Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

K1VQR1

Protein Details
Accession K1VQR1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
758-780PATPQPARAPRRARVRRQPGAVAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
765-774RAPRRARVRR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045117  ATXN2-like  
IPR009604  LsmAD_domain  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF06741  LsmAD  
Amino Acid Sequences MTSMRGRGRGARGGPTQSFESAHDQSARLPAPPALPALLTFRRPWRGGGPPGSAGYRNAANASPRTNEAKLEDKGGKAGFQTDTDISASNRAGERELKPWVPDEPESNGGAATNGGARGDVITFGGPVSNIPWDQFETNTRLFGAKTDYDEELYTTKLDRSSPGYKKREREADRLANEILSKTSSNSHIAEERGQAVAGDTKDEEEKYSGVVRNPNAYVPPGARKATGGGLPVRKDGTTPPPAPKEAPAPASAPKPTAAASAPAEKETTTDVPLPPMPKGNGPASANTNLPTPQSSTPPPATASNNGPRLSADPVIDPAIASSSLGPGPATSMARSTSSIPQGQTQTQATTNGGTSPGGSSAAHAPAPIGAVVDQARQFVESERERVTARKQSMAKNERAHVLAEFKSWQAKFKVPLPIPKDILPILTKDEQKQKEIEEQAAKALKDAEENKKHAAATAKSPLAKPNPLSPNLNLPKPPVQAQQQPKKIVMKIPEIPPFRKKVPPAVPVPETASQNIAVTSPTPSNASVTSGHAKLNPNASSFVFKPNPSAAAFKPGDVTSPKAAPTKLSGPPSVGGPSTSPAPPPSVSPGPTASSSASATPKNPFYKDGPPKRIVVNPRDDFNPFKHGQVPAASSVTPQWPYTGRRSSVAYSQPMHPMAMQNYDGGAGGGTGSGDDPSSPHPGPPPMLQGGIPPNLLPFYRYQPNVNVPPQMQGAMMGQMFPGPGGFVPPQMQGSPHMQQGPQHGPNGTDPAPAPLPATPQPARAPRRARVRRQPGAVA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.5
3 0.46
4 0.4
5 0.38
6 0.33
7 0.35
8 0.31
9 0.33
10 0.31
11 0.29
12 0.29
13 0.35
14 0.32
15 0.26
16 0.26
17 0.25
18 0.24
19 0.25
20 0.24
21 0.18
22 0.17
23 0.17
24 0.23
25 0.25
26 0.25
27 0.28
28 0.34
29 0.4
30 0.41
31 0.43
32 0.43
33 0.47
34 0.53
35 0.56
36 0.53
37 0.49
38 0.5
39 0.5
40 0.44
41 0.36
42 0.31
43 0.26
44 0.23
45 0.21
46 0.22
47 0.23
48 0.26
49 0.28
50 0.28
51 0.29
52 0.34
53 0.33
54 0.34
55 0.33
56 0.38
57 0.35
58 0.39
59 0.39
60 0.34
61 0.37
62 0.35
63 0.32
64 0.24
65 0.27
66 0.22
67 0.2
68 0.23
69 0.19
70 0.2
71 0.2
72 0.2
73 0.17
74 0.19
75 0.19
76 0.18
77 0.19
78 0.19
79 0.2
80 0.24
81 0.27
82 0.27
83 0.33
84 0.31
85 0.31
86 0.32
87 0.33
88 0.32
89 0.31
90 0.3
91 0.3
92 0.31
93 0.3
94 0.28
95 0.25
96 0.2
97 0.18
98 0.14
99 0.09
100 0.07
101 0.07
102 0.07
103 0.07
104 0.07
105 0.07
106 0.07
107 0.07
108 0.06
109 0.06
110 0.07
111 0.07
112 0.07
113 0.06
114 0.06
115 0.07
116 0.1
117 0.1
118 0.1
119 0.12
120 0.15
121 0.16
122 0.18
123 0.2
124 0.23
125 0.24
126 0.24
127 0.23
128 0.21
129 0.2
130 0.2
131 0.22
132 0.18
133 0.2
134 0.22
135 0.23
136 0.23
137 0.23
138 0.23
139 0.18
140 0.17
141 0.14
142 0.12
143 0.13
144 0.14
145 0.14
146 0.15
147 0.21
148 0.3
149 0.39
150 0.48
151 0.55
152 0.61
153 0.66
154 0.72
155 0.76
156 0.73
157 0.72
158 0.72
159 0.72
160 0.67
161 0.64
162 0.56
163 0.47
164 0.41
165 0.33
166 0.24
167 0.16
168 0.14
169 0.12
170 0.15
171 0.16
172 0.19
173 0.19
174 0.21
175 0.22
176 0.23
177 0.25
178 0.24
179 0.22
180 0.19
181 0.18
182 0.15
183 0.13
184 0.15
185 0.12
186 0.12
187 0.11
188 0.12
189 0.13
190 0.14
191 0.14
192 0.12
193 0.12
194 0.12
195 0.17
196 0.19
197 0.2
198 0.25
199 0.25
200 0.28
201 0.29
202 0.29
203 0.25
204 0.23
205 0.22
206 0.2
207 0.24
208 0.24
209 0.24
210 0.23
211 0.22
212 0.23
213 0.23
214 0.22
215 0.19
216 0.2
217 0.23
218 0.24
219 0.25
220 0.25
221 0.22
222 0.21
223 0.22
224 0.25
225 0.28
226 0.31
227 0.35
228 0.38
229 0.4
230 0.4
231 0.39
232 0.36
233 0.32
234 0.31
235 0.26
236 0.24
237 0.26
238 0.28
239 0.26
240 0.22
241 0.19
242 0.18
243 0.16
244 0.16
245 0.14
246 0.14
247 0.15
248 0.19
249 0.19
250 0.19
251 0.19
252 0.17
253 0.17
254 0.17
255 0.16
256 0.13
257 0.15
258 0.14
259 0.17
260 0.19
261 0.2
262 0.17
263 0.19
264 0.18
265 0.18
266 0.21
267 0.2
268 0.23
269 0.23
270 0.25
271 0.25
272 0.26
273 0.24
274 0.21
275 0.21
276 0.16
277 0.16
278 0.15
279 0.14
280 0.14
281 0.17
282 0.18
283 0.22
284 0.23
285 0.24
286 0.24
287 0.24
288 0.25
289 0.25
290 0.29
291 0.31
292 0.35
293 0.34
294 0.32
295 0.29
296 0.29
297 0.28
298 0.24
299 0.17
300 0.13
301 0.14
302 0.14
303 0.14
304 0.12
305 0.09
306 0.08
307 0.07
308 0.06
309 0.05
310 0.05
311 0.05
312 0.06
313 0.05
314 0.04
315 0.05
316 0.07
317 0.08
318 0.07
319 0.08
320 0.09
321 0.1
322 0.11
323 0.13
324 0.15
325 0.18
326 0.2
327 0.19
328 0.22
329 0.23
330 0.23
331 0.23
332 0.2
333 0.19
334 0.17
335 0.18
336 0.15
337 0.13
338 0.12
339 0.1
340 0.1
341 0.08
342 0.07
343 0.06
344 0.06
345 0.06
346 0.06
347 0.07
348 0.08
349 0.09
350 0.09
351 0.08
352 0.08
353 0.07
354 0.08
355 0.07
356 0.05
357 0.04
358 0.05
359 0.06
360 0.07
361 0.07
362 0.07
363 0.07
364 0.08
365 0.08
366 0.08
367 0.14
368 0.13
369 0.16
370 0.17
371 0.18
372 0.18
373 0.2
374 0.23
375 0.24
376 0.25
377 0.28
378 0.31
379 0.35
380 0.45
381 0.48
382 0.5
383 0.47
384 0.47
385 0.42
386 0.4
387 0.35
388 0.25
389 0.23
390 0.17
391 0.14
392 0.14
393 0.12
394 0.16
395 0.16
396 0.19
397 0.18
398 0.2
399 0.21
400 0.26
401 0.34
402 0.31
403 0.38
404 0.38
405 0.41
406 0.39
407 0.38
408 0.35
409 0.26
410 0.26
411 0.2
412 0.17
413 0.16
414 0.19
415 0.19
416 0.21
417 0.3
418 0.3
419 0.31
420 0.32
421 0.3
422 0.32
423 0.32
424 0.33
425 0.27
426 0.26
427 0.27
428 0.29
429 0.27
430 0.2
431 0.19
432 0.15
433 0.16
434 0.21
435 0.27
436 0.3
437 0.32
438 0.33
439 0.34
440 0.33
441 0.31
442 0.32
443 0.24
444 0.24
445 0.27
446 0.28
447 0.28
448 0.28
449 0.31
450 0.29
451 0.31
452 0.27
453 0.3
454 0.33
455 0.35
456 0.37
457 0.33
458 0.4
459 0.4
460 0.41
461 0.33
462 0.32
463 0.34
464 0.33
465 0.35
466 0.29
467 0.31
468 0.37
469 0.46
470 0.52
471 0.54
472 0.54
473 0.55
474 0.55
475 0.51
476 0.47
477 0.42
478 0.39
479 0.38
480 0.41
481 0.46
482 0.45
483 0.47
484 0.47
485 0.47
486 0.44
487 0.44
488 0.41
489 0.43
490 0.47
491 0.5
492 0.5
493 0.51
494 0.49
495 0.45
496 0.47
497 0.41
498 0.34
499 0.28
500 0.24
501 0.18
502 0.17
503 0.16
504 0.12
505 0.08
506 0.08
507 0.09
508 0.09
509 0.09
510 0.1
511 0.1
512 0.11
513 0.12
514 0.13
515 0.13
516 0.16
517 0.19
518 0.18
519 0.19
520 0.21
521 0.24
522 0.24
523 0.29
524 0.27
525 0.25
526 0.26
527 0.26
528 0.26
529 0.24
530 0.3
531 0.27
532 0.25
533 0.27
534 0.26
535 0.28
536 0.25
537 0.28
538 0.21
539 0.26
540 0.27
541 0.24
542 0.25
543 0.22
544 0.23
545 0.21
546 0.24
547 0.18
548 0.2
549 0.22
550 0.22
551 0.23
552 0.21
553 0.24
554 0.27
555 0.29
556 0.31
557 0.3
558 0.29
559 0.29
560 0.29
561 0.27
562 0.21
563 0.16
564 0.13
565 0.14
566 0.15
567 0.15
568 0.14
569 0.13
570 0.16
571 0.16
572 0.17
573 0.22
574 0.23
575 0.24
576 0.25
577 0.27
578 0.26
579 0.26
580 0.26
581 0.2
582 0.18
583 0.18
584 0.18
585 0.2
586 0.19
587 0.2
588 0.23
589 0.29
590 0.32
591 0.32
592 0.33
593 0.34
594 0.43
595 0.52
596 0.58
597 0.6
598 0.58
599 0.59
600 0.59
601 0.61
602 0.59
603 0.56
604 0.56
605 0.51
606 0.5
607 0.5
608 0.49
609 0.45
610 0.41
611 0.41
612 0.31
613 0.31
614 0.33
615 0.31
616 0.31
617 0.31
618 0.31
619 0.25
620 0.26
621 0.24
622 0.2
623 0.21
624 0.22
625 0.21
626 0.18
627 0.18
628 0.21
629 0.25
630 0.33
631 0.38
632 0.36
633 0.37
634 0.41
635 0.41
636 0.44
637 0.46
638 0.43
639 0.38
640 0.39
641 0.42
642 0.39
643 0.37
644 0.31
645 0.29
646 0.26
647 0.27
648 0.25
649 0.2
650 0.19
651 0.18
652 0.17
653 0.12
654 0.1
655 0.05
656 0.05
657 0.04
658 0.04
659 0.04
660 0.04
661 0.04
662 0.04
663 0.05
664 0.06
665 0.09
666 0.16
667 0.16
668 0.17
669 0.21
670 0.25
671 0.28
672 0.3
673 0.32
674 0.28
675 0.29
676 0.28
677 0.28
678 0.3
679 0.29
680 0.26
681 0.21
682 0.19
683 0.2
684 0.2
685 0.17
686 0.15
687 0.2
688 0.27
689 0.3
690 0.32
691 0.37
692 0.45
693 0.52
694 0.52
695 0.51
696 0.44
697 0.45
698 0.43
699 0.37
700 0.29
701 0.22
702 0.2
703 0.17
704 0.17
705 0.13
706 0.11
707 0.11
708 0.11
709 0.09
710 0.08
711 0.05
712 0.05
713 0.1
714 0.1
715 0.12
716 0.15
717 0.17
718 0.19
719 0.19
720 0.2
721 0.2
722 0.26
723 0.27
724 0.29
725 0.31
726 0.29
727 0.32
728 0.39
729 0.45
730 0.42
731 0.43
732 0.39
733 0.38
734 0.4
735 0.43
736 0.36
737 0.29
738 0.26
739 0.28
740 0.28
741 0.27
742 0.25
743 0.2
744 0.25
745 0.26
746 0.33
747 0.29
748 0.33
749 0.4
750 0.48
751 0.53
752 0.57
753 0.61
754 0.61
755 0.71
756 0.77
757 0.8
758 0.81
759 0.86
760 0.85