Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V1J5R7

Protein Details
Accession A0A4V1J5R7    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
260-284IAIMNEKRRRRRESHNAVERRRRDNBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
266-281KRRRRRESHNAVERRR
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011598  bHLH_dom  
IPR036638  HLH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046983  F:protein dimerization activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00010  HLH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50888  BHLH  
CDD cd11387  bHLHzip_USF_MITF  
Amino Acid Sequences MNQPSLRLTHPAAFHAQQQQHHHHQQQQQQQQQQQQQQQYQHKLQQRDLEALNNSFSNTTINPNLLNVHAAFSNASLPFQTDHSSPDLGTQPDTDMNDHLHALASPISIARPGGMNMRSMGDSDSADDLRQNSLNPSSPFAASPATTNGGMLYSPLGDNTIYENAELTSGSYHGTTHGIPIQMGNHLNGRFLRADQLATSPPVHAFQSMSLPTHTPDWLSGSLDPSSFVPQAPFPFGPADSSLVNNIFDPEDGGDMAKQIAIMNEKRRRRRESHNAVERRRRDNINEKIQELSAMLPEQYAEGANKPNKGSILRRSVDYIRQLEKTVEQQNLRIRELEIQHGGRLHNGGNGNLQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.42
3 0.43
4 0.44
5 0.5
6 0.55
7 0.59
8 0.67
9 0.67
10 0.66
11 0.69
12 0.71
13 0.74
14 0.76
15 0.74
16 0.74
17 0.74
18 0.74
19 0.75
20 0.76
21 0.74
22 0.72
23 0.7
24 0.71
25 0.74
26 0.73
27 0.72
28 0.71
29 0.7
30 0.67
31 0.66
32 0.65
33 0.58
34 0.55
35 0.49
36 0.47
37 0.43
38 0.39
39 0.36
40 0.28
41 0.25
42 0.2
43 0.19
44 0.16
45 0.13
46 0.17
47 0.17
48 0.18
49 0.17
50 0.18
51 0.19
52 0.17
53 0.18
54 0.13
55 0.13
56 0.12
57 0.12
58 0.11
59 0.1
60 0.13
61 0.11
62 0.11
63 0.1
64 0.11
65 0.11
66 0.13
67 0.15
68 0.11
69 0.14
70 0.16
71 0.17
72 0.16
73 0.18
74 0.21
75 0.19
76 0.19
77 0.18
78 0.16
79 0.18
80 0.2
81 0.17
82 0.15
83 0.16
84 0.16
85 0.15
86 0.14
87 0.11
88 0.1
89 0.1
90 0.09
91 0.07
92 0.06
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.07
100 0.12
101 0.12
102 0.13
103 0.13
104 0.15
105 0.15
106 0.14
107 0.15
108 0.11
109 0.1
110 0.1
111 0.12
112 0.1
113 0.1
114 0.11
115 0.11
116 0.11
117 0.12
118 0.11
119 0.11
120 0.13
121 0.18
122 0.18
123 0.2
124 0.19
125 0.19
126 0.19
127 0.18
128 0.17
129 0.12
130 0.12
131 0.11
132 0.12
133 0.11
134 0.11
135 0.1
136 0.09
137 0.08
138 0.07
139 0.06
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.05
144 0.04
145 0.05
146 0.07
147 0.08
148 0.08
149 0.08
150 0.08
151 0.08
152 0.08
153 0.07
154 0.06
155 0.04
156 0.04
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.07
162 0.06
163 0.07
164 0.09
165 0.09
166 0.09
167 0.09
168 0.09
169 0.1
170 0.11
171 0.1
172 0.12
173 0.12
174 0.13
175 0.13
176 0.14
177 0.13
178 0.12
179 0.15
180 0.12
181 0.12
182 0.11
183 0.13
184 0.12
185 0.13
186 0.13
187 0.11
188 0.11
189 0.11
190 0.11
191 0.1
192 0.09
193 0.08
194 0.12
195 0.13
196 0.13
197 0.13
198 0.13
199 0.13
200 0.14
201 0.14
202 0.1
203 0.09
204 0.12
205 0.12
206 0.13
207 0.13
208 0.13
209 0.14
210 0.14
211 0.14
212 0.11
213 0.14
214 0.12
215 0.12
216 0.11
217 0.12
218 0.14
219 0.17
220 0.16
221 0.15
222 0.16
223 0.15
224 0.16
225 0.15
226 0.16
227 0.12
228 0.13
229 0.13
230 0.12
231 0.13
232 0.11
233 0.11
234 0.09
235 0.09
236 0.09
237 0.07
238 0.07
239 0.07
240 0.07
241 0.06
242 0.07
243 0.07
244 0.06
245 0.06
246 0.05
247 0.07
248 0.12
249 0.17
250 0.26
251 0.35
252 0.43
253 0.52
254 0.6
255 0.66
256 0.68
257 0.74
258 0.76
259 0.78
260 0.81
261 0.82
262 0.84
263 0.85
264 0.88
265 0.84
266 0.79
267 0.75
268 0.68
269 0.66
270 0.67
271 0.68
272 0.69
273 0.66
274 0.61
275 0.56
276 0.52
277 0.44
278 0.34
279 0.25
280 0.16
281 0.13
282 0.12
283 0.09
284 0.09
285 0.09
286 0.09
287 0.09
288 0.08
289 0.1
290 0.18
291 0.22
292 0.25
293 0.26
294 0.28
295 0.3
296 0.34
297 0.39
298 0.4
299 0.46
300 0.44
301 0.45
302 0.49
303 0.5
304 0.51
305 0.52
306 0.49
307 0.44
308 0.44
309 0.44
310 0.41
311 0.4
312 0.41
313 0.4
314 0.41
315 0.38
316 0.42
317 0.48
318 0.51
319 0.49
320 0.43
321 0.38
322 0.38
323 0.39
324 0.4
325 0.39
326 0.35
327 0.36
328 0.37
329 0.37
330 0.32
331 0.31
332 0.25
333 0.24
334 0.24