Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V1IWF5

Protein Details
Accession A0A4V1IWF5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-27MSTTTPDCTKRRRRSTRSLRARPSGSDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
12-14RRR
155-167EKEIYKAKARERS
Subcellular Location(s) mito 17.5, cyto_mito 10.5, nucl 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
IPR031061  HMGB_plant  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MSTTTPDCTKRRRRSTRSLRARPSGSDIEWTRAPEFSALPVAPPLLEIGNLSPAPLPVPASAMLVVPRMTHQSPLGRQEKSPVALPPEATSKKPYFGPNEMAQPNVLRAPGHAPSGFAIYVHEGRSDYAPNGGVNSPGLVLKAAGAKWRQKSAAEKEIYKAKARERSKDHAKIVAEWRASLHPDQIMEENRLRRLSNYLYGDKHQRQQRVIEIDRPRRPPSGFVIFTNQLREKHFHEHKHVVHYLKWASGEWWKLSEEEREHYRNITRQCVADYQKAIRQYQEQRMRYRVEAGLRGELMPYQLK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.88
2 0.93
3 0.93
4 0.94
5 0.93
6 0.91
7 0.89
8 0.83
9 0.75
10 0.71
11 0.65
12 0.55
13 0.53
14 0.46
15 0.42
16 0.41
17 0.4
18 0.34
19 0.29
20 0.28
21 0.22
22 0.2
23 0.17
24 0.2
25 0.16
26 0.16
27 0.16
28 0.16
29 0.13
30 0.13
31 0.12
32 0.07
33 0.08
34 0.07
35 0.08
36 0.12
37 0.12
38 0.12
39 0.12
40 0.11
41 0.12
42 0.12
43 0.13
44 0.08
45 0.11
46 0.11
47 0.11
48 0.12
49 0.12
50 0.12
51 0.11
52 0.11
53 0.1
54 0.1
55 0.14
56 0.14
57 0.16
58 0.18
59 0.23
60 0.27
61 0.36
62 0.4
63 0.37
64 0.37
65 0.4
66 0.41
67 0.37
68 0.35
69 0.29
70 0.28
71 0.28
72 0.28
73 0.25
74 0.29
75 0.29
76 0.27
77 0.31
78 0.27
79 0.28
80 0.32
81 0.35
82 0.32
83 0.34
84 0.38
85 0.35
86 0.42
87 0.4
88 0.36
89 0.32
90 0.27
91 0.24
92 0.19
93 0.17
94 0.09
95 0.09
96 0.12
97 0.13
98 0.15
99 0.14
100 0.13
101 0.13
102 0.15
103 0.14
104 0.11
105 0.1
106 0.1
107 0.11
108 0.11
109 0.11
110 0.09
111 0.1
112 0.12
113 0.12
114 0.1
115 0.1
116 0.1
117 0.09
118 0.11
119 0.1
120 0.09
121 0.08
122 0.08
123 0.07
124 0.06
125 0.06
126 0.05
127 0.04
128 0.05
129 0.07
130 0.07
131 0.1
132 0.12
133 0.17
134 0.2
135 0.22
136 0.22
137 0.23
138 0.3
139 0.33
140 0.39
141 0.36
142 0.35
143 0.34
144 0.4
145 0.4
146 0.36
147 0.33
148 0.29
149 0.36
150 0.38
151 0.44
152 0.43
153 0.5
154 0.57
155 0.62
156 0.58
157 0.54
158 0.52
159 0.49
160 0.47
161 0.44
162 0.35
163 0.27
164 0.27
165 0.23
166 0.24
167 0.2
168 0.16
169 0.12
170 0.12
171 0.13
172 0.15
173 0.16
174 0.18
175 0.21
176 0.22
177 0.23
178 0.25
179 0.24
180 0.21
181 0.24
182 0.23
183 0.27
184 0.29
185 0.31
186 0.32
187 0.34
188 0.42
189 0.41
190 0.45
191 0.44
192 0.44
193 0.42
194 0.44
195 0.48
196 0.48
197 0.47
198 0.48
199 0.52
200 0.56
201 0.61
202 0.63
203 0.59
204 0.55
205 0.53
206 0.48
207 0.46
208 0.45
209 0.4
210 0.37
211 0.41
212 0.39
213 0.4
214 0.42
215 0.39
216 0.32
217 0.34
218 0.35
219 0.33
220 0.4
221 0.46
222 0.46
223 0.51
224 0.57
225 0.58
226 0.62
227 0.63
228 0.56
229 0.5
230 0.5
231 0.44
232 0.37
233 0.34
234 0.27
235 0.24
236 0.27
237 0.28
238 0.23
239 0.23
240 0.22
241 0.22
242 0.24
243 0.29
244 0.27
245 0.29
246 0.34
247 0.36
248 0.36
249 0.39
250 0.42
251 0.42
252 0.43
253 0.45
254 0.41
255 0.39
256 0.42
257 0.46
258 0.45
259 0.45
260 0.45
261 0.42
262 0.43
263 0.47
264 0.45
265 0.41
266 0.45
267 0.46
268 0.52
269 0.58
270 0.61
271 0.62
272 0.66
273 0.67
274 0.61
275 0.58
276 0.52
277 0.48
278 0.48
279 0.45
280 0.44
281 0.4
282 0.38
283 0.33
284 0.29