FuNGI

A0A3M6Y0S0

Protein Details

Accession

A0A3M6Y0S0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
32-58	DREQGQSKFKRLKRGHREERKGSEARG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
39-53	KFKRLKRGHREERKG

Subcellular Location(s)

nucl 15, cyto_nucl 14, cyto 11

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012337 RNaseH-like_sf IPR028083 Spt6_acidic_N_dom IPR028088 Spt6_HTH_DNA-bd_dom IPR028231 Spt6_YqgF IPR023323 Tex-like_dom_sf IPR023319 Tex-like_HTH_dom_sf IPR017072 TF_Spt6
Gene Ontology	GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF14641 HTH_44 PF14632 SPT6_acidic PF14639 YqgF

Amino Acid Sequences

EKRKRRREQKEEEDEALDEEDLDLIGIGGGEDREQGQSKFKRLKRGHREERKGSEARGVEDIFSDEEEGEGVAPAARGRGFGGFGQDEMDDFIEQDEFPDEEGGGLDEDLGIRAPTGRANFADIQKLQESGMDEATMEDFRGAFGDGDEFAWALEAEAEHNEENADPDKPLELKDVFEPSQLQEKMLTDEDNEIRMTDVPERLQLARRSHKPLNDLSPEELDERHSEEAAWISSTMFPRTRMEGKFREPFEAAVKSVLDMMNRENFEPPFIFQNRKDFLIHSEQVPASPDPEHPNAPPYKVNAEKLLGQDDLWNILEQDLKFRAFCERREAIRTSLGSLKELMGEEFNDPIFEELLSNAVQIEDLQDIQDYLNFQYSAQLRDIAIAQAEEGGQQKRARGAKGLWDKIRAGSAYHLVRAFGITADALAVNIENGPKTYTEDPDKRPDDLADTLIQEPEFRTSEDVLKAAKSMFIEELCNSPRFRRFMRKTYFERLVFDVKRTEKGVKVIDEEHPYYEFKYLRNWEARNFLLDRPELFLKMLRAESEGLVEVIVRIQGEKQFRADLHKAILSDNFSEVADAWNQLRKEIMDKSLARLHVFIARGVKDTIKNECENMLAANCRKAYTDRLDQAPYRPTGMMLGTVPRVLALSNGAGNRGDAICWAYMEENGRVQENGKFTDLRLGNQEKFIPEGKDVAAFVELVERRKPDVLAVSGWSVETRKLYKELQDVIEAKKLMGAPYEDPEDDSERQDPLDVFI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.63
2	0.53
3	0.43
4	0.32
5	0.21
6	0.14
7	0.11
8	0.08
9	0.07
10	0.06
11	0.04
12	0.04
13	0.04
14	0.04
15	0.04
16	0.05
17	0.05
18	0.06
19	0.07
20	0.11
21	0.14
22	0.15
23	0.24
24	0.3
25	0.39
26	0.48
27	0.52
28	0.59
29	0.66
30	0.76
31	0.77
32	0.83
33	0.85
34	0.86
35	0.92
36	0.91
37	0.9
38	0.88
39	0.8
40	0.71
41	0.67
42	0.59
43	0.51
44	0.47
45	0.39
46	0.3
47	0.27
48	0.27
49	0.2
50	0.18
51	0.16
52	0.1
53	0.09
54	0.09
55	0.08
56	0.07
57	0.06
58	0.06
59	0.06
60	0.06
61	0.06
62	0.08
63	0.08
64	0.08
65	0.1
66	0.11
67	0.12
68	0.13
69	0.18
70	0.17
71	0.17
72	0.17
73	0.16
74	0.15
75	0.14
76	0.15
77	0.09
78	0.09
79	0.09
80	0.09
81	0.09
82	0.09
83	0.1
84	0.09
85	0.09
86	0.1
87	0.09
88	0.08
89	0.09
90	0.09
91	0.07
92	0.07
93	0.06
94	0.05
95	0.06
96	0.06
97	0.06
98	0.05
99	0.05
100	0.06
101	0.07
102	0.1
103	0.12
104	0.15
105	0.15
106	0.2
107	0.25
108	0.26
109	0.33
110	0.3
111	0.32
112	0.3
113	0.3
114	0.25
115	0.22
116	0.22
117	0.17
118	0.17
119	0.13
120	0.12
121	0.12
122	0.14
123	0.11
124	0.09
125	0.07
126	0.07
127	0.07
128	0.07
129	0.08
130	0.06
131	0.06
132	0.08
133	0.08
134	0.08
135	0.08
136	0.07
137	0.06
138	0.07
139	0.06
140	0.05
141	0.05
142	0.05
143	0.06
144	0.06
145	0.09
146	0.08
147	0.08
148	0.09
149	0.08
150	0.1
151	0.11
152	0.11
153	0.1
154	0.1
155	0.12
156	0.13
157	0.14
158	0.17
159	0.15
160	0.16
161	0.19
162	0.24
163	0.22
164	0.23
165	0.23
166	0.2
167	0.29
168	0.27
169	0.25
170	0.22
171	0.22
172	0.24
173	0.24
174	0.23
175	0.15
176	0.2
177	0.2
178	0.19
179	0.18
180	0.15
181	0.15
182	0.15
183	0.16
184	0.14
185	0.15
186	0.15
187	0.16
188	0.19
189	0.2
190	0.25
191	0.3
192	0.35
193	0.41
194	0.46
195	0.52
196	0.55
197	0.57
198	0.55
199	0.54
200	0.54
201	0.51
202	0.48
203	0.42
204	0.39
205	0.37
206	0.33
207	0.27
208	0.21
209	0.17
210	0.17
211	0.15
212	0.14
213	0.12
214	0.12
215	0.13
216	0.12
217	0.11
218	0.08
219	0.08
220	0.12
221	0.13
222	0.15
223	0.15
224	0.17
225	0.18
226	0.23
227	0.29
228	0.29
229	0.35
230	0.37
231	0.42
232	0.48
233	0.47
234	0.46
235	0.4
236	0.38
237	0.36
238	0.32
239	0.26
240	0.2
241	0.19
242	0.15
243	0.16
244	0.15
245	0.11
246	0.1
247	0.12
248	0.16
249	0.16
250	0.17
251	0.18
252	0.17
253	0.19
254	0.18
255	0.17
256	0.19
257	0.21
258	0.25
259	0.24
260	0.32
261	0.32
262	0.33
263	0.33
264	0.27
265	0.29
266	0.32
267	0.32
268	0.24
269	0.26
270	0.24
271	0.23
272	0.25
273	0.21
274	0.14
275	0.14
276	0.16
277	0.17
278	0.19
279	0.2
280	0.18
281	0.24
282	0.24
283	0.25
284	0.25
285	0.23
286	0.27
287	0.28
288	0.29
289	0.26
290	0.26
291	0.27
292	0.26
293	0.26
294	0.2
295	0.16
296	0.16
297	0.14
298	0.14
299	0.12
300	0.11
301	0.08
302	0.09
303	0.12
304	0.1
305	0.13
306	0.13
307	0.13
308	0.13
309	0.13
310	0.21
311	0.21
312	0.23
313	0.28
314	0.3
315	0.32
316	0.37
317	0.39
318	0.32
319	0.34
320	0.33
321	0.27
322	0.27
323	0.25
324	0.21
325	0.19
326	0.17
327	0.14
328	0.14
329	0.12
330	0.08
331	0.08
332	0.08
333	0.08
334	0.07
335	0.06
336	0.06
337	0.06
338	0.06
339	0.05
340	0.05
341	0.04
342	0.05
343	0.05
344	0.05
345	0.05
346	0.04
347	0.04
348	0.04
349	0.05
350	0.04
351	0.04
352	0.04
353	0.04
354	0.05
355	0.05
356	0.06
357	0.05
358	0.05
359	0.07
360	0.07
361	0.07
362	0.11
363	0.13
364	0.14
365	0.13
366	0.14
367	0.12
368	0.13
369	0.13
370	0.09
371	0.08
372	0.06
373	0.05
374	0.05
375	0.05
376	0.05
377	0.07
378	0.07
379	0.1
380	0.11
381	0.12
382	0.17
383	0.2
384	0.19
385	0.2
386	0.21
387	0.27
388	0.35
389	0.4
390	0.36
391	0.36
392	0.36
393	0.34
394	0.34
395	0.25
396	0.18
397	0.13
398	0.17
399	0.15
400	0.17
401	0.16
402	0.14
403	0.14
404	0.13
405	0.12
406	0.07
407	0.06
408	0.04
409	0.04
410	0.04
411	0.04
412	0.03
413	0.03
414	0.03
415	0.03
416	0.03
417	0.04
418	0.04
419	0.04
420	0.05
421	0.05
422	0.09
423	0.11
424	0.14
425	0.21
426	0.27
427	0.31
428	0.39
429	0.4
430	0.38
431	0.37
432	0.34
433	0.3
434	0.26
435	0.24
436	0.16
437	0.16
438	0.15
439	0.15
440	0.15
441	0.11
442	0.1
443	0.12
444	0.11
445	0.09
446	0.11
447	0.12
448	0.15
449	0.16
450	0.16
451	0.14
452	0.13
453	0.14
454	0.12
455	0.12
456	0.09
457	0.09
458	0.1
459	0.1
460	0.11
461	0.11
462	0.14
463	0.15
464	0.17
465	0.17
466	0.19
467	0.23
468	0.26
469	0.3
470	0.38
471	0.42
472	0.5
473	0.58
474	0.63
475	0.64
476	0.68
477	0.72
478	0.62
479	0.57
480	0.51
481	0.51
482	0.44
483	0.4
484	0.38
485	0.32
486	0.33
487	0.33
488	0.32
489	0.26
490	0.3
491	0.33
492	0.28
493	0.29
494	0.29
495	0.31
496	0.33
497	0.31
498	0.27
499	0.25
500	0.23
501	0.22
502	0.23
503	0.2
504	0.16
505	0.23
506	0.25
507	0.3
508	0.37
509	0.38
510	0.36
511	0.4
512	0.4
513	0.37
514	0.36
515	0.31
516	0.28
517	0.27
518	0.25
519	0.23
520	0.24
521	0.2
522	0.19
523	0.19
524	0.16
525	0.18
526	0.18
527	0.15
528	0.15
529	0.16
530	0.15
531	0.14
532	0.13
533	0.1
534	0.09
535	0.08
536	0.07
537	0.06
538	0.06
539	0.05
540	0.05
541	0.06
542	0.11
543	0.15
544	0.17
545	0.18
546	0.21
547	0.22
548	0.29
549	0.3
550	0.28
551	0.27
552	0.28
553	0.27
554	0.25
555	0.27
556	0.21
557	0.19
558	0.18
559	0.15
560	0.13
561	0.13
562	0.12
563	0.11
564	0.1
565	0.1
566	0.1
567	0.15
568	0.15
569	0.15
570	0.16
571	0.15
572	0.18
573	0.21
574	0.22
575	0.26
576	0.26
577	0.31
578	0.35
579	0.35
580	0.32
581	0.29
582	0.27
583	0.24
584	0.24
585	0.22
586	0.22
587	0.21
588	0.23
589	0.23
590	0.25
591	0.25
592	0.28
593	0.32
594	0.32
595	0.33
596	0.32
597	0.31
598	0.29
599	0.25
600	0.23
601	0.18
602	0.19
603	0.2
604	0.23
605	0.23
606	0.23
607	0.24
608	0.25
609	0.29
610	0.31
611	0.38
612	0.39
613	0.42
614	0.47
615	0.47
616	0.49
617	0.49
618	0.43
619	0.36
620	0.31
621	0.27
622	0.24
623	0.23
624	0.2
625	0.15
626	0.16
627	0.14
628	0.14
629	0.14
630	0.12
631	0.11
632	0.09
633	0.09
634	0.08
635	0.08
636	0.12
637	0.12
638	0.13
639	0.13
640	0.13
641	0.15
642	0.13
643	0.12
644	0.09
645	0.11
646	0.1
647	0.1
648	0.11
649	0.1
650	0.12
651	0.15
652	0.16
653	0.18
654	0.18
655	0.2
656	0.19
657	0.2
658	0.22
659	0.23
660	0.24
661	0.23
662	0.22
663	0.22
664	0.31
665	0.3
666	0.28
667	0.33
668	0.37
669	0.36
670	0.39
671	0.41
672	0.32
673	0.35
674	0.36
675	0.3
676	0.25
677	0.26
678	0.23
679	0.23
680	0.22
681	0.2
682	0.16
683	0.14
684	0.12
685	0.17
686	0.19
687	0.19
688	0.23
689	0.24
690	0.26
691	0.29
692	0.29
693	0.25
694	0.29
695	0.29
696	0.27
697	0.28
698	0.27
699	0.25
700	0.25
701	0.22
702	0.17
703	0.17
704	0.2
705	0.2
706	0.22
707	0.27
708	0.3
709	0.36
710	0.42
711	0.46
712	0.43
713	0.48
714	0.47
715	0.46
716	0.49
717	0.42
718	0.34
719	0.32
720	0.3
721	0.24
722	0.24
723	0.24
724	0.21
725	0.25
726	0.3
727	0.26
728	0.26
729	0.29
730	0.3
731	0.29
732	0.3
733	0.27
734	0.24
735	0.24
736	0.25

A0A3M6Y0S0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer