Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4P9ZUP0

Protein Details
Accession A0A4P9ZUP0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-28ESTTVIRKRKDQPKVARKESDLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12, cyto 3.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001387  Cro/C1-type_HTH  
IPR010982  Lambda_DNA-bd_dom_sf  
IPR013729  MBF1_N  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF01381  HTH_3  
PF08523  MBF1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50943  HTH_CROC1  
CDD cd00093  HTH_XRE  
Amino Acid Sequences MADQDWESTTVIRKRKDQPKVARKESDLNSARRAGATIATDRKAVTNKGHQGLHYQQLAKIDYADDVVAPPKLKSSVPQAIQTARNSKGLTQKDLGSLINEKPTVVAEYESGRAIPSQQILAKLERSLGVKLRGSNIGEPLPKRGSK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.6
3 0.68
4 0.71
5 0.76
6 0.8
7 0.86
8 0.86
9 0.83
10 0.77
11 0.76
12 0.69
13 0.68
14 0.63
15 0.56
16 0.52
17 0.48
18 0.44
19 0.35
20 0.32
21 0.22
22 0.19
23 0.18
24 0.19
25 0.21
26 0.22
27 0.22
28 0.22
29 0.23
30 0.23
31 0.24
32 0.23
33 0.28
34 0.33
35 0.37
36 0.38
37 0.35
38 0.38
39 0.39
40 0.39
41 0.33
42 0.28
43 0.25
44 0.27
45 0.27
46 0.22
47 0.19
48 0.14
49 0.11
50 0.1
51 0.09
52 0.06
53 0.05
54 0.06
55 0.07
56 0.07
57 0.06
58 0.07
59 0.08
60 0.08
61 0.1
62 0.16
63 0.21
64 0.23
65 0.26
66 0.27
67 0.29
68 0.32
69 0.33
70 0.3
71 0.26
72 0.27
73 0.25
74 0.26
75 0.31
76 0.3
77 0.31
78 0.29
79 0.28
80 0.26
81 0.28
82 0.25
83 0.18
84 0.19
85 0.16
86 0.18
87 0.17
88 0.15
89 0.14
90 0.15
91 0.14
92 0.12
93 0.11
94 0.09
95 0.11
96 0.12
97 0.12
98 0.11
99 0.1
100 0.1
101 0.11
102 0.12
103 0.11
104 0.13
105 0.14
106 0.18
107 0.2
108 0.22
109 0.23
110 0.21
111 0.21
112 0.2
113 0.21
114 0.21
115 0.24
116 0.27
117 0.28
118 0.3
119 0.32
120 0.35
121 0.35
122 0.35
123 0.34
124 0.34
125 0.36
126 0.36
127 0.38