FuNGI

A0A3M6YTR0

Protein Details

Accession

A0A3M6YTR0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
138-174	SDAKGRKGQQKTQQNKRPKQERSKKDRKPREPDDIDA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
140-167	AKGRKGQQKTQQNKRPKQERSKKDRKPR

Subcellular Location(s)

nucl 18, cyto_nucl 14, cyto 8

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027075 CPSF2 IPR025069 Cpsf2_C IPR036866 RibonucZ/Hydroxyglut_hydro IPR011108 RMMBL
Gene Ontology	GO:0005847 C:mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex GO:0003723 F:RNA binding GO:0006379 P:mRNA cleavage GO:0006378 P:mRNA polyadenylation
Pfam	View protein in Pfam PF13299 CPSF100_C PF07521 RMMBL

Amino Acid Sequences

MTEEADEEDESESEDEDAEHQGRALNLSAQMTQQSKRKGGVTGGALSEAELGINILIRGKGVYDYDVRGKRGREKVFPFVAKRIRDDEFGEIIKAEDYLRAEERDEVDGVDMSSRAEAEKKETAVGQKRKWDEIAPASDAKGRKGQQKTQQNKRPKQERSKKDRKPREPDDIDAAIARATGESMPNGGGDATAAAVAASPAADDESEDSDSDEEDEESDYEPSDESGDSQGPRKVTWEERTVEVKCRVSFVDFAGLHEKRDLQMIIPLIRPRKLILIAGTESETTSLADECRRLLGSVDDGADGSEGGADVFAPAINEVIDASVDTNAWSLKLSRELVKRLVWQNVKGLGVVAITGQLGAEPLEDASAALKEDEAQQARKKAKLLKPEEQEKQPQPNQPTSSSPDHSPSDPLPSTPLLDLPPSATAGNLSAASGASGSSGGGGPLTRPVHVGDLRLASLRHLLASAGHLCEFRGEGTLLVDGVVVVRKRAGGRLEVESDVRGLVAAATAAARQKRKVSPGSFFKVRDEVYKGLAVVAGV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.1
2	0.09
3	0.09
4	0.14
5	0.13
6	0.13
7	0.12
8	0.14
9	0.15
10	0.16
11	0.16
12	0.15
13	0.16
14	0.18
15	0.19
16	0.18
17	0.23
18	0.24
19	0.28
20	0.32
21	0.36
22	0.38
23	0.4
24	0.42
25	0.4
26	0.4
27	0.42
28	0.39
29	0.36
30	0.33
31	0.31
32	0.28
33	0.24
34	0.22
35	0.15
36	0.1
37	0.06
38	0.06
39	0.05
40	0.05
41	0.05
42	0.06
43	0.06
44	0.07
45	0.07
46	0.08
47	0.1
48	0.1
49	0.13
50	0.15
51	0.18
52	0.27
53	0.32
54	0.35
55	0.38
56	0.41
57	0.47
58	0.54
59	0.57
60	0.57
61	0.58
62	0.64
63	0.68
64	0.7
65	0.65
66	0.65
67	0.66
68	0.6
69	0.58
70	0.54
71	0.47
72	0.44
73	0.42
74	0.38
75	0.34
76	0.32
77	0.28
78	0.23
79	0.21
80	0.18
81	0.16
82	0.11
83	0.1
84	0.11
85	0.13
86	0.16
87	0.16
88	0.17
89	0.2
90	0.22
91	0.21
92	0.2
93	0.17
94	0.16
95	0.15
96	0.14
97	0.12
98	0.1
99	0.08
100	0.07
101	0.07
102	0.07
103	0.09
104	0.1
105	0.15
106	0.19
107	0.19
108	0.2
109	0.22
110	0.3
111	0.37
112	0.45
113	0.44
114	0.48
115	0.51
116	0.53
117	0.52
118	0.46
119	0.43
120	0.41
121	0.41
122	0.36
123	0.34
124	0.32
125	0.34
126	0.33
127	0.28
128	0.29
129	0.28
130	0.33
131	0.39
132	0.46
133	0.52
134	0.62
135	0.7
136	0.74
137	0.79
138	0.82
139	0.84
140	0.86
141	0.87
142	0.86
143	0.87
144	0.87
145	0.89
146	0.88
147	0.91
148	0.9
149	0.91
150	0.92
151	0.91
152	0.91
153	0.87
154	0.87
155	0.8
156	0.74
157	0.69
158	0.59
159	0.49
160	0.39
161	0.31
162	0.2
163	0.16
164	0.12
165	0.05
166	0.05
167	0.05
168	0.05
169	0.05
170	0.06
171	0.06
172	0.06
173	0.06
174	0.06
175	0.05
176	0.04
177	0.04
178	0.03
179	0.03
180	0.03
181	0.03
182	0.03
183	0.03
184	0.03
185	0.02
186	0.02
187	0.02
188	0.03
189	0.03
190	0.03
191	0.04
192	0.07
193	0.08
194	0.08
195	0.08
196	0.08
197	0.08
198	0.09
199	0.08
200	0.06
201	0.05
202	0.06
203	0.06
204	0.07
205	0.07
206	0.06
207	0.06
208	0.06
209	0.06
210	0.06
211	0.06
212	0.06
213	0.07
214	0.09
215	0.1
216	0.12
217	0.14
218	0.14
219	0.14
220	0.15
221	0.17
222	0.21
223	0.25
224	0.28
225	0.27
226	0.3
227	0.35
228	0.34
229	0.36
230	0.35
231	0.33
232	0.28
233	0.28
234	0.25
235	0.22
236	0.21
237	0.17
238	0.2
239	0.17
240	0.18
241	0.24
242	0.24
243	0.22
244	0.22
245	0.22
246	0.14
247	0.16
248	0.14
249	0.08
250	0.1
251	0.11
252	0.13
253	0.14
254	0.17
255	0.17
256	0.18
257	0.18
258	0.16
259	0.17
260	0.16
261	0.15
262	0.14
263	0.15
264	0.14
265	0.15
266	0.15
267	0.12
268	0.11
269	0.1
270	0.09
271	0.06
272	0.06
273	0.05
274	0.06
275	0.07
276	0.07
277	0.07
278	0.08
279	0.08
280	0.08
281	0.08
282	0.08
283	0.09
284	0.09
285	0.1
286	0.09
287	0.08
288	0.08
289	0.07
290	0.06
291	0.05
292	0.03
293	0.03
294	0.02
295	0.02
296	0.02
297	0.02
298	0.02
299	0.03
300	0.03
301	0.03
302	0.03
303	0.03
304	0.03
305	0.03
306	0.03
307	0.03
308	0.03
309	0.04
310	0.04
311	0.04
312	0.04
313	0.05
314	0.05
315	0.05
316	0.05
317	0.06
318	0.07
319	0.11
320	0.13
321	0.19
322	0.23
323	0.26
324	0.29
325	0.31
326	0.36
327	0.35
328	0.42
329	0.38
330	0.36
331	0.37
332	0.37
333	0.34
334	0.28
335	0.24
336	0.16
337	0.13
338	0.12
339	0.07
340	0.05
341	0.04
342	0.04
343	0.04
344	0.03
345	0.03
346	0.03
347	0.03
348	0.03
349	0.03
350	0.03
351	0.04
352	0.04
353	0.04
354	0.04
355	0.05
356	0.04
357	0.04
358	0.05
359	0.08
360	0.13
361	0.15
362	0.18
363	0.22
364	0.29
365	0.33
366	0.35
367	0.37
368	0.41
369	0.45
370	0.51
371	0.55
372	0.57
373	0.63
374	0.69
375	0.7
376	0.66
377	0.7
378	0.65
379	0.67
380	0.63
381	0.62
382	0.58
383	0.6
384	0.58
385	0.52
386	0.5
387	0.47
388	0.47
389	0.43
390	0.4
391	0.38
392	0.37
393	0.35
394	0.34
395	0.29
396	0.3
397	0.28
398	0.26
399	0.24
400	0.23
401	0.23
402	0.2
403	0.21
404	0.14
405	0.15
406	0.14
407	0.13
408	0.13
409	0.13
410	0.12
411	0.1
412	0.09
413	0.09
414	0.11
415	0.09
416	0.08
417	0.07
418	0.07
419	0.07
420	0.06
421	0.05
422	0.04
423	0.04
424	0.04
425	0.05
426	0.05
427	0.05
428	0.05
429	0.05
430	0.05
431	0.12
432	0.14
433	0.13
434	0.14
435	0.16
436	0.22
437	0.23
438	0.24
439	0.21
440	0.22
441	0.23
442	0.24
443	0.22
444	0.17
445	0.19
446	0.18
447	0.15
448	0.13
449	0.12
450	0.11
451	0.15
452	0.17
453	0.15
454	0.16
455	0.15
456	0.15
457	0.16
458	0.16
459	0.12
460	0.12
461	0.11
462	0.1
463	0.11
464	0.12
465	0.11
466	0.1
467	0.09
468	0.06
469	0.07
470	0.11
471	0.1
472	0.1
473	0.11
474	0.14
475	0.15
476	0.2
477	0.22
478	0.23
479	0.27
480	0.32
481	0.35
482	0.34
483	0.34
484	0.3
485	0.27
486	0.22
487	0.18
488	0.12
489	0.08
490	0.06
491	0.06
492	0.05
493	0.05
494	0.05
495	0.07
496	0.12
497	0.18
498	0.21
499	0.25
500	0.33
501	0.39
502	0.47
503	0.55
504	0.56
505	0.6
506	0.67
507	0.72
508	0.72
509	0.67
510	0.64
511	0.6
512	0.56
513	0.52
514	0.48
515	0.41
516	0.38
517	0.38
518	0.34
519	0.27

A0A3M6YTR0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer