FuNGI

A0A3M7AAA8

Protein Details

Accession

A0A3M7AAA8

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
28-52	KANTSIFNPKKKPVKRAPQQAQLGT	Hydrophilic
189-214	APTGDAGKKPTKKKPQKKVEDVYYDE	Hydrophilic
421-448	AEEEERKKQKKLRRKLKRKEMRHEYESD	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
37-40	KKKP
171-206	EAKRAERQAEREENKKLIAPTGDAGKKPTKKKPQKK
424-440	EERKKQKKLRRKLKRKE
576-581	GHKLKI

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 12, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSASPANQTPGSSSATPNNAALPTIRRKANTSIFNPKKKPVKRAPQQAQLGTAAGQTPMDGRQALGPNASSRPTNGSATAPNPDEDPSLYSEFPIFVSKSTLARGLHYHAFRLNTDERKQDGKPIEVDPYDETVFTRPVRLHRRLARDKAEGVDASAAASDVDDKEKEQREAKRAERQAEREENKKLIAPTGDAGKKPTKKKPQKKVEDVYYDESNPKHQQRSQLRYAEARPWHLEDFEGKQKWIGSYEEPLSNTNVMFEVTEGGFKMIPVEKWYKMVRADRVATMDMSQVEKIMTAKHKAPRWFMNSHEAADAAKEEALAMKREQLENAKRRQKEEDDGDGPGFMKQEDYRADVDEIDFEFNDEFQDDDEGMIYGEVPDEDTKEIEQRIRKEMRDANLGGTGVKDEDKDWDEEEQAEKRAEEEERKKQKKLRRKLKRKEMRHEYESDTDDENRYEESSESEDSQEEREREEKERKEKEAAQAANGDKSGASTKGSNTPNGRPEKRAAPGGSLKRDADLSEMSGNESSRKKTKLNGASAPGGAARSMSPDTGKRAGHSGYGSGSETETSRAGRPGGHKLKIKHTSPRNSPAPGSPADGSRAASPSGSRAQSPARSPPVQSGPFPTLDEIKAAIPTGGIAIDELVKRFKSRVAGEKTTAFIAMVRQVGKQDPGTKKIVPKD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.28
2	0.32
3	0.33
4	0.31
5	0.31
6	0.26
7	0.25
8	0.25
9	0.26
10	0.31
11	0.36
12	0.39
13	0.38
14	0.42
15	0.5
16	0.57
17	0.58
18	0.57
19	0.62
20	0.68
21	0.75
22	0.76
23	0.76
24	0.78
25	0.76
26	0.79
27	0.79
28	0.8
29	0.81
30	0.87
31	0.88
32	0.87
33	0.88
34	0.8
35	0.72
36	0.62
37	0.53
38	0.42
39	0.33
40	0.24
41	0.16
42	0.13
43	0.1
44	0.1
45	0.1
46	0.12
47	0.11
48	0.11
49	0.17
50	0.21
51	0.22
52	0.22
53	0.22
54	0.23
55	0.26
56	0.27
57	0.22
58	0.19
59	0.24
60	0.26
61	0.26
62	0.25
63	0.26
64	0.28
65	0.3
66	0.34
67	0.29
68	0.26
69	0.25
70	0.25
71	0.23
72	0.2
73	0.19
74	0.18
75	0.2
76	0.2
77	0.19
78	0.19
79	0.18
80	0.17
81	0.19
82	0.15
83	0.12
84	0.16
85	0.18
86	0.19
87	0.2
88	0.24
89	0.21
90	0.23
91	0.25
92	0.26
93	0.31
94	0.31
95	0.31
96	0.29
97	0.31
98	0.29
99	0.33
100	0.35
101	0.36
102	0.39
103	0.42
104	0.42
105	0.45
106	0.45
107	0.46
108	0.44
109	0.4
110	0.4
111	0.37
112	0.39
113	0.35
114	0.36
115	0.3
116	0.29
117	0.25
118	0.22
119	0.2
120	0.17
121	0.2
122	0.18
123	0.2
124	0.18
125	0.27
126	0.36
127	0.41
128	0.48
129	0.53
130	0.63
131	0.69
132	0.75
133	0.73
134	0.68
135	0.65
136	0.57
137	0.53
138	0.43
139	0.34
140	0.27
141	0.2
142	0.15
143	0.12
144	0.1
145	0.06
146	0.06
147	0.06
148	0.06
149	0.08
150	0.08
151	0.09
152	0.17
153	0.21
154	0.25
155	0.31
156	0.37
157	0.42
158	0.5
159	0.55
160	0.58
161	0.59
162	0.63
163	0.64
164	0.63
165	0.64
166	0.66
167	0.64
168	0.6
169	0.58
170	0.53
171	0.46
172	0.44
173	0.36
174	0.29
175	0.26
176	0.22
177	0.19
178	0.25
179	0.27
180	0.24
181	0.28
182	0.33
183	0.39
184	0.44
185	0.53
186	0.56
187	0.65
188	0.75
189	0.82
190	0.85
191	0.88
192	0.91
193	0.9
194	0.87
195	0.83
196	0.77
197	0.71
198	0.62
199	0.53
200	0.45
201	0.37
202	0.33
203	0.33
204	0.33
205	0.34
206	0.34
207	0.43
208	0.5
209	0.58
210	0.61
211	0.6
212	0.57
213	0.56
214	0.56
215	0.54
216	0.46
217	0.42
218	0.36
219	0.34
220	0.32
221	0.28
222	0.26
223	0.21
224	0.23
225	0.28
226	0.26
227	0.23
228	0.24
229	0.25
230	0.24
231	0.24
232	0.21
233	0.14
234	0.17
235	0.2
236	0.21
237	0.21
238	0.22
239	0.21
240	0.19
241	0.17
242	0.14
243	0.11
244	0.09
245	0.08
246	0.07
247	0.07
248	0.06
249	0.07
250	0.07
251	0.07
252	0.07
253	0.06
254	0.09
255	0.09
256	0.09
257	0.12
258	0.16
259	0.16
260	0.21
261	0.22
262	0.23
263	0.26
264	0.31
265	0.31
266	0.33
267	0.34
268	0.31
269	0.32
270	0.29
271	0.25
272	0.2
273	0.17
274	0.13
275	0.12
276	0.11
277	0.09
278	0.08
279	0.08
280	0.08
281	0.1
282	0.12
283	0.14
284	0.19
285	0.24
286	0.3
287	0.33
288	0.37
289	0.4
290	0.43
291	0.43
292	0.41
293	0.43
294	0.39
295	0.36
296	0.32
297	0.25
298	0.19
299	0.17
300	0.15
301	0.07
302	0.06
303	0.05
304	0.04
305	0.06
306	0.07
307	0.09
308	0.08
309	0.12
310	0.13
311	0.14
312	0.15
313	0.2
314	0.28
315	0.33
316	0.42
317	0.46
318	0.46
319	0.48
320	0.52
321	0.49
322	0.47
323	0.45
324	0.43
325	0.37
326	0.36
327	0.34
328	0.29
329	0.25
330	0.19
331	0.14
332	0.07
333	0.07
334	0.06
335	0.09
336	0.1
337	0.13
338	0.13
339	0.14
340	0.15
341	0.13
342	0.13
343	0.12
344	0.11
345	0.09
346	0.08
347	0.07
348	0.06
349	0.06
350	0.06
351	0.05
352	0.05
353	0.04
354	0.05
355	0.05
356	0.05
357	0.05
358	0.05
359	0.04
360	0.04
361	0.04
362	0.03
363	0.03
364	0.03
365	0.04
366	0.04
367	0.05
368	0.05
369	0.06
370	0.06
371	0.08
372	0.1
373	0.13
374	0.17
375	0.19
376	0.27
377	0.31
378	0.31
379	0.35
380	0.39
381	0.38
382	0.4
383	0.38
384	0.31
385	0.29
386	0.28
387	0.22
388	0.17
389	0.14
390	0.09
391	0.08
392	0.07
393	0.06
394	0.09
395	0.11
396	0.12
397	0.12
398	0.13
399	0.13
400	0.14
401	0.16
402	0.15
403	0.15
404	0.15
405	0.14
406	0.13
407	0.15
408	0.16
409	0.22
410	0.27
411	0.36
412	0.47
413	0.51
414	0.56
415	0.6
416	0.68
417	0.7
418	0.73
419	0.74
420	0.75
421	0.82
422	0.88
423	0.92
424	0.94
425	0.93
426	0.93
427	0.93
428	0.89
429	0.83
430	0.76
431	0.7
432	0.64
433	0.56
434	0.47
435	0.38
436	0.31
437	0.27
438	0.23
439	0.19
440	0.15
441	0.13
442	0.12
443	0.1
444	0.11
445	0.12
446	0.13
447	0.14
448	0.14
449	0.14
450	0.14
451	0.17
452	0.19
453	0.17
454	0.18
455	0.21
456	0.23
457	0.29
458	0.37
459	0.42
460	0.47
461	0.53
462	0.54
463	0.57
464	0.59
465	0.6
466	0.6
467	0.53
468	0.45
469	0.44
470	0.42
471	0.37
472	0.32
473	0.25
474	0.16
475	0.16
476	0.16
477	0.11
478	0.11
479	0.11
480	0.13
481	0.22
482	0.24
483	0.28
484	0.31
485	0.36
486	0.42
487	0.5
488	0.51
489	0.46
490	0.49
491	0.5
492	0.49
493	0.5
494	0.43
495	0.4
496	0.46
497	0.49
498	0.5
499	0.47
500	0.43
501	0.37
502	0.37
503	0.31
504	0.25
505	0.19
506	0.16
507	0.15
508	0.15
509	0.15
510	0.16
511	0.16
512	0.18
513	0.2
514	0.23
515	0.27
516	0.31
517	0.31
518	0.36
519	0.46
520	0.5
521	0.55
522	0.57
523	0.55
524	0.54
525	0.52
526	0.46
527	0.37
528	0.28
529	0.2
530	0.14
531	0.09
532	0.1
533	0.11
534	0.11
535	0.13
536	0.16
537	0.22
538	0.27
539	0.27
540	0.25
541	0.28
542	0.28
543	0.29
544	0.27
545	0.23
546	0.19
547	0.2
548	0.2
549	0.17
550	0.16
551	0.14
552	0.13
553	0.14
554	0.14
555	0.14
556	0.14
557	0.16
558	0.16
559	0.2
560	0.24
561	0.33
562	0.4
563	0.45
564	0.49
565	0.52
566	0.61
567	0.66
568	0.67
569	0.66
570	0.67
571	0.7
572	0.73
573	0.77
574	0.73
575	0.68
576	0.65
577	0.6
578	0.55
579	0.47
580	0.43
581	0.35
582	0.31
583	0.3
584	0.29
585	0.25
586	0.23
587	0.23
588	0.19
589	0.18
590	0.17
591	0.18
592	0.24
593	0.24
594	0.22
595	0.24
596	0.3
597	0.35
598	0.39
599	0.44
600	0.45
601	0.45
602	0.46
603	0.51
604	0.53
605	0.5
606	0.48
607	0.45
608	0.41
609	0.41
610	0.4
611	0.35
612	0.29
613	0.26
614	0.26
615	0.21
616	0.18
617	0.17
618	0.16
619	0.14
620	0.1
621	0.1
622	0.09
623	0.08
624	0.06
625	0.06
626	0.06
627	0.1
628	0.11
629	0.12
630	0.15
631	0.16
632	0.18
633	0.19
634	0.23
635	0.27
636	0.33
637	0.42
638	0.47
639	0.53
640	0.56
641	0.58
642	0.56
643	0.49
644	0.42
645	0.32
646	0.24
647	0.2
648	0.2
649	0.21
650	0.2
651	0.2
652	0.22
653	0.25
654	0.29
655	0.32
656	0.36
657	0.39
658	0.43
659	0.48
660	0.5

A0A3M7AAA8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer