Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3N2PV20

Protein Details
Accession A0A3N2PV20    Localization Confidence High Confidence Score 17.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MPPAKKRKTRAAAKAEKALDHydrophilic
262-281KAEEARLKKRRERMAKDGDDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-14KKRKTRAAAK
266-274ARLKKRRER
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 12.5, cyto 4, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MPPAKKRKTRAAAKAEKALDAASTIDQQKAQDADNETKKEVDTGASNTDADAPPVDAAATGGESSTSTNDDPATKAQDRLARFKALQARAKSSTEQNFKEATREAQRVATDPSQLTALNRRRAIASHKLLKADIEDAGGDFERKRAWDWTVEESEKWDRRLEKKAAHRDNTAFADYHAEANKMYKAQLKHVTPNMERYAKDKMAAIERAAASGGLDIVETEDGELIAIDKDGSFYSTADSTTFAQNKPDRADVDRLVADLRKAEEARLKKRRERMAKDGDDGDVTYINDKNKQFNQKLARFYNKYTTEIRDSFERGTMI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.85
2 0.75
3 0.66
4 0.56
5 0.45
6 0.34
7 0.25
8 0.2
9 0.13
10 0.16
11 0.16
12 0.17
13 0.18
14 0.18
15 0.21
16 0.21
17 0.21
18 0.22
19 0.26
20 0.33
21 0.4
22 0.42
23 0.39
24 0.39
25 0.38
26 0.33
27 0.29
28 0.22
29 0.18
30 0.18
31 0.2
32 0.2
33 0.2
34 0.19
35 0.22
36 0.2
37 0.17
38 0.15
39 0.12
40 0.11
41 0.11
42 0.11
43 0.06
44 0.07
45 0.06
46 0.06
47 0.05
48 0.05
49 0.05
50 0.05
51 0.06
52 0.07
53 0.09
54 0.09
55 0.1
56 0.11
57 0.12
58 0.14
59 0.16
60 0.22
61 0.21
62 0.23
63 0.26
64 0.3
65 0.32
66 0.38
67 0.38
68 0.35
69 0.34
70 0.38
71 0.43
72 0.45
73 0.49
74 0.45
75 0.48
76 0.47
77 0.49
78 0.46
79 0.44
80 0.45
81 0.46
82 0.44
83 0.41
84 0.4
85 0.38
86 0.39
87 0.33
88 0.3
89 0.29
90 0.29
91 0.27
92 0.27
93 0.27
94 0.26
95 0.29
96 0.26
97 0.21
98 0.19
99 0.19
100 0.17
101 0.16
102 0.16
103 0.21
104 0.26
105 0.3
106 0.31
107 0.31
108 0.3
109 0.32
110 0.37
111 0.37
112 0.37
113 0.39
114 0.4
115 0.4
116 0.4
117 0.38
118 0.33
119 0.25
120 0.18
121 0.1
122 0.08
123 0.07
124 0.08
125 0.08
126 0.07
127 0.06
128 0.06
129 0.07
130 0.07
131 0.09
132 0.1
133 0.12
134 0.16
135 0.19
136 0.23
137 0.26
138 0.26
139 0.25
140 0.26
141 0.31
142 0.29
143 0.27
144 0.25
145 0.25
146 0.29
147 0.37
148 0.39
149 0.39
150 0.46
151 0.55
152 0.6
153 0.59
154 0.58
155 0.52
156 0.51
157 0.46
158 0.38
159 0.28
160 0.2
161 0.21
162 0.18
163 0.19
164 0.15
165 0.13
166 0.12
167 0.13
168 0.14
169 0.11
170 0.12
171 0.14
172 0.14
173 0.2
174 0.28
175 0.29
176 0.33
177 0.37
178 0.43
179 0.39
180 0.44
181 0.43
182 0.39
183 0.36
184 0.34
185 0.36
186 0.3
187 0.3
188 0.26
189 0.23
190 0.25
191 0.26
192 0.24
193 0.21
194 0.21
195 0.2
196 0.18
197 0.15
198 0.1
199 0.09
200 0.08
201 0.04
202 0.03
203 0.03
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.05
218 0.05
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.08
223 0.09
224 0.09
225 0.09
226 0.11
227 0.11
228 0.18
229 0.21
230 0.19
231 0.27
232 0.3
233 0.34
234 0.35
235 0.38
236 0.33
237 0.35
238 0.4
239 0.34
240 0.35
241 0.31
242 0.28
243 0.26
244 0.25
245 0.21
246 0.17
247 0.17
248 0.18
249 0.18
250 0.2
251 0.26
252 0.34
253 0.44
254 0.51
255 0.57
256 0.59
257 0.68
258 0.76
259 0.79
260 0.79
261 0.79
262 0.81
263 0.78
264 0.75
265 0.68
266 0.59
267 0.49
268 0.41
269 0.32
270 0.23
271 0.17
272 0.16
273 0.17
274 0.18
275 0.24
276 0.25
277 0.32
278 0.38
279 0.48
280 0.49
281 0.55
282 0.63
283 0.63
284 0.71
285 0.71
286 0.74
287 0.68
288 0.69
289 0.7
290 0.63
291 0.6
292 0.56
293 0.54
294 0.52
295 0.49
296 0.48
297 0.43
298 0.43
299 0.41