Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3M6W1Z8

Protein Details
Accession A0A3M6W1Z8    Localization Confidence High Confidence Score 21
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-34QTPDMAGKKQKKGKGNADNSVKKRKRBasic
42-68GENQTAEPEKKKSKKRKSEGGEEAPSTHydrophilic
101-125ADEAASTKKDKKKKRKSNAEDTTGVHydrophilic
147-172NIFRGEQKKIKKTKKNQQKGPNDALSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
15-36GKKQKKGKGNADNSVKKRKREE
48-59EPEKKKSKKRKS
108-116KKDKKKKRK
154-161KKIKKTKK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 10.666, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
Amino Acid Sequences MSTEDPAVQTPDMAGKKQKKGKGNADNSVKKRKREEEAQAAGENQTAEPEKKKSKKRKSEGGEEAPSTTAGAAEAAPSAETPKSSKKEEGKAVAAPATPTADEAASTKKDKKKKRKSNAEDTTGVTDSQSKPPQKQSQSAGPESPANIFRGEQKKIKKTKKNQQKGPNDALSAQAQRDNDRPLSTVPPTAESDEVLQSHSPFVQQTASFYLALSPCANNFPLEGLCAEHISPLLLTYYGPLKGIVLSYDNARLSASPEEAATMTTPSSRDAQTILAKSTDEYAVTFVWLTADFVLFRPQKGTYLEGYVNLQNESLLGLVCYNYFNAGIEWNRLPKDWQWVSDEEGALTGKGKGKKATQEGEGHWVDAEGKKVDGRLIFRVKDFEATSGSEGGAGSINIVGTLLSEVDEKALEEGESRG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.39
3 0.48
4 0.57
5 0.63
6 0.64
7 0.72
8 0.79
9 0.81
10 0.81
11 0.81
12 0.83
13 0.86
14 0.83
15 0.85
16 0.8
17 0.76
18 0.76
19 0.75
20 0.73
21 0.73
22 0.76
23 0.75
24 0.76
25 0.73
26 0.65
27 0.59
28 0.5
29 0.42
30 0.32
31 0.21
32 0.17
33 0.17
34 0.18
35 0.21
36 0.28
37 0.37
38 0.46
39 0.57
40 0.64
41 0.73
42 0.81
43 0.86
44 0.9
45 0.88
46 0.89
47 0.89
48 0.87
49 0.82
50 0.72
51 0.63
52 0.53
53 0.44
54 0.34
55 0.23
56 0.14
57 0.08
58 0.07
59 0.06
60 0.05
61 0.06
62 0.06
63 0.06
64 0.06
65 0.08
66 0.08
67 0.09
68 0.12
69 0.21
70 0.25
71 0.29
72 0.37
73 0.43
74 0.51
75 0.57
76 0.59
77 0.54
78 0.52
79 0.5
80 0.44
81 0.37
82 0.29
83 0.22
84 0.18
85 0.14
86 0.12
87 0.11
88 0.09
89 0.09
90 0.09
91 0.13
92 0.15
93 0.19
94 0.27
95 0.33
96 0.42
97 0.53
98 0.63
99 0.7
100 0.77
101 0.85
102 0.89
103 0.91
104 0.94
105 0.92
106 0.87
107 0.79
108 0.7
109 0.63
110 0.52
111 0.42
112 0.31
113 0.26
114 0.22
115 0.26
116 0.31
117 0.3
118 0.34
119 0.43
120 0.52
121 0.52
122 0.55
123 0.53
124 0.55
125 0.58
126 0.57
127 0.49
128 0.41
129 0.38
130 0.32
131 0.3
132 0.22
133 0.17
134 0.15
135 0.14
136 0.2
137 0.25
138 0.28
139 0.32
140 0.38
141 0.47
142 0.56
143 0.66
144 0.68
145 0.73
146 0.8
147 0.85
148 0.87
149 0.88
150 0.88
151 0.88
152 0.86
153 0.82
154 0.74
155 0.64
156 0.54
157 0.46
158 0.39
159 0.3
160 0.22
161 0.18
162 0.16
163 0.17
164 0.19
165 0.2
166 0.19
167 0.18
168 0.19
169 0.18
170 0.21
171 0.2
172 0.2
173 0.17
174 0.18
175 0.19
176 0.19
177 0.17
178 0.14
179 0.14
180 0.13
181 0.12
182 0.11
183 0.1
184 0.09
185 0.09
186 0.09
187 0.08
188 0.06
189 0.07
190 0.08
191 0.08
192 0.09
193 0.11
194 0.12
195 0.12
196 0.12
197 0.13
198 0.11
199 0.12
200 0.12
201 0.09
202 0.08
203 0.1
204 0.1
205 0.08
206 0.08
207 0.08
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.06
216 0.06
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.05
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.07
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.08
235 0.12
236 0.11
237 0.11
238 0.11
239 0.11
240 0.11
241 0.13
242 0.12
243 0.09
244 0.09
245 0.1
246 0.1
247 0.1
248 0.08
249 0.07
250 0.06
251 0.07
252 0.08
253 0.08
254 0.11
255 0.11
256 0.11
257 0.12
258 0.15
259 0.19
260 0.21
261 0.2
262 0.18
263 0.18
264 0.17
265 0.18
266 0.15
267 0.1
268 0.09
269 0.09
270 0.09
271 0.09
272 0.09
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.07
281 0.15
282 0.15
283 0.16
284 0.17
285 0.18
286 0.2
287 0.22
288 0.24
289 0.18
290 0.22
291 0.22
292 0.21
293 0.23
294 0.22
295 0.21
296 0.18
297 0.16
298 0.12
299 0.11
300 0.1
301 0.08
302 0.05
303 0.04
304 0.04
305 0.05
306 0.06
307 0.06
308 0.06
309 0.06
310 0.07
311 0.07
312 0.07
313 0.11
314 0.12
315 0.16
316 0.18
317 0.21
318 0.22
319 0.22
320 0.25
321 0.24
322 0.33
323 0.32
324 0.32
325 0.33
326 0.33
327 0.37
328 0.39
329 0.36
330 0.26
331 0.24
332 0.21
333 0.17
334 0.16
335 0.15
336 0.16
337 0.21
338 0.24
339 0.27
340 0.32
341 0.41
342 0.48
343 0.5
344 0.5
345 0.52
346 0.51
347 0.55
348 0.5
349 0.41
350 0.33
351 0.29
352 0.25
353 0.2
354 0.22
355 0.14
356 0.15
357 0.16
358 0.17
359 0.2
360 0.22
361 0.23
362 0.29
363 0.35
364 0.37
365 0.38
366 0.41
367 0.38
368 0.4
369 0.37
370 0.31
371 0.26
372 0.26
373 0.26
374 0.23
375 0.21
376 0.17
377 0.15
378 0.14
379 0.12
380 0.09
381 0.08
382 0.08
383 0.08
384 0.06
385 0.07
386 0.06
387 0.05
388 0.06
389 0.05
390 0.06
391 0.07
392 0.07
393 0.08
394 0.09
395 0.08
396 0.09
397 0.09
398 0.09