Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V1IWX6

Protein Details
Accession A0A4V1IWX6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MTREKQSSDRIKNKNPAPVQHydrophilic
613-635AVAKRMPKVVKRRRKVEGEEGAGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
615-627AKRMPKVVKRRRK
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 11, cyto 8.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR008847  Suf  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02184  HAT  
PF05843  Suf  
PF13431  TPR_17  
Amino Acid Sequences MTREKQSSDRIKNKNPAPVQITAEQLMREAHEFREVAIAAPRQKITDKEELAEYQMDKRRSFEDMLRRNRIHVGTWLNYAAWEQSQDEITRARSIYERALDVDARNVTVYLKYLEMEMKNRNVNRARNLFDRVVALLPRVDQFWLKFTYMEEMLGNVNGARQIFERWMQWQPEEPAWMAYAKMEMRYGEVDRARAVYQRFVQVHPDPKNWLKWVRFEEEQNNIEQVREIFDQAFQFLGDDHMDQKLVIAFAKFESKQREYERARAIFKYALERLPKHKSEALYKQYTQFEKRFGDKDDIETVVMAKRRGQYEQQVRENPRNYDVWFDYARLEEATADVERTREVYERAIAQVPPSEEKRHWRRYIYLWINYALFEELVAKDYERTRQIYQECLRLIPHKKFTFAKIWLLAARFEIRRLNLTAARKTLGMGIGKAPKDRLFKGYIELELELREFDRCRTLYTKFLEYNPANCYAWIRFAELERSLGDYERARAIFELAVAQPALDMPELLWKAYIDFEVEMAEFASARKLYERLLQRTEHVKVWISYARFELEAVAEDEDPAEREEERAERARKTFQRAYDSMKQRDLKEERVLLLEAWREMEAHYGDAASRAAVAKRMPKVVKRRRKVEGEEGAGAGAWEEYYDYIFPDDETQKPNLKLLELAYQLKSKREAEARAKAASASTSASAPDTEETAASDDEHA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.76
3 0.73
4 0.68
5 0.64
6 0.59
7 0.53
8 0.5
9 0.43
10 0.4
11 0.32
12 0.28
13 0.24
14 0.2
15 0.2
16 0.18
17 0.17
18 0.21
19 0.21
20 0.2
21 0.25
22 0.23
23 0.22
24 0.26
25 0.3
26 0.29
27 0.34
28 0.34
29 0.3
30 0.33
31 0.36
32 0.37
33 0.42
34 0.39
35 0.37
36 0.41
37 0.39
38 0.39
39 0.38
40 0.32
41 0.31
42 0.36
43 0.38
44 0.34
45 0.36
46 0.35
47 0.36
48 0.39
49 0.38
50 0.42
51 0.48
52 0.57
53 0.64
54 0.63
55 0.61
56 0.63
57 0.57
58 0.49
59 0.46
60 0.44
61 0.37
62 0.39
63 0.38
64 0.31
65 0.29
66 0.27
67 0.22
68 0.15
69 0.14
70 0.12
71 0.13
72 0.15
73 0.16
74 0.17
75 0.18
76 0.19
77 0.22
78 0.21
79 0.21
80 0.21
81 0.23
82 0.27
83 0.28
84 0.27
85 0.25
86 0.28
87 0.28
88 0.26
89 0.28
90 0.23
91 0.2
92 0.19
93 0.17
94 0.15
95 0.14
96 0.15
97 0.11
98 0.11
99 0.11
100 0.12
101 0.17
102 0.19
103 0.23
104 0.27
105 0.31
106 0.38
107 0.39
108 0.46
109 0.48
110 0.52
111 0.56
112 0.58
113 0.57
114 0.55
115 0.6
116 0.53
117 0.47
118 0.41
119 0.34
120 0.29
121 0.25
122 0.21
123 0.16
124 0.16
125 0.15
126 0.14
127 0.13
128 0.13
129 0.14
130 0.17
131 0.19
132 0.19
133 0.18
134 0.18
135 0.22
136 0.2
137 0.2
138 0.16
139 0.13
140 0.13
141 0.13
142 0.12
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.08
148 0.08
149 0.1
150 0.13
151 0.15
152 0.16
153 0.18
154 0.24
155 0.25
156 0.26
157 0.3
158 0.3
159 0.3
160 0.31
161 0.27
162 0.22
163 0.21
164 0.2
165 0.14
166 0.11
167 0.12
168 0.11
169 0.11
170 0.12
171 0.11
172 0.13
173 0.15
174 0.17
175 0.19
176 0.2
177 0.2
178 0.19
179 0.21
180 0.2
181 0.22
182 0.22
183 0.21
184 0.22
185 0.29
186 0.3
187 0.29
188 0.34
189 0.36
190 0.43
191 0.43
192 0.42
193 0.4
194 0.42
195 0.46
196 0.45
197 0.47
198 0.41
199 0.43
200 0.46
201 0.46
202 0.45
203 0.44
204 0.45
205 0.45
206 0.43
207 0.37
208 0.34
209 0.28
210 0.26
211 0.22
212 0.17
213 0.13
214 0.13
215 0.13
216 0.11
217 0.13
218 0.13
219 0.12
220 0.12
221 0.08
222 0.08
223 0.07
224 0.08
225 0.07
226 0.07
227 0.08
228 0.08
229 0.08
230 0.08
231 0.08
232 0.08
233 0.07
234 0.08
235 0.07
236 0.07
237 0.08
238 0.13
239 0.13
240 0.16
241 0.23
242 0.24
243 0.31
244 0.34
245 0.43
246 0.42
247 0.49
248 0.53
249 0.51
250 0.52
251 0.46
252 0.44
253 0.37
254 0.34
255 0.32
256 0.26
257 0.26
258 0.27
259 0.29
260 0.33
261 0.38
262 0.39
263 0.37
264 0.38
265 0.36
266 0.4
267 0.46
268 0.47
269 0.45
270 0.45
271 0.46
272 0.48
273 0.49
274 0.47
275 0.4
276 0.38
277 0.35
278 0.38
279 0.35
280 0.33
281 0.35
282 0.3
283 0.31
284 0.29
285 0.26
286 0.22
287 0.19
288 0.17
289 0.14
290 0.16
291 0.13
292 0.13
293 0.16
294 0.18
295 0.2
296 0.22
297 0.29
298 0.37
299 0.45
300 0.48
301 0.52
302 0.54
303 0.59
304 0.6
305 0.52
306 0.45
307 0.38
308 0.32
309 0.3
310 0.27
311 0.23
312 0.2
313 0.19
314 0.17
315 0.16
316 0.16
317 0.11
318 0.1
319 0.07
320 0.06
321 0.07
322 0.06
323 0.06
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.07
328 0.08
329 0.08
330 0.08
331 0.09
332 0.1
333 0.11
334 0.13
335 0.13
336 0.12
337 0.12
338 0.13
339 0.13
340 0.14
341 0.15
342 0.17
343 0.16
344 0.25
345 0.34
346 0.41
347 0.44
348 0.43
349 0.45
350 0.47
351 0.57
352 0.54
353 0.49
354 0.41
355 0.39
356 0.36
357 0.33
358 0.28
359 0.18
360 0.11
361 0.07
362 0.07
363 0.05
364 0.07
365 0.07
366 0.06
367 0.08
368 0.09
369 0.13
370 0.15
371 0.18
372 0.18
373 0.24
374 0.25
375 0.31
376 0.32
377 0.34
378 0.32
379 0.29
380 0.29
381 0.3
382 0.35
383 0.32
384 0.38
385 0.34
386 0.37
387 0.38
388 0.41
389 0.42
390 0.39
391 0.37
392 0.3
393 0.3
394 0.28
395 0.27
396 0.24
397 0.18
398 0.19
399 0.15
400 0.15
401 0.16
402 0.15
403 0.17
404 0.18
405 0.2
406 0.21
407 0.26
408 0.27
409 0.26
410 0.26
411 0.24
412 0.22
413 0.21
414 0.19
415 0.15
416 0.13
417 0.15
418 0.2
419 0.21
420 0.21
421 0.21
422 0.23
423 0.27
424 0.28
425 0.27
426 0.26
427 0.26
428 0.29
429 0.29
430 0.25
431 0.22
432 0.21
433 0.17
434 0.14
435 0.14
436 0.1
437 0.08
438 0.09
439 0.08
440 0.08
441 0.14
442 0.14
443 0.17
444 0.2
445 0.22
446 0.28
447 0.31
448 0.36
449 0.32
450 0.33
451 0.38
452 0.36
453 0.37
454 0.32
455 0.32
456 0.27
457 0.25
458 0.26
459 0.18
460 0.21
461 0.19
462 0.18
463 0.16
464 0.17
465 0.2
466 0.18
467 0.19
468 0.15
469 0.16
470 0.15
471 0.14
472 0.16
473 0.13
474 0.14
475 0.17
476 0.17
477 0.15
478 0.15
479 0.15
480 0.13
481 0.12
482 0.13
483 0.09
484 0.1
485 0.09
486 0.09
487 0.07
488 0.07
489 0.08
490 0.05
491 0.05
492 0.04
493 0.11
494 0.11
495 0.12
496 0.12
497 0.11
498 0.12
499 0.13
500 0.13
501 0.08
502 0.08
503 0.08
504 0.08
505 0.08
506 0.08
507 0.07
508 0.07
509 0.05
510 0.05
511 0.08
512 0.08
513 0.08
514 0.1
515 0.11
516 0.12
517 0.2
518 0.28
519 0.31
520 0.36
521 0.36
522 0.39
523 0.45
524 0.46
525 0.41
526 0.35
527 0.32
528 0.28
529 0.32
530 0.32
531 0.26
532 0.25
533 0.24
534 0.23
535 0.2
536 0.19
537 0.16
538 0.12
539 0.12
540 0.12
541 0.12
542 0.1
543 0.1
544 0.1
545 0.1
546 0.1
547 0.09
548 0.09
549 0.07
550 0.08
551 0.11
552 0.13
553 0.17
554 0.25
555 0.28
556 0.31
557 0.35
558 0.44
559 0.47
560 0.54
561 0.56
562 0.54
563 0.59
564 0.57
565 0.62
566 0.63
567 0.66
568 0.62
569 0.64
570 0.62
571 0.55
572 0.62
573 0.59
574 0.55
575 0.54
576 0.52
577 0.45
578 0.43
579 0.42
580 0.32
581 0.31
582 0.27
583 0.19
584 0.18
585 0.16
586 0.14
587 0.13
588 0.17
589 0.14
590 0.13
591 0.13
592 0.11
593 0.11
594 0.12
595 0.12
596 0.08
597 0.08
598 0.09
599 0.1
600 0.13
601 0.16
602 0.22
603 0.26
604 0.35
605 0.39
606 0.46
607 0.56
608 0.64
609 0.72
610 0.75
611 0.79
612 0.8
613 0.83
614 0.83
615 0.82
616 0.8
617 0.75
618 0.68
619 0.59
620 0.5
621 0.4
622 0.32
623 0.22
624 0.12
625 0.06
626 0.04
627 0.04
628 0.04
629 0.06
630 0.07
631 0.07
632 0.08
633 0.09
634 0.09
635 0.15
636 0.19
637 0.21
638 0.25
639 0.29
640 0.35
641 0.36
642 0.39
643 0.34
644 0.32
645 0.31
646 0.29
647 0.33
648 0.3
649 0.33
650 0.32
651 0.36
652 0.37
653 0.38
654 0.41
655 0.35
656 0.38
657 0.41
658 0.48
659 0.52
660 0.6
661 0.6
662 0.56
663 0.55
664 0.48
665 0.42
666 0.34
667 0.26
668 0.19
669 0.16
670 0.14
671 0.14
672 0.15
673 0.14
674 0.15
675 0.14
676 0.13
677 0.13
678 0.12
679 0.13
680 0.14
681 0.14