Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4P9XTB7

Protein Details
Accession A0A4P9XTB7    Localization Confidence High Confidence Score 22.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
203-225NRDGRWRERSPRRGGRDRSRSTDBasic
232-258YRSDSRDRYSRDRRNSSRDRHARYGRDBasic
276-305DDYYRRDDRRDYDRRRRPASRSRSRSQERRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
204-275RDGRWRERSPRRGGRDRSRSTDRYRRRGYRSDSRDRYSRDRRNSSRDRHARYGRDDGDDRSHRGRRDDRDRR
280-305RRDDRRDYDRRRRPASRSRSRSQERR
Subcellular Location(s) nucl 22, mito 2, cyto 2, cyto_mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MSSSSNTFETWGNPTNMNLNELVYVNIQSSPYFKALYEKKTYHEVVDEIYNNVDTLAEPFMKGTTASSAFCLLYKLWTLKLTVRQLTGMLNHTDSPHIRALGMLYIRYICKPANMWDWLVDYLEDEEEVQVRGGRDPMSMTIGQLCRALLTQQKWCNTMLPRIPVPIARDINEKLSAYMAEHGLTADQPAPATTATEQRHAANRDGRWRERSPRRGGRDRSRSTDRYRRRGYRSDSRDRYSRDRRNSSRDRHARYGRDDGDDRSHRGRRDDRDRRDDYYRRDDRRDYDRRRRPASRSRSRSQERR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.32
3 0.32
4 0.32
5 0.26
6 0.21
7 0.2
8 0.19
9 0.2
10 0.14
11 0.13
12 0.12
13 0.13
14 0.13
15 0.11
16 0.13
17 0.15
18 0.16
19 0.16
20 0.15
21 0.23
22 0.29
23 0.36
24 0.42
25 0.41
26 0.42
27 0.48
28 0.5
29 0.42
30 0.39
31 0.32
32 0.26
33 0.3
34 0.28
35 0.22
36 0.21
37 0.2
38 0.16
39 0.15
40 0.13
41 0.07
42 0.08
43 0.1
44 0.09
45 0.09
46 0.09
47 0.1
48 0.1
49 0.1
50 0.09
51 0.1
52 0.12
53 0.13
54 0.13
55 0.15
56 0.15
57 0.15
58 0.16
59 0.12
60 0.12
61 0.14
62 0.14
63 0.14
64 0.16
65 0.17
66 0.2
67 0.28
68 0.32
69 0.32
70 0.31
71 0.3
72 0.3
73 0.29
74 0.27
75 0.23
76 0.18
77 0.16
78 0.16
79 0.16
80 0.18
81 0.17
82 0.18
83 0.17
84 0.16
85 0.15
86 0.14
87 0.14
88 0.15
89 0.15
90 0.11
91 0.1
92 0.11
93 0.12
94 0.12
95 0.13
96 0.09
97 0.1
98 0.12
99 0.15
100 0.19
101 0.2
102 0.21
103 0.2
104 0.22
105 0.2
106 0.19
107 0.15
108 0.1
109 0.09
110 0.08
111 0.07
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.06
118 0.07
119 0.07
120 0.08
121 0.09
122 0.08
123 0.09
124 0.09
125 0.11
126 0.1
127 0.1
128 0.13
129 0.13
130 0.13
131 0.13
132 0.12
133 0.09
134 0.09
135 0.11
136 0.11
137 0.13
138 0.19
139 0.23
140 0.25
141 0.26
142 0.26
143 0.29
144 0.27
145 0.3
146 0.27
147 0.26
148 0.25
149 0.24
150 0.25
151 0.22
152 0.23
153 0.24
154 0.22
155 0.2
156 0.23
157 0.22
158 0.25
159 0.25
160 0.22
161 0.16
162 0.15
163 0.14
164 0.11
165 0.12
166 0.09
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.06
172 0.07
173 0.06
174 0.06
175 0.05
176 0.05
177 0.06
178 0.06
179 0.07
180 0.08
181 0.15
182 0.16
183 0.19
184 0.2
185 0.21
186 0.28
187 0.29
188 0.33
189 0.32
190 0.33
191 0.4
192 0.46
193 0.48
194 0.49
195 0.51
196 0.57
197 0.61
198 0.67
199 0.68
200 0.71
201 0.76
202 0.79
203 0.83
204 0.83
205 0.84
206 0.81
207 0.78
208 0.77
209 0.74
210 0.73
211 0.74
212 0.73
213 0.73
214 0.76
215 0.77
216 0.77
217 0.8
218 0.79
219 0.79
220 0.79
221 0.8
222 0.78
223 0.74
224 0.74
225 0.71
226 0.73
227 0.73
228 0.73
229 0.72
230 0.76
231 0.78
232 0.81
233 0.84
234 0.83
235 0.83
236 0.83
237 0.81
238 0.81
239 0.82
240 0.78
241 0.75
242 0.76
243 0.67
244 0.64
245 0.58
246 0.52
247 0.53
248 0.5
249 0.49
250 0.48
251 0.5
252 0.47
253 0.53
254 0.57
255 0.58
256 0.65
257 0.71
258 0.73
259 0.78
260 0.8
261 0.77
262 0.78
263 0.76
264 0.73
265 0.74
266 0.73
267 0.7
268 0.73
269 0.73
270 0.7
271 0.73
272 0.75
273 0.75
274 0.76
275 0.79
276 0.82
277 0.85
278 0.86
279 0.85
280 0.85
281 0.86
282 0.86
283 0.84
284 0.83
285 0.84