FuNGI

A0A3N4KJ38

Protein Details

Accession

A0A3N4KJ38

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
523-551	FSQLLGAEKDKKRKDKKGKGKATDIQNVE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
71-127	RGAAGGLKFKPKAIARKTKEERDAIAAKFEASATPAPARGNRGDRGQRGGRVRGRGR
531-543	KDKKRKDKKGKGK

Subcellular Location(s)

nucl 19, mito 5, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MPPRLKAVPKPVARRRVAGGGEASAEASQPSTGPSTPAAEIAEPPAPIAQAPPPGRLDSLTPKPLVGPPIRGAAGGLKFKPKAIARKTKEERDAIAAKFEASATPAPARGNRGDRGQRGGRVRGRGRGGFSDTPATASGPFALGSVNTGRLKEVAVERGTNFTKHRQSMGADLDGVKRKAKMKTEDGQEINYSSSDDSDDARMDVEFIGYLDDLAGKKDDEGDQQMDDEDRLWGAGAPLRVPRSHHHELKSSVNTDSSTKTDKGIKKGKSKVEFETTIKIKDEPVDDDDIALPDLDSPPLSPPSPKAAKPDPEVLTQQFKEETEMEEVDRQATLREMVGDFSGIKVDDDIEMESGITDSKKNLELDNQIFCFQFPEILPQLVSSEDAKESIAVAPTAPINTDDKSAASAPPLPNVPLSLKQQKISAKAQMALLESFPPSGVAGQLRVHKSGRISILWGSQDSEDGPIEFDVSRGSRMGFLQEAVVIKQKSPWGEQDVDEKGRQKGAAFSLGQIKGKFVVCPNFSQLLGAEKDKKRKDKKGKGKATDIQNVEP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.72
2	0.67
3	0.66
4	0.59
5	0.52
6	0.45
7	0.36
8	0.34
9	0.3
10	0.26
11	0.17
12	0.16
13	0.11
14	0.09
15	0.08
16	0.07
17	0.09
18	0.11
19	0.11
20	0.13
21	0.15
22	0.18
23	0.18
24	0.2
25	0.19
26	0.17
27	0.18
28	0.2
29	0.2
30	0.17
31	0.17
32	0.16
33	0.14
34	0.13
35	0.14
36	0.14
37	0.21
38	0.23
39	0.26
40	0.28
41	0.3
42	0.3
43	0.29
44	0.31
45	0.31
46	0.37
47	0.38
48	0.36
49	0.35
50	0.36
51	0.38
52	0.4
53	0.35
54	0.32
55	0.29
56	0.33
57	0.33
58	0.31
59	0.28
60	0.27
61	0.29
62	0.3
63	0.29
64	0.31
65	0.31
66	0.32
67	0.39
68	0.39
69	0.43
70	0.48
71	0.57
72	0.57
73	0.68
74	0.75
75	0.77
76	0.78
77	0.72
78	0.64
79	0.61
80	0.61
81	0.5
82	0.46
83	0.37
84	0.3
85	0.27
86	0.24
87	0.16
88	0.13
89	0.14
90	0.13
91	0.14
92	0.15
93	0.17
94	0.19
95	0.24
96	0.27
97	0.31
98	0.31
99	0.39
100	0.45
101	0.46
102	0.51
103	0.51
104	0.52
105	0.52
106	0.58
107	0.54
108	0.56
109	0.57
110	0.56
111	0.58
112	0.54
113	0.52
114	0.48
115	0.49
116	0.42
117	0.4
118	0.37
119	0.31
120	0.29
121	0.26
122	0.23
123	0.16
124	0.14
125	0.13
126	0.09
127	0.09
128	0.07
129	0.07
130	0.06
131	0.07
132	0.08
133	0.13
134	0.13
135	0.14
136	0.14
137	0.14
138	0.15
139	0.16
140	0.18
141	0.18
142	0.19
143	0.21
144	0.21
145	0.26
146	0.27
147	0.26
148	0.26
149	0.28
150	0.33
151	0.34
152	0.35
153	0.32
154	0.33
155	0.36
156	0.37
157	0.3
158	0.24
159	0.23
160	0.26
161	0.28
162	0.28
163	0.23
164	0.23
165	0.27
166	0.32
167	0.38
168	0.4
169	0.43
170	0.49
171	0.54
172	0.58
173	0.54
174	0.5
175	0.44
176	0.38
177	0.31
178	0.23
179	0.18
180	0.1
181	0.09
182	0.08
183	0.08
184	0.08
185	0.09
186	0.09
187	0.09
188	0.09
189	0.08
190	0.08
191	0.07
192	0.06
193	0.05
194	0.04
195	0.05
196	0.04
197	0.04
198	0.04
199	0.05
200	0.06
201	0.06
202	0.07
203	0.06
204	0.06
205	0.08
206	0.1
207	0.1
208	0.13
209	0.14
210	0.13
211	0.14
212	0.14
213	0.12
214	0.11
215	0.1
216	0.07
217	0.05
218	0.05
219	0.05
220	0.04
221	0.05
222	0.07
223	0.07
224	0.08
225	0.1
226	0.12
227	0.12
228	0.15
229	0.18
230	0.24
231	0.31
232	0.35
233	0.36
234	0.39
235	0.42
236	0.46
237	0.46
238	0.38
239	0.32
240	0.28
241	0.26
242	0.22
243	0.21
244	0.17
245	0.17
246	0.16
247	0.18
248	0.24
249	0.27
250	0.34
251	0.4
252	0.45
253	0.5
254	0.57
255	0.62
256	0.61
257	0.61
258	0.57
259	0.54
260	0.51
261	0.44
262	0.43
263	0.37
264	0.32
265	0.3
266	0.26
267	0.2
268	0.19
269	0.19
270	0.14
271	0.15
272	0.16
273	0.15
274	0.15
275	0.15
276	0.13
277	0.12
278	0.09
279	0.07
280	0.05
281	0.05
282	0.05
283	0.04
284	0.05
285	0.06
286	0.08
287	0.09
288	0.09
289	0.1
290	0.18
291	0.22
292	0.23
293	0.27
294	0.31
295	0.36
296	0.39
297	0.44
298	0.39
299	0.38
300	0.39
301	0.35
302	0.35
303	0.3
304	0.28
305	0.22
306	0.2
307	0.19
308	0.17
309	0.17
310	0.14
311	0.14
312	0.14
313	0.15
314	0.15
315	0.13
316	0.12
317	0.1
318	0.08
319	0.08
320	0.08
321	0.06
322	0.07
323	0.07
324	0.07
325	0.07
326	0.08
327	0.07
328	0.06
329	0.07
330	0.06
331	0.06
332	0.05
333	0.06
334	0.05
335	0.06
336	0.06
337	0.06
338	0.06
339	0.06
340	0.05
341	0.05
342	0.05
343	0.05
344	0.05
345	0.06
346	0.08
347	0.12
348	0.12
349	0.13
350	0.17
351	0.23
352	0.26
353	0.3
354	0.29
355	0.27
356	0.26
357	0.25
358	0.22
359	0.15
360	0.15
361	0.11
362	0.15
363	0.15
364	0.16
365	0.16
366	0.14
367	0.15
368	0.13
369	0.14
370	0.09
371	0.09
372	0.09
373	0.09
374	0.09
375	0.08
376	0.09
377	0.09
378	0.09
379	0.08
380	0.07
381	0.08
382	0.09
383	0.09
384	0.08
385	0.08
386	0.1
387	0.11
388	0.12
389	0.12
390	0.12
391	0.14
392	0.14
393	0.13
394	0.13
395	0.18
396	0.17
397	0.2
398	0.2
399	0.19
400	0.18
401	0.2
402	0.21
403	0.2
404	0.26
405	0.32
406	0.34
407	0.34
408	0.39
409	0.42
410	0.44
411	0.44
412	0.44
413	0.38
414	0.38
415	0.38
416	0.35
417	0.33
418	0.27
419	0.23
420	0.18
421	0.15
422	0.13
423	0.12
424	0.1
425	0.08
426	0.08
427	0.09
428	0.08
429	0.11
430	0.14
431	0.21
432	0.23
433	0.26
434	0.26
435	0.27
436	0.28
437	0.31
438	0.31
439	0.26
440	0.26
441	0.25
442	0.29
443	0.29
444	0.27
445	0.23
446	0.2
447	0.19
448	0.18
449	0.17
450	0.13
451	0.11
452	0.12
453	0.1
454	0.11
455	0.1
456	0.1
457	0.11
458	0.11
459	0.12
460	0.12
461	0.13
462	0.14
463	0.14
464	0.18
465	0.15
466	0.15
467	0.14
468	0.16
469	0.16
470	0.15
471	0.22
472	0.19
473	0.18
474	0.22
475	0.25
476	0.25
477	0.28
478	0.32
479	0.32
480	0.34
481	0.36
482	0.39
483	0.43
484	0.43
485	0.44
486	0.42
487	0.37
488	0.38
489	0.37
490	0.31
491	0.3
492	0.29
493	0.33
494	0.29
495	0.3
496	0.36
497	0.38
498	0.41
499	0.35
500	0.33
501	0.3
502	0.3
503	0.3
504	0.27
505	0.33
506	0.32
507	0.35
508	0.4
509	0.38
510	0.37
511	0.35
512	0.3
513	0.28
514	0.29
515	0.3
516	0.34
517	0.38
518	0.48
519	0.56
520	0.66
521	0.7
522	0.78
523	0.84
524	0.86
525	0.91
526	0.92
527	0.94
528	0.92
529	0.92
530	0.89
531	0.87
532	0.85

A0A3N4KJ38

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer