FuNGI

A0A3N2Q9Y5

Protein Details

Accession

A0A3N2Q9Y5

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
138-159	EFSIYKKIPGPKKRTDPRQGTI	Hydrophilic
243-263	TDDVKKPKKEKESKTNKVAER	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
212-271	EKKANKAKEAAAAKISKHSRQESQGGKNKSATDDVKKPKKEKESKTNKVAERPKETVKIL
273-273	K
421-429	RSRRGGGGK
627-635	RSRRGRGGG

Subcellular Location(s)

nucl 15.5, mito 10, cyto_nucl 9

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1 PF03467 Smg4_UPF3
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3

Amino Acid Sequences

MQDRTLPRKANGVLPITASQTAGNTQSSNATKSAKVKTPIEGDKLLIRRLPPGLTEEEFWNILGPQWRPGKGLVDWFDFRAGKVSQDPAKTSKPARVYLHVKKRDSLTELSEIVQTKGWEDAKLTYNNTCLIGPPALEFSIYKKIPGPKKRTDPRQGTIDQDPEFMAFLHSLTNPEPEKETAPIDDKAAAVAEESKSETKVMTTPLIEYLKEKKANKAKEAAAAKISKHSRQESQGGKNKSATDDVKKPKKEKESKTNKVAERPKETVKILTKKEKATTEAAKAAETVASQLTASAQEAPKSRRANIAAAARILQRDLGLSPGSAHRKARLNAAKSEGEAKPTSSKDATTSSTTEPSAVAAGAGAGAGAGAGTAAGAAAASSTTTNSAAPAASSSAPATNTASTSQPADRSTTPTASKSGRSRRGGGGKNANSSEAKNKNADPAAAAPAAPTPAKGPIVLLKKKDKSQAPAAESTTPASNSPSSAKAPAPQPGSKTSSGRAAGGAKKSSATVTAGAIRGFVKHANPSQGVTEAALRQALEPFGAITLIETDRRKGFAYVDFAEHQGLVKAVAASPVTVGQGAVQVMERKEKKATSGGSVAPPTASAPPPASSTPASAQKSEQTTSRRSRRGRGGGGGGKNAQPADGGSQQQAGAATSQSGTKAG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.4
2	0.41
3	0.36
4	0.34
5	0.27
6	0.21
7	0.18
8	0.19
9	0.18
10	0.18
11	0.15
12	0.15
13	0.22
14	0.24
15	0.25
16	0.26
17	0.27
18	0.29
19	0.36
20	0.43
21	0.44
22	0.48
23	0.48
24	0.51
25	0.57
26	0.59
27	0.57
28	0.51
29	0.46
30	0.47
31	0.47
32	0.44
33	0.38
34	0.33
35	0.32
36	0.33
37	0.32
38	0.26
39	0.27
40	0.29
41	0.28
42	0.3
43	0.27
44	0.27
45	0.26
46	0.24
47	0.21
48	0.16
49	0.17
50	0.2
51	0.19
52	0.24
53	0.29
54	0.31
55	0.31
56	0.33
57	0.35
58	0.32
59	0.39
60	0.37
61	0.37
62	0.37
63	0.36
64	0.4
65	0.35
66	0.33
67	0.3
68	0.25
69	0.22
70	0.24
71	0.3
72	0.3
73	0.33
74	0.37
75	0.37
76	0.42
77	0.45
78	0.44
79	0.44
80	0.44
81	0.48
82	0.49
83	0.52
84	0.56
85	0.61
86	0.69
87	0.71
88	0.68
89	0.65
90	0.64
91	0.61
92	0.56
93	0.49
94	0.43
95	0.39
96	0.38
97	0.35
98	0.34
99	0.3
100	0.26
101	0.24
102	0.2
103	0.16
104	0.2
105	0.2
106	0.17
107	0.18
108	0.21
109	0.25
110	0.28
111	0.3
112	0.26
113	0.27
114	0.28
115	0.28
116	0.23
117	0.18
118	0.18
119	0.16
120	0.14
121	0.14
122	0.14
123	0.13
124	0.13
125	0.12
126	0.14
127	0.22
128	0.21
129	0.21
130	0.25
131	0.33
132	0.42
133	0.52
134	0.56
135	0.57
136	0.68
137	0.77
138	0.82
139	0.84
140	0.83
141	0.79
142	0.78
143	0.71
144	0.65
145	0.61
146	0.56
147	0.46
148	0.39
149	0.33
150	0.25
151	0.23
152	0.18
153	0.14
154	0.08
155	0.07
156	0.08
157	0.08
158	0.1
159	0.1
160	0.16
161	0.16
162	0.16
163	0.19
164	0.19
165	0.2
166	0.2
167	0.21
168	0.18
169	0.21
170	0.21
171	0.2
172	0.19
173	0.17
174	0.15
175	0.14
176	0.11
177	0.08
178	0.09
179	0.09
180	0.08
181	0.11
182	0.11
183	0.11
184	0.12
185	0.12
186	0.1
187	0.12
188	0.14
189	0.14
190	0.14
191	0.14
192	0.19
193	0.2
194	0.19
195	0.2
196	0.24
197	0.28
198	0.35
199	0.35
200	0.39
201	0.46
202	0.52
203	0.54
204	0.54
205	0.49
206	0.5
207	0.51
208	0.44
209	0.41
210	0.37
211	0.33
212	0.34
213	0.35
214	0.32
215	0.35
216	0.37
217	0.36
218	0.38
219	0.46
220	0.45
221	0.52
222	0.56
223	0.54
224	0.52
225	0.51
226	0.47
227	0.41
228	0.39
229	0.33
230	0.31
231	0.37
232	0.45
233	0.5
234	0.55
235	0.57
236	0.6
237	0.67
238	0.7
239	0.71
240	0.72
241	0.75
242	0.78
243	0.82
244	0.83
245	0.75
246	0.75
247	0.73
248	0.69
249	0.65
250	0.6
251	0.56
252	0.52
253	0.5
254	0.47
255	0.47
256	0.48
257	0.47
258	0.52
259	0.52
260	0.51
261	0.54
262	0.5
263	0.45
264	0.43
265	0.41
266	0.35
267	0.35
268	0.32
269	0.27
270	0.25
271	0.22
272	0.16
273	0.12
274	0.1
275	0.06
276	0.05
277	0.05
278	0.05
279	0.05
280	0.05
281	0.06
282	0.08
283	0.08
284	0.11
285	0.15
286	0.17
287	0.24
288	0.25
289	0.26
290	0.28
291	0.3
292	0.29
293	0.31
294	0.33
295	0.27
296	0.26
297	0.26
298	0.21
299	0.19
300	0.17
301	0.12
302	0.07
303	0.07
304	0.06
305	0.07
306	0.06
307	0.06
308	0.07
309	0.11
310	0.15
311	0.16
312	0.17
313	0.19
314	0.25
315	0.26
316	0.34
317	0.36
318	0.36
319	0.37
320	0.41
321	0.37
322	0.32
323	0.36
324	0.27
325	0.24
326	0.21
327	0.19
328	0.19
329	0.19
330	0.21
331	0.16
332	0.17
333	0.15
334	0.18
335	0.19
336	0.17
337	0.19
338	0.18
339	0.19
340	0.19
341	0.17
342	0.14
343	0.12
344	0.1
345	0.07
346	0.06
347	0.04
348	0.04
349	0.03
350	0.03
351	0.02
352	0.02
353	0.02
354	0.01
355	0.01
356	0.01
357	0.01
358	0.01
359	0.01
360	0.01
361	0.01
362	0.01
363	0.01
364	0.01
365	0.01
366	0.02
367	0.02
368	0.02
369	0.03
370	0.04
371	0.05
372	0.05
373	0.05
374	0.06
375	0.05
376	0.05
377	0.06
378	0.07
379	0.06
380	0.07
381	0.07
382	0.08
383	0.08
384	0.09
385	0.1
386	0.09
387	0.1
388	0.1
389	0.11
390	0.1
391	0.12
392	0.13
393	0.14
394	0.14
395	0.17
396	0.17
397	0.21
398	0.23
399	0.25
400	0.25
401	0.24
402	0.27
403	0.25
404	0.3
405	0.33
406	0.4
407	0.46
408	0.47
409	0.5
410	0.53
411	0.6
412	0.6
413	0.59
414	0.6
415	0.54
416	0.55
417	0.52
418	0.47
419	0.39
420	0.35
421	0.36
422	0.31
423	0.31
424	0.29
425	0.29
426	0.32
427	0.32
428	0.3
429	0.23
430	0.2
431	0.21
432	0.18
433	0.18
434	0.12
435	0.12
436	0.13
437	0.11
438	0.1
439	0.07
440	0.1
441	0.11
442	0.1
443	0.11
444	0.16
445	0.25
446	0.29
447	0.34
448	0.4
449	0.44
450	0.49
451	0.55
452	0.54
453	0.51
454	0.56
455	0.59
456	0.54
457	0.54
458	0.52
459	0.46
460	0.41
461	0.37
462	0.29
463	0.21
464	0.18
465	0.16
466	0.14
467	0.14
468	0.16
469	0.17
470	0.18
471	0.2
472	0.2
473	0.22
474	0.25
475	0.29
476	0.32
477	0.32
478	0.33
479	0.35
480	0.39
481	0.38
482	0.38
483	0.33
484	0.35
485	0.34
486	0.31
487	0.28
488	0.28
489	0.3
490	0.32
491	0.32
492	0.26
493	0.25
494	0.25
495	0.23
496	0.2
497	0.16
498	0.13
499	0.13
500	0.16
501	0.17
502	0.16
503	0.17
504	0.15
505	0.14
506	0.14
507	0.15
508	0.13
509	0.18
510	0.21
511	0.26
512	0.27
513	0.27
514	0.27
515	0.27
516	0.25
517	0.2
518	0.2
519	0.15
520	0.15
521	0.14
522	0.13
523	0.12
524	0.13
525	0.12
526	0.09
527	0.09
528	0.08
529	0.07
530	0.07
531	0.06
532	0.05
533	0.08
534	0.09
535	0.14
536	0.14
537	0.17
538	0.19
539	0.21
540	0.22
541	0.21
542	0.23
543	0.24
544	0.29
545	0.28
546	0.31
547	0.3
548	0.29
549	0.29
550	0.26
551	0.2
552	0.15
553	0.13
554	0.09
555	0.09
556	0.09
557	0.08
558	0.1
559	0.1
560	0.09
561	0.1
562	0.11
563	0.1
564	0.09
565	0.09
566	0.07
567	0.09
568	0.09
569	0.09
570	0.1
571	0.14
572	0.15
573	0.24
574	0.26
575	0.27
576	0.32
577	0.32
578	0.34
579	0.38
580	0.4
581	0.36
582	0.39
583	0.4
584	0.41
585	0.4
586	0.37
587	0.29
588	0.27
589	0.23
590	0.22
591	0.19
592	0.17
593	0.18
594	0.19
595	0.23
596	0.23
597	0.25
598	0.23
599	0.25
600	0.28
601	0.35
602	0.36
603	0.34
604	0.36
605	0.39
606	0.42
607	0.4
608	0.41
609	0.38
610	0.44
611	0.53
612	0.61
613	0.63
614	0.64
615	0.72
616	0.76
617	0.8
618	0.78
619	0.74
620	0.74
621	0.73
622	0.72
623	0.68
624	0.6
625	0.52
626	0.47
627	0.4
628	0.3
629	0.22
630	0.19
631	0.2
632	0.22
633	0.22
634	0.21
635	0.23
636	0.23
637	0.24
638	0.23
639	0.18
640	0.14
641	0.12
642	0.12
643	0.11
644	0.12

A0A3N2Q9Y5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer