Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4P9ZDB3

Protein Details
Accession A0A4P9ZDB3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
155-177EEESRERERKHERERDRERRDAGBasic
596-621AVPLTRHKSTSKQLKKKINRDLDSSMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
162-174ERKHERERDRERR
Subcellular Location(s) cyto 13.5, cyto_nucl 10.5, nucl 4.5, E.R. 4, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040351  RAB3IL/RAB3IP/Sec2  
IPR009449  Sec2_N  
Gene Ontology GO:0005085  F:guanyl-nucleotide exchange factor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF06428  Sec2p  
CDD cd21044  Rab11BD_RAB3IP_like  
Amino Acid Sequences MAEEDLHARLAEEVAVLSTKLVTEVARLLLLEETVHLLRRENHGLRQQLDVLRDIEEAHATAAAEAAELSAAVQAVTDERNTALAKNAQLEAEVEDLTATLFNEANEMVSSASRETYNFKVKNRKLIEELGEKDILILDLQRQLHDLKRLIETMEEESRERERKHERERDRERRDAGRNADRDAADEGVDLLVYSPRACSIRFDLPMYQRDFRAFVYQLVRPDFVFELGSLKTLRYFRKIWNDEIEPSLDVPAPMGSFINRWAVKSFWLFLVEGKARIEPVSGVNETFKVSYKGPKTGLEVPIALRDPCSFCGEQNETRLEHARLYSVKLYSSARDTRDAVGETTVDVGGEPHHVVGLYPLCNYCLVKLRAVCEFFAKLRLIHSNIYKLTPSSVADAAVSGFQFKRAADAVETPKVIWADEPVLVKLYLLLLGIRAKIFWSRTGFWDTEDDVECLSVEDIRLDVFRDFVATNVSFQEFRLEAVGLAQSGAGDSGVGGVGERGVGVVEKLTEGEGAGTDAVMRSDRVLQEVDHAEQLLKEYAEVAGAGSEHAVTHPTELKIPEEIPENKLSKETEKTCSEKSSQGASETPKDASKPAVPLTRHKSTSKQLKKKINRDLDSSMEMLKENFE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.08
3 0.08
4 0.08
5 0.07
6 0.07
7 0.07
8 0.08
9 0.07
10 0.09
11 0.12
12 0.13
13 0.13
14 0.13
15 0.13
16 0.13
17 0.13
18 0.11
19 0.09
20 0.11
21 0.12
22 0.15
23 0.15
24 0.17
25 0.21
26 0.28
27 0.37
28 0.37
29 0.43
30 0.48
31 0.54
32 0.53
33 0.53
34 0.52
35 0.46
36 0.45
37 0.4
38 0.33
39 0.28
40 0.27
41 0.23
42 0.18
43 0.16
44 0.14
45 0.11
46 0.11
47 0.1
48 0.09
49 0.09
50 0.08
51 0.07
52 0.06
53 0.05
54 0.04
55 0.04
56 0.04
57 0.04
58 0.04
59 0.04
60 0.04
61 0.04
62 0.06
63 0.07
64 0.07
65 0.08
66 0.08
67 0.11
68 0.12
69 0.13
70 0.16
71 0.19
72 0.21
73 0.23
74 0.24
75 0.21
76 0.21
77 0.21
78 0.18
79 0.15
80 0.13
81 0.1
82 0.09
83 0.09
84 0.08
85 0.08
86 0.06
87 0.06
88 0.07
89 0.07
90 0.08
91 0.08
92 0.08
93 0.08
94 0.08
95 0.08
96 0.07
97 0.09
98 0.08
99 0.1
100 0.1
101 0.11
102 0.14
103 0.21
104 0.3
105 0.34
106 0.4
107 0.5
108 0.53
109 0.62
110 0.63
111 0.61
112 0.56
113 0.57
114 0.57
115 0.54
116 0.53
117 0.47
118 0.42
119 0.37
120 0.32
121 0.26
122 0.2
123 0.12
124 0.09
125 0.07
126 0.12
127 0.13
128 0.13
129 0.14
130 0.16
131 0.2
132 0.26
133 0.27
134 0.24
135 0.27
136 0.27
137 0.26
138 0.26
139 0.24
140 0.23
141 0.24
142 0.22
143 0.2
144 0.22
145 0.28
146 0.32
147 0.31
148 0.34
149 0.4
150 0.48
151 0.58
152 0.66
153 0.69
154 0.74
155 0.85
156 0.88
157 0.86
158 0.83
159 0.78
160 0.77
161 0.75
162 0.71
163 0.68
164 0.66
165 0.6
166 0.55
167 0.55
168 0.46
169 0.4
170 0.35
171 0.27
172 0.18
173 0.16
174 0.13
175 0.08
176 0.08
177 0.06
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.07
184 0.09
185 0.09
186 0.12
187 0.16
188 0.23
189 0.24
190 0.27
191 0.3
192 0.34
193 0.4
194 0.42
195 0.38
196 0.32
197 0.32
198 0.31
199 0.27
200 0.27
201 0.22
202 0.21
203 0.23
204 0.25
205 0.27
206 0.28
207 0.27
208 0.22
209 0.23
210 0.19
211 0.16
212 0.14
213 0.1
214 0.1
215 0.1
216 0.11
217 0.1
218 0.09
219 0.12
220 0.16
221 0.18
222 0.21
223 0.24
224 0.29
225 0.39
226 0.43
227 0.42
228 0.44
229 0.45
230 0.41
231 0.4
232 0.35
233 0.24
234 0.21
235 0.19
236 0.13
237 0.1
238 0.08
239 0.07
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.05
244 0.05
245 0.07
246 0.14
247 0.13
248 0.14
249 0.15
250 0.16
251 0.17
252 0.18
253 0.18
254 0.12
255 0.13
256 0.12
257 0.12
258 0.17
259 0.16
260 0.15
261 0.15
262 0.14
263 0.13
264 0.13
265 0.13
266 0.08
267 0.09
268 0.11
269 0.11
270 0.11
271 0.11
272 0.12
273 0.12
274 0.12
275 0.11
276 0.1
277 0.11
278 0.17
279 0.19
280 0.22
281 0.24
282 0.25
283 0.28
284 0.31
285 0.33
286 0.27
287 0.25
288 0.22
289 0.23
290 0.22
291 0.17
292 0.12
293 0.11
294 0.11
295 0.12
296 0.16
297 0.13
298 0.13
299 0.19
300 0.22
301 0.23
302 0.24
303 0.25
304 0.22
305 0.23
306 0.25
307 0.2
308 0.17
309 0.15
310 0.15
311 0.14
312 0.16
313 0.17
314 0.14
315 0.14
316 0.15
317 0.15
318 0.14
319 0.18
320 0.2
321 0.19
322 0.21
323 0.23
324 0.22
325 0.23
326 0.23
327 0.18
328 0.15
329 0.13
330 0.1
331 0.1
332 0.08
333 0.06
334 0.05
335 0.04
336 0.04
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.05
342 0.05
343 0.07
344 0.09
345 0.08
346 0.09
347 0.09
348 0.09
349 0.11
350 0.11
351 0.1
352 0.16
353 0.17
354 0.19
355 0.21
356 0.22
357 0.25
358 0.26
359 0.25
360 0.19
361 0.2
362 0.17
363 0.19
364 0.18
365 0.14
366 0.16
367 0.19
368 0.19
369 0.2
370 0.22
371 0.23
372 0.24
373 0.25
374 0.23
375 0.19
376 0.19
377 0.17
378 0.16
379 0.13
380 0.13
381 0.12
382 0.11
383 0.11
384 0.1
385 0.09
386 0.08
387 0.07
388 0.07
389 0.07
390 0.09
391 0.08
392 0.1
393 0.1
394 0.11
395 0.11
396 0.17
397 0.2
398 0.22
399 0.23
400 0.2
401 0.21
402 0.21
403 0.19
404 0.14
405 0.11
406 0.1
407 0.13
408 0.14
409 0.12
410 0.13
411 0.13
412 0.12
413 0.11
414 0.09
415 0.07
416 0.06
417 0.06
418 0.06
419 0.07
420 0.08
421 0.08
422 0.08
423 0.08
424 0.11
425 0.13
426 0.16
427 0.2
428 0.21
429 0.24
430 0.29
431 0.29
432 0.27
433 0.29
434 0.25
435 0.23
436 0.23
437 0.2
438 0.15
439 0.15
440 0.14
441 0.11
442 0.1
443 0.07
444 0.05
445 0.05
446 0.05
447 0.06
448 0.06
449 0.07
450 0.07
451 0.07
452 0.07
453 0.09
454 0.09
455 0.09
456 0.13
457 0.12
458 0.13
459 0.14
460 0.16
461 0.14
462 0.14
463 0.18
464 0.13
465 0.13
466 0.14
467 0.12
468 0.11
469 0.12
470 0.12
471 0.08
472 0.08
473 0.07
474 0.05
475 0.05
476 0.05
477 0.04
478 0.03
479 0.03
480 0.03
481 0.03
482 0.03
483 0.03
484 0.03
485 0.03
486 0.03
487 0.03
488 0.03
489 0.03
490 0.03
491 0.04
492 0.04
493 0.05
494 0.05
495 0.05
496 0.06
497 0.06
498 0.06
499 0.06
500 0.05
501 0.06
502 0.06
503 0.05
504 0.05
505 0.05
506 0.06
507 0.06
508 0.06
509 0.07
510 0.12
511 0.12
512 0.14
513 0.15
514 0.15
515 0.2
516 0.23
517 0.23
518 0.2
519 0.2
520 0.18
521 0.17
522 0.19
523 0.15
524 0.12
525 0.11
526 0.1
527 0.1
528 0.1
529 0.09
530 0.07
531 0.05
532 0.06
533 0.06
534 0.05
535 0.05
536 0.05
537 0.05
538 0.07
539 0.07
540 0.1
541 0.15
542 0.15
543 0.19
544 0.2
545 0.22
546 0.23
547 0.24
548 0.23
549 0.26
550 0.28
551 0.28
552 0.35
553 0.35
554 0.32
555 0.35
556 0.36
557 0.34
558 0.4
559 0.4
560 0.4
561 0.45
562 0.49
563 0.5
564 0.53
565 0.51
566 0.47
567 0.46
568 0.46
569 0.42
570 0.4
571 0.4
572 0.4
573 0.43
574 0.39
575 0.38
576 0.33
577 0.33
578 0.31
579 0.32
580 0.31
581 0.3
582 0.34
583 0.4
584 0.4
585 0.48
586 0.55
587 0.58
588 0.59
589 0.57
590 0.59
591 0.61
592 0.7
593 0.71
594 0.74
595 0.75
596 0.81
597 0.88
598 0.91
599 0.92
600 0.91
601 0.85
602 0.81
603 0.77
604 0.71
605 0.64
606 0.55
607 0.46
608 0.36
609 0.32