FuNGI

A0A3M6XIQ7

Protein Details

Accession

A0A3M6XIQ7

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
263-287	IIELRKKQRAERSRKRKRDEKDEGI	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
260-281	KDPIIELRKKQRAERSRKRKRD

Subcellular Location(s)

nucl 12, cyto_nucl 10, mito 6, cyto 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045867 DNA-dir_RpoC_beta_prime IPR000722 RNA_pol_asu IPR006592 RNA_pol_N IPR007080 RNA_pol_Rpb1_1 IPR044893 RNA_pol_Rpb1_clamp_domain
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF04997 RNA_pol_Rpb1_1 PF00623 RNA_pol_Rpb1_2

Amino Acid Sequences

MNISAPVSNQLTSVSFTHLTSTDIHALSARRITSSTTLDTLLNPIPGGLYTPELGQFGDNACATCGLKNPQCPGHCGHIEMPVPCYHPTFLDQVLRLVRASCVYCYRLKMGRVAVHRFGAKLRLVECGLVQELRELDEITASSATAKDIAAESGSEDEESGEEGDAEAKGLIDQRERFVKSAIARARKEDRLSTQKTEATTNARRAIISEFMGNITKGKKCNNCKGINHSYRKDRFVKIFRKPLSEKDRYAMIQSGHKAKDPIIELRKKQRAERSRKRKRDEKDEGIVADIVGEEEEEPEEEEGDDVNMDEESEGEVEIAGGDMVADAAGEATKKKTAKDQEEYLNPSRIHAQLTALFEREQPILSAVYGHNRQSNKAAAPLTPDMFFLKDILVPPNRYRPEARTGSNEIAEAQENTLYKNILTACDTLNTIQRELSGKESRDSRYRVRTYGDFETTWITLQDAVNSLIDRDRNPVQGAAAKRNPEGIKQKLEKKEGMFRKYMMGKRVNFAARTVISPDPNIETNEIGVPPVFAVKLTYPEPVTSWNVEELQEAVRNGPFVWPGAVAIE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.19
2	0.19
3	0.19
4	0.21
5	0.2
6	0.2
7	0.2
8	0.24
9	0.25
10	0.23
11	0.24
12	0.24
13	0.25
14	0.27
15	0.29
16	0.25
17	0.2
18	0.21
19	0.24
20	0.26
21	0.29
22	0.29
23	0.26
24	0.27
25	0.26
26	0.26
27	0.27
28	0.24
29	0.2
30	0.16
31	0.14
32	0.13
33	0.12
34	0.14
35	0.11
36	0.11
37	0.1
38	0.11
39	0.13
40	0.13
41	0.13
42	0.12
43	0.12
44	0.11
45	0.14
46	0.14
47	0.13
48	0.13
49	0.14
50	0.15
51	0.15
52	0.19
53	0.23
54	0.27
55	0.32
56	0.37
57	0.43
58	0.44
59	0.46
60	0.45
61	0.46
62	0.43
63	0.41
64	0.38
65	0.38
66	0.39
67	0.37
68	0.35
69	0.29
70	0.3
71	0.27
72	0.28
73	0.21
74	0.19
75	0.21
76	0.22
77	0.23
78	0.25
79	0.25
80	0.27
81	0.29
82	0.28
83	0.26
84	0.23
85	0.2
86	0.19
87	0.19
88	0.18
89	0.2
90	0.22
91	0.25
92	0.27
93	0.32
94	0.34
95	0.34
96	0.36
97	0.38
98	0.41
99	0.45
100	0.48
101	0.46
102	0.44
103	0.44
104	0.4
105	0.35
106	0.34
107	0.29
108	0.26
109	0.23
110	0.23
111	0.23
112	0.23
113	0.21
114	0.18
115	0.17
116	0.15
117	0.14
118	0.12
119	0.11
120	0.12
121	0.13
122	0.11
123	0.09
124	0.1
125	0.1
126	0.09
127	0.09
128	0.08
129	0.07
130	0.07
131	0.07
132	0.07
133	0.07
134	0.07
135	0.07
136	0.07
137	0.07
138	0.07
139	0.07
140	0.08
141	0.08
142	0.07
143	0.07
144	0.06
145	0.06
146	0.07
147	0.07
148	0.05
149	0.05
150	0.05
151	0.06
152	0.06
153	0.06
154	0.05
155	0.04
156	0.05
157	0.08
158	0.09
159	0.13
160	0.14
161	0.17
162	0.23
163	0.25
164	0.25
165	0.24
166	0.27
167	0.24
168	0.32
169	0.36
170	0.38
171	0.37
172	0.42
173	0.47
174	0.48
175	0.48
176	0.44
177	0.45
178	0.46
179	0.51
180	0.49
181	0.47
182	0.45
183	0.43
184	0.41
185	0.36
186	0.35
187	0.35
188	0.36
189	0.36
190	0.34
191	0.32
192	0.32
193	0.31
194	0.26
195	0.21
196	0.16
197	0.12
198	0.13
199	0.14
200	0.13
201	0.12
202	0.12
203	0.15
204	0.16
205	0.23
206	0.3
207	0.37
208	0.47
209	0.54
210	0.59
211	0.6
212	0.67
213	0.7
214	0.72
215	0.72
216	0.67
217	0.67
218	0.64
219	0.66
220	0.63
221	0.56
222	0.54
223	0.56
224	0.6
225	0.59
226	0.64
227	0.6
228	0.63
229	0.61
230	0.62
231	0.62
232	0.58
233	0.51
234	0.44
235	0.45
236	0.38
237	0.38
238	0.31
239	0.23
240	0.22
241	0.23
242	0.27
243	0.24
244	0.25
245	0.24
246	0.21
247	0.24
248	0.22
249	0.27
250	0.29
251	0.34
252	0.36
253	0.45
254	0.52
255	0.49
256	0.52
257	0.54
258	0.56
259	0.62
260	0.69
261	0.71
262	0.76
263	0.84
264	0.86
265	0.85
266	0.82
267	0.82
268	0.8
269	0.76
270	0.7
271	0.62
272	0.55
273	0.47
274	0.4
275	0.29
276	0.19
277	0.11
278	0.06
279	0.04
280	0.04
281	0.03
282	0.03
283	0.03
284	0.03
285	0.04
286	0.04
287	0.04
288	0.04
289	0.04
290	0.04
291	0.04
292	0.04
293	0.03
294	0.03
295	0.03
296	0.03
297	0.03
298	0.03
299	0.03
300	0.04
301	0.04
302	0.03
303	0.03
304	0.03
305	0.03
306	0.03
307	0.02
308	0.02
309	0.02
310	0.02
311	0.02
312	0.02
313	0.02
314	0.02
315	0.02
316	0.02
317	0.03
318	0.03
319	0.05
320	0.09
321	0.1
322	0.11
323	0.18
324	0.27
325	0.34
326	0.39
327	0.43
328	0.46
329	0.5
330	0.56
331	0.52
332	0.5
333	0.42
334	0.37
335	0.35
336	0.29
337	0.26
338	0.2
339	0.19
340	0.17
341	0.21
342	0.21
343	0.19
344	0.19
345	0.18
346	0.19
347	0.18
348	0.14
349	0.1
350	0.1
351	0.09
352	0.09
353	0.1
354	0.09
355	0.14
356	0.16
357	0.17
358	0.21
359	0.21
360	0.23
361	0.24
362	0.28
363	0.23
364	0.25
365	0.25
366	0.21
367	0.25
368	0.26
369	0.24
370	0.21
371	0.2
372	0.17
373	0.16
374	0.16
375	0.12
376	0.09
377	0.1
378	0.11
379	0.15
380	0.18
381	0.21
382	0.24
383	0.32
384	0.34
385	0.35
386	0.37
387	0.36
388	0.41
389	0.43
390	0.43
391	0.4
392	0.44
393	0.43
394	0.41
395	0.37
396	0.28
397	0.24
398	0.23
399	0.17
400	0.12
401	0.12
402	0.11
403	0.12
404	0.13
405	0.11
406	0.1
407	0.12
408	0.13
409	0.12
410	0.14
411	0.14
412	0.14
413	0.15
414	0.16
415	0.14
416	0.2
417	0.2
418	0.18
419	0.17
420	0.18
421	0.2
422	0.21
423	0.27
424	0.27
425	0.27
426	0.3
427	0.35
428	0.37
429	0.42
430	0.45
431	0.46
432	0.5
433	0.52
434	0.52
435	0.52
436	0.52
437	0.5
438	0.52
439	0.48
440	0.38
441	0.35
442	0.35
443	0.3
444	0.26
445	0.2
446	0.14
447	0.13
448	0.13
449	0.14
450	0.13
451	0.13
452	0.14
453	0.14
454	0.14
455	0.14
456	0.16
457	0.15
458	0.18
459	0.2
460	0.22
461	0.24
462	0.24
463	0.23
464	0.27
465	0.31
466	0.35
467	0.37
468	0.36
469	0.35
470	0.42
471	0.41
472	0.43
473	0.47
474	0.45
475	0.5
476	0.55
477	0.63
478	0.65
479	0.69
480	0.67
481	0.63
482	0.67
483	0.66
484	0.64
485	0.58
486	0.51
487	0.54
488	0.57
489	0.57
490	0.55
491	0.54
492	0.51
493	0.51
494	0.58
495	0.54
496	0.47
497	0.43
498	0.41
499	0.34
500	0.34
501	0.35
502	0.31
503	0.28
504	0.28
505	0.29
506	0.26
507	0.27
508	0.27
509	0.24
510	0.21
511	0.2
512	0.22
513	0.19
514	0.16
515	0.14
516	0.12
517	0.1
518	0.11
519	0.1
520	0.07
521	0.1
522	0.11
523	0.16
524	0.17
525	0.21
526	0.21
527	0.22
528	0.23
529	0.25
530	0.28
531	0.26
532	0.26
533	0.26
534	0.26
535	0.25
536	0.25
537	0.22
538	0.21
539	0.22
540	0.2
541	0.19
542	0.19
543	0.19
544	0.18
545	0.2
546	0.18
547	0.15
548	0.16
549	0.14

A0A3M6XIQ7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer