Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V1J4W6

Protein Details
Accession A0A4V1J4W6    Localization Confidence High Confidence Score 19.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
108-129TPTSQGKRPVGRPRKRPLPPTSHydrophilic
161-184TPVVRGKRRGRPPRSASQRPNPTPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
114-124KRPVGRPRKRP
165-176RGKRRGRPPRSA
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR031824  RNF220_mid  
IPR040178  RNF220_RING  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0004842  F:ubiquitin-protein transferase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF15926  RNF220  
PF13923  zf-C3HC4_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50089  ZF_RING_2  
CDD cd16563  RING-HC_RNF220  
Amino Acid Sequences MELNPTLNYSHSNESTPPQRADNDSPAITPMTAISGPDTSIAMGQWQPIPAPASATRQSSPNVSTESYSVTDNPFAPTTLERRPTRQTATMTQQLETADTVSTSPIPTPTSQGKRPVGRPRKRPLPPTSLESIADGEFPAPVTPTRRRGRPPGTTRTSTITPVVRGKRRGRPPRSASQRPNPTPRSDPTTTSPSSTDDCFMCGQPLPTDMDEINHHIDMCLGRQNNGIDPSSPSSSSVSNPSELAAPAPSNFVSYTWAGETRIRASALLQTSPAVLASGPMVSMRKHQDIEGDLDIDEEELKAFGEAQYTDVDIQRLMRSKRPVSTPSARPLGSRPEPLQVQAQTPQFEYSAQPPATPSSPPPEYDQNTSMNPPSVGLDAQIIIESLKNRIREQEDLVQTVKTCLICMEAYQTPLVSTICWHVHCEQCWLHTLGVKKLCPQCQVITQPTDLRRIYL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.41
3 0.44
4 0.42
5 0.39
6 0.41
7 0.46
8 0.5
9 0.51
10 0.49
11 0.43
12 0.41
13 0.39
14 0.36
15 0.29
16 0.22
17 0.15
18 0.13
19 0.13
20 0.12
21 0.13
22 0.12
23 0.13
24 0.13
25 0.13
26 0.1
27 0.1
28 0.1
29 0.1
30 0.1
31 0.12
32 0.14
33 0.14
34 0.14
35 0.16
36 0.18
37 0.15
38 0.19
39 0.2
40 0.25
41 0.28
42 0.32
43 0.31
44 0.31
45 0.33
46 0.32
47 0.31
48 0.28
49 0.28
50 0.25
51 0.25
52 0.23
53 0.25
54 0.22
55 0.21
56 0.19
57 0.18
58 0.19
59 0.19
60 0.21
61 0.18
62 0.17
63 0.18
64 0.2
65 0.22
66 0.27
67 0.35
68 0.35
69 0.39
70 0.46
71 0.5
72 0.53
73 0.54
74 0.52
75 0.5
76 0.55
77 0.58
78 0.52
79 0.46
80 0.42
81 0.36
82 0.32
83 0.25
84 0.18
85 0.11
86 0.09
87 0.09
88 0.08
89 0.09
90 0.08
91 0.09
92 0.1
93 0.12
94 0.12
95 0.17
96 0.25
97 0.31
98 0.35
99 0.43
100 0.48
101 0.53
102 0.6
103 0.67
104 0.69
105 0.71
106 0.77
107 0.78
108 0.81
109 0.82
110 0.82
111 0.79
112 0.77
113 0.72
114 0.68
115 0.62
116 0.54
117 0.47
118 0.39
119 0.32
120 0.23
121 0.19
122 0.14
123 0.1
124 0.08
125 0.08
126 0.07
127 0.06
128 0.07
129 0.13
130 0.18
131 0.27
132 0.33
133 0.39
134 0.44
135 0.53
136 0.6
137 0.65
138 0.68
139 0.68
140 0.7
141 0.67
142 0.64
143 0.59
144 0.52
145 0.43
146 0.39
147 0.31
148 0.27
149 0.32
150 0.37
151 0.38
152 0.44
153 0.5
154 0.55
155 0.64
156 0.71
157 0.71
158 0.74
159 0.75
160 0.78
161 0.8
162 0.81
163 0.78
164 0.78
165 0.81
166 0.76
167 0.79
168 0.71
169 0.66
170 0.61
171 0.56
172 0.54
173 0.45
174 0.43
175 0.38
176 0.41
177 0.37
178 0.34
179 0.32
180 0.26
181 0.25
182 0.23
183 0.2
184 0.14
185 0.15
186 0.14
187 0.13
188 0.12
189 0.11
190 0.11
191 0.1
192 0.11
193 0.11
194 0.1
195 0.11
196 0.1
197 0.11
198 0.11
199 0.13
200 0.14
201 0.12
202 0.12
203 0.1
204 0.11
205 0.1
206 0.1
207 0.12
208 0.11
209 0.11
210 0.13
211 0.14
212 0.15
213 0.17
214 0.16
215 0.12
216 0.14
217 0.16
218 0.15
219 0.15
220 0.14
221 0.13
222 0.13
223 0.14
224 0.17
225 0.15
226 0.15
227 0.15
228 0.14
229 0.14
230 0.13
231 0.12
232 0.08
233 0.07
234 0.07
235 0.08
236 0.07
237 0.07
238 0.08
239 0.07
240 0.09
241 0.09
242 0.1
243 0.09
244 0.1
245 0.11
246 0.12
247 0.13
248 0.13
249 0.14
250 0.13
251 0.12
252 0.12
253 0.16
254 0.16
255 0.15
256 0.13
257 0.12
258 0.12
259 0.12
260 0.11
261 0.06
262 0.04
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.04
267 0.05
268 0.06
269 0.06
270 0.11
271 0.15
272 0.18
273 0.19
274 0.19
275 0.22
276 0.23
277 0.27
278 0.23
279 0.19
280 0.16
281 0.15
282 0.15
283 0.12
284 0.1
285 0.05
286 0.04
287 0.04
288 0.04
289 0.04
290 0.04
291 0.04
292 0.06
293 0.06
294 0.07
295 0.08
296 0.08
297 0.1
298 0.1
299 0.1
300 0.09
301 0.1
302 0.13
303 0.18
304 0.2
305 0.25
306 0.31
307 0.35
308 0.4
309 0.44
310 0.45
311 0.47
312 0.53
313 0.53
314 0.53
315 0.54
316 0.5
317 0.45
318 0.44
319 0.45
320 0.41
321 0.4
322 0.35
323 0.35
324 0.36
325 0.36
326 0.39
327 0.31
328 0.3
329 0.3
330 0.32
331 0.28
332 0.28
333 0.27
334 0.22
335 0.21
336 0.2
337 0.18
338 0.23
339 0.22
340 0.21
341 0.21
342 0.24
343 0.25
344 0.24
345 0.23
346 0.22
347 0.24
348 0.25
349 0.29
350 0.34
351 0.36
352 0.4
353 0.41
354 0.37
355 0.37
356 0.39
357 0.36
358 0.29
359 0.26
360 0.21
361 0.19
362 0.17
363 0.15
364 0.13
365 0.12
366 0.1
367 0.1
368 0.09
369 0.08
370 0.07
371 0.09
372 0.09
373 0.13
374 0.17
375 0.2
376 0.21
377 0.28
378 0.32
379 0.34
380 0.39
381 0.44
382 0.43
383 0.44
384 0.44
385 0.38
386 0.34
387 0.32
388 0.29
389 0.19
390 0.15
391 0.13
392 0.14
393 0.13
394 0.14
395 0.18
396 0.17
397 0.18
398 0.19
399 0.18
400 0.16
401 0.17
402 0.17
403 0.11
404 0.11
405 0.15
406 0.19
407 0.2
408 0.24
409 0.27
410 0.33
411 0.35
412 0.4
413 0.37
414 0.34
415 0.38
416 0.37
417 0.33
418 0.3
419 0.33
420 0.34
421 0.39
422 0.39
423 0.42
424 0.48
425 0.52
426 0.53
427 0.53
428 0.5
429 0.51
430 0.57
431 0.56
432 0.52
433 0.51
434 0.54
435 0.53
436 0.56