Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3M7AP16

Protein Details
Accession A0A3M7AP16    Localization Confidence High Confidence Score 22.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
544-563VNPTRKPTSASKKPSRAKTTHydrophilic
640-669GGKSERDKSTKKRGRGRPPKQTPTQQDRSVBasic
688-714PDDQEAPPKKRPRGRPPKRGKGAQTGABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
408-416YKPRPSKRR
642-659KSERDKSTKKRGRGRPPK
694-709PPKKRPRGRPPKRGKG
860-862PPK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 14.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000116  HMGA  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Amino Acid Sequences MPPAIADSDDDGEELMSDDDKAPSVLPDNNDVPAPDGSGTNEQSTGSTERLQRHIRSAERALISPDNKAIPRAEYNGSPTFQSGEAVKRRHTSVPGAGLPASSPGAVKRRKTIKTYGSKRPSVSMPADDPTFASFPHDTEVARTSHSARYSEHSGGNGSSSLLRESLQADFLNHEPNEMLKDSGSTAVDNESSQQRMVAQALSDRKGPSTSVSKLLESDEDKSSSFPWTASAQTPAGKKITEEGTDVNEEAGRDLKSSGGKMENQEHHHAYIHATSHRASQQDIHDRTDSTATMPRADDPSAPEKEPPLERHDAEVQREATNEPSWPEIMAKVREQQPCERQATIRAPRSSPIVQINTAAAVEPHQPVEESSASAQKATRGHKKSVHNSDIDLPNSDDIAVGLPKERYKPRPSKRRSTAIHDEPVDYSVRPEKAAKLKRNKTSNASARVSVDHAEASETKAEKEQAGPSPEIEETQAEKIGKNSASGNDPVTQELRANSQAEATSKFELDSKSGQSKSLVIDETQQDRPSSEHQDGSFEDEIKVNPTRKPTSASKKPSRAKTTLYEDHLDHDAAHRTPSLSQQQAHRKRAFRDITNQKSTSSSQHPEQSIVNHDEEEDELARDSSAPDLDGEKNAFQASGGKSERDKSTKKRGRGRPPKQTPTQQDRSVEKASDDSEAEENLGGISGPDDQEAPPKKRPRGRPPKRGKGAQTGAIGEKQDHGDESQAIESNEGERKEEVQSEKKGRGRPPRDVVPVQPEQGKQSPVAGEPSEESTHAPNGPHETEKGLEEPLPDPTEANTSVKQAPTPSPEKSAAGKSTPPPNRASPTSHSPIKSHSKVPYRVGLSKRQKIPSLLRTMRPPKRPT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.08
3 0.07
4 0.08
5 0.09
6 0.1
7 0.11
8 0.11
9 0.1
10 0.11
11 0.15
12 0.18
13 0.2
14 0.25
15 0.26
16 0.27
17 0.27
18 0.26
19 0.25
20 0.21
21 0.21
22 0.15
23 0.14
24 0.17
25 0.22
26 0.23
27 0.22
28 0.22
29 0.2
30 0.2
31 0.23
32 0.22
33 0.19
34 0.23
35 0.26
36 0.31
37 0.39
38 0.46
39 0.45
40 0.5
41 0.56
42 0.55
43 0.58
44 0.57
45 0.56
46 0.52
47 0.5
48 0.47
49 0.46
50 0.42
51 0.38
52 0.36
53 0.34
54 0.32
55 0.33
56 0.3
57 0.27
58 0.31
59 0.32
60 0.32
61 0.3
62 0.35
63 0.37
64 0.36
65 0.32
66 0.29
67 0.26
68 0.23
69 0.22
70 0.19
71 0.23
72 0.3
73 0.33
74 0.36
75 0.38
76 0.41
77 0.45
78 0.46
79 0.43
80 0.42
81 0.46
82 0.44
83 0.42
84 0.39
85 0.34
86 0.3
87 0.26
88 0.2
89 0.12
90 0.11
91 0.13
92 0.22
93 0.28
94 0.31
95 0.39
96 0.47
97 0.54
98 0.59
99 0.64
100 0.65
101 0.7
102 0.76
103 0.78
104 0.77
105 0.76
106 0.72
107 0.67
108 0.6
109 0.56
110 0.52
111 0.46
112 0.4
113 0.37
114 0.36
115 0.32
116 0.29
117 0.25
118 0.21
119 0.16
120 0.18
121 0.15
122 0.15
123 0.17
124 0.17
125 0.14
126 0.17
127 0.2
128 0.17
129 0.18
130 0.19
131 0.19
132 0.23
133 0.26
134 0.25
135 0.24
136 0.29
137 0.33
138 0.35
139 0.33
140 0.29
141 0.28
142 0.26
143 0.26
144 0.2
145 0.15
146 0.13
147 0.12
148 0.12
149 0.11
150 0.11
151 0.11
152 0.12
153 0.13
154 0.14
155 0.14
156 0.14
157 0.16
158 0.16
159 0.22
160 0.2
161 0.19
162 0.17
163 0.17
164 0.19
165 0.18
166 0.17
167 0.1
168 0.11
169 0.12
170 0.14
171 0.14
172 0.11
173 0.11
174 0.12
175 0.12
176 0.12
177 0.13
178 0.14
179 0.15
180 0.14
181 0.14
182 0.13
183 0.14
184 0.15
185 0.13
186 0.11
187 0.15
188 0.2
189 0.21
190 0.24
191 0.22
192 0.22
193 0.22
194 0.22
195 0.21
196 0.23
197 0.24
198 0.28
199 0.3
200 0.29
201 0.29
202 0.3
203 0.29
204 0.25
205 0.25
206 0.21
207 0.21
208 0.2
209 0.2
210 0.2
211 0.18
212 0.17
213 0.13
214 0.13
215 0.14
216 0.16
217 0.17
218 0.19
219 0.18
220 0.22
221 0.23
222 0.23
223 0.23
224 0.2
225 0.19
226 0.2
227 0.23
228 0.2
229 0.2
230 0.19
231 0.2
232 0.22
233 0.21
234 0.18
235 0.14
236 0.13
237 0.12
238 0.13
239 0.1
240 0.09
241 0.09
242 0.12
243 0.12
244 0.13
245 0.16
246 0.16
247 0.19
248 0.22
249 0.3
250 0.33
251 0.36
252 0.4
253 0.39
254 0.37
255 0.35
256 0.32
257 0.26
258 0.22
259 0.21
260 0.17
261 0.17
262 0.16
263 0.19
264 0.22
265 0.21
266 0.19
267 0.21
268 0.27
269 0.36
270 0.37
271 0.37
272 0.35
273 0.35
274 0.36
275 0.33
276 0.25
277 0.17
278 0.21
279 0.18
280 0.18
281 0.18
282 0.19
283 0.19
284 0.2
285 0.19
286 0.17
287 0.23
288 0.24
289 0.24
290 0.23
291 0.22
292 0.25
293 0.28
294 0.27
295 0.27
296 0.29
297 0.29
298 0.32
299 0.38
300 0.37
301 0.36
302 0.38
303 0.33
304 0.29
305 0.29
306 0.26
307 0.21
308 0.19
309 0.17
310 0.13
311 0.12
312 0.12
313 0.11
314 0.11
315 0.11
316 0.14
317 0.16
318 0.17
319 0.21
320 0.28
321 0.31
322 0.34
323 0.38
324 0.41
325 0.44
326 0.45
327 0.41
328 0.35
329 0.38
330 0.44
331 0.45
332 0.47
333 0.43
334 0.41
335 0.4
336 0.45
337 0.39
338 0.34
339 0.31
340 0.26
341 0.24
342 0.24
343 0.23
344 0.18
345 0.17
346 0.13
347 0.07
348 0.07
349 0.08
350 0.08
351 0.08
352 0.08
353 0.08
354 0.08
355 0.12
356 0.11
357 0.1
358 0.1
359 0.13
360 0.13
361 0.14
362 0.14
363 0.14
364 0.18
365 0.23
366 0.32
367 0.33
368 0.37
369 0.44
370 0.52
371 0.58
372 0.62
373 0.61
374 0.52
375 0.49
376 0.51
377 0.47
378 0.4
379 0.32
380 0.23
381 0.19
382 0.18
383 0.16
384 0.1
385 0.06
386 0.06
387 0.05
388 0.05
389 0.06
390 0.07
391 0.08
392 0.13
393 0.18
394 0.23
395 0.32
396 0.42
397 0.51
398 0.61
399 0.67
400 0.73
401 0.76
402 0.8
403 0.74
404 0.73
405 0.72
406 0.67
407 0.65
408 0.55
409 0.49
410 0.39
411 0.37
412 0.29
413 0.19
414 0.14
415 0.13
416 0.12
417 0.13
418 0.13
419 0.16
420 0.25
421 0.33
422 0.41
423 0.48
424 0.55
425 0.62
426 0.67
427 0.66
428 0.62
429 0.64
430 0.63
431 0.6
432 0.53
433 0.47
434 0.41
435 0.39
436 0.34
437 0.25
438 0.18
439 0.11
440 0.09
441 0.09
442 0.08
443 0.09
444 0.11
445 0.1
446 0.1
447 0.11
448 0.12
449 0.11
450 0.13
451 0.15
452 0.16
453 0.19
454 0.19
455 0.18
456 0.19
457 0.18
458 0.17
459 0.14
460 0.11
461 0.1
462 0.1
463 0.13
464 0.11
465 0.12
466 0.12
467 0.15
468 0.14
469 0.14
470 0.14
471 0.13
472 0.15
473 0.16
474 0.17
475 0.16
476 0.17
477 0.17
478 0.16
479 0.15
480 0.13
481 0.13
482 0.14
483 0.13
484 0.14
485 0.12
486 0.13
487 0.14
488 0.14
489 0.16
490 0.15
491 0.14
492 0.13
493 0.13
494 0.14
495 0.14
496 0.15
497 0.15
498 0.16
499 0.21
500 0.21
501 0.22
502 0.2
503 0.21
504 0.2
505 0.21
506 0.18
507 0.13
508 0.16
509 0.19
510 0.22
511 0.23
512 0.23
513 0.2
514 0.2
515 0.21
516 0.22
517 0.24
518 0.22
519 0.23
520 0.22
521 0.24
522 0.24
523 0.28
524 0.25
525 0.2
526 0.19
527 0.17
528 0.17
529 0.18
530 0.22
531 0.18
532 0.19
533 0.24
534 0.27
535 0.27
536 0.33
537 0.38
538 0.45
539 0.52
540 0.6
541 0.64
542 0.7
543 0.77
544 0.8
545 0.79
546 0.72
547 0.66
548 0.64
549 0.63
550 0.59
551 0.55
552 0.49
553 0.41
554 0.4
555 0.37
556 0.3
557 0.21
558 0.18
559 0.18
560 0.15
561 0.16
562 0.14
563 0.13
564 0.14
565 0.2
566 0.24
567 0.24
568 0.26
569 0.33
570 0.44
571 0.53
572 0.6
573 0.61
574 0.59
575 0.59
576 0.67
577 0.64
578 0.58
579 0.59
580 0.61
581 0.63
582 0.66
583 0.63
584 0.54
585 0.51
586 0.49
587 0.44
588 0.4
589 0.35
590 0.32
591 0.37
592 0.37
593 0.36
594 0.36
595 0.32
596 0.31
597 0.3
598 0.27
599 0.21
600 0.2
601 0.18
602 0.17
603 0.17
604 0.12
605 0.09
606 0.09
607 0.09
608 0.09
609 0.08
610 0.08
611 0.07
612 0.07
613 0.07
614 0.07
615 0.1
616 0.11
617 0.13
618 0.15
619 0.14
620 0.14
621 0.14
622 0.13
623 0.1
624 0.15
625 0.14
626 0.2
627 0.21
628 0.22
629 0.24
630 0.28
631 0.34
632 0.36
633 0.41
634 0.42
635 0.52
636 0.59
637 0.66
638 0.72
639 0.77
640 0.81
641 0.86
642 0.88
643 0.88
644 0.9
645 0.9
646 0.89
647 0.88
648 0.86
649 0.85
650 0.83
651 0.77
652 0.73
653 0.67
654 0.65
655 0.58
656 0.49
657 0.4
658 0.34
659 0.3
660 0.26
661 0.22
662 0.18
663 0.16
664 0.15
665 0.15
666 0.12
667 0.11
668 0.08
669 0.08
670 0.05
671 0.04
672 0.04
673 0.05
674 0.06
675 0.06
676 0.07
677 0.07
678 0.16
679 0.24
680 0.29
681 0.36
682 0.45
683 0.53
684 0.61
685 0.71
686 0.74
687 0.79
688 0.84
689 0.87
690 0.89
691 0.92
692 0.93
693 0.91
694 0.86
695 0.85
696 0.79
697 0.74
698 0.66
699 0.58
700 0.51
701 0.45
702 0.39
703 0.29
704 0.25
705 0.2
706 0.18
707 0.16
708 0.14
709 0.14
710 0.14
711 0.15
712 0.15
713 0.16
714 0.16
715 0.15
716 0.15
717 0.16
718 0.2
719 0.19
720 0.18
721 0.17
722 0.19
723 0.21
724 0.27
725 0.29
726 0.33
727 0.41
728 0.45
729 0.52
730 0.56
731 0.61
732 0.63
733 0.68
734 0.68
735 0.69
736 0.72
737 0.73
738 0.75
739 0.72
740 0.68
741 0.65
742 0.62
743 0.55
744 0.52
745 0.44
746 0.42
747 0.43
748 0.39
749 0.32
750 0.31
751 0.3
752 0.26
753 0.3
754 0.24
755 0.21
756 0.21
757 0.25
758 0.22
759 0.21
760 0.21
761 0.19
762 0.21
763 0.22
764 0.22
765 0.2
766 0.25
767 0.28
768 0.29
769 0.27
770 0.27
771 0.26
772 0.27
773 0.26
774 0.22
775 0.2
776 0.2
777 0.2
778 0.22
779 0.23
780 0.21
781 0.2
782 0.19
783 0.23
784 0.23
785 0.26
786 0.22
787 0.24
788 0.28
789 0.28
790 0.29
791 0.28
792 0.31
793 0.35
794 0.39
795 0.38
796 0.39
797 0.41
798 0.42
799 0.43
800 0.45
801 0.42
802 0.41
803 0.43
804 0.43
805 0.51
806 0.55
807 0.54
808 0.52
809 0.54
810 0.58
811 0.56
812 0.57
813 0.53
814 0.55
815 0.59
816 0.61
817 0.56
818 0.51
819 0.55
820 0.59
821 0.57
822 0.55
823 0.56
824 0.59
825 0.63
826 0.67
827 0.68
828 0.64
829 0.67
830 0.66
831 0.68
832 0.69
833 0.71
834 0.74
835 0.72
836 0.71
837 0.7
838 0.75
839 0.73
840 0.74
841 0.71
842 0.68
843 0.72
844 0.77
845 0.79