Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3M6XSB2

Protein Details
Accession A0A3M6XSB2    Localization Confidence High Confidence Score 15.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
63-86SVTSSRAGPRSKKTRQRGDLEDEFHydrophilic
350-369LASGKHKKRKGAKTSTDNYSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
354-361KHKKRKGA
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 13.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MPKAKWIDKKNATTFSLVHRAQNDPLIHDQDAPSMVFAEKQQQRRPVDDVDDEDDYPYSSAGSVTSSRAGPRSKKTRQRGDLEDEFGLSFKPHEGEAAQHGVFYDDTKYDYMQHMRDLGSGEGPVTWVEASAPADKKKGKQKLEDALRDMDIGRGAETQSVGGSSMASEAKSLLPEEVLPSEFVKKRSYQDQQDVPDDIAGFQPDMDPRLREVLEALDDEEYVDDEEDIFAELTKDGYEVERDEWEHLGEQQAFDEDEAQLGDDGWESDDTIRAASPPPNLQPADFVLQDGEDAKPPEDPQAQLPADPTGGAWIEELKKFKADDKAAKAQNKGQAAAAPSAIESSALSSLASGKHKKRKGAKTSTDNYSMTSSALARTDQQTLLDARFDKIIEEEDEMDEMADDEASGLGENASMASGLTGMSEASKASKYSNMSGLSGVSGISSYSRATDSEAPQLQRSDFNSIMDDFLGNYSTTGKAARRVKRGGPQSGMEQLDEIRSNLGPARLRGKGAARAS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.56
3 0.56
4 0.47
5 0.44
6 0.4
7 0.41
8 0.4
9 0.45
10 0.39
11 0.33
12 0.38
13 0.38
14 0.35
15 0.34
16 0.32
17 0.28
18 0.28
19 0.24
20 0.19
21 0.15
22 0.14
23 0.14
24 0.14
25 0.22
26 0.27
27 0.35
28 0.42
29 0.49
30 0.53
31 0.56
32 0.59
33 0.55
34 0.54
35 0.5
36 0.47
37 0.43
38 0.42
39 0.38
40 0.34
41 0.28
42 0.23
43 0.19
44 0.14
45 0.1
46 0.07
47 0.07
48 0.06
49 0.09
50 0.1
51 0.12
52 0.14
53 0.16
54 0.17
55 0.23
56 0.29
57 0.33
58 0.41
59 0.5
60 0.58
61 0.67
62 0.75
63 0.81
64 0.83
65 0.85
66 0.82
67 0.8
68 0.76
69 0.7
70 0.6
71 0.5
72 0.41
73 0.33
74 0.26
75 0.17
76 0.12
77 0.09
78 0.09
79 0.08
80 0.1
81 0.1
82 0.12
83 0.16
84 0.21
85 0.19
86 0.18
87 0.18
88 0.18
89 0.17
90 0.16
91 0.14
92 0.09
93 0.11
94 0.12
95 0.12
96 0.14
97 0.18
98 0.22
99 0.22
100 0.23
101 0.24
102 0.24
103 0.25
104 0.24
105 0.2
106 0.16
107 0.15
108 0.13
109 0.1
110 0.1
111 0.08
112 0.07
113 0.06
114 0.05
115 0.05
116 0.07
117 0.09
118 0.14
119 0.18
120 0.19
121 0.24
122 0.27
123 0.33
124 0.42
125 0.49
126 0.5
127 0.55
128 0.61
129 0.67
130 0.74
131 0.73
132 0.66
133 0.6
134 0.53
135 0.45
136 0.37
137 0.28
138 0.2
139 0.14
140 0.11
141 0.09
142 0.09
143 0.09
144 0.09
145 0.08
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.06
150 0.06
151 0.05
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.07
156 0.07
157 0.08
158 0.08
159 0.09
160 0.07
161 0.07
162 0.07
163 0.08
164 0.09
165 0.09
166 0.09
167 0.1
168 0.16
169 0.18
170 0.2
171 0.22
172 0.23
173 0.26
174 0.34
175 0.41
176 0.41
177 0.46
178 0.51
179 0.51
180 0.51
181 0.49
182 0.4
183 0.34
184 0.27
185 0.2
186 0.14
187 0.1
188 0.07
189 0.06
190 0.07
191 0.07
192 0.09
193 0.09
194 0.09
195 0.1
196 0.14
197 0.14
198 0.12
199 0.12
200 0.11
201 0.12
202 0.11
203 0.11
204 0.08
205 0.07
206 0.07
207 0.07
208 0.06
209 0.05
210 0.05
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.05
225 0.06
226 0.06
227 0.07
228 0.08
229 0.09
230 0.1
231 0.1
232 0.1
233 0.1
234 0.09
235 0.11
236 0.1
237 0.09
238 0.08
239 0.08
240 0.08
241 0.07
242 0.08
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.03
251 0.03
252 0.04
253 0.04
254 0.04
255 0.04
256 0.05
257 0.05
258 0.06
259 0.06
260 0.06
261 0.07
262 0.09
263 0.11
264 0.12
265 0.14
266 0.18
267 0.18
268 0.18
269 0.17
270 0.17
271 0.18
272 0.16
273 0.14
274 0.1
275 0.1
276 0.1
277 0.09
278 0.08
279 0.07
280 0.08
281 0.08
282 0.09
283 0.09
284 0.14
285 0.14
286 0.15
287 0.15
288 0.22
289 0.22
290 0.21
291 0.22
292 0.18
293 0.16
294 0.15
295 0.13
296 0.07
297 0.07
298 0.07
299 0.06
300 0.07
301 0.1
302 0.12
303 0.14
304 0.13
305 0.15
306 0.15
307 0.19
308 0.25
309 0.28
310 0.34
311 0.39
312 0.47
313 0.52
314 0.55
315 0.53
316 0.5
317 0.5
318 0.44
319 0.38
320 0.3
321 0.26
322 0.24
323 0.23
324 0.18
325 0.13
326 0.11
327 0.1
328 0.1
329 0.07
330 0.05
331 0.05
332 0.05
333 0.05
334 0.05
335 0.05
336 0.07
337 0.1
338 0.16
339 0.21
340 0.29
341 0.38
342 0.43
343 0.51
344 0.59
345 0.67
346 0.72
347 0.77
348 0.78
349 0.79
350 0.81
351 0.78
352 0.74
353 0.63
354 0.55
355 0.46
356 0.36
357 0.27
358 0.21
359 0.16
360 0.12
361 0.13
362 0.12
363 0.12
364 0.14
365 0.16
366 0.15
367 0.15
368 0.17
369 0.17
370 0.18
371 0.19
372 0.18
373 0.15
374 0.17
375 0.16
376 0.14
377 0.13
378 0.15
379 0.13
380 0.14
381 0.15
382 0.14
383 0.14
384 0.13
385 0.12
386 0.09
387 0.08
388 0.06
389 0.05
390 0.04
391 0.04
392 0.04
393 0.04
394 0.04
395 0.04
396 0.04
397 0.04
398 0.04
399 0.04
400 0.04
401 0.03
402 0.03
403 0.03
404 0.03
405 0.03
406 0.04
407 0.04
408 0.04
409 0.04
410 0.05
411 0.05
412 0.07
413 0.09
414 0.09
415 0.11
416 0.16
417 0.19
418 0.22
419 0.28
420 0.28
421 0.27
422 0.27
423 0.26
424 0.21
425 0.18
426 0.15
427 0.08
428 0.07
429 0.06
430 0.06
431 0.07
432 0.06
433 0.08
434 0.09
435 0.09
436 0.14
437 0.2
438 0.22
439 0.3
440 0.36
441 0.36
442 0.38
443 0.4
444 0.37
445 0.36
446 0.36
447 0.34
448 0.3
449 0.29
450 0.29
451 0.27
452 0.27
453 0.22
454 0.19
455 0.13
456 0.12
457 0.12
458 0.1
459 0.09
460 0.1
461 0.1
462 0.11
463 0.15
464 0.16
465 0.23
466 0.33
467 0.41
468 0.47
469 0.53
470 0.6
471 0.65
472 0.72
473 0.72
474 0.68
475 0.63
476 0.59
477 0.6
478 0.54
479 0.45
480 0.37
481 0.29
482 0.29
483 0.27
484 0.22
485 0.17
486 0.15
487 0.17
488 0.19
489 0.24
490 0.23
491 0.26
492 0.32
493 0.33
494 0.35
495 0.38
496 0.41