Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3N4KEH6

Protein Details
Accession A0A3N4KEH6    Localization Confidence High Confidence Score 19.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
47-74VKELSVRTRTKAKPKKKKKGAAEEDQEEBasic
105-138SDDPEPAAKKKKKQSKRITKKPAKPPRMRRLPSVBasic
222-242EESRPVKKARGRPKKVADPESBasic
281-303EMAALKKPRGRPRKGEQPPDGQGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
54-66TRTKAKPKKKKKG
112-134AKKKKKQSKRITKKPAKPPRMRR
164-198KASKGRKTARTTKKATAAERSGVAEGTKQKRTTKK
226-236PVKKARGRPKK
258-267KKPRGRSKKA
284-314ALKKPRGRPRKGEQPPDGQGAAKPKRARKSK
Subcellular Location(s) cyto 15.5, cyto_nucl 13, nucl 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000116  HMGA  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
Amino Acid Sequences CAHVAHVGCLAGVFLDGEVGAEVRGEVLPVEGACPGCGGVTQWVDLVKELSVRTRTKAKPKKKKKGAAEEDQEEEEEEEEEEEEEQDLIDEEMADLDTDTDSVVSDDPEPAAKKKKKQSKRITKKPAKPPRMRRLPSVIEDSDGDPGSDLAISEAESEKAESEKASKGRKTARTTKKATAAERSGVAEGTKQKRTTKKKTLQAVAEEEVVKEVKIKIEEDEEESRPVKKARGRPKKVADPESETEAVVLAVKDVAVVKKPRGRSKKATDPEPGPEPEPVEEMAALKKPRGRPRKGEQPPDGQGAAKPKRARKSKAELVVPESDWEGVEIV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.04
2 0.04
3 0.04
4 0.04
5 0.05
6 0.05
7 0.04
8 0.04
9 0.04
10 0.05
11 0.05
12 0.05
13 0.05
14 0.05
15 0.07
16 0.07
17 0.08
18 0.08
19 0.09
20 0.09
21 0.09
22 0.09
23 0.07
24 0.08
25 0.08
26 0.11
27 0.12
28 0.13
29 0.13
30 0.15
31 0.15
32 0.15
33 0.15
34 0.1
35 0.12
36 0.12
37 0.17
38 0.22
39 0.24
40 0.27
41 0.36
42 0.43
43 0.51
44 0.61
45 0.67
46 0.72
47 0.82
48 0.89
49 0.9
50 0.93
51 0.92
52 0.93
53 0.91
54 0.9
55 0.87
56 0.8
57 0.72
58 0.63
59 0.52
60 0.41
61 0.32
62 0.22
63 0.14
64 0.1
65 0.08
66 0.07
67 0.07
68 0.07
69 0.07
70 0.07
71 0.06
72 0.06
73 0.05
74 0.05
75 0.05
76 0.05
77 0.04
78 0.04
79 0.04
80 0.04
81 0.04
82 0.04
83 0.04
84 0.04
85 0.04
86 0.04
87 0.04
88 0.04
89 0.04
90 0.05
91 0.05
92 0.06
93 0.06
94 0.07
95 0.1
96 0.11
97 0.14
98 0.24
99 0.29
100 0.37
101 0.46
102 0.56
103 0.63
104 0.73
105 0.81
106 0.82
107 0.88
108 0.91
109 0.93
110 0.93
111 0.93
112 0.93
113 0.93
114 0.92
115 0.9
116 0.9
117 0.89
118 0.9
119 0.83
120 0.77
121 0.74
122 0.68
123 0.61
124 0.56
125 0.45
126 0.36
127 0.34
128 0.29
129 0.24
130 0.19
131 0.15
132 0.09
133 0.08
134 0.07
135 0.06
136 0.05
137 0.03
138 0.03
139 0.04
140 0.04
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.05
149 0.07
150 0.11
151 0.16
152 0.21
153 0.22
154 0.27
155 0.34
156 0.42
157 0.47
158 0.54
159 0.59
160 0.62
161 0.67
162 0.67
163 0.67
164 0.64
165 0.6
166 0.56
167 0.48
168 0.4
169 0.36
170 0.32
171 0.24
172 0.19
173 0.17
174 0.13
175 0.18
176 0.21
177 0.25
178 0.26
179 0.32
180 0.41
181 0.51
182 0.58
183 0.63
184 0.67
185 0.71
186 0.77
187 0.77
188 0.72
189 0.67
190 0.61
191 0.52
192 0.45
193 0.37
194 0.28
195 0.23
196 0.18
197 0.13
198 0.11
199 0.1
200 0.1
201 0.11
202 0.12
203 0.12
204 0.15
205 0.16
206 0.2
207 0.23
208 0.22
209 0.24
210 0.24
211 0.24
212 0.23
213 0.24
214 0.25
215 0.27
216 0.35
217 0.43
218 0.54
219 0.61
220 0.68
221 0.76
222 0.8
223 0.82
224 0.8
225 0.74
226 0.7
227 0.65
228 0.6
229 0.52
230 0.41
231 0.33
232 0.26
233 0.2
234 0.13
235 0.11
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.06
241 0.08
242 0.12
243 0.15
244 0.21
245 0.27
246 0.34
247 0.44
248 0.52
249 0.59
250 0.64
251 0.71
252 0.76
253 0.78
254 0.78
255 0.75
256 0.7
257 0.67
258 0.63
259 0.55
260 0.46
261 0.4
262 0.35
263 0.29
264 0.27
265 0.22
266 0.17
267 0.15
268 0.14
269 0.15
270 0.19
271 0.19
272 0.2
273 0.25
274 0.33
275 0.43
276 0.52
277 0.58
278 0.61
279 0.71
280 0.79
281 0.83
282 0.86
283 0.82
284 0.81
285 0.77
286 0.73
287 0.64
288 0.54
289 0.47
290 0.47
291 0.46
292 0.44
293 0.46
294 0.49
295 0.58
296 0.67
297 0.72
298 0.71
299 0.75
300 0.77
301 0.8
302 0.8
303 0.74
304 0.7
305 0.68
306 0.59
307 0.5
308 0.41
309 0.32
310 0.24