Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3M6YDC0

Protein Details
Accession A0A3M6YDC0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
39-61EDEFRVLKTTKRKPERYDCTTCDHydrophilic
265-290QKTIEKYCKPCPKCGKKIEKNGGCDAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
178-200RTKKDEKAKGKEPQTKRPSKAKK
Subcellular Location(s) mito 12, nucl 11, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031127  E3_UB_ligase_RBR  
IPR002867  IBR_dom  
IPR044066  TRIAD_supradom  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0004842  F:ubiquitin-protein transferase activity  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
Pfam View protein in Pfam  
PF01485  IBR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51873  TRIAD  
CDD cd20335  BRcat_RBR  
Amino Acid Sequences MAPSAATRNHAVAAQPQPLRRSARLQTAAVAAQAPPKPEDEFRVLKTTKRKPERYDCTTCDRNLSASSFPKYLPTDNCKHLINTCKACTKTHIAVMMDSVTYDKLACPECPELLTNADVKRQAAKDVYKRYDELERRGISEKVPGWRWCLNPECRGGQVHESLLTQEDPPKQDSATARTKKDEKAKGKEPQTKRPSKAKKIVRLFVDLTSANPPVDEKDQKDIFTCKTCGHRACVPCDRPFHNGETCIQYKQRLGQAEANSEKSQKTIEKYCKPCPKCGKKIEKNGGCDAMICPCGERFCWLCLVPYATINATGHDKECRYAAGNNRFDPHAGPGAPGQAALW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.36
3 0.39
4 0.4
5 0.45
6 0.5
7 0.46
8 0.48
9 0.46
10 0.52
11 0.54
12 0.52
13 0.49
14 0.46
15 0.43
16 0.35
17 0.3
18 0.2
19 0.21
20 0.22
21 0.22
22 0.19
23 0.21
24 0.23
25 0.24
26 0.29
27 0.3
28 0.33
29 0.34
30 0.42
31 0.41
32 0.44
33 0.52
34 0.57
35 0.6
36 0.66
37 0.71
38 0.71
39 0.81
40 0.85
41 0.84
42 0.83
43 0.77
44 0.75
45 0.73
46 0.64
47 0.58
48 0.49
49 0.43
50 0.36
51 0.34
52 0.31
53 0.31
54 0.33
55 0.29
56 0.28
57 0.31
58 0.31
59 0.34
60 0.35
61 0.37
62 0.4
63 0.43
64 0.46
65 0.42
66 0.41
67 0.41
68 0.42
69 0.43
70 0.43
71 0.43
72 0.47
73 0.47
74 0.47
75 0.47
76 0.45
77 0.4
78 0.37
79 0.38
80 0.32
81 0.3
82 0.3
83 0.26
84 0.19
85 0.15
86 0.12
87 0.07
88 0.07
89 0.07
90 0.06
91 0.08
92 0.1
93 0.11
94 0.14
95 0.16
96 0.16
97 0.17
98 0.17
99 0.16
100 0.15
101 0.16
102 0.16
103 0.15
104 0.17
105 0.17
106 0.17
107 0.21
108 0.2
109 0.21
110 0.22
111 0.27
112 0.33
113 0.41
114 0.44
115 0.41
116 0.41
117 0.41
118 0.45
119 0.43
120 0.4
121 0.39
122 0.36
123 0.37
124 0.39
125 0.37
126 0.28
127 0.3
128 0.27
129 0.24
130 0.29
131 0.27
132 0.29
133 0.33
134 0.33
135 0.33
136 0.37
137 0.37
138 0.35
139 0.37
140 0.34
141 0.31
142 0.31
143 0.28
144 0.23
145 0.2
146 0.17
147 0.15
148 0.13
149 0.12
150 0.12
151 0.11
152 0.09
153 0.12
154 0.14
155 0.14
156 0.15
157 0.16
158 0.15
159 0.18
160 0.19
161 0.21
162 0.28
163 0.32
164 0.32
165 0.35
166 0.39
167 0.4
168 0.48
169 0.51
170 0.5
171 0.53
172 0.59
173 0.63
174 0.69
175 0.74
176 0.7
177 0.71
178 0.73
179 0.74
180 0.71
181 0.74
182 0.74
183 0.74
184 0.78
185 0.76
186 0.76
187 0.75
188 0.75
189 0.67
190 0.62
191 0.55
192 0.46
193 0.4
194 0.3
195 0.24
196 0.21
197 0.19
198 0.14
199 0.12
200 0.12
201 0.11
202 0.16
203 0.19
204 0.18
205 0.25
206 0.27
207 0.28
208 0.3
209 0.3
210 0.28
211 0.29
212 0.29
213 0.24
214 0.28
215 0.34
216 0.34
217 0.36
218 0.39
219 0.38
220 0.44
221 0.51
222 0.49
223 0.48
224 0.51
225 0.5
226 0.47
227 0.46
228 0.44
229 0.38
230 0.35
231 0.32
232 0.34
233 0.32
234 0.32
235 0.3
236 0.28
237 0.27
238 0.3
239 0.33
240 0.29
241 0.32
242 0.35
243 0.37
244 0.42
245 0.43
246 0.43
247 0.39
248 0.37
249 0.33
250 0.27
251 0.27
252 0.24
253 0.26
254 0.31
255 0.4
256 0.48
257 0.55
258 0.65
259 0.72
260 0.71
261 0.75
262 0.77
263 0.78
264 0.78
265 0.82
266 0.83
267 0.83
268 0.91
269 0.92
270 0.87
271 0.82
272 0.77
273 0.7
274 0.58
275 0.49
276 0.39
277 0.32
278 0.26
279 0.21
280 0.16
281 0.15
282 0.16
283 0.15
284 0.19
285 0.17
286 0.18
287 0.22
288 0.22
289 0.22
290 0.24
291 0.27
292 0.23
293 0.22
294 0.23
295 0.19
296 0.22
297 0.2
298 0.19
299 0.2
300 0.21
301 0.21
302 0.25
303 0.25
304 0.23
305 0.24
306 0.25
307 0.24
308 0.29
309 0.37
310 0.42
311 0.48
312 0.49
313 0.51
314 0.5
315 0.47
316 0.43
317 0.38
318 0.34
319 0.28
320 0.26
321 0.25
322 0.27
323 0.26