Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

K1VMF9

Protein Details
Accession K1VMF9    Localization Confidence High Confidence Score 21.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
171-200SDKSTSKATKSKKKKATKTKNSGRRRGPDDBasic
231-254DEDKEAKPKKEPKERKPRLQLTGEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
121-151RKAEILAKRKEAADAKRKENAERKAAAKAAK
177-197KATKSKKKKATKTKNSGRRRG
217-248SKKKTPKDARIDGGDEDKEAKPKKEPKERKPR
293-304GIRRLPGRRPFR
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MSTTTETQNKNGQDNAAVAADSTASTQPTPEVEGYRVYVGNLAFAATEAEVREHFSKVGGEILSVILPTRFKSRRPAGYAFVTFKDEADANKAVETLNETEIGDRKIQLQVARSKEENAERKAEILAKRKEAADAKRKENAERKAAAKAAKDAEKAQSSAQAGGDTTAVESDKSTSKATKSKKKKATKTKNSGRRRGPDDDDDTAVEDDKDSSKAVSKKKTPKDARIDGGDEDKEAKPKKEPKERKPRLQLTGENSKNTVFVANLPFTVDDEKLAELFSNLSIKVKSAHVIKGIRRLPGRRPFRGSKGFGFVELEDPSQQDEAVEKINGSNIGDRKVTAKVAQEMKPIEEIQAEQDKKDKEEAAKSGGATPTPAEPATSNAAASPAPATATAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.31
3 0.24
4 0.2
5 0.16
6 0.13
7 0.12
8 0.1
9 0.1
10 0.09
11 0.1
12 0.1
13 0.11
14 0.12
15 0.13
16 0.16
17 0.17
18 0.18
19 0.18
20 0.21
21 0.22
22 0.23
23 0.22
24 0.19
25 0.2
26 0.17
27 0.16
28 0.14
29 0.12
30 0.09
31 0.09
32 0.1
33 0.07
34 0.08
35 0.07
36 0.09
37 0.09
38 0.13
39 0.15
40 0.15
41 0.15
42 0.15
43 0.15
44 0.15
45 0.19
46 0.14
47 0.13
48 0.12
49 0.13
50 0.12
51 0.11
52 0.1
53 0.08
54 0.08
55 0.1
56 0.19
57 0.21
58 0.23
59 0.34
60 0.42
61 0.5
62 0.56
63 0.59
64 0.55
65 0.6
66 0.62
67 0.55
68 0.48
69 0.43
70 0.36
71 0.31
72 0.28
73 0.22
74 0.18
75 0.2
76 0.2
77 0.16
78 0.16
79 0.17
80 0.14
81 0.14
82 0.16
83 0.13
84 0.12
85 0.13
86 0.13
87 0.14
88 0.17
89 0.18
90 0.16
91 0.14
92 0.15
93 0.16
94 0.19
95 0.19
96 0.23
97 0.28
98 0.32
99 0.35
100 0.34
101 0.34
102 0.36
103 0.42
104 0.43
105 0.4
106 0.39
107 0.35
108 0.35
109 0.35
110 0.36
111 0.34
112 0.36
113 0.37
114 0.36
115 0.38
116 0.37
117 0.4
118 0.41
119 0.43
120 0.44
121 0.46
122 0.47
123 0.52
124 0.53
125 0.55
126 0.57
127 0.55
128 0.51
129 0.49
130 0.46
131 0.44
132 0.46
133 0.43
134 0.35
135 0.34
136 0.31
137 0.3
138 0.3
139 0.28
140 0.29
141 0.27
142 0.27
143 0.23
144 0.22
145 0.2
146 0.19
147 0.18
148 0.14
149 0.12
150 0.11
151 0.11
152 0.07
153 0.06
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.06
159 0.08
160 0.1
161 0.11
162 0.13
163 0.16
164 0.23
165 0.32
166 0.4
167 0.49
168 0.57
169 0.66
170 0.74
171 0.81
172 0.85
173 0.89
174 0.89
175 0.9
176 0.9
177 0.9
178 0.9
179 0.88
180 0.84
181 0.8
182 0.75
183 0.7
184 0.64
185 0.59
186 0.55
187 0.47
188 0.41
189 0.33
190 0.28
191 0.23
192 0.19
193 0.13
194 0.08
195 0.07
196 0.07
197 0.07
198 0.06
199 0.07
200 0.12
201 0.18
202 0.24
203 0.3
204 0.38
205 0.47
206 0.55
207 0.65
208 0.67
209 0.7
210 0.74
211 0.73
212 0.68
213 0.61
214 0.56
215 0.46
216 0.42
217 0.33
218 0.24
219 0.21
220 0.19
221 0.21
222 0.21
223 0.21
224 0.26
225 0.34
226 0.43
227 0.51
228 0.61
229 0.66
230 0.75
231 0.83
232 0.86
233 0.88
234 0.86
235 0.82
236 0.79
237 0.73
238 0.68
239 0.7
240 0.62
241 0.53
242 0.46
243 0.39
244 0.32
245 0.27
246 0.21
247 0.1
248 0.11
249 0.14
250 0.14
251 0.14
252 0.14
253 0.14
254 0.14
255 0.16
256 0.13
257 0.09
258 0.1
259 0.1
260 0.09
261 0.09
262 0.08
263 0.06
264 0.07
265 0.07
266 0.08
267 0.08
268 0.09
269 0.1
270 0.1
271 0.12
272 0.12
273 0.15
274 0.17
275 0.2
276 0.25
277 0.31
278 0.33
279 0.4
280 0.42
281 0.44
282 0.46
283 0.48
284 0.51
285 0.55
286 0.61
287 0.59
288 0.64
289 0.65
290 0.68
291 0.73
292 0.68
293 0.62
294 0.6
295 0.54
296 0.47
297 0.43
298 0.34
299 0.28
300 0.25
301 0.22
302 0.15
303 0.15
304 0.16
305 0.14
306 0.13
307 0.1
308 0.09
309 0.1
310 0.12
311 0.12
312 0.1
313 0.11
314 0.13
315 0.14
316 0.14
317 0.19
318 0.18
319 0.22
320 0.22
321 0.22
322 0.22
323 0.24
324 0.25
325 0.22
326 0.25
327 0.3
328 0.36
329 0.39
330 0.43
331 0.41
332 0.41
333 0.41
334 0.36
335 0.3
336 0.24
337 0.22
338 0.22
339 0.3
340 0.28
341 0.26
342 0.32
343 0.33
344 0.34
345 0.38
346 0.37
347 0.33
348 0.4
349 0.43
350 0.43
351 0.43
352 0.41
353 0.42
354 0.39
355 0.33
356 0.26
357 0.24
358 0.21
359 0.21
360 0.2
361 0.17
362 0.16
363 0.19
364 0.24
365 0.23
366 0.2
367 0.18
368 0.19
369 0.17
370 0.17
371 0.15
372 0.09
373 0.09