Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3G2SAQ3

Protein Details
Accession A0A3G2SAQ3    Localization Confidence Low Confidence Score 9.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
172-205AKNRQEPPKTPKPTKAPKPKKDKAAKAPPKSAPAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
173-208KNRQEPPKTPKPTKAPKPKKDKAAKAPPKSAPAPRI
Subcellular Location(s) cyto_mito 10, mito 9, cyto 9, nucl 5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR039722  Upf3  
IPR005120  UPF3_dom  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
Pfam View protein in Pfam  
PF03467  Smg4_UPF3  
CDD cd12455  RRM_like_Smg4_UPF3  
Amino Acid Sequences MTDSARKAVVRDLPPTLPAEVFWKAVEPWVRTEPETARTAKHTSYVQGKRAEQPGVWDTPSVAYIEFLTPALLLAFATHFHGHIFRDSKGHDFVAFVDVALIQSCARWAPTTYERYKGAVEHAPEYKAFVASLEAPPAKAMPDKPADKADAPVTTPLVEYMRQKQQPSEAPAKNRQEPPKTPKPTKAPKPKKDKAAKAPPKSAPAPRITILTKPPPPPPSSHA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.38
3 0.34
4 0.25
5 0.22
6 0.22
7 0.2
8 0.19
9 0.17
10 0.17
11 0.15
12 0.21
13 0.26
14 0.23
15 0.26
16 0.3
17 0.32
18 0.31
19 0.35
20 0.33
21 0.32
22 0.35
23 0.31
24 0.28
25 0.3
26 0.32
27 0.29
28 0.3
29 0.26
30 0.27
31 0.36
32 0.4
33 0.42
34 0.45
35 0.47
36 0.49
37 0.51
38 0.48
39 0.38
40 0.37
41 0.35
42 0.31
43 0.29
44 0.23
45 0.19
46 0.18
47 0.18
48 0.13
49 0.1
50 0.07
51 0.08
52 0.08
53 0.08
54 0.07
55 0.07
56 0.06
57 0.06
58 0.06
59 0.05
60 0.04
61 0.04
62 0.04
63 0.04
64 0.07
65 0.07
66 0.07
67 0.07
68 0.09
69 0.09
70 0.14
71 0.16
72 0.15
73 0.17
74 0.18
75 0.21
76 0.21
77 0.21
78 0.16
79 0.14
80 0.14
81 0.13
82 0.12
83 0.09
84 0.07
85 0.07
86 0.06
87 0.06
88 0.06
89 0.04
90 0.04
91 0.04
92 0.04
93 0.04
94 0.05
95 0.06
96 0.1
97 0.16
98 0.22
99 0.24
100 0.27
101 0.28
102 0.29
103 0.29
104 0.24
105 0.22
106 0.19
107 0.19
108 0.18
109 0.19
110 0.18
111 0.17
112 0.18
113 0.15
114 0.12
115 0.1
116 0.08
117 0.08
118 0.09
119 0.09
120 0.11
121 0.1
122 0.1
123 0.11
124 0.11
125 0.1
126 0.11
127 0.11
128 0.13
129 0.2
130 0.21
131 0.24
132 0.26
133 0.28
134 0.26
135 0.28
136 0.25
137 0.2
138 0.19
139 0.18
140 0.17
141 0.14
142 0.13
143 0.12
144 0.11
145 0.12
146 0.14
147 0.19
148 0.28
149 0.31
150 0.33
151 0.33
152 0.39
153 0.44
154 0.47
155 0.51
156 0.47
157 0.5
158 0.58
159 0.63
160 0.64
161 0.65
162 0.67
163 0.65
164 0.69
165 0.72
166 0.73
167 0.76
168 0.74
169 0.75
170 0.77
171 0.8
172 0.82
173 0.84
174 0.84
175 0.85
176 0.9
177 0.89
178 0.89
179 0.89
180 0.89
181 0.88
182 0.88
183 0.89
184 0.87
185 0.88
186 0.82
187 0.78
188 0.74
189 0.71
190 0.66
191 0.61
192 0.57
193 0.5
194 0.5
195 0.45
196 0.44
197 0.44
198 0.46
199 0.48
200 0.48
201 0.54
202 0.55
203 0.56