Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V1J3C6

Protein Details
Accession A0A4V1J3C6    Localization Confidence Low Confidence Score 6.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
552-571QQPRSPHKSPQKKALTQKTTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) extr 8, mito 6, nucl 5, cyto_mito 5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
IPR006086  XPG-I_dom  
IPR006084  XPG/Rad2  
Gene Ontology GO:0004518  F:nuclease activity  
GO:0006974  P:DNA damage response  
Pfam View protein in Pfam  
PF00867  XPG_I  
CDD cd09870  PIN_YEN1  
Amino Acid Sequences MGITDLWLLLAPATAKRVPFPLFLAHFLAQHRRPPRLAIDAYMFLFWSLLPSLEPLDGPAQRRILRNFMAKLWYLVQNNVSFVVVFDGRYKPGKLRHGHIPEMPEALSYDDALRHFATVPAAQYGERNGLVELLKAILLRNRLDWVQAPAEAEAECAWLLRLGVVDYVVSDDSDTLVFGATHVLRMFNRVKCVDDGVPVLSSTDYYVTPVTMLNVARVTGLTRDRLVFVAALRGGDYSSGAEGIGITRASELALCGTTVLLAAPRKKVQDFGKFPDFAGAFVAALVDADARSAVLLDPHYAMKDELDRAESLAAFTAHLNEFIDAHGGAIFGRATRLARVTIDDYYAMFRAVFRFCPGSVSFAELALVANDLAATVAGRVARANVTVGPGVIGYLSVSETGCQTYEPYYDPAPVIYAFPHERKYNLRPFVLKLLAQHRFWKHIQFARTKPMEDVQLAVLKFKRVALNEAVYLVKSSRNPPIVLADLKGYSSELKETSTHGAGLLVPEKMGAELGKDVENDADELLDDDERILTVVTPLEAVKYVSEQYVREQQPRSPHKSPQKKALTQKTTLDSIWPKLSPQKHAGPRRLDFLPPETLNTRVIVTIDLTQPEAPAEKFQVVDPVPIDGIFARESSQNTGTRPTTVERRKEPPTAHSTRSPSPNVFSALPTKNRARVLPRKHRQTLLPGQSVVTSFFQTTPRLRPSKTPSFNLTETENDCVFKNHRIVGLGPSVDSVNNSPETSPTKRTKPMDFSPETSPIKAKSESASEKDPFFEPNPFFGSPGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.17
3 0.19
4 0.25
5 0.26
6 0.27
7 0.28
8 0.32
9 0.33
10 0.35
11 0.39
12 0.34
13 0.34
14 0.36
15 0.42
16 0.38
17 0.43
18 0.45
19 0.46
20 0.47
21 0.49
22 0.51
23 0.51
24 0.49
25 0.45
26 0.44
27 0.42
28 0.41
29 0.36
30 0.3
31 0.21
32 0.19
33 0.14
34 0.12
35 0.09
36 0.08
37 0.08
38 0.09
39 0.11
40 0.12
41 0.12
42 0.11
43 0.17
44 0.2
45 0.23
46 0.27
47 0.32
48 0.35
49 0.42
50 0.44
51 0.45
52 0.48
53 0.52
54 0.5
55 0.47
56 0.48
57 0.42
58 0.41
59 0.38
60 0.39
61 0.33
62 0.33
63 0.33
64 0.3
65 0.3
66 0.28
67 0.25
68 0.17
69 0.16
70 0.17
71 0.13
72 0.12
73 0.15
74 0.16
75 0.19
76 0.23
77 0.24
78 0.26
79 0.34
80 0.42
81 0.44
82 0.47
83 0.55
84 0.58
85 0.61
86 0.59
87 0.55
88 0.48
89 0.45
90 0.39
91 0.29
92 0.23
93 0.2
94 0.17
95 0.13
96 0.12
97 0.12
98 0.13
99 0.15
100 0.14
101 0.13
102 0.14
103 0.14
104 0.16
105 0.15
106 0.16
107 0.15
108 0.16
109 0.15
110 0.16
111 0.16
112 0.17
113 0.16
114 0.15
115 0.13
116 0.15
117 0.15
118 0.14
119 0.13
120 0.1
121 0.1
122 0.09
123 0.11
124 0.11
125 0.14
126 0.15
127 0.16
128 0.18
129 0.18
130 0.2
131 0.21
132 0.23
133 0.22
134 0.22
135 0.21
136 0.19
137 0.19
138 0.17
139 0.15
140 0.1
141 0.09
142 0.08
143 0.07
144 0.07
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.07
155 0.07
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.09
167 0.08
168 0.1
169 0.1
170 0.13
171 0.12
172 0.18
173 0.25
174 0.23
175 0.29
176 0.29
177 0.31
178 0.3
179 0.35
180 0.3
181 0.26
182 0.25
183 0.2
184 0.19
185 0.17
186 0.16
187 0.11
188 0.1
189 0.09
190 0.09
191 0.07
192 0.08
193 0.08
194 0.08
195 0.08
196 0.08
197 0.09
198 0.11
199 0.11
200 0.11
201 0.11
202 0.11
203 0.11
204 0.11
205 0.11
206 0.11
207 0.13
208 0.14
209 0.15
210 0.16
211 0.16
212 0.17
213 0.17
214 0.13
215 0.11
216 0.14
217 0.12
218 0.12
219 0.11
220 0.1
221 0.1
222 0.09
223 0.09
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.06
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.07
248 0.1
249 0.12
250 0.16
251 0.19
252 0.21
253 0.22
254 0.28
255 0.32
256 0.39
257 0.42
258 0.46
259 0.5
260 0.48
261 0.47
262 0.47
263 0.4
264 0.29
265 0.25
266 0.18
267 0.11
268 0.11
269 0.1
270 0.05
271 0.04
272 0.04
273 0.03
274 0.03
275 0.03
276 0.03
277 0.03
278 0.03
279 0.03
280 0.03
281 0.04
282 0.05
283 0.06
284 0.07
285 0.08
286 0.08
287 0.09
288 0.09
289 0.08
290 0.1
291 0.11
292 0.1
293 0.12
294 0.11
295 0.11
296 0.12
297 0.11
298 0.09
299 0.08
300 0.08
301 0.07
302 0.06
303 0.08
304 0.08
305 0.08
306 0.08
307 0.07
308 0.08
309 0.07
310 0.08
311 0.06
312 0.06
313 0.05
314 0.05
315 0.05
316 0.05
317 0.05
318 0.04
319 0.04
320 0.05
321 0.05
322 0.06
323 0.08
324 0.08
325 0.08
326 0.11
327 0.12
328 0.12
329 0.12
330 0.12
331 0.11
332 0.11
333 0.11
334 0.09
335 0.07
336 0.07
337 0.09
338 0.09
339 0.1
340 0.1
341 0.11
342 0.11
343 0.14
344 0.14
345 0.15
346 0.14
347 0.17
348 0.15
349 0.13
350 0.14
351 0.1
352 0.1
353 0.07
354 0.07
355 0.04
356 0.03
357 0.03
358 0.03
359 0.02
360 0.02
361 0.02
362 0.02
363 0.03
364 0.03
365 0.04
366 0.04
367 0.05
368 0.05
369 0.05
370 0.06
371 0.05
372 0.07
373 0.07
374 0.06
375 0.06
376 0.05
377 0.05
378 0.04
379 0.04
380 0.03
381 0.03
382 0.03
383 0.03
384 0.03
385 0.04
386 0.04
387 0.05
388 0.05
389 0.05
390 0.05
391 0.06
392 0.07
393 0.08
394 0.1
395 0.1
396 0.11
397 0.11
398 0.1
399 0.1
400 0.09
401 0.08
402 0.07
403 0.09
404 0.11
405 0.13
406 0.16
407 0.15
408 0.17
409 0.22
410 0.29
411 0.34
412 0.36
413 0.37
414 0.36
415 0.37
416 0.4
417 0.37
418 0.31
419 0.26
420 0.29
421 0.31
422 0.31
423 0.35
424 0.31
425 0.34
426 0.35
427 0.35
428 0.33
429 0.34
430 0.38
431 0.39
432 0.41
433 0.45
434 0.45
435 0.42
436 0.37
437 0.34
438 0.31
439 0.24
440 0.22
441 0.15
442 0.17
443 0.16
444 0.17
445 0.16
446 0.14
447 0.14
448 0.15
449 0.17
450 0.14
451 0.17
452 0.18
453 0.19
454 0.19
455 0.2
456 0.18
457 0.15
458 0.14
459 0.11
460 0.11
461 0.11
462 0.13
463 0.18
464 0.21
465 0.21
466 0.21
467 0.24
468 0.24
469 0.23
470 0.21
471 0.17
472 0.15
473 0.14
474 0.13
475 0.11
476 0.09
477 0.08
478 0.09
479 0.08
480 0.1
481 0.1
482 0.12
483 0.15
484 0.15
485 0.14
486 0.12
487 0.12
488 0.11
489 0.12
490 0.11
491 0.08
492 0.07
493 0.07
494 0.07
495 0.07
496 0.07
497 0.05
498 0.05
499 0.06
500 0.07
501 0.08
502 0.08
503 0.08
504 0.08
505 0.09
506 0.08
507 0.07
508 0.06
509 0.04
510 0.05
511 0.06
512 0.05
513 0.05
514 0.05
515 0.05
516 0.05
517 0.05
518 0.04
519 0.04
520 0.04
521 0.05
522 0.05
523 0.05
524 0.06
525 0.06
526 0.06
527 0.07
528 0.06
529 0.07
530 0.08
531 0.09
532 0.11
533 0.11
534 0.14
535 0.24
536 0.26
537 0.3
538 0.31
539 0.33
540 0.42
541 0.5
542 0.55
543 0.5
544 0.56
545 0.62
546 0.71
547 0.72
548 0.73
549 0.74
550 0.73
551 0.79
552 0.8
553 0.76
554 0.69
555 0.7
556 0.63
557 0.56
558 0.48
559 0.44
560 0.36
561 0.33
562 0.32
563 0.27
564 0.25
565 0.3
566 0.34
567 0.33
568 0.37
569 0.42
570 0.48
571 0.57
572 0.64
573 0.64
574 0.63
575 0.62
576 0.58
577 0.5
578 0.44
579 0.39
580 0.38
581 0.3
582 0.32
583 0.29
584 0.28
585 0.27
586 0.25
587 0.22
588 0.15
589 0.15
590 0.12
591 0.11
592 0.13
593 0.14
594 0.13
595 0.14
596 0.14
597 0.14
598 0.14
599 0.14
600 0.12
601 0.12
602 0.13
603 0.13
604 0.14
605 0.14
606 0.2
607 0.19
608 0.2
609 0.18
610 0.18
611 0.16
612 0.16
613 0.16
614 0.09
615 0.11
616 0.09
617 0.09
618 0.09
619 0.11
620 0.13
621 0.17
622 0.22
623 0.23
624 0.23
625 0.29
626 0.29
627 0.28
628 0.29
629 0.29
630 0.35
631 0.4
632 0.48
633 0.48
634 0.54
635 0.58
636 0.62
637 0.61
638 0.59
639 0.6
640 0.58
641 0.56
642 0.57
643 0.58
644 0.57
645 0.61
646 0.58
647 0.51
648 0.48
649 0.46
650 0.42
651 0.37
652 0.33
653 0.34
654 0.36
655 0.38
656 0.41
657 0.42
658 0.44
659 0.47
660 0.49
661 0.51
662 0.55
663 0.61
664 0.66
665 0.72
666 0.76
667 0.79
668 0.79
669 0.74
670 0.74
671 0.74
672 0.71
673 0.66
674 0.56
675 0.51
676 0.47
677 0.43
678 0.36
679 0.27
680 0.19
681 0.15
682 0.17
683 0.19
684 0.23
685 0.26
686 0.31
687 0.38
688 0.42
689 0.43
690 0.5
691 0.57
692 0.63
693 0.66
694 0.64
695 0.61
696 0.63
697 0.63
698 0.56
699 0.5
700 0.45
701 0.4
702 0.39
703 0.34
704 0.28
705 0.26
706 0.28
707 0.28
708 0.28
709 0.31
710 0.29
711 0.3
712 0.32
713 0.33
714 0.33
715 0.36
716 0.3
717 0.26
718 0.24
719 0.22
720 0.2
721 0.2
722 0.17
723 0.15
724 0.17
725 0.18
726 0.17
727 0.21
728 0.27
729 0.3
730 0.37
731 0.41
732 0.46
733 0.55
734 0.6
735 0.64
736 0.67
737 0.7
738 0.72
739 0.69
740 0.66
741 0.63
742 0.66
743 0.61
744 0.54
745 0.49
746 0.42
747 0.42
748 0.4
749 0.36
750 0.31
751 0.38
752 0.42
753 0.44
754 0.48
755 0.46
756 0.45
757 0.45
758 0.42
759 0.38
760 0.33
761 0.36
762 0.31
763 0.33
764 0.37
765 0.35