	0.1
150	0.08
151	0.08
152	0.06
153	0.06
154	0.06
155	0.05
156	0.05
157	0.05
158	0.05
159	0.07
160	0.09
161	0.12
162	0.16
163	0.18
164	0.2
165	0.21
166	0.22
167	0.25
168	0.32
169	0.37
170	0.38
171	0.41
172	0.46
173	0.46
174	0.48
175	0.45
176	0.37
177	0.31
178	0.28
179	0.27
180	0.22
181	0.21
182	0.19
183	0.17
184	0.18
185	0.15
186	0.13
187	0.09
188	0.14
189	0.19
190	0.27
191	0.3
192	0.35
193	0.43
194	0.49
195	0.57
196	0.61
197	0.66
198	0.65
199	0.71
200	0.76
201	0.78
202	0.82
203	0.8
204	0.76
205	0.74
206	0.74
207	0.73
208	0.69
209	0.66
210	0.61
211	0.58
212	0.56
213	0.51
214	0.49
215	0.45
216	0.41
217	0.36
218	0.36
219	0.38
220	0.38
221	0.37
222	0.32
223	0.3
224	0.27
225	0.26
226	0.24
227	0.2
228	0.17
229	0.18
230	0.19
231	0.17
232	0.17
233	0.16
234	0.14
235	0.14
236	0.12
237	0.1
238	0.1
239	0.11
240	0.11
241	0.12
242	0.12
243	0.1
244	0.09
245	0.09
246	0.08
247	0.06
248	0.05
249	0.06
250	0.05
251	0.05
252	0.06
253	0.06
254	0.05
255	0.06
256	0.06
257	0.05
258	0.04
259	0.06
260	0.07
261	0.07
262	0.11
263	0.17
264	0.17
265	0.22
266	0.25
267	0.29
268	0.35
269	0.42
270	0.49
271	0.53
272	0.58
273	0.62
274	0.62
275	0.57
276	0.57
277	0.54
278	0.5
279	0.42
280	0.38
281	0.31
282	0.29
283	0.29
284	0.22
285	0.18
286	0.13
287	0.13
288	0.11
289	0.17
290	0.22
291	0.23
292	0.26
293	0.28
294	0.36
295	0.41
296	0.45
297	0.44
298	0.48
299	0.56
300	0.56
301	0.6
302	0.55
303	0.54
304	0.58
305	0.58
306	0.53
307	0.46
308	0.46
309	0.42
310	0.48
311	0.46
312	0.46
313	0.45
314	0.45
315	0.44
316	0.43
317	0.39
318	0.34
319	0.35
320	0.37
321	0.4
322	0.4
323	0.46
324	0.53
325	0.62
326	0.67
327	0.65
328	0.59
329	0.57
330	0.53
331	0.49
332	0.43
333	0.33
334	0.27
335	0.24
336	0.21
337	0.18
338	0.16
339	0.12
340	0.11
341	0.1
342	0.06
343	0.05
344	0.05
345	0.05
346	0.05
347	0.05
348	0.05
349	0.05
350	0.05
351	0.05
352	0.05
353	0.04
354	0.04
355	0.03
356	0.03
357	0.05
358	0.08
359	0.08
360	0.09
361	0.09
362	0.09
363	0.11
364	0.15
365	0.18
366	0.22
367	0.24
368	0.27
369	0.31
370	0.31
371	0.34
372	0.35
373	0.35
374	0.35
375	0.34
376	0.34
377	0.31
378	0.31
379	0.27
380	0.23
381	0.2
382	0.15
383	0.15
384	0.12
385	0.12
386	0.14
387	0.15
388	0.17
389	0.18
390	0.2
391	0.21
392	0.22
393	0.23
394	0.21
395	0.24
396	0.29
397	0.36
398	0.43
399	0.48
400	0.57
401	0.65
402	0.68
403	0.72
404	0.73
405	0.72
406	0.72
407	0.75
408	0.73
409	0.71
410	0.75
411	0.76
412	0.78
413	0.76
414	0.67
415	0.62
416	0.54
417	0.46
418	0.41
419	0.32
420	0.23
421	0.16
422	0.16
423	0.11
424	0.11
425	0.11
426	0.1
427	0.09
428	0.08
429	0.08
430	0.08
431	0.07
432	0.07
433	0.06
434	0.06
435	0.07
436	0.08
437	0.08
438	0.08
439	0.08
440	0.08
441	0.09
442	0.09
443	0.1
444	0.09
445	0.09
446	0.1
447	0.16
448	0.23
449	0.26
450	0.27
451	0.33
452	0.38
453	0.43
454	0.46
455	0.42
456	0.38
457	0.38
458	0.37
459	0.34
460	0.3
461	0.27
462	0.24
463	0.22
464	0.2
465	0.18
466	0.17
467	0.13
468	0.12
469	0.1
470	0.1
471	0.1
472	0.08
473	0.09
474	0.1
475	0.11
476	0.11
477	0.1
478	0.08
479	0.08
480	0.09
481	0.07
482	0.06
483	0.05
484	0.06
485	0.06
486	0.05
487	0.05
488	0.05
489	0.05
490	0.05
491	0.05
492	0.06
493	0.06
494	0.06
495	0.06
496	0.05
497	0.05
498	0.05
499	0.04
500	0.03
501	0.03
502	0.03
503	0.04
504	0.03
505	0.04
506	0.04
507	0.05
508	0.06
509	0.08
510	0.09
511	0.11
512	0.19
513	0.19
514	0.2
515	0.22
516	0.23
517	0.24
518	0.29
519	0.34
520	0.36
521	0.41
522	0.43
523	0.46
524	0.52
525	0.53
526	0.48
527	0.43
528	0.4
529	0.39
530	0.42
531	0.39
532	0.3
533	0.27
534	0.26
535	0.25
536	0.21
537	0.21
538	0.24
539	0.28
540	0.3
541	0.35
542	0.38
543	0.42
544	0.47
545	0.51
546	0.48
547	0.48
548	0.48
549	0.43
550	0.41
551	0.36
552	0.3
553	0.21
554	0.16
555	0.12
556	0.14
557	0.15
558	0.15
559	0.25
560	0.33
561	0.38
562	0.45
563	0.54
564	0.61
565	0.7
566	0.8
567	0.81
568	0.81
569	0.8
570	0.79
571	0.73
572	0.62
573	0.53
574	0.44
575	0.34
576	0.27
577	0.24
578	0.21
579	0.18
580	0.21
581	0.2
582	0.22
583	0.27
584	0.31
585	0.34
586	0.39
587	0.44
588	0.5
589	0.57
590	0.56
591	0.54
592	0.55
593	0.6
594	0.54
595	0.48
596	0.41
597	0.34
598	0.34
599	0.32
600	0.25
601	0.18
602	0.17
603	0.19
604	0.23
605	0.22
606	0.2
607	0.18
608	0.2
609	0.19
610	0.21
611	0.22
612	0.24
613	0.33
614	0.4
615	0.44
616	0.45
617	0.49
618	0.53
619	0.58
620	0.61
621	0.61
622	0.59
623	0.6
624	0.62
625	0.58
626	0.53
627	0.44
628	0.34
629	0.26
630	0.19
631	0.14
632	0.09
633	0.09
634	0.12
635	0.16
636	0.18
637	0.23
638	0.27
639	0.34
640	0.39
641	0.42
642	0.48
643	0.47
644	0.5
645	0.54
646	0.6
647	0.59
648	0.59
649	0.57
650	0.49
651	0.47
652	0.43
653	0.34
654	0.25
655	0.19
656	0.17
657	0.17
658	0.2
659	0.2
660	0.22
661	0.24
662	0.25
663	0.25
664	0.26
665	0.29
666	0.29
667	0.27
668	0.25
669	0.23
670	0.23
671	0.23
672	0.19
673	0.15
674	0.11
675	0.12
676	0.11
677	0.1
678	0.1
679	0.11
680	0.11
681	0.11
682	0.11
683	0.1
684	0.1
685	0.13
686	0.12
687	0.13
688	0.14
689	0.14
690	0.14
691	0.16
692	0.17
693	0.15
694	0.19
695	0.16
696	0.18
697	0.19
698	0.19
699	0.25
700	0.28
701	0.35
702	0.36
703	0.43
704	0.5
705	0.52
706	0.61
707	0.62
708	0.68
709	0.66
710	0.7
711	0.66
712	0.63
713	0.61
714	0.52
715	0.49
716	0.42
717	0.42
718	0.41
719	0.44
720	0.39
721	0.4
722	0.39
723	0.42
724	0.49
725	0.54
726	0.55
727	0.56
728	0.55
729	0.59
730	0.69
731	0.72

A0A3N4KPU5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer