Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

K1VTB8

Protein Details
Accession K1VTB8    Localization Confidence High Confidence Score 21.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
789-842DDGIVSVKKKKAKKPKKASPSPVTDGAPGSGDAKSEKKKPAKKQKVKAGDIPTFHydrophilic
853-881EPAKAATNQRKAKKAKHDTKGDSKKKTGIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
9-20SKGKKAASSSKP
119-125GKVKPRR
796-835KKKKAKKPKKASPSPVTDGAPGSGDAKSEKKKPAKKQKVK
862-878RKAKKAKHDTKGDSKKK
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002562  3'-5'_exonuclease_dom  
IPR012588  Exosome-assoc_fac_Rrp6_N  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR045092  Rrp6-like  
Gene Ontology GO:0000176  C:nuclear exosome (RNase complex)  
GO:0000175  F:3'-5'-RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000467  P:exonucleolytic trimming to generate mature 3'-end of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Pfam View protein in Pfam  
PF01612  DNA_pol_A_exo1  
PF08066  PMC2NT  
CDD cd06147  Rrp6p_like_exo  
Amino Acid Sequences MASGNGSKSKGKKAASSSKPSSKPSSRAQSEGSPSAPGPVPNPSTDFAGFVDNMTKALEASTSAAAGFPDKSDLAFHRTLDRKFAKGLDATGQRVLDLTDRLLQLAVEGSQEKTKAAGGKVKPRRKVTDEDDVVDSFQATVIEPIDALLEDAVGSGCRTLLTLKDSNLDEVNGKKQKAAIDIKPSLAAKAGQKLPGPFSQTSQARLPTHLFNAPGIAKPQLLFQDGVDNSPDARWSPTLPVKEHAMVPLGHTISEDDSWPMGEMDDDPKKVAARREKIAKFEQHPYYYETRHLPYPTSMFTSSTPIRPKSFEDTPFEFIDTPEQLAALTETLKKAKEIAVDLEHHNQRSYYGFTCLMQISTREGDWIIDTLALRAELREHKLGHVFADPSVVKVFHGADSDIVWLQEDFDIYIVNLFDTYHATKVLEFPKFSLASLLQLYCDFEPDKRYQMADWRIRPIPDEMMKYARSDTHFLLFIYDNLRNALIARASRTPSPSVEGQTPKPNPQRAMRKVLDLSSETALKLYQRDGYDPVKGQGMNGWANLSKKLGKKDVMKEEVLIQLSHLRPNNASVLARTLVHQSAEAYARADEIAEVIKNAAAAFRARSPSKSPSKSLTPLSGTTSRAQSVVTATKKSTKAAGPVIDVWAGIGTGAGAPSSSALFGSTLTKKTASPSKNSQKASSSLFGSTLSTPGGGRSSRKASPGFNAVQSSIFSALAPAVAAPKVEVEAPGSSLPAPETVPFVPAANRKNATSDQIPTATTTKKSAQPAETTAEVEVATSAAPKATVDDDGIVSVKKKKAKKPKKASPSPVTDGAPGSGDAKSEKKKPAKKQKVKAGDIPTFSYENEANLLDEPAKAATNQRKAKKAKHDTKGDSKKKTGIDTSAFRRPAPDATAPKSGNRSGTFM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.68
3 0.73
4 0.72
5 0.75
6 0.78
7 0.76
8 0.76
9 0.73
10 0.71
11 0.71
12 0.73
13 0.68
14 0.66
15 0.65
16 0.63
17 0.62
18 0.59
19 0.5
20 0.42
21 0.37
22 0.37
23 0.34
24 0.28
25 0.23
26 0.26
27 0.28
28 0.27
29 0.3
30 0.28
31 0.3
32 0.29
33 0.29
34 0.22
35 0.23
36 0.21
37 0.18
38 0.2
39 0.16
40 0.16
41 0.15
42 0.14
43 0.1
44 0.11
45 0.1
46 0.08
47 0.1
48 0.1
49 0.1
50 0.1
51 0.1
52 0.1
53 0.11
54 0.11
55 0.09
56 0.11
57 0.11
58 0.12
59 0.15
60 0.17
61 0.22
62 0.24
63 0.25
64 0.31
65 0.38
66 0.39
67 0.46
68 0.47
69 0.43
70 0.43
71 0.45
72 0.4
73 0.35
74 0.36
75 0.35
76 0.36
77 0.36
78 0.36
79 0.34
80 0.28
81 0.27
82 0.25
83 0.19
84 0.16
85 0.15
86 0.17
87 0.17
88 0.18
89 0.18
90 0.16
91 0.14
92 0.14
93 0.12
94 0.09
95 0.1
96 0.11
97 0.14
98 0.15
99 0.14
100 0.14
101 0.16
102 0.19
103 0.21
104 0.29
105 0.32
106 0.43
107 0.54
108 0.61
109 0.67
110 0.7
111 0.75
112 0.71
113 0.74
114 0.7
115 0.7
116 0.65
117 0.6
118 0.55
119 0.47
120 0.42
121 0.33
122 0.27
123 0.16
124 0.13
125 0.1
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.07
133 0.06
134 0.06
135 0.05
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.05
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.06
147 0.09
148 0.15
149 0.18
150 0.19
151 0.24
152 0.25
153 0.27
154 0.26
155 0.25
156 0.21
157 0.21
158 0.29
159 0.3
160 0.3
161 0.28
162 0.3
163 0.32
164 0.38
165 0.43
166 0.39
167 0.43
168 0.45
169 0.45
170 0.46
171 0.43
172 0.35
173 0.29
174 0.26
175 0.2
176 0.26
177 0.28
178 0.27
179 0.3
180 0.31
181 0.34
182 0.34
183 0.37
184 0.3
185 0.29
186 0.34
187 0.34
188 0.36
189 0.35
190 0.38
191 0.34
192 0.36
193 0.37
194 0.31
195 0.33
196 0.31
197 0.28
198 0.22
199 0.24
200 0.23
201 0.21
202 0.2
203 0.17
204 0.16
205 0.15
206 0.18
207 0.16
208 0.17
209 0.16
210 0.15
211 0.22
212 0.21
213 0.22
214 0.2
215 0.18
216 0.16
217 0.16
218 0.16
219 0.09
220 0.11
221 0.11
222 0.12
223 0.18
224 0.24
225 0.28
226 0.29
227 0.31
228 0.32
229 0.33
230 0.32
231 0.27
232 0.24
233 0.19
234 0.19
235 0.21
236 0.17
237 0.15
238 0.15
239 0.14
240 0.13
241 0.14
242 0.13
243 0.09
244 0.09
245 0.09
246 0.09
247 0.08
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.12
252 0.16
253 0.16
254 0.16
255 0.17
256 0.19
257 0.22
258 0.28
259 0.32
260 0.34
261 0.4
262 0.5
263 0.52
264 0.56
265 0.6
266 0.6
267 0.54
268 0.57
269 0.57
270 0.49
271 0.48
272 0.47
273 0.44
274 0.38
275 0.38
276 0.33
277 0.29
278 0.31
279 0.3
280 0.27
281 0.25
282 0.26
283 0.24
284 0.25
285 0.23
286 0.21
287 0.2
288 0.25
289 0.24
290 0.27
291 0.31
292 0.3
293 0.31
294 0.31
295 0.34
296 0.35
297 0.39
298 0.38
299 0.39
300 0.4
301 0.42
302 0.4
303 0.38
304 0.31
305 0.25
306 0.24
307 0.18
308 0.14
309 0.11
310 0.1
311 0.09
312 0.08
313 0.09
314 0.05
315 0.06
316 0.07
317 0.08
318 0.1
319 0.11
320 0.11
321 0.12
322 0.13
323 0.15
324 0.15
325 0.17
326 0.19
327 0.21
328 0.23
329 0.29
330 0.3
331 0.27
332 0.26
333 0.23
334 0.2
335 0.2
336 0.2
337 0.14
338 0.15
339 0.15
340 0.15
341 0.18
342 0.17
343 0.15
344 0.13
345 0.12
346 0.12
347 0.12
348 0.12
349 0.1
350 0.1
351 0.1
352 0.09
353 0.09
354 0.06
355 0.07
356 0.07
357 0.06
358 0.07
359 0.06
360 0.06
361 0.05
362 0.08
363 0.11
364 0.14
365 0.17
366 0.17
367 0.18
368 0.21
369 0.22
370 0.2
371 0.19
372 0.16
373 0.13
374 0.17
375 0.15
376 0.13
377 0.14
378 0.13
379 0.1
380 0.11
381 0.12
382 0.08
383 0.09
384 0.08
385 0.08
386 0.08
387 0.09
388 0.08
389 0.07
390 0.06
391 0.05
392 0.06
393 0.06
394 0.05
395 0.04
396 0.04
397 0.04
398 0.04
399 0.05
400 0.04
401 0.04
402 0.04
403 0.04
404 0.04
405 0.07
406 0.08
407 0.08
408 0.08
409 0.08
410 0.09
411 0.13
412 0.18
413 0.18
414 0.17
415 0.17
416 0.21
417 0.21
418 0.21
419 0.18
420 0.13
421 0.13
422 0.14
423 0.13
424 0.09
425 0.09
426 0.1
427 0.08
428 0.1
429 0.08
430 0.08
431 0.12
432 0.13
433 0.16
434 0.15
435 0.16
436 0.15
437 0.22
438 0.3
439 0.33
440 0.34
441 0.35
442 0.36
443 0.36
444 0.37
445 0.31
446 0.27
447 0.23
448 0.23
449 0.2
450 0.22
451 0.22
452 0.22
453 0.21
454 0.18
455 0.17
456 0.18
457 0.17
458 0.16
459 0.16
460 0.15
461 0.17
462 0.14
463 0.13
464 0.14
465 0.13
466 0.12
467 0.11
468 0.11
469 0.09
470 0.09
471 0.09
472 0.08
473 0.08
474 0.1
475 0.12
476 0.14
477 0.15
478 0.17
479 0.18
480 0.17
481 0.19
482 0.19
483 0.18
484 0.22
485 0.24
486 0.24
487 0.31
488 0.32
489 0.37
490 0.41
491 0.43
492 0.42
493 0.47
494 0.54
495 0.52
496 0.59
497 0.52
498 0.5
499 0.47
500 0.45
501 0.39
502 0.3
503 0.26
504 0.19
505 0.18
506 0.14
507 0.13
508 0.12
509 0.1
510 0.1
511 0.09
512 0.12
513 0.12
514 0.14
515 0.17
516 0.19
517 0.21
518 0.21
519 0.21
520 0.19
521 0.19
522 0.17
523 0.15
524 0.17
525 0.15
526 0.14
527 0.14
528 0.13
529 0.14
530 0.15
531 0.15
532 0.16
533 0.19
534 0.23
535 0.27
536 0.31
537 0.38
538 0.45
539 0.53
540 0.52
541 0.48
542 0.44
543 0.42
544 0.4
545 0.33
546 0.25
547 0.16
548 0.17
549 0.18
550 0.21
551 0.2
552 0.18
553 0.17
554 0.19
555 0.21
556 0.17
557 0.17
558 0.13
559 0.15
560 0.15
561 0.15
562 0.14
563 0.14
564 0.13
565 0.13
566 0.12
567 0.1
568 0.12
569 0.13
570 0.13
571 0.11
572 0.1
573 0.1
574 0.1
575 0.09
576 0.06
577 0.05
578 0.06
579 0.05
580 0.05
581 0.05
582 0.06
583 0.06
584 0.06
585 0.06
586 0.05
587 0.06
588 0.08
589 0.11
590 0.16
591 0.17
592 0.19
593 0.24
594 0.32
595 0.41
596 0.43
597 0.43
598 0.44
599 0.49
600 0.51
601 0.49
602 0.45
603 0.38
604 0.36
605 0.38
606 0.36
607 0.32
608 0.3
609 0.29
610 0.25
611 0.22
612 0.2
613 0.16
614 0.16
615 0.21
616 0.22
617 0.22
618 0.22
619 0.29
620 0.3
621 0.31
622 0.31
623 0.26
624 0.29
625 0.32
626 0.33
627 0.28
628 0.28
629 0.28
630 0.24
631 0.21
632 0.16
633 0.11
634 0.08
635 0.06
636 0.04
637 0.03
638 0.03
639 0.03
640 0.03
641 0.03
642 0.03
643 0.04
644 0.04
645 0.04
646 0.04
647 0.04
648 0.05
649 0.06
650 0.11
651 0.13
652 0.15
653 0.16
654 0.17
655 0.17
656 0.22
657 0.3
658 0.29
659 0.33
660 0.42
661 0.51
662 0.58
663 0.6
664 0.59
665 0.54
666 0.54
667 0.53
668 0.45
669 0.37
670 0.29
671 0.27
672 0.24
673 0.22
674 0.19
675 0.15
676 0.12
677 0.1
678 0.1
679 0.1
680 0.13
681 0.13
682 0.15
683 0.19
684 0.25
685 0.27
686 0.31
687 0.34
688 0.33
689 0.36
690 0.4
691 0.37
692 0.35
693 0.34
694 0.3
695 0.28
696 0.26
697 0.23
698 0.17
699 0.14
700 0.11
701 0.1
702 0.09
703 0.08
704 0.07
705 0.06
706 0.06
707 0.06
708 0.06
709 0.06
710 0.06
711 0.07
712 0.07
713 0.08
714 0.08
715 0.09
716 0.11
717 0.11
718 0.11
719 0.11
720 0.11
721 0.11
722 0.1
723 0.1
724 0.09
725 0.12
726 0.12
727 0.13
728 0.13
729 0.13
730 0.17
731 0.22
732 0.26
733 0.3
734 0.31
735 0.31
736 0.35
737 0.36
738 0.37
739 0.35
740 0.34
741 0.31
742 0.31
743 0.31
744 0.28
745 0.3
746 0.28
747 0.26
748 0.27
749 0.28
750 0.32
751 0.38
752 0.42
753 0.42
754 0.43
755 0.45
756 0.45
757 0.42
758 0.37
759 0.31
760 0.25
761 0.2
762 0.16
763 0.12
764 0.08
765 0.06
766 0.06
767 0.06
768 0.05
769 0.06
770 0.05
771 0.07
772 0.09
773 0.1
774 0.1
775 0.11
776 0.12
777 0.13
778 0.14
779 0.12
780 0.13
781 0.19
782 0.23
783 0.29
784 0.37
785 0.46
786 0.57
787 0.67
788 0.76
789 0.81
790 0.87
791 0.91
792 0.94
793 0.94
794 0.92
795 0.9
796 0.85
797 0.79
798 0.69
799 0.6
800 0.5
801 0.41
802 0.32
803 0.24
804 0.2
805 0.14
806 0.14
807 0.14
808 0.2
809 0.26
810 0.32
811 0.41
812 0.49
813 0.58
814 0.68
815 0.77
816 0.82
817 0.87
818 0.9
819 0.91
820 0.92
821 0.89
822 0.87
823 0.85
824 0.8
825 0.72
826 0.66
827 0.58
828 0.49
829 0.42
830 0.37
831 0.28
832 0.22
833 0.21
834 0.18
835 0.15
836 0.15
837 0.17
838 0.13
839 0.13
840 0.13
841 0.12
842 0.12
843 0.12
844 0.19
845 0.27
846 0.36
847 0.45
848 0.52
849 0.6
850 0.67
851 0.76
852 0.79
853 0.81
854 0.81
855 0.83
856 0.86
857 0.85
858 0.89
859 0.91
860 0.89
861 0.86
862 0.81
863 0.78
864 0.73
865 0.71
866 0.65
867 0.61
868 0.59
869 0.59
870 0.61
871 0.63
872 0.59
873 0.53
874 0.5
875 0.45
876 0.42
877 0.4
878 0.42
879 0.4
880 0.44
881 0.53
882 0.52
883 0.54
884 0.56
885 0.53
886 0.51