Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V1J2W8

Protein Details
Accession A0A4V1J2W8    Localization Confidence High Confidence Score 16.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
222-244QDRPIKFKKSKMKSGSKKRMAEQHydrophilic
440-466PSESAKKAFRMKRDKEKKQGLVRIKISHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
222-240QDRPIKFKKSKMKSGSKKR
444-458AKKAFRMKRDKEKKQ
564-575PKNAKRAKVKRI
Subcellular Location(s) cyto 14, cyto_nucl 13.833, nucl 11.5, mito_nucl 7.166, cyto_pero 7.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045347  HIND  
IPR005011  SNU66/SART1  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF19252  HIND  
PF03343  SART-1  
Amino Acid Sequences MAEEIRFSVEETNKLRARLGLPLLPTGPPEKPITDAEAAKNARTPKNSVSLSVQETNRLRRSLGLRPAVPDGPDATATTDTEIYSSLTIYTGRSAGEDLGVRVGHSAKELSSLRDGEMFTLEDRGILDEDDDCLVNEALERHAKQQERDRERKKLGCSVGAGLGAFYDDESEPGEEIQPVLIVGTTITPSRVALRDPQPPSGNVVKIAGLFEDLDEKQPAKQDRPIKFKKSKMKSGSKKRMAEQPLVVATSEMVTLTLVIDDDVDDDIEDFLARSRREKVIARAQMSAEEISAEARTNARMSMVADLKDGLVFDPTRDFLDTLGDDPLRDDDEIAAKSDSSAGMTTDSAVPTGGSVANADKTDIKDVLNVAQPTATNGGQEIKQSERMEAVAIEKPAPNDLKTPDKQSEQPEPSSPTIEAPILGGILSTLKYLRQHSKVPSESAKKAFRMKRDKEKKQGLVRIKISIQERLAREELEKDPAYVRATPEQKEKIFDRVLSERLVSEGIVSDSQVSGRYQRHAGTSDDLANYNPQVQVLNKDETGKVLSQKEAWKALSHRYHGLAPKNAKRAKVKRIE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.42
3 0.38
4 0.37
5 0.37
6 0.39
7 0.34
8 0.33
9 0.35
10 0.35
11 0.31
12 0.31
13 0.28
14 0.24
15 0.23
16 0.24
17 0.22
18 0.24
19 0.26
20 0.3
21 0.31
22 0.33
23 0.33
24 0.38
25 0.38
26 0.36
27 0.38
28 0.39
29 0.4
30 0.4
31 0.42
32 0.39
33 0.47
34 0.47
35 0.46
36 0.45
37 0.45
38 0.47
39 0.49
40 0.44
41 0.43
42 0.47
43 0.52
44 0.51
45 0.47
46 0.41
47 0.41
48 0.46
49 0.47
50 0.51
51 0.51
52 0.47
53 0.49
54 0.53
55 0.48
56 0.43
57 0.36
58 0.28
59 0.22
60 0.21
61 0.19
62 0.17
63 0.16
64 0.16
65 0.16
66 0.15
67 0.13
68 0.12
69 0.12
70 0.11
71 0.1
72 0.1
73 0.08
74 0.08
75 0.09
76 0.09
77 0.1
78 0.1
79 0.09
80 0.1
81 0.11
82 0.1
83 0.12
84 0.12
85 0.11
86 0.13
87 0.13
88 0.12
89 0.13
90 0.13
91 0.11
92 0.11
93 0.12
94 0.09
95 0.16
96 0.17
97 0.19
98 0.22
99 0.23
100 0.22
101 0.24
102 0.24
103 0.18
104 0.19
105 0.17
106 0.13
107 0.14
108 0.13
109 0.1
110 0.11
111 0.11
112 0.1
113 0.09
114 0.09
115 0.07
116 0.09
117 0.09
118 0.09
119 0.08
120 0.09
121 0.09
122 0.08
123 0.09
124 0.08
125 0.11
126 0.15
127 0.16
128 0.19
129 0.26
130 0.29
131 0.33
132 0.41
133 0.49
134 0.54
135 0.64
136 0.67
137 0.7
138 0.75
139 0.76
140 0.72
141 0.7
142 0.63
143 0.56
144 0.51
145 0.43
146 0.37
147 0.31
148 0.26
149 0.17
150 0.14
151 0.1
152 0.08
153 0.05
154 0.06
155 0.05
156 0.05
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.08
161 0.09
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.04
169 0.03
170 0.03
171 0.04
172 0.05
173 0.05
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.09
178 0.1
179 0.11
180 0.17
181 0.22
182 0.3
183 0.33
184 0.37
185 0.36
186 0.36
187 0.4
188 0.37
189 0.33
190 0.25
191 0.23
192 0.19
193 0.18
194 0.17
195 0.12
196 0.08
197 0.07
198 0.07
199 0.09
200 0.09
201 0.1
202 0.11
203 0.11
204 0.12
205 0.17
206 0.2
207 0.2
208 0.26
209 0.33
210 0.41
211 0.5
212 0.57
213 0.61
214 0.66
215 0.72
216 0.75
217 0.74
218 0.76
219 0.76
220 0.79
221 0.8
222 0.83
223 0.86
224 0.85
225 0.81
226 0.74
227 0.74
228 0.67
229 0.61
230 0.5
231 0.43
232 0.35
233 0.31
234 0.27
235 0.18
236 0.14
237 0.1
238 0.09
239 0.05
240 0.04
241 0.03
242 0.03
243 0.03
244 0.03
245 0.03
246 0.03
247 0.03
248 0.03
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.03
253 0.04
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.03
258 0.05
259 0.09
260 0.09
261 0.11
262 0.14
263 0.16
264 0.2
265 0.23
266 0.28
267 0.34
268 0.39
269 0.39
270 0.38
271 0.36
272 0.33
273 0.31
274 0.25
275 0.15
276 0.09
277 0.07
278 0.06
279 0.06
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.07
289 0.11
290 0.12
291 0.12
292 0.12
293 0.12
294 0.11
295 0.11
296 0.1
297 0.06
298 0.06
299 0.06
300 0.06
301 0.07
302 0.08
303 0.09
304 0.09
305 0.09
306 0.07
307 0.1
308 0.1
309 0.1
310 0.11
311 0.1
312 0.09
313 0.1
314 0.1
315 0.09
316 0.09
317 0.08
318 0.06
319 0.1
320 0.1
321 0.11
322 0.1
323 0.09
324 0.09
325 0.1
326 0.09
327 0.06
328 0.06
329 0.05
330 0.06
331 0.06
332 0.07
333 0.08
334 0.08
335 0.07
336 0.07
337 0.06
338 0.05
339 0.06
340 0.06
341 0.04
342 0.05
343 0.06
344 0.08
345 0.08
346 0.09
347 0.1
348 0.1
349 0.13
350 0.13
351 0.12
352 0.12
353 0.13
354 0.15
355 0.18
356 0.17
357 0.15
358 0.15
359 0.15
360 0.15
361 0.17
362 0.14
363 0.09
364 0.1
365 0.12
366 0.11
367 0.13
368 0.14
369 0.13
370 0.19
371 0.2
372 0.2
373 0.19
374 0.18
375 0.18
376 0.16
377 0.17
378 0.13
379 0.13
380 0.14
381 0.14
382 0.15
383 0.18
384 0.19
385 0.17
386 0.17
387 0.2
388 0.28
389 0.29
390 0.35
391 0.35
392 0.37
393 0.41
394 0.44
395 0.5
396 0.46
397 0.46
398 0.44
399 0.45
400 0.43
401 0.4
402 0.34
403 0.25
404 0.23
405 0.2
406 0.16
407 0.12
408 0.1
409 0.08
410 0.07
411 0.06
412 0.04
413 0.05
414 0.05
415 0.05
416 0.05
417 0.07
418 0.11
419 0.17
420 0.24
421 0.28
422 0.34
423 0.39
424 0.49
425 0.5
426 0.52
427 0.55
428 0.55
429 0.56
430 0.58
431 0.57
432 0.52
433 0.58
434 0.58
435 0.6
436 0.64
437 0.67
438 0.71
439 0.76
440 0.82
441 0.83
442 0.88
443 0.87
444 0.86
445 0.86
446 0.84
447 0.82
448 0.75
449 0.69
450 0.6
451 0.57
452 0.5
453 0.46
454 0.41
455 0.38
456 0.37
457 0.37
458 0.37
459 0.33
460 0.32
461 0.31
462 0.3
463 0.3
464 0.29
465 0.24
466 0.24
467 0.26
468 0.28
469 0.25
470 0.27
471 0.28
472 0.32
473 0.35
474 0.42
475 0.46
476 0.44
477 0.48
478 0.46
479 0.46
480 0.45
481 0.43
482 0.41
483 0.38
484 0.39
485 0.35
486 0.34
487 0.26
488 0.24
489 0.23
490 0.16
491 0.12
492 0.11
493 0.11
494 0.11
495 0.1
496 0.1
497 0.1
498 0.1
499 0.12
500 0.11
501 0.16
502 0.19
503 0.23
504 0.25
505 0.27
506 0.31
507 0.32
508 0.33
509 0.32
510 0.32
511 0.33
512 0.31
513 0.3
514 0.26
515 0.26
516 0.24
517 0.23
518 0.19
519 0.15
520 0.16
521 0.17
522 0.23
523 0.25
524 0.29
525 0.28
526 0.3
527 0.3
528 0.3
529 0.33
530 0.29
531 0.3
532 0.29
533 0.3
534 0.33
535 0.38
536 0.42
537 0.43
538 0.42
539 0.42
540 0.42
541 0.49
542 0.52
543 0.5
544 0.49
545 0.47
546 0.52
547 0.53
548 0.58
549 0.57
550 0.58
551 0.63
552 0.68
553 0.69
554 0.7
555 0.74
556 0.75