FuNGI

A0A3N4KQH5

Protein Details

Accession

A0A3N4KQH5

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-38	MDPLRRKVREPYNPLRNSRPPQRRPPVPSQSRAPPPKF	Hydrophilic
484-510	EAKKETAKRATEKRKAKKRAENGESPA	Basic
528-558	ISKSARNEVKSRKRSRSPESQKSTKRRCNDL	Hydrophilic
569-611	ISPAPQPRANVKKRPRSPEPAKPQKPSGLLKRRRQNKVADNTI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
400-424	RKKVKIRQKLLKAHGKKVSKALKRR
469-503	KKVADEKAAEEARKLEAKKETAKRATEKRKAKKRA
536-547	VKSRKRSRSPES
576-603	RANVKKRPRSPEPAKPQKPSGLLKRRRQ

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MDPLRRKVREPYNPLRNSRPPQRRPPVPSQSRAPPPKFKQQVVEEEPEPDYEDSTEWTCYTLTTTRNAITAGSRYHVMRLHPKFVEVPDPADRTGESVIMVPETVNITDPETFKQPIRLHRRDATAPLAGKNGAEASKSETPKPVDEEEQKRLEFKAEKARRREELMSKVAPDGGGRNNFKIKGEKKTQQVRQSNAEQVANRKMRYEEQYPWFLEDADNGQTWQGQREHAMSNGEFVVLHMDHVQGSFNMIPVEKWYRFTKVKRVNKMTEKEIKAGEKVLSGEEPALPSWAKKVPKEEFVETEELTKQEQRLYSKNASLVPRRQIRTIKGGEEGNQVNEELDFNVEDQFDNDDAGGVLGDFGEGNEGEEAAKDAAKRIIKDQLSANVFGSRTEKDLIEERKKVKIRQKLLKAHGKKVSKALKRREGNYIYDSDEEDPYLNKLLSASDNDSDSDSEAEAEEFKKWKLELKKVADEKAAEEARKLEAKKETAKRATEKRKAKKRAENGESPADDIPTSAPATPALIPHAISKSARNEVKSRKRSRSPESQKSTKRRCNDLAPNPSIDSPLISPAPQPRANVKKRPRSPEPAKPQKPSGLLKRRRQNKVADNTILVPEKKNANSASPTVSKSPSPSTNTAPTLPITDEEIIAVLRADPEGVSSKDITEIFRSRLKAGTKDVSVLAQRLKQFGTREGDINKWKLKKEFA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.82
2	0.81
3	0.81
4	0.79
5	0.8
6	0.81
7	0.79
8	0.82
9	0.87
10	0.88
11	0.86
12	0.88
13	0.88
14	0.86
15	0.84
16	0.8
17	0.79
18	0.8
19	0.81
20	0.78
21	0.77
22	0.74
23	0.79
24	0.79
25	0.74
26	0.72
27	0.7
28	0.73
29	0.69
30	0.69
31	0.59
32	0.54
33	0.51
34	0.42
35	0.38
36	0.28
37	0.22
38	0.16
39	0.16
40	0.16
41	0.17
42	0.17
43	0.14
44	0.15
45	0.14
46	0.13
47	0.16
48	0.18
49	0.18
50	0.21
51	0.25
52	0.25
53	0.26
54	0.26
55	0.23
56	0.22
57	0.24
58	0.22
59	0.21
60	0.22
61	0.21
62	0.25
63	0.27
64	0.29
65	0.35
66	0.38
67	0.44
68	0.42
69	0.44
70	0.43
71	0.42
72	0.44
73	0.36
74	0.35
75	0.34
76	0.36
77	0.34
78	0.32
79	0.29
80	0.24
81	0.24
82	0.19
83	0.13
84	0.12
85	0.12
86	0.11
87	0.11
88	0.09
89	0.09
90	0.1
91	0.1
92	0.09
93	0.1
94	0.11
95	0.15
96	0.16
97	0.17
98	0.2
99	0.22
100	0.22
101	0.3
102	0.33
103	0.4
104	0.49
105	0.53
106	0.56
107	0.6
108	0.65
109	0.6
110	0.59
111	0.54
112	0.49
113	0.45
114	0.39
115	0.35
116	0.29
117	0.25
118	0.22
119	0.19
120	0.14
121	0.13
122	0.12
123	0.17
124	0.24
125	0.27
126	0.28
127	0.31
128	0.33
129	0.36
130	0.39
131	0.36
132	0.36
133	0.43
134	0.48
135	0.49
136	0.51
137	0.49
138	0.46
139	0.43
140	0.41
141	0.36
142	0.34
143	0.39
144	0.43
145	0.51
146	0.57
147	0.63
148	0.61
149	0.63
150	0.65
151	0.61
152	0.6
153	0.59
154	0.53
155	0.48
156	0.44
157	0.39
158	0.32
159	0.25
160	0.2
161	0.19
162	0.25
163	0.25
164	0.28
165	0.32
166	0.33
167	0.35
168	0.41
169	0.4
170	0.41
171	0.48
172	0.51
173	0.56
174	0.65
175	0.71
176	0.71
177	0.74
178	0.7
179	0.68
180	0.66
181	0.63
182	0.56
183	0.52
184	0.43
185	0.4
186	0.45
187	0.43
188	0.38
189	0.34
190	0.33
191	0.35
192	0.39
193	0.39
194	0.37
195	0.38
196	0.43
197	0.42
198	0.42
199	0.37
200	0.31
201	0.26
202	0.2
203	0.17
204	0.14
205	0.13
206	0.11
207	0.11
208	0.12
209	0.13
210	0.16
211	0.14
212	0.13
213	0.15
214	0.18
215	0.19
216	0.19
217	0.22
218	0.17
219	0.18
220	0.17
221	0.15
222	0.12
223	0.11
224	0.12
225	0.09
226	0.09
227	0.08
228	0.08
229	0.08
230	0.09
231	0.09
232	0.06
233	0.08
234	0.07
235	0.07
236	0.08
237	0.08
238	0.08
239	0.11
240	0.17
241	0.16
242	0.19
243	0.21
244	0.26
245	0.33
246	0.37
247	0.44
248	0.48
249	0.57
250	0.63
251	0.69
252	0.71
253	0.74
254	0.75
255	0.72
256	0.7
257	0.64
258	0.56
259	0.52
260	0.45
261	0.37
262	0.34
263	0.27
264	0.19
265	0.17
266	0.15
267	0.12
268	0.11
269	0.1
270	0.09
271	0.09
272	0.08
273	0.08
274	0.07
275	0.07
276	0.1
277	0.15
278	0.17
279	0.18
280	0.26
281	0.28
282	0.35
283	0.4
284	0.39
285	0.36
286	0.37
287	0.37
288	0.3
289	0.28
290	0.22
291	0.18
292	0.17
293	0.16
294	0.13
295	0.13
296	0.16
297	0.18
298	0.21
299	0.27
300	0.28
301	0.29
302	0.31
303	0.33
304	0.34
305	0.36
306	0.37
307	0.38
308	0.42
309	0.42
310	0.44
311	0.44
312	0.43
313	0.46
314	0.43
315	0.37
316	0.33
317	0.32
318	0.29
319	0.29
320	0.27
321	0.19
322	0.17
323	0.15
324	0.12
325	0.12
326	0.1
327	0.06
328	0.05
329	0.05
330	0.05
331	0.06
332	0.06
333	0.06
334	0.06
335	0.07
336	0.07
337	0.07
338	0.06
339	0.05
340	0.05
341	0.05
342	0.04
343	0.03
344	0.03
345	0.02
346	0.02
347	0.02
348	0.02
349	0.03
350	0.03
351	0.03
352	0.03
353	0.03
354	0.03
355	0.04
356	0.05
357	0.04
358	0.05
359	0.05
360	0.06
361	0.1
362	0.12
363	0.13
364	0.14
365	0.22
366	0.21
367	0.23
368	0.24
369	0.26
370	0.26
371	0.27
372	0.25
373	0.2
374	0.2
375	0.18
376	0.19
377	0.13
378	0.13
379	0.13
380	0.13
381	0.12
382	0.19
383	0.26
384	0.3
385	0.35
386	0.35
387	0.42
388	0.46
389	0.51
390	0.53
391	0.54
392	0.57
393	0.61
394	0.68
395	0.69
396	0.74
397	0.78
398	0.74
399	0.73
400	0.71
401	0.65
402	0.57
403	0.57
404	0.58
405	0.55
406	0.6
407	0.61
408	0.64
409	0.65
410	0.66
411	0.66
412	0.61
413	0.57
414	0.51
415	0.44
416	0.36
417	0.32
418	0.3
419	0.23
420	0.19
421	0.16
422	0.13
423	0.11
424	0.1
425	0.11
426	0.09
427	0.07
428	0.07
429	0.08
430	0.09
431	0.11
432	0.13
433	0.13
434	0.13
435	0.14
436	0.15
437	0.14
438	0.13
439	0.11
440	0.08
441	0.07
442	0.07
443	0.07
444	0.07
445	0.08
446	0.09
447	0.1
448	0.1
449	0.12
450	0.12
451	0.19
452	0.26
453	0.34
454	0.41
455	0.47
456	0.55
457	0.57
458	0.59
459	0.55
460	0.48
461	0.4
462	0.39
463	0.34
464	0.25
465	0.23
466	0.21
467	0.21
468	0.26
469	0.25
470	0.22
471	0.24
472	0.29
473	0.38
474	0.44
475	0.5
476	0.52
477	0.57
478	0.59
479	0.65
480	0.71
481	0.71
482	0.74
483	0.76
484	0.8
485	0.85
486	0.87
487	0.87
488	0.86
489	0.88
490	0.85
491	0.82
492	0.76
493	0.74
494	0.64
495	0.56
496	0.46
497	0.36
498	0.28
499	0.21
500	0.16
501	0.1
502	0.11
503	0.09
504	0.09
505	0.09
506	0.11
507	0.11
508	0.11
509	0.11
510	0.11
511	0.12
512	0.14
513	0.16
514	0.16
515	0.16
516	0.2
517	0.22
518	0.3
519	0.32
520	0.33
521	0.39
522	0.48
523	0.58
524	0.64
525	0.69
526	0.7
527	0.77
528	0.82
529	0.82
530	0.82
531	0.82
532	0.82
533	0.82
534	0.83
535	0.83
536	0.85
537	0.89
538	0.86
539	0.82
540	0.8
541	0.76
542	0.76
543	0.77
544	0.76
545	0.75
546	0.7
547	0.66
548	0.59
549	0.53
550	0.45
551	0.34
552	0.26
553	0.17
554	0.17
555	0.15
556	0.14
557	0.17
558	0.22
559	0.29
560	0.3
561	0.31
562	0.37
563	0.47
564	0.55
565	0.62
566	0.66
567	0.7
568	0.76
569	0.83
570	0.82
571	0.82
572	0.83
573	0.84
574	0.85
575	0.85
576	0.84
577	0.81
578	0.78
579	0.74
580	0.72
581	0.69
582	0.69
583	0.69
584	0.7
585	0.75
586	0.79
587	0.82
588	0.84
589	0.82
590	0.81
591	0.8
592	0.8
593	0.79
594	0.72
595	0.65
596	0.58
597	0.57
598	0.52
599	0.43
600	0.35
601	0.3
602	0.33
603	0.32
604	0.35
605	0.32
606	0.32
607	0.36
608	0.36
609	0.38
610	0.35
611	0.37
612	0.36
613	0.37
614	0.33
615	0.33
616	0.37
617	0.38
618	0.4
619	0.41
620	0.44
621	0.49
622	0.5
623	0.48
624	0.43
625	0.37
626	0.33
627	0.3
628	0.25
629	0.22
630	0.19
631	0.17
632	0.16
633	0.15
634	0.12
635	0.11
636	0.1
637	0.07
638	0.06
639	0.06
640	0.06
641	0.06
642	0.08
643	0.13
644	0.14
645	0.16
646	0.16
647	0.17
648	0.21
649	0.22
650	0.22
651	0.24
652	0.27
653	0.29
654	0.33
655	0.35
656	0.33
657	0.39
658	0.42
659	0.4
660	0.44
661	0.47
662	0.43
663	0.43
664	0.42
665	0.41
666	0.38
667	0.37
668	0.34
669	0.32
670	0.32
671	0.32
672	0.33
673	0.34
674	0.34
675	0.38
676	0.4
677	0.38
678	0.42
679	0.42
680	0.48
681	0.51
682	0.55
683	0.56
684	0.55
685	0.58

A0A3N4KQH5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer