FuNGI

A0A3M2S630

Protein Details

Accession

A0A3M2S630

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
4-47	IDHAAAKADKKSKKEKKKRAREEDAPVDTERKHKKSKSVVAPAD	Basic
53-79	VVNGDLKAEKKKKKSKKDKHVEEAAVP	Basic
84-111	SAAVEEPKSEKKHKKKKHHDEDVAAPVE	Basic
115-162	SSVVADGEKKKKHKKKNKDAEGDETTDKSEKKQKKHKKDHQPEPEPEA	Basic
425-453	AETAKMRKGKRGGQRRQRKRAPEFSMTRF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
10-40	KADKKSKKEKKKRAREEDAPVDTERKHKKSK
59-71	KAEKKKKKSKKDK
91-101	KSEKKHKKKKH
123-152	KKKKHKKKNKDAEGDETTDKSEKKQKKHKK
429-445	KMRKGKRGGQRRQRKRA

Subcellular Location(s)

nucl 13, cyto_nucl 11.833, cyto 9.5, mito_nucl 9.333

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036898 RNA_pol_Rpb7-like_N_sf IPR041901 RNAP_I_Rpa43_N IPR041178 RPA43_OB IPR045113 Rpb7-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006352 P:DNA-templated transcription initiation
Pfam	View protein in Pfam PF17875 RPA43_OB
CDD	cd04328 RNAP_I_Rpa43_N

Amino Acid Sequences

MAPIDHAAAKADKKSKKEKKKRAREEDAPVDTERKHKKSKSVVAPADLPAPEVVNGDLKAEKKKKKSKKDKHVEEAAVPAEDESAAVEEPKSEKKHKKKKHHDEDVAAPVEEADSSVVADGEKKKKHKKKNKDAEGDETTDKSEKKQKKHKKDHQPEPEPEAEAEEDASPDPDAMDVDFAIPARPKSKSSSNIHQPPDIPANPQFPFFTQTVSLYEPLYPIGWAQPVTNCQYQHLRHLQNKYVPSLRGVLLDYKNVAFGEQPGRNGAAMDDETPTTVMSKDEAAVGFGWITADVDLFVPSRGAWMEGSVNLQTEGHIGVVCFGKFNASIEARRLPPDWKWVPNESPEAQGFEETASVITADDHGVVRQIHSTGFWADGSGEKIKGKIRFRIRNFDVGTSGETSYLSLEGTMLDKQGEKAVVAEEAETAKMRKGKRGGQRRQRKRAPEFSMTRFDVDEEEQTQDNEEEKREVLAVSED

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.57
2	0.66
3	0.73
4	0.81
5	0.84
6	0.87
7	0.92
8	0.96
9	0.96
10	0.95
11	0.93
12	0.92
13	0.91
14	0.84
15	0.76
16	0.67
17	0.6
18	0.51
19	0.51
20	0.51
21	0.48
22	0.52
23	0.54
24	0.62
25	0.69
26	0.78
27	0.79
28	0.8
29	0.78
30	0.73
31	0.7
32	0.62
33	0.57
34	0.46
35	0.36
36	0.26
37	0.22
38	0.18
39	0.15
40	0.15
41	0.13
42	0.13
43	0.14
44	0.17
45	0.18
46	0.28
47	0.36
48	0.44
49	0.51
50	0.61
51	0.7
52	0.78
53	0.88
54	0.89
55	0.91
56	0.94
57	0.95
58	0.93
59	0.92
60	0.85
61	0.75
62	0.68
63	0.58
64	0.47
65	0.36
66	0.27
67	0.17
68	0.13
69	0.11
70	0.06
71	0.06
72	0.06
73	0.06
74	0.06
75	0.08
76	0.11
77	0.18
78	0.23
79	0.31
80	0.42
81	0.52
82	0.64
83	0.73
84	0.81
85	0.86
86	0.92
87	0.94
88	0.95
89	0.92
90	0.87
91	0.84
92	0.8
93	0.71
94	0.59
95	0.47
96	0.36
97	0.27
98	0.21
99	0.14
100	0.06
101	0.04
102	0.04
103	0.04
104	0.05
105	0.05
106	0.09
107	0.15
108	0.23
109	0.29
110	0.37
111	0.48
112	0.58
113	0.69
114	0.76
115	0.81
116	0.85
117	0.9
118	0.93
119	0.92
120	0.87
121	0.84
122	0.78
123	0.71
124	0.61
125	0.5
126	0.41
127	0.34
128	0.29
129	0.25
130	0.3
131	0.33
132	0.41
133	0.52
134	0.61
135	0.69
136	0.81
137	0.87
138	0.89
139	0.93
140	0.94
141	0.94
142	0.92
143	0.85
144	0.8
145	0.72
146	0.61
147	0.5
148	0.41
149	0.3
150	0.21
151	0.17
152	0.11
153	0.09
154	0.08
155	0.08
156	0.06
157	0.06
158	0.06
159	0.05
160	0.05
161	0.04
162	0.05
163	0.04
164	0.04
165	0.05
166	0.05
167	0.06
168	0.07
169	0.08
170	0.1
171	0.12
172	0.14
173	0.18
174	0.25
175	0.33
176	0.38
177	0.47
178	0.54
179	0.61
180	0.62
181	0.59
182	0.52
183	0.47
184	0.47
185	0.38
186	0.3
187	0.25
188	0.28
189	0.26
190	0.27
191	0.24
192	0.18
193	0.21
194	0.18
195	0.16
196	0.12
197	0.13
198	0.14
199	0.15
200	0.15
201	0.12
202	0.12
203	0.11
204	0.1
205	0.09
206	0.07
207	0.06
208	0.06
209	0.07
210	0.07
211	0.07
212	0.08
213	0.1
214	0.15
215	0.17
216	0.17
217	0.18
218	0.24
219	0.24
220	0.29
221	0.35
222	0.37
223	0.39
224	0.43
225	0.45
226	0.44
227	0.45
228	0.41
229	0.36
230	0.31
231	0.27
232	0.25
233	0.22
234	0.18
235	0.17
236	0.19
237	0.16
238	0.16
239	0.16
240	0.13
241	0.14
242	0.12
243	0.11
244	0.07
245	0.08
246	0.14
247	0.15
248	0.15
249	0.15
250	0.16
251	0.16
252	0.15
253	0.13
254	0.09
255	0.08
256	0.08
257	0.08
258	0.08
259	0.08
260	0.08
261	0.08
262	0.06
263	0.06
264	0.06
265	0.06
266	0.06
267	0.06
268	0.07
269	0.07
270	0.08
271	0.07
272	0.07
273	0.06
274	0.06
275	0.06
276	0.04
277	0.05
278	0.04
279	0.03
280	0.04
281	0.04
282	0.05
283	0.05
284	0.05
285	0.05
286	0.05
287	0.06
288	0.06
289	0.06
290	0.06
291	0.07
292	0.08
293	0.08
294	0.1
295	0.09
296	0.1
297	0.09
298	0.09
299	0.08
300	0.08
301	0.07
302	0.06
303	0.06
304	0.05
305	0.07
306	0.09
307	0.08
308	0.08
309	0.08
310	0.09
311	0.09
312	0.1
313	0.14
314	0.15
315	0.16
316	0.19
317	0.24
318	0.24
319	0.26
320	0.26
321	0.24
322	0.24
323	0.32
324	0.34
325	0.35
326	0.38
327	0.41
328	0.43
329	0.44
330	0.48
331	0.39
332	0.38
333	0.34
334	0.31
335	0.26
336	0.23
337	0.2
338	0.14
339	0.13
340	0.09
341	0.08
342	0.06
343	0.05
344	0.05
345	0.05
346	0.05
347	0.05
348	0.06
349	0.06
350	0.06
351	0.09
352	0.09
353	0.1
354	0.11
355	0.11
356	0.11
357	0.11
358	0.13
359	0.11
360	0.12
361	0.11
362	0.1
363	0.1
364	0.11
365	0.14
366	0.15
367	0.16
368	0.15
369	0.18
370	0.23
371	0.3
372	0.33
373	0.39
374	0.47
375	0.56
376	0.61
377	0.69
378	0.68
379	0.7
380	0.67
381	0.61
382	0.52
383	0.43
384	0.4
385	0.32
386	0.28
387	0.19
388	0.16
389	0.14
390	0.13
391	0.11
392	0.09
393	0.06
394	0.06
395	0.06
396	0.08
397	0.08
398	0.08
399	0.09
400	0.1
401	0.11
402	0.14
403	0.14
404	0.13
405	0.13
406	0.13
407	0.14
408	0.13
409	0.13
410	0.11
411	0.11
412	0.12
413	0.12
414	0.12
415	0.15
416	0.2
417	0.22
418	0.29
419	0.36
420	0.43
421	0.53
422	0.63
423	0.7
424	0.76
425	0.85
426	0.88
427	0.92
428	0.93
429	0.93
430	0.91
431	0.91
432	0.88
433	0.87
434	0.84
435	0.79
436	0.78
437	0.7
438	0.62
439	0.51
440	0.44
441	0.37
442	0.32
443	0.29
444	0.23
445	0.24
446	0.23
447	0.22
448	0.24
449	0.22
450	0.22
451	0.21
452	0.21
453	0.2
454	0.2
455	0.21
456	0.2
457	0.19

A0A3M2S630

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer