Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4P9ZDF4

Protein Details
Accession A0A4P9ZDF4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
285-307ALPSILGKKKKKNAVRKKMGAMTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
291-302GKKKKKNAVRKK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MGKKRFDKKSATTFSVVHRSHEDALYYDNDALRHVFVELPKGHKAGTPAPKKQPPPEEHVELSKNESFAAQYGIFFDDSKYDYLQHLKPMGQEGGVFIEAEKPPKKKIEDIFKDSLPSATTRQVALDETENIPEELRGFNPDMDPRLREVLEALDDEAYLAEGEGDDEILADLLRSGAAEDGEISDYDEWDMDNHQDEFKKYEDYDLDATFESGEGVALENPYNEGEAPEGLDGAYAGATVNSAWEKDFRRFSSQKKDTNDWDSDEDFDDDEKLDDGEKLDAVGALPSILGKKKKKNAVRKKMGAMTDTSSFSMSSSANFRTQGLQLLDDRYEQMAGKFEQRAERNNKEFSYLLERPDLEDMLNEFLGTYELDRGGRRLAKKDAELDAIQQAADSVSRSKLAAGRRKKQLAVAKLGSSLGNLAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.63
3 0.55
4 0.47
5 0.43
6 0.42
7 0.41
8 0.4
9 0.34
10 0.25
11 0.27
12 0.26
13 0.24
14 0.22
15 0.2
16 0.18
17 0.18
18 0.19
19 0.16
20 0.14
21 0.13
22 0.15
23 0.14
24 0.22
25 0.24
26 0.27
27 0.3
28 0.3
29 0.3
30 0.29
31 0.32
32 0.34
33 0.41
34 0.46
35 0.51
36 0.6
37 0.67
38 0.72
39 0.76
40 0.76
41 0.71
42 0.7
43 0.69
44 0.66
45 0.6
46 0.61
47 0.55
48 0.46
49 0.47
50 0.41
51 0.33
52 0.27
53 0.25
54 0.19
55 0.16
56 0.19
57 0.14
58 0.12
59 0.13
60 0.14
61 0.14
62 0.14
63 0.14
64 0.12
65 0.13
66 0.15
67 0.14
68 0.14
69 0.16
70 0.22
71 0.24
72 0.26
73 0.28
74 0.27
75 0.28
76 0.31
77 0.29
78 0.23
79 0.21
80 0.17
81 0.17
82 0.15
83 0.14
84 0.09
85 0.14
86 0.15
87 0.21
88 0.25
89 0.24
90 0.28
91 0.35
92 0.38
93 0.39
94 0.47
95 0.52
96 0.56
97 0.62
98 0.62
99 0.56
100 0.55
101 0.48
102 0.41
103 0.31
104 0.24
105 0.19
106 0.19
107 0.19
108 0.17
109 0.17
110 0.17
111 0.17
112 0.17
113 0.16
114 0.15
115 0.14
116 0.15
117 0.15
118 0.14
119 0.13
120 0.11
121 0.1
122 0.09
123 0.09
124 0.11
125 0.11
126 0.12
127 0.14
128 0.16
129 0.18
130 0.19
131 0.2
132 0.19
133 0.21
134 0.2
135 0.18
136 0.17
137 0.14
138 0.14
139 0.13
140 0.11
141 0.08
142 0.08
143 0.08
144 0.07
145 0.06
146 0.04
147 0.04
148 0.03
149 0.03
150 0.03
151 0.03
152 0.03
153 0.03
154 0.03
155 0.03
156 0.03
157 0.03
158 0.02
159 0.03
160 0.03
161 0.03
162 0.02
163 0.03
164 0.03
165 0.03
166 0.03
167 0.04
168 0.04
169 0.05
170 0.05
171 0.06
172 0.05
173 0.05
174 0.06
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.07
181 0.08
182 0.09
183 0.11
184 0.11
185 0.13
186 0.13
187 0.15
188 0.13
189 0.15
190 0.14
191 0.16
192 0.17
193 0.15
194 0.16
195 0.13
196 0.13
197 0.1
198 0.1
199 0.07
200 0.04
201 0.04
202 0.03
203 0.03
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.03
222 0.03
223 0.02
224 0.02
225 0.02
226 0.03
227 0.03
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.05
232 0.09
233 0.12
234 0.16
235 0.21
236 0.23
237 0.32
238 0.36
239 0.42
240 0.49
241 0.55
242 0.57
243 0.58
244 0.61
245 0.57
246 0.59
247 0.55
248 0.46
249 0.42
250 0.35
251 0.31
252 0.27
253 0.23
254 0.17
255 0.15
256 0.12
257 0.09
258 0.09
259 0.08
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.07
264 0.07
265 0.07
266 0.07
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.05
272 0.04
273 0.04
274 0.04
275 0.06
276 0.1
277 0.18
278 0.24
279 0.33
280 0.41
281 0.5
282 0.59
283 0.69
284 0.76
285 0.8
286 0.85
287 0.83
288 0.82
289 0.79
290 0.72
291 0.63
292 0.54
293 0.45
294 0.38
295 0.32
296 0.26
297 0.2
298 0.17
299 0.16
300 0.15
301 0.12
302 0.11
303 0.13
304 0.15
305 0.17
306 0.18
307 0.18
308 0.19
309 0.2
310 0.24
311 0.22
312 0.21
313 0.21
314 0.23
315 0.23
316 0.21
317 0.21
318 0.16
319 0.16
320 0.14
321 0.13
322 0.15
323 0.15
324 0.19
325 0.21
326 0.23
327 0.29
328 0.32
329 0.4
330 0.45
331 0.53
332 0.54
333 0.56
334 0.54
335 0.5
336 0.48
337 0.42
338 0.43
339 0.36
340 0.33
341 0.32
342 0.32
343 0.3
344 0.32
345 0.29
346 0.19
347 0.19
348 0.18
349 0.16
350 0.16
351 0.14
352 0.11
353 0.11
354 0.11
355 0.1
356 0.09
357 0.08
358 0.1
359 0.12
360 0.13
361 0.14
362 0.2
363 0.26
364 0.3
365 0.33
366 0.4
367 0.44
368 0.48
369 0.52
370 0.49
371 0.49
372 0.45
373 0.41
374 0.36
375 0.31
376 0.26
377 0.2
378 0.16
379 0.11
380 0.11
381 0.1
382 0.1
383 0.11
384 0.12
385 0.13
386 0.16
387 0.2
388 0.29
389 0.37
390 0.45
391 0.53
392 0.62
393 0.68
394 0.68
395 0.72
396 0.72
397 0.7
398 0.69
399 0.65
400 0.57
401 0.52
402 0.51
403 0.42
404 0.33