Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3M6YIT3

Protein Details
Accession A0A3M6YIT3    Localization Confidence High Confidence Score 18.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-24QSMSPPPPQKQPPPPYNSYPHydrophilic
449-471AEEARIRKREARRKKAAENAQSSHydrophilic
492-512QVKVSKKEQERQKKEANKQAEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
444-464KRDRAAEEARIRKREARRKKA
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 11.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
Amino Acid Sequences MSFHQSMSPPPPQKQPPPPYNSYPSAASPAGSSQGFAPPPAKRPRLSPDPRSPAQQNGMAPQYAPPVGGPGAYGNPYAPQPPAQSPYGSPSPYVGSPQSSFNAPQLHQQNQPQWYSQPPTPSSRQMSPQAAQAQTPQRVQSSQMMPPPPRPQKEEQDHRTRIDDINDPMHGSGVNLADEENYMHSFQTNQSTSFGSSANNSFNQLSQSFNNESQQQSGGAFQGTLGEPQSQEEIENQVKRKRADAARTKAEQNQHPMLNQFLQTGPLRTRIDRVCNANGVTMDVRGLYQRLPQPPQPQYRTNVMMNEKEGIASTSIDNRPEYTAGRGENWEQLASLLCLATGERLRGLMDESFALARARRFGDHGRVPPEFLDIAVGQGERREEEVRPESITGTQWDKVPDTTSSPAANGDHLPNGTDKPSTPQPQPTISFADSITARLREVEKRDRAAEEARIRKREARRKKAAENAQSSEEAAAVAAAETPVPEESSAPQVKVSKKEQERQKKEANKQAEANVHQTTNQTAALMALGGSKKMKKYSWMTGGASAMPTNRFAPSKPASTNTSSPGATSPAAAVKTEGGSPAATGGQAMSRAGSQQQETKLPEWGDWREDGAEGRGIQARDWALVLERDGKEKKALQRVLNKLA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.76
3 0.76
4 0.78
5 0.8
6 0.78
7 0.77
8 0.72
9 0.65
10 0.57
11 0.49
12 0.47
13 0.4
14 0.32
15 0.26
16 0.23
17 0.24
18 0.2
19 0.18
20 0.14
21 0.2
22 0.2
23 0.21
24 0.24
25 0.24
26 0.33
27 0.43
28 0.47
29 0.42
30 0.49
31 0.56
32 0.62
33 0.67
34 0.69
35 0.7
36 0.73
37 0.74
38 0.75
39 0.69
40 0.65
41 0.62
42 0.56
43 0.47
44 0.44
45 0.45
46 0.38
47 0.35
48 0.29
49 0.27
50 0.22
51 0.21
52 0.15
53 0.14
54 0.14
55 0.14
56 0.13
57 0.11
58 0.13
59 0.14
60 0.14
61 0.12
62 0.13
63 0.15
64 0.16
65 0.15
66 0.16
67 0.2
68 0.24
69 0.28
70 0.28
71 0.29
72 0.29
73 0.34
74 0.36
75 0.32
76 0.28
77 0.25
78 0.27
79 0.26
80 0.28
81 0.23
82 0.21
83 0.22
84 0.25
85 0.25
86 0.24
87 0.25
88 0.25
89 0.29
90 0.25
91 0.32
92 0.35
93 0.38
94 0.41
95 0.46
96 0.49
97 0.48
98 0.5
99 0.44
100 0.4
101 0.42
102 0.42
103 0.38
104 0.39
105 0.37
106 0.41
107 0.44
108 0.5
109 0.49
110 0.48
111 0.51
112 0.51
113 0.53
114 0.48
115 0.49
116 0.48
117 0.43
118 0.4
119 0.4
120 0.41
121 0.39
122 0.4
123 0.35
124 0.31
125 0.31
126 0.33
127 0.34
128 0.31
129 0.32
130 0.35
131 0.4
132 0.4
133 0.45
134 0.53
135 0.54
136 0.54
137 0.55
138 0.56
139 0.61
140 0.69
141 0.73
142 0.72
143 0.74
144 0.74
145 0.7
146 0.66
147 0.58
148 0.5
149 0.44
150 0.4
151 0.32
152 0.31
153 0.29
154 0.27
155 0.24
156 0.21
157 0.17
158 0.12
159 0.12
160 0.09
161 0.09
162 0.08
163 0.08
164 0.08
165 0.09
166 0.09
167 0.08
168 0.08
169 0.08
170 0.08
171 0.08
172 0.09
173 0.11
174 0.19
175 0.18
176 0.18
177 0.19
178 0.21
179 0.21
180 0.22
181 0.2
182 0.13
183 0.14
184 0.15
185 0.16
186 0.16
187 0.17
188 0.16
189 0.16
190 0.18
191 0.17
192 0.17
193 0.15
194 0.2
195 0.21
196 0.22
197 0.24
198 0.24
199 0.24
200 0.23
201 0.22
202 0.18
203 0.15
204 0.14
205 0.13
206 0.1
207 0.09
208 0.07
209 0.08
210 0.08
211 0.08
212 0.08
213 0.09
214 0.08
215 0.09
216 0.11
217 0.08
218 0.09
219 0.09
220 0.13
221 0.17
222 0.21
223 0.24
224 0.27
225 0.31
226 0.32
227 0.33
228 0.36
229 0.38
230 0.44
231 0.5
232 0.54
233 0.56
234 0.59
235 0.59
236 0.55
237 0.55
238 0.49
239 0.45
240 0.43
241 0.37
242 0.35
243 0.33
244 0.3
245 0.26
246 0.23
247 0.17
248 0.12
249 0.14
250 0.14
251 0.15
252 0.14
253 0.19
254 0.2
255 0.2
256 0.25
257 0.25
258 0.31
259 0.33
260 0.37
261 0.32
262 0.33
263 0.33
264 0.29
265 0.26
266 0.21
267 0.17
268 0.12
269 0.1
270 0.08
271 0.07
272 0.06
273 0.07
274 0.06
275 0.1
276 0.15
277 0.19
278 0.22
279 0.27
280 0.34
281 0.41
282 0.48
283 0.49
284 0.48
285 0.47
286 0.49
287 0.48
288 0.42
289 0.4
290 0.34
291 0.31
292 0.28
293 0.25
294 0.2
295 0.16
296 0.15
297 0.1
298 0.08
299 0.07
300 0.07
301 0.11
302 0.12
303 0.14
304 0.14
305 0.14
306 0.14
307 0.15
308 0.15
309 0.11
310 0.13
311 0.12
312 0.13
313 0.14
314 0.14
315 0.15
316 0.15
317 0.13
318 0.11
319 0.1
320 0.09
321 0.08
322 0.07
323 0.05
324 0.04
325 0.04
326 0.04
327 0.06
328 0.06
329 0.06
330 0.06
331 0.06
332 0.07
333 0.07
334 0.08
335 0.07
336 0.07
337 0.06
338 0.07
339 0.07
340 0.07
341 0.07
342 0.07
343 0.07
344 0.09
345 0.1
346 0.1
347 0.13
348 0.16
349 0.23
350 0.28
351 0.32
352 0.34
353 0.33
354 0.33
355 0.3
356 0.29
357 0.21
358 0.15
359 0.13
360 0.08
361 0.08
362 0.08
363 0.08
364 0.06
365 0.07
366 0.07
367 0.06
368 0.08
369 0.1
370 0.1
371 0.16
372 0.19
373 0.19
374 0.2
375 0.2
376 0.18
377 0.18
378 0.19
379 0.15
380 0.15
381 0.15
382 0.16
383 0.17
384 0.17
385 0.16
386 0.17
387 0.16
388 0.17
389 0.17
390 0.18
391 0.17
392 0.16
393 0.17
394 0.15
395 0.16
396 0.14
397 0.13
398 0.12
399 0.12
400 0.12
401 0.12
402 0.13
403 0.12
404 0.12
405 0.11
406 0.14
407 0.22
408 0.26
409 0.28
410 0.33
411 0.35
412 0.4
413 0.42
414 0.39
415 0.37
416 0.33
417 0.31
418 0.24
419 0.24
420 0.19
421 0.19
422 0.18
423 0.14
424 0.13
425 0.14
426 0.17
427 0.19
428 0.26
429 0.34
430 0.37
431 0.39
432 0.42
433 0.41
434 0.41
435 0.39
436 0.4
437 0.4
438 0.44
439 0.47
440 0.48
441 0.49
442 0.54
443 0.61
444 0.63
445 0.66
446 0.67
447 0.71
448 0.76
449 0.81
450 0.84
451 0.83
452 0.82
453 0.77
454 0.7
455 0.62
456 0.54
457 0.47
458 0.37
459 0.27
460 0.18
461 0.11
462 0.07
463 0.04
464 0.04
465 0.04
466 0.03
467 0.03
468 0.03
469 0.04
470 0.05
471 0.05
472 0.06
473 0.06
474 0.08
475 0.16
476 0.18
477 0.17
478 0.2
479 0.25
480 0.29
481 0.35
482 0.39
483 0.41
484 0.47
485 0.56
486 0.63
487 0.69
488 0.73
489 0.74
490 0.79
491 0.79
492 0.8
493 0.81
494 0.78
495 0.72
496 0.67
497 0.66
498 0.63
499 0.56
500 0.52
501 0.45
502 0.38
503 0.34
504 0.31
505 0.26
506 0.21
507 0.18
508 0.13
509 0.11
510 0.11
511 0.09
512 0.08
513 0.07
514 0.08
515 0.08
516 0.09
517 0.13
518 0.16
519 0.19
520 0.23
521 0.25
522 0.29
523 0.36
524 0.44
525 0.49
526 0.53
527 0.51
528 0.5
529 0.5
530 0.43
531 0.37
532 0.28
533 0.22
534 0.17
535 0.17
536 0.15
537 0.17
538 0.17
539 0.17
540 0.25
541 0.27
542 0.33
543 0.34
544 0.37
545 0.39
546 0.44
547 0.46
548 0.42
549 0.41
550 0.35
551 0.32
552 0.3
553 0.28
554 0.22
555 0.19
556 0.17
557 0.17
558 0.17
559 0.17
560 0.16
561 0.14
562 0.15
563 0.15
564 0.15
565 0.12
566 0.11
567 0.11
568 0.11
569 0.1
570 0.09
571 0.08
572 0.08
573 0.08
574 0.09
575 0.09
576 0.08
577 0.08
578 0.1
579 0.13
580 0.16
581 0.17
582 0.23
583 0.27
584 0.33
585 0.36
586 0.37
587 0.4
588 0.37
589 0.37
590 0.37
591 0.37
592 0.34
593 0.31
594 0.32
595 0.26
596 0.26
597 0.25
598 0.22
599 0.22
600 0.18
601 0.2
602 0.23
603 0.22
604 0.21
605 0.25
606 0.23
607 0.2
608 0.2
609 0.18
610 0.16
611 0.17
612 0.19
613 0.23
614 0.23
615 0.3
616 0.32
617 0.34
618 0.37
619 0.43
620 0.49
621 0.51
622 0.58
623 0.58
624 0.66