Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V1J316

Protein Details
Accession A0A4V1J316    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
216-252NDSSIKHSPSRKRRNLDDQECKKPKIKREDTPSSPTKHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 4.5, cyto_mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015381  XLF_N  
IPR038051  XRCC4-like_N_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF09302  XLF  
Amino Acid Sequences WHVVEAAEKKYLCGFLEVHPTYAIYVTDVARVWEHAPDEDAVRRTARAANVADFDRAKMAFLVLQFGRVFEHPQETLHLRETDGKLAMRTQISGALTWTFLFDALSPADAAVFFRKLCLLSFANHSYLCRQRAQLEHIVRVQQKYTLYLEENYKTVNGSELMEKYKRQHRDDAVLLNDYSSADLASCAPTFKTSSLKERSIASYTSSAKPCSLMHNDSSIKHSPSRKRRNLDDQECKKPKIKREDTPSSPTKSFSARLSSPVQSSSPVKLEGTSPRRRRIGRICR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.21
3 0.32
4 0.32
5 0.3
6 0.28
7 0.27
8 0.25
9 0.24
10 0.2
11 0.1
12 0.12
13 0.11
14 0.14
15 0.14
16 0.14
17 0.14
18 0.15
19 0.15
20 0.15
21 0.16
22 0.14
23 0.16
24 0.16
25 0.18
26 0.21
27 0.22
28 0.21
29 0.21
30 0.2
31 0.21
32 0.24
33 0.23
34 0.24
35 0.24
36 0.25
37 0.27
38 0.28
39 0.29
40 0.25
41 0.24
42 0.21
43 0.18
44 0.16
45 0.13
46 0.12
47 0.11
48 0.11
49 0.15
50 0.13
51 0.16
52 0.15
53 0.15
54 0.16
55 0.15
56 0.18
57 0.14
58 0.18
59 0.15
60 0.16
61 0.2
62 0.2
63 0.22
64 0.23
65 0.22
66 0.19
67 0.25
68 0.26
69 0.25
70 0.25
71 0.24
72 0.21
73 0.21
74 0.24
75 0.17
76 0.16
77 0.14
78 0.15
79 0.15
80 0.14
81 0.14
82 0.11
83 0.11
84 0.1
85 0.1
86 0.07
87 0.06
88 0.06
89 0.05
90 0.06
91 0.06
92 0.07
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.07
100 0.07
101 0.07
102 0.08
103 0.08
104 0.09
105 0.12
106 0.12
107 0.12
108 0.17
109 0.19
110 0.2
111 0.2
112 0.2
113 0.2
114 0.24
115 0.25
116 0.22
117 0.21
118 0.23
119 0.26
120 0.3
121 0.34
122 0.31
123 0.31
124 0.3
125 0.34
126 0.32
127 0.3
128 0.26
129 0.2
130 0.18
131 0.18
132 0.17
133 0.15
134 0.14
135 0.16
136 0.18
137 0.17
138 0.16
139 0.14
140 0.13
141 0.12
142 0.1
143 0.09
144 0.07
145 0.07
146 0.09
147 0.11
148 0.14
149 0.15
150 0.16
151 0.2
152 0.26
153 0.33
154 0.34
155 0.4
156 0.4
157 0.45
158 0.47
159 0.47
160 0.42
161 0.36
162 0.32
163 0.25
164 0.22
165 0.16
166 0.13
167 0.08
168 0.06
169 0.04
170 0.04
171 0.05
172 0.06
173 0.06
174 0.07
175 0.07
176 0.08
177 0.1
178 0.11
179 0.17
180 0.18
181 0.27
182 0.32
183 0.34
184 0.35
185 0.36
186 0.38
187 0.34
188 0.32
189 0.26
190 0.26
191 0.28
192 0.32
193 0.31
194 0.29
195 0.27
196 0.28
197 0.26
198 0.27
199 0.29
200 0.26
201 0.26
202 0.32
203 0.34
204 0.33
205 0.38
206 0.36
207 0.33
208 0.35
209 0.42
210 0.45
211 0.54
212 0.64
213 0.68
214 0.72
215 0.78
216 0.83
217 0.86
218 0.86
219 0.86
220 0.83
221 0.85
222 0.84
223 0.79
224 0.74
225 0.7
226 0.68
227 0.69
228 0.7
229 0.68
230 0.72
231 0.78
232 0.78
233 0.8
234 0.78
235 0.73
236 0.65
237 0.57
238 0.5
239 0.44
240 0.41
241 0.36
242 0.37
243 0.32
244 0.36
245 0.39
246 0.39
247 0.37
248 0.36
249 0.33
250 0.3
251 0.32
252 0.31
253 0.29
254 0.28
255 0.26
256 0.24
257 0.28
258 0.34
259 0.4
260 0.46
261 0.51
262 0.57
263 0.66
264 0.68
265 0.73