Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3M7AFA4

Protein Details
Accession A0A3M7AFA4    Localization Confidence High Confidence Score 17.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
590-629DGEGSDRARKQKRDSTPPPRETSREKADRKRLELKRQLESBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
511-516KPAKLG
518-523IGGRKP
596-642RARKQKRDSTPPPRETSREKADRKRLELKRQLESGKNGGATKKKRKF
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 13, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015381  XLF_N  
IPR038051  XRCC4-like_N_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF09302  XLF  
CDD cd22285  HD_XLF_N  
Amino Acid Sequences MSPRWRTLSISDESLPPLLIKAHLHSEGYTIHLTDLSRIWSESLTKREINKRALNNDCSIDPTDGPEQYTILLEKINGTLEQEDGTSLRFRPGDTKQGLKLKLQAPLPHPLSPLNWTVDFSLQESGQLNDQLITPLFHQCHEFQAQTRLLMHALHEKDRVISKLCDRLEASGNDLSIPFPQTNGKLNRKSKRSHREQLAPFVRGLGDFDEEDWRKQWQQMDRSEERLEDGVLEEVTKGLKVAVGDQKVPGIRAEWWRRIHGEVTSANLETKSNGIASGGGSQTPVESKERLQKSPGSGGETENDRFQRQSTPPVSKRSAATFKNGGRQDTQLVASSFTQEREGPAKVATEVSPDDESTEDEEDLDAPAKKPSQPATADEQATSFSKHEGAPRKTLGAIGGGGRQESPKRTPSVPEGTSFSPSESTKTAQSPPSTIQPRPRLGAIGGKRDTGSSASTYPEKAPSPSYSSSAQAPAERTAASQEPSAFNSATPHRGFESNSAISEDEAAAPKKPAKLGTIGGRKPQGRTKAPTEQASAADSQDNTMSPRKSKMDTIGGRKKVTDADGSHDYIQEDATRSGDGSRGDRSHVNDGEGSDRARKQKRDSTPPPRETSREKADRKRLELKRQLESGKNGGATKKKRKF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.27
3 0.21
4 0.18
5 0.15
6 0.15
7 0.15
8 0.17
9 0.22
10 0.24
11 0.25
12 0.24
13 0.25
14 0.23
15 0.25
16 0.23
17 0.17
18 0.16
19 0.17
20 0.17
21 0.17
22 0.18
23 0.17
24 0.17
25 0.17
26 0.18
27 0.17
28 0.23
29 0.27
30 0.31
31 0.33
32 0.37
33 0.44
34 0.53
35 0.59
36 0.62
37 0.64
38 0.67
39 0.71
40 0.74
41 0.71
42 0.66
43 0.6
44 0.52
45 0.47
46 0.42
47 0.35
48 0.27
49 0.26
50 0.26
51 0.24
52 0.25
53 0.22
54 0.2
55 0.18
56 0.19
57 0.16
58 0.12
59 0.12
60 0.1
61 0.11
62 0.12
63 0.13
64 0.11
65 0.12
66 0.13
67 0.12
68 0.13
69 0.11
70 0.11
71 0.1
72 0.11
73 0.12
74 0.12
75 0.16
76 0.16
77 0.17
78 0.23
79 0.27
80 0.35
81 0.37
82 0.42
83 0.45
84 0.52
85 0.54
86 0.49
87 0.52
88 0.46
89 0.48
90 0.47
91 0.46
92 0.41
93 0.48
94 0.49
95 0.44
96 0.41
97 0.37
98 0.35
99 0.32
100 0.33
101 0.27
102 0.24
103 0.23
104 0.23
105 0.24
106 0.23
107 0.21
108 0.19
109 0.15
110 0.17
111 0.17
112 0.16
113 0.15
114 0.15
115 0.14
116 0.12
117 0.13
118 0.12
119 0.11
120 0.12
121 0.11
122 0.16
123 0.16
124 0.16
125 0.19
126 0.18
127 0.23
128 0.25
129 0.25
130 0.22
131 0.29
132 0.29
133 0.28
134 0.28
135 0.24
136 0.21
137 0.2
138 0.19
139 0.2
140 0.21
141 0.22
142 0.23
143 0.22
144 0.24
145 0.27
146 0.27
147 0.23
148 0.25
149 0.26
150 0.33
151 0.33
152 0.34
153 0.32
154 0.33
155 0.34
156 0.31
157 0.3
158 0.24
159 0.24
160 0.2
161 0.2
162 0.17
163 0.13
164 0.14
165 0.1
166 0.1
167 0.13
168 0.15
169 0.23
170 0.31
171 0.38
172 0.46
173 0.55
174 0.62
175 0.66
176 0.72
177 0.75
178 0.77
179 0.78
180 0.79
181 0.78
182 0.79
183 0.77
184 0.8
185 0.75
186 0.65
187 0.55
188 0.46
189 0.38
190 0.27
191 0.24
192 0.15
193 0.1
194 0.09
195 0.1
196 0.17
197 0.18
198 0.19
199 0.19
200 0.2
201 0.19
202 0.23
203 0.27
204 0.27
205 0.34
206 0.4
207 0.47
208 0.48
209 0.51
210 0.48
211 0.43
212 0.37
213 0.3
214 0.23
215 0.15
216 0.13
217 0.09
218 0.08
219 0.08
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.05
224 0.05
225 0.04
226 0.05
227 0.05
228 0.1
229 0.15
230 0.17
231 0.18
232 0.18
233 0.2
234 0.2
235 0.2
236 0.15
237 0.11
238 0.13
239 0.22
240 0.28
241 0.33
242 0.35
243 0.37
244 0.38
245 0.38
246 0.36
247 0.28
248 0.26
249 0.2
250 0.2
251 0.19
252 0.18
253 0.16
254 0.15
255 0.14
256 0.1
257 0.1
258 0.08
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.08
265 0.08
266 0.07
267 0.07
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.09
272 0.08
273 0.09
274 0.12
275 0.2
276 0.24
277 0.25
278 0.27
279 0.29
280 0.3
281 0.35
282 0.34
283 0.29
284 0.26
285 0.25
286 0.25
287 0.25
288 0.23
289 0.19
290 0.19
291 0.16
292 0.16
293 0.16
294 0.2
295 0.18
296 0.26
297 0.28
298 0.36
299 0.4
300 0.46
301 0.47
302 0.43
303 0.42
304 0.4
305 0.42
306 0.34
307 0.35
308 0.35
309 0.34
310 0.4
311 0.4
312 0.35
313 0.3
314 0.3
315 0.27
316 0.22
317 0.21
318 0.16
319 0.15
320 0.15
321 0.13
322 0.14
323 0.14
324 0.12
325 0.13
326 0.1
327 0.12
328 0.13
329 0.14
330 0.12
331 0.12
332 0.12
333 0.11
334 0.12
335 0.1
336 0.1
337 0.09
338 0.11
339 0.11
340 0.1
341 0.1
342 0.1
343 0.1
344 0.1
345 0.11
346 0.08
347 0.08
348 0.08
349 0.08
350 0.08
351 0.09
352 0.08
353 0.07
354 0.09
355 0.1
356 0.11
357 0.14
358 0.17
359 0.21
360 0.23
361 0.25
362 0.31
363 0.34
364 0.34
365 0.31
366 0.28
367 0.23
368 0.22
369 0.2
370 0.13
371 0.09
372 0.1
373 0.12
374 0.18
375 0.26
376 0.28
377 0.32
378 0.32
379 0.33
380 0.32
381 0.31
382 0.25
383 0.16
384 0.14
385 0.1
386 0.12
387 0.1
388 0.1
389 0.1
390 0.11
391 0.13
392 0.16
393 0.18
394 0.21
395 0.24
396 0.25
397 0.28
398 0.33
399 0.39
400 0.36
401 0.34
402 0.34
403 0.31
404 0.33
405 0.3
406 0.25
407 0.2
408 0.19
409 0.19
410 0.17
411 0.17
412 0.17
413 0.2
414 0.23
415 0.24
416 0.25
417 0.26
418 0.26
419 0.34
420 0.35
421 0.36
422 0.41
423 0.44
424 0.46
425 0.45
426 0.43
427 0.36
428 0.33
429 0.38
430 0.33
431 0.35
432 0.33
433 0.32
434 0.31
435 0.3
436 0.29
437 0.22
438 0.2
439 0.13
440 0.13
441 0.15
442 0.16
443 0.17
444 0.18
445 0.2
446 0.19
447 0.19
448 0.21
449 0.22
450 0.26
451 0.27
452 0.28
453 0.26
454 0.27
455 0.27
456 0.27
457 0.25
458 0.22
459 0.22
460 0.21
461 0.2
462 0.19
463 0.17
464 0.17
465 0.18
466 0.17
467 0.17
468 0.17
469 0.17
470 0.19
471 0.21
472 0.18
473 0.16
474 0.19
475 0.2
476 0.24
477 0.23
478 0.23
479 0.23
480 0.25
481 0.26
482 0.26
483 0.3
484 0.25
485 0.25
486 0.25
487 0.23
488 0.21
489 0.21
490 0.17
491 0.12
492 0.14
493 0.14
494 0.13
495 0.15
496 0.18
497 0.2
498 0.22
499 0.22
500 0.22
501 0.25
502 0.29
503 0.37
504 0.44
505 0.44
506 0.47
507 0.51
508 0.51
509 0.51
510 0.53
511 0.53
512 0.5
513 0.54
514 0.56
515 0.6
516 0.64
517 0.64
518 0.6
519 0.54
520 0.48
521 0.44
522 0.37
523 0.28
524 0.24
525 0.2
526 0.17
527 0.15
528 0.14
529 0.15
530 0.21
531 0.23
532 0.23
533 0.29
534 0.32
535 0.34
536 0.38
537 0.42
538 0.46
539 0.51
540 0.59
541 0.63
542 0.64
543 0.63
544 0.59
545 0.54
546 0.47
547 0.42
548 0.39
549 0.31
550 0.32
551 0.35
552 0.37
553 0.36
554 0.34
555 0.31
556 0.24
557 0.23
558 0.19
559 0.17
560 0.15
561 0.15
562 0.14
563 0.14
564 0.15
565 0.17
566 0.17
567 0.17
568 0.23
569 0.23
570 0.26
571 0.3
572 0.34
573 0.4
574 0.39
575 0.39
576 0.34
577 0.34
578 0.34
579 0.32
580 0.29
581 0.27
582 0.31
583 0.38
584 0.44
585 0.5
586 0.55
587 0.63
588 0.71
589 0.75
590 0.81
591 0.83
592 0.85
593 0.87
594 0.85
595 0.82
596 0.78
597 0.75
598 0.73
599 0.72
600 0.72
601 0.73
602 0.76
603 0.81
604 0.83
605 0.83
606 0.85
607 0.84
608 0.85
609 0.85
610 0.81
611 0.78
612 0.77
613 0.75
614 0.72
615 0.68
616 0.63
617 0.58
618 0.55
619 0.5
620 0.49
621 0.52
622 0.55