Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3N4KW40

Protein Details
Accession A0A3N4KW40    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
201-228GEGHMAKDCPRPRKGKKRETMPFSNDSKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
211-220RPRKGKKRET
227-231SKRRR
Subcellular Location(s) mito 14.5, mito_nucl 13, nucl 10.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MSTPKAPAAPAQRAIAKPKGMSSKLLTMKFMQRTAAPTAVRAALAQEESKRDAAREKMIAAITPVGDAETRWELSYVHRTTGGTAKVVDWGYSEILADDRRGGGGDSEEEEEEEEEKGSGRMVFGAFKSKGEAAKTADENDSGDESDASDKRQRNVSLRGLTSISNSGPPPSASAMKCRGCGGEGHTQAKCPKAKCYACDGEGHMAKDCPRPRKGKKRETMPFSNDSKRRRSGN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.49
3 0.45
4 0.39
5 0.42
6 0.47
7 0.43
8 0.44
9 0.42
10 0.46
11 0.49
12 0.5
13 0.46
14 0.41
15 0.48
16 0.48
17 0.45
18 0.37
19 0.32
20 0.34
21 0.36
22 0.37
23 0.29
24 0.25
25 0.26
26 0.25
27 0.23
28 0.19
29 0.16
30 0.12
31 0.13
32 0.15
33 0.14
34 0.16
35 0.19
36 0.21
37 0.2
38 0.19
39 0.23
40 0.25
41 0.28
42 0.27
43 0.25
44 0.27
45 0.26
46 0.25
47 0.21
48 0.19
49 0.13
50 0.11
51 0.1
52 0.07
53 0.07
54 0.07
55 0.09
56 0.1
57 0.11
58 0.11
59 0.11
60 0.11
61 0.15
62 0.24
63 0.22
64 0.2
65 0.21
66 0.21
67 0.22
68 0.27
69 0.25
70 0.16
71 0.16
72 0.15
73 0.17
74 0.17
75 0.16
76 0.11
77 0.11
78 0.11
79 0.1
80 0.1
81 0.06
82 0.07
83 0.07
84 0.07
85 0.06
86 0.06
87 0.06
88 0.06
89 0.06
90 0.05
91 0.05
92 0.06
93 0.07
94 0.08
95 0.08
96 0.07
97 0.07
98 0.07
99 0.07
100 0.07
101 0.06
102 0.05
103 0.05
104 0.05
105 0.05
106 0.05
107 0.04
108 0.05
109 0.05
110 0.06
111 0.06
112 0.13
113 0.13
114 0.13
115 0.14
116 0.15
117 0.16
118 0.16
119 0.19
120 0.15
121 0.19
122 0.19
123 0.2
124 0.19
125 0.18
126 0.17
127 0.15
128 0.13
129 0.1
130 0.09
131 0.07
132 0.07
133 0.11
134 0.11
135 0.12
136 0.18
137 0.2
138 0.22
139 0.29
140 0.31
141 0.33
142 0.4
143 0.44
144 0.44
145 0.42
146 0.42
147 0.37
148 0.34
149 0.3
150 0.25
151 0.18
152 0.15
153 0.15
154 0.14
155 0.14
156 0.14
157 0.14
158 0.15
159 0.2
160 0.18
161 0.24
162 0.31
163 0.32
164 0.33
165 0.32
166 0.3
167 0.25
168 0.26
169 0.26
170 0.27
171 0.3
172 0.33
173 0.33
174 0.36
175 0.38
176 0.43
177 0.43
178 0.35
179 0.36
180 0.42
181 0.47
182 0.46
183 0.53
184 0.53
185 0.49
186 0.5
187 0.47
188 0.45
189 0.44
190 0.42
191 0.35
192 0.3
193 0.32
194 0.37
195 0.4
196 0.4
197 0.44
198 0.53
199 0.63
200 0.72
201 0.8
202 0.83
203 0.86
204 0.89
205 0.91
206 0.9
207 0.88
208 0.84
209 0.81
210 0.77
211 0.77
212 0.73
213 0.69
214 0.68