FuNGI

A0A3M6YBK0

Protein Details

Accession

A0A3M6YBK0

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
66-88	GAAGTRGTRNKKVHRHLNNGDIV	Hydrophilic
839-858	MTRKELKKRGDEKRVKAGDK	Basic
964-983	ADERKARRSAAKDRENRIKT	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
841-860	RKELKKRGDEKRVKAGDKAK
970-972	RRS

Subcellular Location(s)

cyto 15.5, cyto_nucl 15, nucl 11.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR015699 DNA-dir_RNA_pol1_lsu_N IPR045867 DNA-dir_RpoC_beta_prime IPR000722 RNA_pol_asu IPR006592 RNA_pol_N IPR007066 RNA_pol_Rpb1_3 IPR042102 RNA_pol_Rpb1_3_sf IPR007083 RNA_pol_Rpb1_4 IPR007081 RNA_pol_Rpb1_5 IPR038120 Rpb1_funnel_sf
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF00623 RNA_pol_Rpb1_2 PF04983 RNA_pol_Rpb1_3 PF05000 RNA_pol_Rpb1_4 PF04998 RNA_pol_Rpb1_5
CDD	cd01435 RNAP_I_RPA1_N

Amino Acid Sequences

KLTYPEPVTSWNVEELQEAVRNGPFVWPGAVAIESETGQVINLERKNAEERTALANQLLAPSSTIGAAGTRGTRNKKVHRHLNNGDIVIMNRQPTLHKPSMMCHRARVLPGEKTLRMHYANCNTYNADFDGDEMNLHFPQNELARSEALSIADTDHQYLSSTAGNPLRGLIQDHVSMGVALTSRDTLFERGEYMQLLYSALRPEHGHCAQGRIVTVAPAIFKPKMLWTGKQVVTSVLKNLIQEGYEGLTMSGKSTTDPNLWGLAGANEEGVVVFRDGYLCQGILDKKQIGPSSGGFVNAVYEVYGHTVAGRLLSVMGRLLTRLENMRAFSCGVEDLIFTREGEEKRRDALQGAETLGTRVAAKYVGLVDGEEKENEDQVVDPIELRKRMEGVLREEEQQAGLDSLMNSTTAKELSSLVTNSCLPTALVRAFPANQMQAMTSSGAKGSKVNANQISCNLGQQVLEGRRVPVMVSGKTLPCFKPFEPSVRAGGYIVDRFLTGVRPQEYFFHAMAGREGLIDTAVKTSRSGYLQRCLIKGMEGLKVEYDSSVRDADGSVIQFLYGEDGLDVAKSKYLSDFKFAAENLPSLLGGLGVRGDFDKVISHEASEYMKQAEKAYRKSGDLGASDPALALYSPSRYAGSMSESVYAAARKYVDENPDKVIRNKKKGIEGARGVTKTNFNAILDLRYLKSVVEAGEAVGVVAGQSVGEPSTQMTLNTFHLAGHSAKNVTLGIPRLREIVMTAAKNIATPTMTLRLIEEMSTDEAKKFAKGISKLALSEILDKVTVTETVGKGTAYTEAKKYQIRLDFFPSKEYMKEYAITVEDVVSTIEHRLLPRLQAMTRKELKKRGDEKRVKAGDKAKASDAMPEIGKSAGAMEQESGRPEGDAEGGDDDSDAEGDDDATRDKAKSNRQQAGYEAYEDEEENMLAARNQREDEVEEPEDEGFGGSNKGSPEPDSSEDEEDAADERKARRSAAKDRENRIKTDRKTNDIVKFAFDDISGDSCTFTLEYDSATAKILMLHLVENAARSSLIQSVPGISGAMLDTAATEEAKGTPILAASGVNLPAMWDYQHIINPHHLYTNSVYDILTHYGVEAARASIVIELQSVFGGHGISVDPRHLTLIADYM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.26
2	0.23
3	0.22
4	0.23
5	0.21
6	0.19
7	0.19
8	0.19
9	0.19
10	0.2
11	0.18
12	0.15
13	0.16
14	0.14
15	0.13
16	0.14
17	0.14
18	0.11
19	0.11
20	0.11
21	0.1
22	0.1
23	0.1
24	0.09
25	0.08
26	0.09
27	0.1
28	0.17
29	0.19
30	0.21
31	0.22
32	0.25
33	0.31
34	0.32
35	0.33
36	0.28
37	0.28
38	0.32
39	0.34
40	0.32
41	0.26
42	0.26
43	0.23
44	0.23
45	0.21
46	0.14
47	0.12
48	0.12
49	0.12
50	0.11
51	0.1
52	0.08
53	0.08
54	0.08
55	0.09
56	0.13
57	0.17
58	0.25
59	0.31
60	0.4
61	0.49
62	0.58
63	0.67
64	0.73
65	0.79
66	0.82
67	0.86
68	0.84
69	0.84
70	0.79
71	0.69
72	0.6
73	0.51
74	0.41
75	0.35
76	0.31
77	0.23
78	0.17
79	0.17
80	0.19
81	0.24
82	0.32
83	0.33
84	0.36
85	0.36
86	0.42
87	0.53
88	0.57
89	0.53
90	0.48
91	0.5
92	0.49
93	0.5
94	0.51
95	0.47
96	0.44
97	0.5
98	0.52
99	0.48
100	0.47
101	0.47
102	0.45
103	0.42
104	0.4
105	0.41
106	0.44
107	0.48
108	0.47
109	0.47
110	0.43
111	0.4
112	0.4
113	0.32
114	0.25
115	0.18
116	0.18
117	0.17
118	0.15
119	0.15
120	0.12
121	0.14
122	0.12
123	0.13
124	0.12
125	0.1
126	0.14
127	0.17
128	0.18
129	0.17
130	0.18
131	0.19
132	0.2
133	0.21
134	0.18
135	0.15
136	0.13
137	0.12
138	0.12
139	0.15
140	0.15
141	0.15
142	0.14
143	0.13
144	0.14
145	0.14
146	0.14
147	0.13
148	0.14
149	0.17
150	0.2
151	0.21
152	0.2
153	0.2
154	0.2
155	0.18
156	0.2
157	0.17
158	0.17
159	0.17
160	0.17
161	0.17
162	0.15
163	0.14
164	0.11
165	0.1
166	0.07
167	0.07
168	0.07
169	0.08
170	0.08
171	0.09
172	0.11
173	0.12
174	0.14
175	0.14
176	0.16
177	0.16
178	0.17
179	0.16
180	0.15
181	0.14
182	0.13
183	0.13
184	0.11
185	0.11
186	0.13
187	0.12
188	0.14
189	0.14
190	0.17
191	0.25
192	0.25
193	0.27
194	0.25
195	0.3
196	0.3
197	0.3
198	0.28
199	0.21
200	0.2
201	0.17
202	0.17
203	0.13
204	0.12
205	0.12
206	0.15
207	0.14
208	0.14
209	0.15
210	0.18
211	0.25
212	0.27
213	0.3
214	0.31
215	0.41
216	0.42
217	0.43
218	0.4
219	0.35
220	0.36
221	0.34
222	0.3
223	0.25
224	0.24
225	0.22
226	0.23
227	0.2
228	0.16
229	0.15
230	0.14
231	0.11
232	0.1
233	0.1
234	0.08
235	0.09
236	0.09
237	0.09
238	0.09
239	0.08
240	0.08
241	0.11
242	0.14
243	0.14
244	0.16
245	0.16
246	0.17
247	0.17
248	0.16
249	0.14
250	0.12
251	0.1
252	0.09
253	0.07
254	0.06
255	0.06
256	0.05
257	0.05
258	0.05
259	0.05
260	0.05
261	0.05
262	0.06
263	0.06
264	0.08
265	0.08
266	0.07
267	0.07
268	0.12
269	0.13
270	0.15
271	0.2
272	0.2
273	0.2
274	0.25
275	0.26
276	0.24
277	0.24
278	0.23
279	0.23
280	0.22
281	0.21
282	0.16
283	0.15
284	0.14
285	0.11
286	0.1
287	0.06
288	0.05
289	0.05
290	0.07
291	0.07
292	0.06
293	0.06
294	0.07
295	0.07
296	0.07
297	0.07
298	0.05
299	0.06
300	0.06
301	0.06
302	0.06
303	0.07
304	0.06
305	0.07
306	0.08
307	0.08
308	0.1
309	0.12
310	0.15
311	0.16
312	0.18
313	0.19
314	0.19
315	0.18
316	0.16
317	0.14
318	0.12
319	0.1
320	0.08
321	0.08
322	0.08
323	0.09
324	0.09
325	0.08
326	0.09
327	0.14
328	0.15
329	0.21
330	0.24
331	0.24
332	0.26
333	0.28
334	0.27
335	0.24
336	0.26
337	0.22
338	0.2
339	0.2
340	0.19
341	0.17
342	0.16
343	0.15
344	0.12
345	0.09
346	0.07
347	0.07
348	0.06
349	0.06
350	0.06
351	0.07
352	0.07
353	0.07
354	0.07
355	0.07
356	0.09
357	0.1
358	0.09
359	0.1
360	0.1
361	0.1
362	0.1
363	0.09
364	0.07
365	0.07
366	0.09
367	0.07
368	0.08
369	0.11
370	0.14
371	0.16
372	0.16
373	0.16
374	0.15
375	0.17
376	0.21
377	0.22
378	0.25
379	0.29
380	0.3
381	0.31
382	0.31
383	0.29
384	0.25
385	0.2
386	0.15
387	0.09
388	0.08
389	0.07
390	0.06
391	0.06
392	0.06
393	0.06
394	0.06
395	0.06
396	0.07
397	0.06
398	0.06
399	0.07
400	0.07
401	0.08
402	0.1
403	0.11
404	0.1
405	0.12
406	0.12
407	0.12
408	0.11
409	0.1
410	0.08
411	0.08
412	0.1
413	0.1
414	0.1
415	0.1
416	0.11
417	0.11
418	0.13
419	0.14
420	0.12
421	0.11
422	0.11
423	0.1
424	0.1
425	0.1
426	0.1
427	0.08
428	0.07
429	0.08
430	0.08
431	0.08
432	0.08
433	0.1
434	0.14
435	0.16
436	0.22
437	0.25
438	0.26
439	0.26
440	0.26
441	0.27
442	0.22
443	0.21
444	0.16
445	0.12
446	0.1
447	0.1
448	0.15
449	0.13
450	0.16
451	0.16
452	0.16
453	0.16
454	0.16
455	0.15
456	0.14
457	0.15
458	0.13
459	0.15
460	0.17
461	0.17
462	0.19
463	0.22
464	0.18
465	0.18
466	0.22
467	0.2
468	0.25
469	0.26
470	0.3
471	0.31
472	0.32
473	0.32
474	0.28
475	0.28
476	0.21
477	0.2
478	0.16
479	0.13
480	0.11
481	0.08
482	0.08
483	0.08
484	0.08
485	0.08
486	0.08
487	0.12
488	0.13
489	0.14
490	0.15
491	0.16
492	0.18
493	0.2
494	0.19
495	0.17
496	0.16
497	0.15
498	0.15
499	0.13
500	0.11
501	0.07
502	0.07
503	0.05
504	0.04
505	0.04
506	0.04
507	0.06
508	0.06
509	0.07
510	0.07
511	0.08
512	0.1
513	0.13
514	0.18
515	0.19
516	0.23
517	0.28
518	0.3
519	0.29
520	0.28
521	0.25
522	0.21
523	0.2
524	0.17
525	0.16
526	0.14
527	0.14
528	0.13
529	0.13
530	0.12
531	0.11
532	0.09
533	0.06
534	0.07
535	0.07
536	0.07
537	0.06
538	0.06
539	0.07
540	0.08
541	0.08
542	0.07
543	0.06
544	0.06
545	0.06
546	0.06
547	0.06
548	0.04
549	0.04
550	0.03
551	0.04
552	0.04
553	0.04
554	0.05
555	0.04
556	0.05
557	0.05
558	0.05
559	0.08
560	0.13
561	0.13
562	0.17
563	0.18
564	0.17
565	0.19
566	0.19
567	0.18
568	0.14
569	0.14
570	0.1
571	0.1
572	0.09
573	0.06
574	0.06
575	0.05
576	0.04
577	0.04
578	0.04
579	0.03
580	0.04
581	0.04
582	0.04
583	0.04
584	0.04
585	0.05
586	0.06
587	0.08
588	0.08
589	0.08
590	0.08
591	0.1
592	0.11
593	0.1
594	0.1
595	0.09
596	0.1
597	0.11
598	0.13
599	0.18
600	0.21
601	0.24
602	0.29
603	0.29
604	0.29
605	0.3
606	0.31
607	0.28
608	0.24
609	0.22
610	0.17
611	0.15
612	0.15
613	0.12
614	0.09
615	0.06
616	0.05
617	0.05
618	0.04
619	0.05
620	0.06
621	0.06
622	0.07
623	0.07
624	0.08
625	0.08
626	0.11
627	0.12
628	0.12
629	0.13
630	0.13
631	0.13
632	0.13
633	0.12
634	0.09
635	0.08
636	0.08
637	0.07
638	0.1
639	0.13
640	0.19
641	0.22
642	0.23
643	0.26
644	0.31
645	0.33
646	0.35
647	0.42
648	0.44
649	0.49
650	0.53
651	0.53
652	0.54
653	0.59
654	0.6
655	0.57
656	0.52
657	0.48
658	0.48
659	0.44
660	0.38
661	0.34
662	0.3
663	0.23
664	0.22
665	0.19
666	0.13
667	0.15
668	0.14
669	0.14
670	0.13
671	0.14
672	0.12
673	0.11
674	0.11
675	0.09
676	0.09
677	0.09
678	0.08
679	0.07
680	0.07
681	0.07
682	0.07
683	0.07
684	0.06
685	0.05
686	0.04
687	0.03
688	0.03
689	0.02
690	0.02
691	0.02
692	0.02
693	0.03
694	0.03
695	0.03
696	0.04
697	0.06
698	0.06
699	0.06
700	0.07
701	0.09
702	0.11
703	0.12
704	0.12
705	0.1
706	0.1
707	0.12
708	0.13
709	0.12
710	0.12
711	0.12
712	0.12
713	0.13
714	0.12
715	0.11
716	0.12
717	0.14
718	0.15
719	0.16
720	0.16
721	0.17
722	0.17
723	0.16
724	0.14
725	0.16
726	0.17
727	0.16
728	0.16
729	0.16
730	0.16
731	0.17
732	0.16
733	0.11
734	0.07
735	0.08
736	0.09
737	0.12
738	0.13
739	0.12
740	0.13
741	0.14
742	0.14
743	0.13
744	0.11
745	0.08
746	0.11
747	0.12
748	0.12
749	0.1
750	0.12
751	0.12
752	0.12
753	0.12
754	0.12
755	0.18
756	0.19
757	0.23
758	0.26
759	0.27
760	0.27
761	0.26
762	0.26
763	0.2
764	0.22
765	0.18
766	0.14
767	0.13
768	0.12
769	0.12
770	0.11
771	0.1
772	0.07
773	0.11
774	0.11
775	0.12
776	0.12
777	0.12
778	0.11
779	0.11
780	0.15
781	0.14
782	0.16
783	0.18
784	0.2
785	0.24
786	0.26
787	0.28
788	0.29
789	0.34
790	0.35
791	0.35
792	0.41
793	0.44
794	0.42
795	0.44
796	0.39
797	0.34
798	0.32
799	0.32
800	0.27
801	0.21
802	0.22
803	0.19
804	0.19
805	0.19
806	0.18
807	0.14
808	0.12
809	0.1
810	0.09
811	0.09
812	0.06
813	0.06
814	0.06
815	0.07
816	0.09
817	0.09
818	0.12
819	0.14
820	0.15
821	0.18
822	0.21
823	0.22
824	0.28
825	0.31
826	0.36
827	0.43
828	0.49
829	0.51
830	0.56
831	0.6
832	0.63
833	0.7
834	0.71
835	0.74
836	0.76
837	0.76
838	0.79
839	0.81
840	0.72
841	0.69
842	0.67
843	0.63
844	0.6
845	0.56
846	0.47
847	0.43
848	0.42
849	0.39
850	0.33
851	0.28
852	0.22
853	0.2
854	0.19
855	0.15
856	0.14
857	0.1
858	0.09
859	0.08
860	0.08
861	0.08
862	0.08
863	0.1
864	0.12
865	0.14
866	0.14
867	0.12
868	0.11
869	0.11
870	0.11
871	0.1
872	0.09
873	0.09
874	0.09
875	0.09
876	0.09
877	0.09
878	0.08
879	0.07
880	0.07
881	0.06
882	0.04
883	0.04
884	0.05
885	0.06
886	0.06
887	0.07
888	0.08
889	0.09
890	0.1
891	0.15
892	0.2
893	0.3
894	0.39
895	0.49
896	0.56
897	0.58
898	0.59
899	0.57
900	0.58
901	0.5
902	0.42
903	0.32
904	0.25
905	0.22
906	0.2
907	0.19
908	0.12
909	0.1
910	0.08
911	0.08
912	0.08
913	0.08
914	0.13
915	0.14
916	0.16
917	0.17
918	0.18
919	0.19
920	0.22
921	0.23
922	0.25
923	0.24
924	0.22
925	0.22
926	0.21
927	0.19
928	0.16
929	0.14
930	0.07
931	0.06
932	0.07
933	0.06
934	0.09
935	0.1
936	0.11
937	0.12
938	0.14
939	0.18
940	0.22
941	0.25
942	0.28
943	0.3
944	0.32
945	0.31
946	0.29
947	0.25
948	0.2
949	0.18
950	0.15
951	0.12
952	0.13
953	0.16
954	0.23
955	0.24
956	0.26
957	0.33
958	0.39
959	0.49
960	0.56
961	0.64
962	0.66
963	0.72
964	0.81
965	0.76
966	0.74
967	0.72
968	0.71
969	0.66
970	0.69
971	0.67
972	0.63
973	0.67
974	0.7
975	0.69
976	0.66
977	0.61
978	0.53
979	0.48
980	0.43
981	0.36
982	0.27
983	0.21
984	0.16
985	0.17
986	0.15
987	0.13
988	0.12
989	0.11
990	0.12
991	0.11
992	0.1
993	0.1
994	0.09
995	0.1
996	0.12
997	0.13
998	0.13
999	0.14
1000	0.14
1001	0.11
1002	0.12
1003	0.12
1004	0.11
1005	0.1
1006	0.1
1007	0.09
1008	0.11
1009	0.11
1010	0.11
1011	0.11
1012	0.1
1013	0.09
1014	0.09
1015	0.11
1016	0.13
1017	0.13
1018	0.14
1019	0.14
1020	0.15
1021	0.16
1022	0.16
1023	0.14
1024	0.09
1025	0.1
1026	0.09
1027	0.08
1028	0.06
1029	0.05
1030	0.05
1031	0.06
1032	0.07
1033	0.06
1034	0.06
1035	0.07
1036	0.08
1037	0.09
1038	0.09
1039	0.08
1040	0.08
1041	0.09
1042	0.09
1043	0.08
1044	0.08
1045	0.08
1046	0.11
1047	0.11
1048	0.1
1049	0.1
1050	0.1
1051	0.1
1052	0.11
1053	0.1
1054	0.08
1055	0.1
1056	0.13
1057	0.18
1058	0.19
1059	0.21
1060	0.28
1061	0.31
1062	0.31
1063	0.33
1064	0.31
1065	0.31
1066	0.33
1067	0.36
1068	0.3
1069	0.27
1070	0.26
1071	0.22
1072	0.25
1073	0.24
1074	0.2
1075	0.14
1076	0.13
1077	0.15
1078	0.15
1079	0.15
1080	0.13
1081	0.1
1082	0.1
1083	0.1
1084	0.1
1085	0.08
1086	0.09
1087	0.08
1088	0.08
1089	0.08
1090	0.08
1091	0.09
1092	0.08
1093	0.08
1094	0.08
1095	0.08
1096	0.06
1097	0.07
1098	0.07
1099	0.1
1100	0.11
1101	0.13
1102	0.14
1103	0.14
1104	0.16
1105	0.16
1106	0.16

A0A3M6YBK0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer