Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3M6YJ91

Protein Details
Accession A0A3M6YJ91    Localization Confidence High Confidence Score 22.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-34QTPDMAGKKQKKGKGNADNSVKKRKRBasic
42-69GENQTAEPEKKKSKKRKSKGDEEAPSTTHydrophilic
100-125KADEAASTKKDKKKKRKSNAEDATGLHydrophilic
147-172NVFRGEQKKIKKTKKNQQKVPNDALSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
15-36GKKQKKGKGNADNSVKKRKREE
48-61EPEKKKSKKRKSKG
86-116KKEEGKAVAAPATPKADEAASTKKDKKKKRK
154-160KKIKKTK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 13.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
Amino Acid Sequences MSTEDPAVQTPDMAGKKQKKGKGNADNSVKKRKREEEAQAAGENQTAEPEKKKSKKRKSKGDEEAPSTTAGAAEAAPSAETPKSSKKEEGKAVAAPATPKADEAASTKKDKKKKRKSNAEDATGLTDSQSKPAEKQSQSAAPESPVNVFRGEQKKIKKTKKNQQKVPNDALSAQAQRDNDRSLSTVAPTAESDEVLQSHSPFVQQTASFYLALSPCANNFPLEGLCAEHISPLLLTYYGPLKGIVLSYDNARLSASPEEAATMTTPSSRDAQTILAKSTDEYAVTFVWLTADFVLFRPQKGTYLEGYVNLQNESLLGLVCYNYFNAGIEWNRLPKDWQWVSDEEGALTGKGKGKKATQEGEGHWANAEGKKFDGRLIFRVKDFEATSGSEGGAGSINIVGTLLSEVDEKALEEGESRG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.39
3 0.48
4 0.57
5 0.63
6 0.64
7 0.72
8 0.79
9 0.81
10 0.81
11 0.81
12 0.83
13 0.86
14 0.83
15 0.85
16 0.8
17 0.76
18 0.76
19 0.75
20 0.73
21 0.73
22 0.76
23 0.75
24 0.76
25 0.73
26 0.65
27 0.59
28 0.5
29 0.42
30 0.32
31 0.21
32 0.17
33 0.17
34 0.18
35 0.21
36 0.28
37 0.37
38 0.46
39 0.57
40 0.64
41 0.73
42 0.82
43 0.88
44 0.92
45 0.91
46 0.93
47 0.94
48 0.93
49 0.9
50 0.85
51 0.78
52 0.68
53 0.58
54 0.47
55 0.36
56 0.25
57 0.17
58 0.11
59 0.07
60 0.06
61 0.06
62 0.06
63 0.06
64 0.06
65 0.08
66 0.08
67 0.09
68 0.12
69 0.21
70 0.25
71 0.29
72 0.37
73 0.43
74 0.51
75 0.57
76 0.59
77 0.54
78 0.52
79 0.5
80 0.44
81 0.37
82 0.3
83 0.25
84 0.22
85 0.18
86 0.16
87 0.15
88 0.13
89 0.13
90 0.16
91 0.22
92 0.23
93 0.3
94 0.38
95 0.44
96 0.53
97 0.62
98 0.7
99 0.73
100 0.8
101 0.85
102 0.89
103 0.91
104 0.93
105 0.91
106 0.86
107 0.76
108 0.66
109 0.58
110 0.47
111 0.38
112 0.27
113 0.22
114 0.17
115 0.17
116 0.2
117 0.17
118 0.18
119 0.26
120 0.35
121 0.31
122 0.34
123 0.35
124 0.38
125 0.39
126 0.39
127 0.32
128 0.25
129 0.25
130 0.23
131 0.21
132 0.17
133 0.16
134 0.15
135 0.14
136 0.2
137 0.25
138 0.28
139 0.32
140 0.38
141 0.47
142 0.56
143 0.66
144 0.68
145 0.73
146 0.8
147 0.85
148 0.87
149 0.88
150 0.88
151 0.88
152 0.86
153 0.82
154 0.74
155 0.64
156 0.54
157 0.46
158 0.39
159 0.3
160 0.22
161 0.18
162 0.16
163 0.17
164 0.18
165 0.18
166 0.16
167 0.15
168 0.16
169 0.15
170 0.15
171 0.13
172 0.14
173 0.12
174 0.12
175 0.11
176 0.12
177 0.1
178 0.1
179 0.09
180 0.07
181 0.07
182 0.08
183 0.08
184 0.06
185 0.07
186 0.07
187 0.07
188 0.06
189 0.07
190 0.08
191 0.08
192 0.09
193 0.11
194 0.12
195 0.12
196 0.12
197 0.13
198 0.11
199 0.12
200 0.12
201 0.09
202 0.08
203 0.1
204 0.1
205 0.08
206 0.08
207 0.08
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.06
216 0.06
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.05
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.07
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.08
235 0.12
236 0.11
237 0.11
238 0.11
239 0.11
240 0.11
241 0.13
242 0.12
243 0.09
244 0.09
245 0.1
246 0.1
247 0.1
248 0.08
249 0.07
250 0.06
251 0.07
252 0.08
253 0.08
254 0.11
255 0.11
256 0.11
257 0.12
258 0.15
259 0.19
260 0.21
261 0.2
262 0.18
263 0.18
264 0.17
265 0.18
266 0.15
267 0.1
268 0.09
269 0.09
270 0.09
271 0.09
272 0.09
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.07
281 0.15
282 0.15
283 0.16
284 0.17
285 0.18
286 0.2
287 0.22
288 0.24
289 0.18
290 0.22
291 0.22
292 0.21
293 0.23
294 0.22
295 0.21
296 0.18
297 0.16
298 0.12
299 0.11
300 0.1
301 0.08
302 0.05
303 0.04
304 0.04
305 0.05
306 0.06
307 0.06
308 0.06
309 0.06
310 0.07
311 0.07
312 0.07
313 0.11
314 0.12
315 0.16
316 0.18
317 0.21
318 0.22
319 0.22
320 0.25
321 0.24
322 0.33
323 0.32
324 0.32
325 0.33
326 0.33
327 0.37
328 0.39
329 0.36
330 0.26
331 0.24
332 0.21
333 0.17
334 0.16
335 0.15
336 0.16
337 0.21
338 0.24
339 0.27
340 0.32
341 0.41
342 0.48
343 0.5
344 0.5
345 0.52
346 0.51
347 0.55
348 0.5
349 0.42
350 0.34
351 0.31
352 0.27
353 0.25
354 0.25
355 0.18
356 0.19
357 0.22
358 0.22
359 0.24
360 0.29
361 0.29
362 0.34
363 0.42
364 0.43
365 0.41
366 0.44
367 0.42
368 0.4
369 0.38
370 0.32
371 0.26
372 0.25
373 0.26
374 0.23
375 0.21
376 0.17
377 0.15
378 0.14
379 0.12
380 0.09
381 0.08
382 0.08
383 0.08
384 0.06
385 0.07
386 0.06
387 0.05
388 0.06
389 0.05
390 0.06
391 0.07
392 0.07
393 0.08
394 0.09
395 0.08
396 0.09
397 0.09
398 0.09