Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4P9XR39

Protein Details
Accession A0A4P9XR39    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
180-200ATAKELSKTRKKRKAPAELASHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
187-194KTRKKRKA
Subcellular Location(s) cysk 15, cyto 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024977  Apc4-like_WD40_dom  
IPR013915  Pre-mRNA_splic_Prp19  
IPR038959  Prp19  
IPR003613  Ubox_domain  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0000974  C:Prp19 complex  
GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
GO:0070534  P:protein K63-linked ubiquitination  
Pfam View protein in Pfam  
PF12894  ANAPC4_WD40  
PF08606  Prp19  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51698  U_BOX  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd16656  RING-Ubox_PRP19  
cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MFCAISGETPQEPVVATTSGLVFEKRLIIKYLADHGKCPVTGEELTEKDLVDVKIAPKMVKPRPPTLVSLPSLLATFQNEWDSMMLEVFSLKQQYQQVRQELSHALYQHDAACRVIARLVKERDAARSSLATIQMQLNAPAPASAAAPAAEATSMDVDQPAAEEVEGEGLGADIADVLDATAKELSKTRKKRKAPAELASADAIRGYKMSSTVPSMHSSTAPGVNCMDIRGQLVLTGGVDKQVMIYARNEEKVLATLKGHTKRVNEVAFFGGGSTGLTEDGELDSDLGVNKPGVFKSHLLKMHTADVVGVSVHPSQQYVASAGADAQWALSDLGSVKNIFTLESEDSKDGFASIRFHPDGLILATGTNDGVVRVWDVKSRQNVASFTGHTGSVGALAFSENGYYLATADATSPEVKLWDLRKLSNFASIQLPEEHRVESLGWDRSGQYLAVGGSDLRVYQNKTWELLGSWDDNTAEVTGVGFGELAQEVVSVSKDRCFRAYA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.12
3 0.12
4 0.11
5 0.12
6 0.13
7 0.13
8 0.13
9 0.11
10 0.12
11 0.18
12 0.2
13 0.21
14 0.23
15 0.25
16 0.27
17 0.29
18 0.37
19 0.4
20 0.38
21 0.37
22 0.38
23 0.39
24 0.37
25 0.36
26 0.28
27 0.24
28 0.23
29 0.26
30 0.29
31 0.26
32 0.29
33 0.27
34 0.26
35 0.22
36 0.26
37 0.22
38 0.18
39 0.2
40 0.18
41 0.22
42 0.23
43 0.23
44 0.23
45 0.32
46 0.39
47 0.44
48 0.49
49 0.52
50 0.57
51 0.6
52 0.6
53 0.58
54 0.58
55 0.51
56 0.47
57 0.41
58 0.34
59 0.31
60 0.26
61 0.2
62 0.15
63 0.14
64 0.14
65 0.15
66 0.14
67 0.15
68 0.15
69 0.15
70 0.12
71 0.11
72 0.09
73 0.07
74 0.07
75 0.07
76 0.08
77 0.1
78 0.1
79 0.14
80 0.2
81 0.27
82 0.35
83 0.42
84 0.46
85 0.47
86 0.47
87 0.46
88 0.43
89 0.39
90 0.34
91 0.28
92 0.23
93 0.21
94 0.21
95 0.21
96 0.2
97 0.19
98 0.15
99 0.16
100 0.15
101 0.15
102 0.17
103 0.16
104 0.18
105 0.25
106 0.28
107 0.3
108 0.33
109 0.34
110 0.37
111 0.37
112 0.34
113 0.27
114 0.25
115 0.24
116 0.23
117 0.24
118 0.18
119 0.17
120 0.18
121 0.18
122 0.18
123 0.17
124 0.15
125 0.13
126 0.13
127 0.11
128 0.1
129 0.08
130 0.08
131 0.07
132 0.06
133 0.06
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.06
141 0.06
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.06
147 0.05
148 0.05
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.05
153 0.05
154 0.04
155 0.04
156 0.03
157 0.03
158 0.03
159 0.03
160 0.02
161 0.02
162 0.02
163 0.02
164 0.02
165 0.03
166 0.03
167 0.04
168 0.06
169 0.06
170 0.07
171 0.12
172 0.19
173 0.28
174 0.39
175 0.49
176 0.58
177 0.65
178 0.74
179 0.8
180 0.84
181 0.82
182 0.77
183 0.75
184 0.66
185 0.6
186 0.51
187 0.41
188 0.3
189 0.22
190 0.16
191 0.08
192 0.07
193 0.05
194 0.05
195 0.06
196 0.07
197 0.08
198 0.1
199 0.13
200 0.15
201 0.17
202 0.18
203 0.17
204 0.16
205 0.16
206 0.15
207 0.17
208 0.15
209 0.13
210 0.12
211 0.12
212 0.12
213 0.12
214 0.11
215 0.07
216 0.08
217 0.07
218 0.07
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.04
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.07
233 0.11
234 0.12
235 0.13
236 0.13
237 0.12
238 0.12
239 0.13
240 0.14
241 0.1
242 0.09
243 0.12
244 0.19
245 0.22
246 0.25
247 0.26
248 0.26
249 0.29
250 0.35
251 0.34
252 0.27
253 0.25
254 0.23
255 0.2
256 0.18
257 0.15
258 0.08
259 0.06
260 0.05
261 0.04
262 0.03
263 0.03
264 0.03
265 0.03
266 0.04
267 0.04
268 0.04
269 0.04
270 0.04
271 0.04
272 0.04
273 0.05
274 0.04
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.06
279 0.07
280 0.09
281 0.11
282 0.13
283 0.15
284 0.22
285 0.25
286 0.26
287 0.28
288 0.28
289 0.29
290 0.26
291 0.24
292 0.17
293 0.13
294 0.11
295 0.09
296 0.08
297 0.06
298 0.06
299 0.07
300 0.07
301 0.07
302 0.07
303 0.08
304 0.08
305 0.08
306 0.08
307 0.08
308 0.07
309 0.07
310 0.07
311 0.06
312 0.06
313 0.04
314 0.04
315 0.04
316 0.05
317 0.04
318 0.04
319 0.05
320 0.06
321 0.07
322 0.08
323 0.07
324 0.08
325 0.08
326 0.08
327 0.08
328 0.1
329 0.12
330 0.14
331 0.16
332 0.16
333 0.16
334 0.16
335 0.15
336 0.12
337 0.11
338 0.1
339 0.12
340 0.12
341 0.19
342 0.19
343 0.19
344 0.19
345 0.18
346 0.18
347 0.15
348 0.14
349 0.07
350 0.07
351 0.07
352 0.07
353 0.07
354 0.06
355 0.05
356 0.04
357 0.04
358 0.05
359 0.06
360 0.08
361 0.09
362 0.13
363 0.15
364 0.21
365 0.27
366 0.31
367 0.32
368 0.34
369 0.35
370 0.35
371 0.37
372 0.32
373 0.29
374 0.26
375 0.23
376 0.19
377 0.18
378 0.14
379 0.11
380 0.1
381 0.07
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.06
386 0.06
387 0.05
388 0.05
389 0.06
390 0.05
391 0.05
392 0.06
393 0.06
394 0.06
395 0.06
396 0.07
397 0.09
398 0.09
399 0.09
400 0.09
401 0.09
402 0.1
403 0.15
404 0.17
405 0.23
406 0.25
407 0.29
408 0.33
409 0.37
410 0.37
411 0.4
412 0.38
413 0.32
414 0.34
415 0.31
416 0.3
417 0.31
418 0.32
419 0.27
420 0.28
421 0.27
422 0.22
423 0.22
424 0.2
425 0.19
426 0.23
427 0.24
428 0.23
429 0.23
430 0.24
431 0.24
432 0.25
433 0.2
434 0.14
435 0.12
436 0.11
437 0.11
438 0.1
439 0.09
440 0.08
441 0.09
442 0.09
443 0.1
444 0.14
445 0.18
446 0.21
447 0.3
448 0.31
449 0.32
450 0.33
451 0.31
452 0.28
453 0.28
454 0.27
455 0.22
456 0.2
457 0.2
458 0.19
459 0.18
460 0.18
461 0.15
462 0.12
463 0.09
464 0.09
465 0.08
466 0.07
467 0.07
468 0.06
469 0.05
470 0.06
471 0.06
472 0.06
473 0.06
474 0.06
475 0.06
476 0.07
477 0.09
478 0.1
479 0.11
480 0.16
481 0.21
482 0.24