Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3N2PYK9

Protein Details
Accession A0A3N2PYK9    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
108-173AGSGRLREVKPKRPKPPTGEETPDKKPWKKYKPSESPESEARCGKAKTGQRKDKTRKASEVRSHYFHydrophilic
298-322GTDTSPIKKAPKKKKKPRTITELATHydrophilic
353-378AGAKATKKPGRKPTRRKNGKAAPPEPBasic
712-736TAPQPAAKRPRGRPRKDSTASKKAHHydrophilic
769-793VQPATPTRPKRRTASSRCKTQKPAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
99-164PGTKKGRRKAGSGRLREVKPKRPKPPTGEETPDKKPWKKYKPSESPESEARCGKAKTGQRKDKTRK
304-315IKKAPKKKKKPR
356-374KATKKPGRKPTRRKNGKAA
716-752PAAKRPRGRPRKDSTASKKAHDATKPKPGTKAGREAK
Subcellular Location(s) nucl 26, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
IPR027784  Slx4_ascomycetes  
IPR018574  Structure-sp_endonuc_su_Slx4  
Gene Ontology GO:0033557  C:Slx1-Slx4 complex  
GO:0017108  F:5'-flap endonuclease activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
GO:0006996  P:organelle organization  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF09494  Slx4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
CDD cd22999  SAP_SLX4  
Amino Acid Sequences MATPFKPPPLPPSRHDDSSSPFPTLDEIRFGITKPSRKHEEFARSSSHHTPVPTTHAASFLTTKQTPIDLVTPARLLPTEPIDDDYEEDPVQVIRIPAPGTKKGRRKAGSGRLREVKPKRPKPPTGEETPDKKPWKKYKPSESPESEARCGKAKTGQRKDKTRKASEVRSHYFPTVKPNKSKESNESNGDQSEVPAPQIADADAPLELPPASKRRLDWTPPPADKLINLDPASSDIRELVSSTAKHPSNDASKEVFGHFLAKYGREEEQIEAAVVGSLEGIPEIFKKRKQPELAVPEGTDTSPIKKAPKKKKKPRTITELATAAYARPDESEQEPPTASILDYVQQQANAGDAGAKATKKPGRKPTRRKNGKAAPPEPVLLSPNAAIREVAKQDFVFGTSSQLAREQSPTVLRDLQTALRLSNEEACEDGDPFVIPIHSDPFEPEQRRRKLWEVGARDEDGGLLDLEVINLVDTPLAKVPLPEDDPFGYVGDAKRVMSLRRERSLSVHDESFPDVDVLLKDASAGRREEGVSGEKAVPSASSFRSSFLVPRDLSRPSATVMTTTTIATTSAGSGTKQLCTPPYSGQTAGASQTSTLAPAAAQKLDTSSSHPGPSTTQTTSAAAGPGVPPKPKYELYTDSQLSREITSYGFKPVKRRAAMLALLDQCWESKHTRARAALSPLPSNRSLSTTSQKQQQQQQHKGAGATEPTKATAPQPAAKRPRGRPRKDSTASKKAHDATKPKPGTKAGREAKAPASETTTAKTATVEPVQPATPTRPKRRTASSRCKTQKPAAEVIEIPDSASDSSAALTCSPDGSFSSPPGVEIVSLSLDEETETSLVPPVSSAAAAADQQQSGLMRHITRAIRDAPPSKDPSRPSWHEKMLMYDPVILEDLAAWLNSGQLTGVGYDGEVSAWEVKQWCESKSVCCLWRVNVSGKERKRF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.59
3 0.54
4 0.51
5 0.55
6 0.54
7 0.48
8 0.4
9 0.35
10 0.36
11 0.36
12 0.3
13 0.24
14 0.22
15 0.24
16 0.24
17 0.25
18 0.31
19 0.33
20 0.4
21 0.42
22 0.5
23 0.56
24 0.59
25 0.63
26 0.63
27 0.67
28 0.65
29 0.63
30 0.63
31 0.56
32 0.59
33 0.6
34 0.55
35 0.47
36 0.42
37 0.41
38 0.36
39 0.41
40 0.39
41 0.36
42 0.33
43 0.32
44 0.31
45 0.3
46 0.29
47 0.24
48 0.28
49 0.25
50 0.26
51 0.25
52 0.25
53 0.23
54 0.23
55 0.23
56 0.2
57 0.21
58 0.23
59 0.22
60 0.21
61 0.21
62 0.18
63 0.17
64 0.16
65 0.19
66 0.19
67 0.19
68 0.22
69 0.23
70 0.24
71 0.25
72 0.23
73 0.21
74 0.18
75 0.17
76 0.15
77 0.12
78 0.12
79 0.11
80 0.11
81 0.09
82 0.12
83 0.14
84 0.17
85 0.23
86 0.31
87 0.38
88 0.47
89 0.55
90 0.6
91 0.69
92 0.69
93 0.71
94 0.73
95 0.75
96 0.76
97 0.74
98 0.76
99 0.74
100 0.74
101 0.77
102 0.74
103 0.74
104 0.75
105 0.77
106 0.79
107 0.8
108 0.85
109 0.84
110 0.86
111 0.83
112 0.8
113 0.79
114 0.76
115 0.73
116 0.7
117 0.71
118 0.68
119 0.67
120 0.69
121 0.71
122 0.74
123 0.78
124 0.82
125 0.84
126 0.87
127 0.89
128 0.88
129 0.84
130 0.79
131 0.76
132 0.72
133 0.64
134 0.56
135 0.5
136 0.47
137 0.41
138 0.38
139 0.38
140 0.4
141 0.47
142 0.55
143 0.64
144 0.67
145 0.77
146 0.85
147 0.86
148 0.88
149 0.85
150 0.84
151 0.82
152 0.84
153 0.82
154 0.82
155 0.78
156 0.73
157 0.68
158 0.61
159 0.56
160 0.47
161 0.49
162 0.49
163 0.5
164 0.53
165 0.56
166 0.61
167 0.66
168 0.7
169 0.68
170 0.67
171 0.66
172 0.62
173 0.59
174 0.53
175 0.46
176 0.42
177 0.33
178 0.25
179 0.22
180 0.17
181 0.15
182 0.13
183 0.13
184 0.11
185 0.12
186 0.11
187 0.08
188 0.08
189 0.08
190 0.06
191 0.07
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.07
196 0.11
197 0.15
198 0.18
199 0.2
200 0.21
201 0.27
202 0.35
203 0.41
204 0.46
205 0.5
206 0.57
207 0.57
208 0.59
209 0.54
210 0.47
211 0.42
212 0.39
213 0.34
214 0.31
215 0.29
216 0.26
217 0.24
218 0.26
219 0.28
220 0.21
221 0.17
222 0.11
223 0.11
224 0.11
225 0.12
226 0.1
227 0.13
228 0.13
229 0.15
230 0.22
231 0.23
232 0.24
233 0.24
234 0.28
235 0.31
236 0.33
237 0.35
238 0.3
239 0.29
240 0.3
241 0.3
242 0.26
243 0.18
244 0.19
245 0.15
246 0.16
247 0.17
248 0.17
249 0.17
250 0.18
251 0.2
252 0.19
253 0.2
254 0.18
255 0.18
256 0.17
257 0.15
258 0.13
259 0.11
260 0.09
261 0.07
262 0.06
263 0.04
264 0.03
265 0.03
266 0.03
267 0.03
268 0.03
269 0.06
270 0.11
271 0.15
272 0.18
273 0.27
274 0.33
275 0.42
276 0.47
277 0.51
278 0.55
279 0.6
280 0.61
281 0.54
282 0.48
283 0.41
284 0.37
285 0.3
286 0.23
287 0.16
288 0.14
289 0.15
290 0.17
291 0.23
292 0.28
293 0.39
294 0.48
295 0.59
296 0.67
297 0.76
298 0.85
299 0.89
300 0.93
301 0.92
302 0.9
303 0.87
304 0.79
305 0.73
306 0.65
307 0.54
308 0.43
309 0.35
310 0.25
311 0.18
312 0.14
313 0.08
314 0.07
315 0.08
316 0.1
317 0.12
318 0.19
319 0.19
320 0.2
321 0.2
322 0.19
323 0.19
324 0.17
325 0.14
326 0.09
327 0.08
328 0.08
329 0.09
330 0.11
331 0.11
332 0.1
333 0.11
334 0.1
335 0.1
336 0.08
337 0.07
338 0.05
339 0.05
340 0.06
341 0.08
342 0.08
343 0.08
344 0.15
345 0.19
346 0.24
347 0.33
348 0.42
349 0.52
350 0.63
351 0.74
352 0.78
353 0.85
354 0.9
355 0.88
356 0.88
357 0.86
358 0.84
359 0.83
360 0.75
361 0.69
362 0.6
363 0.55
364 0.44
365 0.36
366 0.28
367 0.18
368 0.16
369 0.11
370 0.12
371 0.11
372 0.11
373 0.1
374 0.09
375 0.13
376 0.14
377 0.14
378 0.13
379 0.12
380 0.13
381 0.13
382 0.13
383 0.11
384 0.09
385 0.11
386 0.11
387 0.12
388 0.11
389 0.13
390 0.13
391 0.12
392 0.14
393 0.12
394 0.13
395 0.15
396 0.16
397 0.16
398 0.18
399 0.17
400 0.17
401 0.17
402 0.17
403 0.17
404 0.17
405 0.14
406 0.13
407 0.13
408 0.12
409 0.14
410 0.13
411 0.11
412 0.11
413 0.11
414 0.11
415 0.11
416 0.1
417 0.06
418 0.06
419 0.06
420 0.06
421 0.05
422 0.04
423 0.05
424 0.07
425 0.07
426 0.07
427 0.09
428 0.12
429 0.19
430 0.22
431 0.29
432 0.36
433 0.4
434 0.42
435 0.45
436 0.46
437 0.45
438 0.48
439 0.49
440 0.45
441 0.45
442 0.45
443 0.41
444 0.37
445 0.31
446 0.24
447 0.16
448 0.11
449 0.07
450 0.04
451 0.03
452 0.03
453 0.03
454 0.03
455 0.03
456 0.02
457 0.02
458 0.02
459 0.03
460 0.03
461 0.04
462 0.04
463 0.05
464 0.05
465 0.05
466 0.06
467 0.09
468 0.12
469 0.11
470 0.13
471 0.12
472 0.13
473 0.14
474 0.13
475 0.1
476 0.09
477 0.09
478 0.09
479 0.09
480 0.08
481 0.1
482 0.11
483 0.12
484 0.18
485 0.26
486 0.29
487 0.33
488 0.34
489 0.33
490 0.34
491 0.38
492 0.35
493 0.3
494 0.25
495 0.22
496 0.22
497 0.22
498 0.19
499 0.15
500 0.1
501 0.08
502 0.07
503 0.06
504 0.07
505 0.06
506 0.05
507 0.05
508 0.07
509 0.08
510 0.1
511 0.11
512 0.1
513 0.11
514 0.12
515 0.12
516 0.13
517 0.14
518 0.12
519 0.13
520 0.14
521 0.12
522 0.12
523 0.11
524 0.09
525 0.08
526 0.1
527 0.09
528 0.12
529 0.12
530 0.14
531 0.15
532 0.15
533 0.17
534 0.17
535 0.22
536 0.18
537 0.2
538 0.22
539 0.22
540 0.24
541 0.22
542 0.2
543 0.16
544 0.17
545 0.15
546 0.13
547 0.13
548 0.12
549 0.11
550 0.11
551 0.09
552 0.08
553 0.08
554 0.08
555 0.07
556 0.06
557 0.06
558 0.07
559 0.07
560 0.1
561 0.11
562 0.11
563 0.12
564 0.13
565 0.14
566 0.16
567 0.18
568 0.18
569 0.2
570 0.22
571 0.21
572 0.22
573 0.21
574 0.19
575 0.18
576 0.15
577 0.11
578 0.09
579 0.1
580 0.08
581 0.08
582 0.07
583 0.06
584 0.05
585 0.08
586 0.1
587 0.09
588 0.09
589 0.08
590 0.09
591 0.11
592 0.12
593 0.13
594 0.17
595 0.18
596 0.19
597 0.19
598 0.19
599 0.2
600 0.23
601 0.23
602 0.19
603 0.19
604 0.2
605 0.21
606 0.21
607 0.19
608 0.16
609 0.11
610 0.11
611 0.1
612 0.13
613 0.14
614 0.15
615 0.15
616 0.17
617 0.22
618 0.24
619 0.26
620 0.27
621 0.3
622 0.33
623 0.39
624 0.38
625 0.35
626 0.33
627 0.32
628 0.27
629 0.23
630 0.19
631 0.12
632 0.12
633 0.13
634 0.13
635 0.19
636 0.22
637 0.23
638 0.3
639 0.38
640 0.45
641 0.45
642 0.46
643 0.42
644 0.43
645 0.44
646 0.38
647 0.37
648 0.29
649 0.28
650 0.26
651 0.23
652 0.17
653 0.15
654 0.16
655 0.12
656 0.17
657 0.24
658 0.29
659 0.34
660 0.37
661 0.4
662 0.43
663 0.48
664 0.46
665 0.42
666 0.42
667 0.39
668 0.4
669 0.37
670 0.33
671 0.27
672 0.26
673 0.26
674 0.25
675 0.31
676 0.35
677 0.38
678 0.44
679 0.48
680 0.51
681 0.57
682 0.61
683 0.65
684 0.66
685 0.7
686 0.66
687 0.62
688 0.57
689 0.49
690 0.42
691 0.36
692 0.28
693 0.23
694 0.19
695 0.18
696 0.18
697 0.18
698 0.17
699 0.18
700 0.21
701 0.24
702 0.29
703 0.38
704 0.45
705 0.52
706 0.6
707 0.64
708 0.71
709 0.76
710 0.79
711 0.8
712 0.8
713 0.83
714 0.82
715 0.84
716 0.82
717 0.82
718 0.77
719 0.7
720 0.68
721 0.62
722 0.61
723 0.57
724 0.55
725 0.51
726 0.59
727 0.62
728 0.57
729 0.57
730 0.58
731 0.6
732 0.58
733 0.63
734 0.59
735 0.59
736 0.58
737 0.57
738 0.55
739 0.5
740 0.46
741 0.36
742 0.34
743 0.32
744 0.31
745 0.3
746 0.27
747 0.22
748 0.2
749 0.2
750 0.17
751 0.18
752 0.21
753 0.2
754 0.2
755 0.21
756 0.22
757 0.21
758 0.22
759 0.25
760 0.31
761 0.39
762 0.48
763 0.53
764 0.59
765 0.65
766 0.73
767 0.77
768 0.79
769 0.81
770 0.79
771 0.82
772 0.84
773 0.85
774 0.82
775 0.79
776 0.76
777 0.72
778 0.71
779 0.62
780 0.58
781 0.5
782 0.46
783 0.41
784 0.32
785 0.26
786 0.18
787 0.16
788 0.13
789 0.12
790 0.1
791 0.06
792 0.07
793 0.08
794 0.09
795 0.08
796 0.09
797 0.09
798 0.1
799 0.1
800 0.1
801 0.11
802 0.14
803 0.15
804 0.16
805 0.2
806 0.19
807 0.19
808 0.19
809 0.17
810 0.13
811 0.12
812 0.12
813 0.09
814 0.09
815 0.09
816 0.08
817 0.08
818 0.08
819 0.07
820 0.07
821 0.07
822 0.07
823 0.07
824 0.1
825 0.1
826 0.09
827 0.09
828 0.09
829 0.09
830 0.09
831 0.09
832 0.07
833 0.08
834 0.09
835 0.12
836 0.13
837 0.12
838 0.12
839 0.14
840 0.14
841 0.14
842 0.17
843 0.18
844 0.16
845 0.18
846 0.25
847 0.27
848 0.28
849 0.31
850 0.33
851 0.34
852 0.41
853 0.45
854 0.44
855 0.48
856 0.53
857 0.52
858 0.54
859 0.53
860 0.54
861 0.58
862 0.6
863 0.61
864 0.63
865 0.66
866 0.65
867 0.62
868 0.6
869 0.56
870 0.53
871 0.46
872 0.4
873 0.34
874 0.29
875 0.29
876 0.21
877 0.16
878 0.12
879 0.11
880 0.09
881 0.08
882 0.07
883 0.06
884 0.07
885 0.07
886 0.07
887 0.06
888 0.06
889 0.07
890 0.07
891 0.07
892 0.06
893 0.06
894 0.06
895 0.06
896 0.06
897 0.06
898 0.07
899 0.1
900 0.1
901 0.13
902 0.14
903 0.15
904 0.23
905 0.26
906 0.26
907 0.29
908 0.31
909 0.33
910 0.4
911 0.47
912 0.42
913 0.44
914 0.46
915 0.45
916 0.51
917 0.51
918 0.5
919 0.51
920 0.57
921 0.62