FuNGI

A0A3N2Q5B9

Protein Details

Accession

A0A3N2Q5B9

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
21-64	STNPAAPPRPPPIRRRPRTADPLVARKRPQPKNNNNATRPNVKP	Hydrophilic
593-618	SESSETEPSRKKKQKKATGTSVQPSR	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
27-54	PPRPPPIRRRPRTADPLVARKRPQPKNN
243-252	NAAPKAKQPK
569-588	SGKHKQTEALKKGKSLKRPG
601-608	SRKKKQKK

Subcellular Location(s)

nucl 20, cyto_nucl 14, cyto 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSAPPSGPPNGQAPNPNPTSSTNPAAPPRPPPIRRRPRTADPLVARKRPQPKNNNNATRPNVKPVPGASGAARPPQPPGRAAAAATATATATATSSAATSVDPTTSLLSSIAGHRSKTAANGGWSEPLPPGGREWKIVTSKRNLSEGLRYHAMRFSTSKMGPEKKPVDPTNKDDFTRPVTLQRRDPRQPAPGREPKEAELPPDPEPAPEDEKEVERIAKIKAEKEAWRAMEAAKSAPAIKDPNAAPKAKQPKPEERSVQFHRAPRTEQERKQRELRYEESLPWHLEDADGKNVWVGSYVAPLSETTVCLVATNDGKFAMVPLEKWYKFTAKPNFTTMKLEEAEALMKKQAGVSRWYMQDKEKERQQKEMEDTRQYFRGPARVKTESTTFRGVSREELFDHDQLDYEGDEFQDDDENPGFEADQDEDQKHAVDRIRREQLGANLFGDADEGKVDKEELESRLEEEARRREGKEMTKALIKREKETIYKSDSDSGYDPFETSSEKKKSEDDSDDEKEKGDKTDKQGDEVKKDDEKPGGSQEPPTSSKQETKAAKDKGVSTPGAPKGSLTPSGKHKQTEALKKGKSLKRPGSPDLSESSETEPSRKKKQKKATGTSVQPSRSGTPLPPGAAAGQKPRSGLTSTSDGEATGGEMSDGQQQKKKKLKLVSGGPKATPTGSRAGSPAPATSAASPPASGSRAGSPTNAGPIEAWELIQALPPLPGGITAGELQRIFHGRIGAGPSQTSRADWIQLVKQHGVMGQDRLIRRRE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.44
2	0.46
3	0.44
4	0.4
5	0.4
6	0.44
7	0.42
8	0.43
9	0.39
10	0.41
11	0.47
12	0.5
13	0.49
14	0.48
15	0.52
16	0.57
17	0.6
18	0.64
19	0.69
20	0.75
21	0.8
22	0.83
23	0.83
24	0.83
25	0.86
26	0.83
27	0.82
28	0.79
29	0.82
30	0.81
31	0.79
32	0.73
33	0.71
34	0.74
35	0.75
36	0.77
37	0.77
38	0.79
39	0.82
40	0.9
41	0.92
42	0.88
43	0.87
44	0.83
45	0.81
46	0.73
47	0.71
48	0.65
49	0.57
50	0.54
51	0.46
52	0.46
53	0.39
54	0.38
55	0.31
56	0.32
57	0.32
58	0.34
59	0.35
60	0.29
61	0.33
62	0.39
63	0.39
64	0.34
65	0.36
66	0.36
67	0.35
68	0.34
69	0.32
70	0.26
71	0.23
72	0.22
73	0.18
74	0.12
75	0.11
76	0.1
77	0.07
78	0.06
79	0.06
80	0.06
81	0.06
82	0.06
83	0.06
84	0.06
85	0.06
86	0.08
87	0.08
88	0.08
89	0.09
90	0.1
91	0.11
92	0.11
93	0.12
94	0.1
95	0.1
96	0.11
97	0.13
98	0.2
99	0.2
100	0.2
101	0.21
102	0.23
103	0.23
104	0.24
105	0.27
106	0.23
107	0.24
108	0.27
109	0.27
110	0.28
111	0.27
112	0.25
113	0.2
114	0.2
115	0.19
116	0.16
117	0.19
118	0.23
119	0.24
120	0.26
121	0.29
122	0.33
123	0.4
124	0.44
125	0.47
126	0.48
127	0.54
128	0.55
129	0.55
130	0.5
131	0.44
132	0.48
133	0.45
134	0.43
135	0.41
136	0.38
137	0.36
138	0.38
139	0.35
140	0.3
141	0.28
142	0.26
143	0.28
144	0.28
145	0.32
146	0.37
147	0.43
148	0.43
149	0.51
150	0.52
151	0.5
152	0.58
153	0.58
154	0.6
155	0.59
156	0.63
157	0.63
158	0.62
159	0.58
160	0.51
161	0.49
162	0.45
163	0.44
164	0.38
165	0.38
166	0.42
167	0.46
168	0.52
169	0.58
170	0.61
171	0.63
172	0.68
173	0.64
174	0.66
175	0.68
176	0.67
177	0.68
178	0.68
179	0.67
180	0.66
181	0.63
182	0.55
183	0.55
184	0.48
185	0.42
186	0.38
187	0.36
188	0.33
189	0.34
190	0.32
191	0.25
192	0.26
193	0.25
194	0.25
195	0.22
196	0.22
197	0.2
198	0.21
199	0.23
200	0.23
201	0.2
202	0.16
203	0.18
204	0.16
205	0.2
206	0.2
207	0.21
208	0.24
209	0.28
210	0.32
211	0.34
212	0.39
213	0.35
214	0.34
215	0.32
216	0.28
217	0.26
218	0.23
219	0.19
220	0.14
221	0.13
222	0.13
223	0.12
224	0.14
225	0.14
226	0.14
227	0.19
228	0.18
229	0.27
230	0.3
231	0.31
232	0.3
233	0.36
234	0.45
235	0.44
236	0.52
237	0.5
238	0.56
239	0.61
240	0.68
241	0.67
242	0.62
243	0.65
244	0.63
245	0.65
246	0.59
247	0.58
248	0.56
249	0.52
250	0.49
251	0.48
252	0.52
253	0.52
254	0.54
255	0.6
256	0.61
257	0.63
258	0.69
259	0.67
260	0.63
261	0.61
262	0.57
263	0.53
264	0.48
265	0.46
266	0.42
267	0.4
268	0.34
269	0.28
270	0.25
271	0.18
272	0.16
273	0.16
274	0.14
275	0.15
276	0.14
277	0.13
278	0.13
279	0.13
280	0.12
281	0.11
282	0.09
283	0.06
284	0.07
285	0.07
286	0.07
287	0.07
288	0.07
289	0.09
290	0.09
291	0.08
292	0.07
293	0.08
294	0.08
295	0.07
296	0.08
297	0.08
298	0.1
299	0.1
300	0.09
301	0.09
302	0.09
303	0.08
304	0.09
305	0.09
306	0.07
307	0.07
308	0.12
309	0.19
310	0.19
311	0.21
312	0.23
313	0.24
314	0.27
315	0.35
316	0.4
317	0.38
318	0.41
319	0.44
320	0.45
321	0.43
322	0.44
323	0.36
324	0.31
325	0.26
326	0.24
327	0.19
328	0.16
329	0.17
330	0.13
331	0.13
332	0.09
333	0.08
334	0.08
335	0.09
336	0.11
337	0.11
338	0.13
339	0.16
340	0.2
341	0.23
342	0.25
343	0.25
344	0.26
345	0.32
346	0.34
347	0.36
348	0.39
349	0.45
350	0.44
351	0.5
352	0.5
353	0.48
354	0.49
355	0.52
356	0.5
357	0.47
358	0.48
359	0.42
360	0.41
361	0.36
362	0.32
363	0.24
364	0.29
365	0.25
366	0.27
367	0.31
368	0.31
369	0.32
370	0.31
371	0.36
372	0.31
373	0.32
374	0.31
375	0.25
376	0.24
377	0.25
378	0.23
379	0.22
380	0.2
381	0.18
382	0.15
383	0.18
384	0.19
385	0.18
386	0.19
387	0.15
388	0.13
389	0.12
390	0.12
391	0.08
392	0.06
393	0.06
394	0.05
395	0.05
396	0.05
397	0.05
398	0.06
399	0.06
400	0.08
401	0.08
402	0.08
403	0.08
404	0.08
405	0.07
406	0.06
407	0.07
408	0.06
409	0.08
410	0.09
411	0.1
412	0.1
413	0.1
414	0.11
415	0.1
416	0.12
417	0.13
418	0.17
419	0.21
420	0.28
421	0.33
422	0.33
423	0.34
424	0.33
425	0.35
426	0.34
427	0.31
428	0.24
429	0.18
430	0.18
431	0.16
432	0.14
433	0.09
434	0.05
435	0.04
436	0.04
437	0.04
438	0.04
439	0.05
440	0.05
441	0.06
442	0.09
443	0.1
444	0.12
445	0.13
446	0.14
447	0.16
448	0.16
449	0.16
450	0.19
451	0.23
452	0.26
453	0.28
454	0.28
455	0.3
456	0.35
457	0.4
458	0.42
459	0.4
460	0.37
461	0.4
462	0.41
463	0.44
464	0.45
465	0.4
466	0.34
467	0.37
468	0.39
469	0.37
470	0.41
471	0.39
472	0.36
473	0.38
474	0.36
475	0.36
476	0.32
477	0.3
478	0.27
479	0.24
480	0.21
481	0.18
482	0.17
483	0.12
484	0.12
485	0.13
486	0.14
487	0.21
488	0.24
489	0.26
490	0.27
491	0.3
492	0.35
493	0.38
494	0.41
495	0.37
496	0.4
497	0.44
498	0.45
499	0.41
500	0.37
501	0.33
502	0.28
503	0.27
504	0.25
505	0.25
506	0.29
507	0.39
508	0.38
509	0.41
510	0.48
511	0.48
512	0.48
513	0.46
514	0.44
515	0.38
516	0.4
517	0.39
518	0.35
519	0.32
520	0.29
521	0.32
522	0.31
523	0.27
524	0.29
525	0.28
526	0.3
527	0.32
528	0.33
529	0.3
530	0.3
531	0.35
532	0.35
533	0.41
534	0.4
535	0.44
536	0.51
537	0.5
538	0.5
539	0.47
540	0.47
541	0.44
542	0.44
543	0.37
544	0.29
545	0.34
546	0.35
547	0.34
548	0.3
549	0.25
550	0.25
551	0.27
552	0.33
553	0.27
554	0.27
555	0.34
556	0.42
557	0.45
558	0.42
559	0.41
560	0.42
561	0.49
562	0.55
563	0.55
564	0.57
565	0.55
566	0.59
567	0.68
568	0.66
569	0.66
570	0.65
571	0.66
572	0.66
573	0.71
574	0.7
575	0.68
576	0.64
577	0.57
578	0.51
579	0.46
580	0.39
581	0.34
582	0.32
583	0.29
584	0.28
585	0.3
586	0.35
587	0.36
588	0.45
589	0.53
590	0.6
591	0.64
592	0.75
593	0.81
594	0.84
595	0.88
596	0.87
597	0.87
598	0.85
599	0.83
600	0.79
601	0.7
602	0.61
603	0.54
604	0.46
605	0.38
606	0.33
607	0.26
608	0.26
609	0.27
610	0.26
611	0.24
612	0.22
613	0.22
614	0.24
615	0.25
616	0.26
617	0.27
618	0.27
619	0.28
620	0.28
621	0.29
622	0.27
623	0.26
624	0.23
625	0.25
626	0.25
627	0.25
628	0.25
629	0.22
630	0.2
631	0.18
632	0.14
633	0.08
634	0.07
635	0.05
636	0.05
637	0.07
638	0.14
639	0.18
640	0.21
641	0.25
642	0.3
643	0.4
644	0.5
645	0.55
646	0.56
647	0.61
648	0.66
649	0.71
650	0.77
651	0.78
652	0.78
653	0.75
654	0.68
655	0.61
656	0.53
657	0.45
658	0.37
659	0.29
660	0.26
661	0.23
662	0.24
663	0.24
664	0.24
665	0.26
666	0.25
667	0.23
668	0.19
669	0.19
670	0.19
671	0.19
672	0.2
673	0.19
674	0.19
675	0.18
676	0.17
677	0.19
678	0.18
679	0.17
680	0.17
681	0.19
682	0.23
683	0.24
684	0.23
685	0.23
686	0.23
687	0.29
688	0.26
689	0.21
690	0.18
691	0.19
692	0.22
693	0.19
694	0.18
695	0.12
696	0.13
697	0.13
698	0.15
699	0.14
700	0.1
701	0.1
702	0.1
703	0.1
704	0.09
705	0.09
706	0.07
707	0.07
708	0.09
709	0.1
710	0.11
711	0.14
712	0.14
713	0.15
714	0.18
715	0.21
716	0.21
717	0.21
718	0.23
719	0.2
720	0.23
721	0.28
722	0.27
723	0.25
724	0.26
725	0.25
726	0.27
727	0.28
728	0.25
729	0.24
730	0.23
731	0.24
732	0.25
733	0.28
734	0.31
735	0.35
736	0.39
737	0.36
738	0.35
739	0.33
740	0.33
741	0.32
742	0.29
743	0.27
744	0.27
745	0.32
746	0.35

A0A3N2Q5B9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer