Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3M2RYV8

Protein Details
Accession A0A3M2RYV8    Localization Confidence High Confidence Score 16.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
363-393ALGRKKQSTPPRSPSPRKPPPAKKAPSPNVDHydrophilic
491-522ESRGRARSTKEDAPKPKPRETSQERADRRREEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
352-387RKDIRPTRRLGALGRKKQSTPPRSPSPRKPPPAKKA
423-443PPPKPAAKKGGLGRIGGAKSK
477-479KKK
492-542SRGRARSTKEDAPKPKPRETSQERADRRREELKRELEKKAAAGPAKKKRKF
Subcellular Location(s) nucl 9, cyto_mito 7, mito 6.5, cyto 6.5, extr 2, E.R. 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015381  XLF_N  
IPR038051  XRCC4-like_N_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF09302  XLF  
CDD cd22285  HD_XLF_N  
Amino Acid Sequences MSPTKSWRPLPLPSSSDLPPLLVSLDIATSAYTVHITDMANVWTESLDRKSICIRGWSENTTIDPSDTPDNMAKFLDSLNTALDSTQPGHYQTHLRLEPASKSDAGDGGLTLKITCEIPGLQPLQWPMHLKKLPSSAIATDLVLPLIQAHHTRNHEVESLIRTLGHKDVVITKLLDKLEAVGTGLEHVFNALSGKKRVSRAVAADKIPGLAPFDRRRWKSDLVYTDDGPSNTESLIEDVLGEGGLQFEPTMEVVESPLLDDWWSKFGGASSAGRPSQEKAIPAKETTPPPKESGVGDDDDDDFQVQSTPPHLTAARKSMASRGKPVLDDASTEGDPESPASAKDVPVPPETRKDIRPTRRLGALGRKKQSTPPRSPSPRKPPPAKKAPSPNVDDSETASEAEDDGATASLPDDDPPPAPSPSPPPKPAAKKGGLGRIGGAKSKQPVRETSPPTEPEVTEIAKPATQNPPKRLGVIGKKKVDTKEPPSVVDESRGRARSTKEDAPKPKPRETSQERADRRREELKRELEKKAAAGPAKKKRKF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.44
3 0.43
4 0.35
5 0.32
6 0.23
7 0.2
8 0.18
9 0.14
10 0.12
11 0.09
12 0.08
13 0.08
14 0.07
15 0.07
16 0.06
17 0.06
18 0.06
19 0.06
20 0.06
21 0.07
22 0.1
23 0.1
24 0.11
25 0.13
26 0.13
27 0.15
28 0.14
29 0.14
30 0.11
31 0.12
32 0.14
33 0.15
34 0.19
35 0.18
36 0.2
37 0.25
38 0.29
39 0.31
40 0.34
41 0.36
42 0.39
43 0.45
44 0.46
45 0.44
46 0.42
47 0.42
48 0.38
49 0.35
50 0.28
51 0.23
52 0.22
53 0.24
54 0.22
55 0.23
56 0.23
57 0.24
58 0.23
59 0.23
60 0.2
61 0.16
62 0.16
63 0.15
64 0.12
65 0.12
66 0.12
67 0.12
68 0.12
69 0.12
70 0.12
71 0.12
72 0.13
73 0.15
74 0.15
75 0.16
76 0.17
77 0.2
78 0.24
79 0.25
80 0.32
81 0.31
82 0.31
83 0.32
84 0.33
85 0.35
86 0.32
87 0.32
88 0.24
89 0.23
90 0.23
91 0.21
92 0.19
93 0.15
94 0.12
95 0.11
96 0.11
97 0.1
98 0.09
99 0.08
100 0.08
101 0.08
102 0.08
103 0.08
104 0.09
105 0.1
106 0.16
107 0.17
108 0.17
109 0.18
110 0.21
111 0.21
112 0.23
113 0.27
114 0.23
115 0.32
116 0.33
117 0.32
118 0.35
119 0.39
120 0.38
121 0.35
122 0.36
123 0.27
124 0.27
125 0.27
126 0.22
127 0.17
128 0.15
129 0.13
130 0.1
131 0.09
132 0.06
133 0.06
134 0.07
135 0.09
136 0.11
137 0.17
138 0.2
139 0.23
140 0.24
141 0.26
142 0.26
143 0.24
144 0.25
145 0.22
146 0.2
147 0.18
148 0.17
149 0.15
150 0.16
151 0.17
152 0.15
153 0.11
154 0.11
155 0.16
156 0.16
157 0.18
158 0.16
159 0.16
160 0.2
161 0.19
162 0.18
163 0.14
164 0.14
165 0.13
166 0.12
167 0.11
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.08
172 0.06
173 0.05
174 0.05
175 0.04
176 0.04
177 0.06
178 0.07
179 0.1
180 0.12
181 0.15
182 0.19
183 0.22
184 0.24
185 0.27
186 0.28
187 0.31
188 0.39
189 0.41
190 0.37
191 0.36
192 0.33
193 0.3
194 0.26
195 0.2
196 0.14
197 0.11
198 0.17
199 0.21
200 0.28
201 0.36
202 0.38
203 0.42
204 0.45
205 0.48
206 0.47
207 0.49
208 0.48
209 0.47
210 0.48
211 0.44
212 0.41
213 0.37
214 0.32
215 0.26
216 0.21
217 0.14
218 0.1
219 0.1
220 0.08
221 0.07
222 0.07
223 0.05
224 0.05
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.03
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.05
242 0.04
243 0.05
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.05
248 0.05
249 0.07
250 0.07
251 0.06
252 0.06
253 0.07
254 0.08
255 0.09
256 0.09
257 0.09
258 0.12
259 0.13
260 0.13
261 0.14
262 0.14
263 0.17
264 0.17
265 0.19
266 0.19
267 0.22
268 0.23
269 0.23
270 0.25
271 0.24
272 0.28
273 0.32
274 0.33
275 0.31
276 0.32
277 0.32
278 0.31
279 0.27
280 0.25
281 0.21
282 0.17
283 0.15
284 0.14
285 0.14
286 0.13
287 0.12
288 0.09
289 0.07
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.05
294 0.07
295 0.08
296 0.08
297 0.1
298 0.11
299 0.13
300 0.15
301 0.2
302 0.2
303 0.2
304 0.2
305 0.25
306 0.31
307 0.31
308 0.33
309 0.31
310 0.31
311 0.31
312 0.32
313 0.27
314 0.21
315 0.2
316 0.16
317 0.17
318 0.15
319 0.15
320 0.13
321 0.11
322 0.11
323 0.1
324 0.09
325 0.06
326 0.06
327 0.09
328 0.1
329 0.1
330 0.15
331 0.18
332 0.2
333 0.24
334 0.27
335 0.27
336 0.32
337 0.36
338 0.35
339 0.35
340 0.4
341 0.46
342 0.53
343 0.58
344 0.58
345 0.57
346 0.57
347 0.56
348 0.52
349 0.53
350 0.54
351 0.55
352 0.55
353 0.54
354 0.52
355 0.57
356 0.63
357 0.61
358 0.6
359 0.59
360 0.64
361 0.72
362 0.79
363 0.82
364 0.82
365 0.83
366 0.84
367 0.86
368 0.86
369 0.86
370 0.88
371 0.83
372 0.81
373 0.82
374 0.81
375 0.77
376 0.73
377 0.67
378 0.61
379 0.57
380 0.49
381 0.4
382 0.35
383 0.29
384 0.22
385 0.18
386 0.14
387 0.12
388 0.12
389 0.09
390 0.05
391 0.05
392 0.05
393 0.05
394 0.04
395 0.04
396 0.05
397 0.05
398 0.06
399 0.07
400 0.08
401 0.09
402 0.13
403 0.15
404 0.16
405 0.16
406 0.18
407 0.26
408 0.34
409 0.41
410 0.41
411 0.42
412 0.5
413 0.58
414 0.64
415 0.64
416 0.59
417 0.58
418 0.61
419 0.65
420 0.59
421 0.51
422 0.44
423 0.42
424 0.39
425 0.35
426 0.31
427 0.26
428 0.3
429 0.35
430 0.39
431 0.36
432 0.4
433 0.45
434 0.54
435 0.56
436 0.56
437 0.57
438 0.54
439 0.56
440 0.54
441 0.45
442 0.38
443 0.36
444 0.32
445 0.25
446 0.25
447 0.21
448 0.2
449 0.2
450 0.22
451 0.28
452 0.35
453 0.42
454 0.46
455 0.53
456 0.52
457 0.54
458 0.53
459 0.52
460 0.55
461 0.58
462 0.62
463 0.61
464 0.63
465 0.67
466 0.67
467 0.66
468 0.64
469 0.61
470 0.63
471 0.58
472 0.57
473 0.55
474 0.55
475 0.47
476 0.46
477 0.41
478 0.35
479 0.4
480 0.41
481 0.39
482 0.39
483 0.43
484 0.44
485 0.49
486 0.53
487 0.54
488 0.62
489 0.7
490 0.75
491 0.8
492 0.79
493 0.8
494 0.79
495 0.75
496 0.76
497 0.75
498 0.75
499 0.74
500 0.78
501 0.78
502 0.79
503 0.82
504 0.76
505 0.74
506 0.74
507 0.72
508 0.7
509 0.71
510 0.72
511 0.74
512 0.76
513 0.74
514 0.7
515 0.65
516 0.59
517 0.56
518 0.52
519 0.48
520 0.51
521 0.56
522 0.6