Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V1J402

Protein Details
Accession A0A4V1J402    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
318-345SQIPEHPRITKKVRKKTTKSWRHITIMGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
328-333KKVRKK
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 14.5, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025856  HeH/LEM_domain  
IPR044780  Heh2/Src1  
Gene Ontology GO:0005637  C:nuclear inner membrane  
GO:0003682  F:chromatin binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF12949  HeH  
CDD cd12935  LEM_like  
Amino Acid Sequences MDEADYLQERFDPSKLRVADLRRILLEHHVPFVSLDWKKVLVDLFTDNIAQKASTLHQKKQQQVEANADGIGFVSQAESTQPRARRKPAFPSAPVSTGESGAAGKRSSATAPIDFSDDDDDAKGSTSRQVTPKMTAQALVSGSSGTPCTRAQARIRKTPLMRKISSLGLAVKTVALDTVLSSATTSCRTRAELLVNEDGTSAPPGPLTWTTKELVQSALGPVDSPLQSPTFPPVHAGGQSSGLASARKPTATYQPRSDSPPLKKLRPSNTLTTTTSTTTKSNRRVRHTLAAPDESTNHQGEGGEVFSDYNPFQSGPDSQIPEHPRITKKVRKKTTKSWRHITIMGPSAQADGDDRGQVVFGGP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.33
3 0.35
4 0.39
5 0.42
6 0.48
7 0.49
8 0.5
9 0.42
10 0.42
11 0.4
12 0.41
13 0.43
14 0.35
15 0.33
16 0.29
17 0.28
18 0.27
19 0.28
20 0.29
21 0.23
22 0.23
23 0.21
24 0.23
25 0.22
26 0.24
27 0.24
28 0.16
29 0.17
30 0.18
31 0.17
32 0.17
33 0.19
34 0.17
35 0.16
36 0.15
37 0.12
38 0.1
39 0.11
40 0.14
41 0.23
42 0.28
43 0.33
44 0.41
45 0.49
46 0.57
47 0.63
48 0.67
49 0.65
50 0.64
51 0.66
52 0.6
53 0.53
54 0.45
55 0.36
56 0.29
57 0.2
58 0.16
59 0.08
60 0.05
61 0.04
62 0.04
63 0.04
64 0.07
65 0.08
66 0.13
67 0.19
68 0.27
69 0.35
70 0.42
71 0.5
72 0.57
73 0.61
74 0.67
75 0.71
76 0.71
77 0.66
78 0.66
79 0.61
80 0.54
81 0.49
82 0.42
83 0.33
84 0.26
85 0.22
86 0.16
87 0.13
88 0.12
89 0.12
90 0.09
91 0.08
92 0.09
93 0.1
94 0.1
95 0.13
96 0.15
97 0.14
98 0.16
99 0.16
100 0.18
101 0.17
102 0.17
103 0.16
104 0.13
105 0.12
106 0.11
107 0.1
108 0.08
109 0.09
110 0.09
111 0.07
112 0.11
113 0.13
114 0.17
115 0.2
116 0.26
117 0.27
118 0.3
119 0.34
120 0.33
121 0.31
122 0.28
123 0.25
124 0.22
125 0.21
126 0.18
127 0.13
128 0.1
129 0.1
130 0.09
131 0.09
132 0.06
133 0.08
134 0.07
135 0.1
136 0.12
137 0.17
138 0.25
139 0.34
140 0.39
141 0.46
142 0.5
143 0.54
144 0.55
145 0.59
146 0.6
147 0.59
148 0.54
149 0.48
150 0.46
151 0.41
152 0.38
153 0.3
154 0.23
155 0.15
156 0.15
157 0.13
158 0.1
159 0.08
160 0.07
161 0.06
162 0.04
163 0.03
164 0.03
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.05
170 0.05
171 0.09
172 0.09
173 0.09
174 0.1
175 0.12
176 0.14
177 0.16
178 0.19
179 0.2
180 0.23
181 0.25
182 0.24
183 0.22
184 0.21
185 0.18
186 0.14
187 0.12
188 0.08
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.07
193 0.1
194 0.13
195 0.14
196 0.16
197 0.17
198 0.19
199 0.2
200 0.19
201 0.17
202 0.14
203 0.13
204 0.11
205 0.11
206 0.09
207 0.07
208 0.07
209 0.09
210 0.09
211 0.09
212 0.09
213 0.1
214 0.1
215 0.11
216 0.15
217 0.13
218 0.13
219 0.15
220 0.15
221 0.16
222 0.17
223 0.18
224 0.14
225 0.14
226 0.14
227 0.13
228 0.11
229 0.1
230 0.1
231 0.08
232 0.12
233 0.11
234 0.11
235 0.12
236 0.14
237 0.24
238 0.32
239 0.37
240 0.4
241 0.44
242 0.46
243 0.51
244 0.55
245 0.53
246 0.51
247 0.55
248 0.55
249 0.55
250 0.59
251 0.61
252 0.63
253 0.63
254 0.62
255 0.6
256 0.6
257 0.6
258 0.55
259 0.51
260 0.44
261 0.39
262 0.36
263 0.3
264 0.28
265 0.3
266 0.37
267 0.44
268 0.5
269 0.56
270 0.62
271 0.67
272 0.7
273 0.72
274 0.69
275 0.67
276 0.64
277 0.61
278 0.53
279 0.47
280 0.43
281 0.36
282 0.34
283 0.27
284 0.21
285 0.17
286 0.16
287 0.15
288 0.15
289 0.12
290 0.09
291 0.08
292 0.08
293 0.08
294 0.1
295 0.1
296 0.09
297 0.1
298 0.1
299 0.1
300 0.12
301 0.14
302 0.18
303 0.24
304 0.26
305 0.26
306 0.33
307 0.37
308 0.39
309 0.42
310 0.44
311 0.43
312 0.47
313 0.57
314 0.59
315 0.65
316 0.72
317 0.78
318 0.82
319 0.85
320 0.88
321 0.9
322 0.91
323 0.9
324 0.89
325 0.86
326 0.81
327 0.76
328 0.69
329 0.66
330 0.61
331 0.53
332 0.44
333 0.36
334 0.31
335 0.27
336 0.23
337 0.17
338 0.14
339 0.14
340 0.15
341 0.14
342 0.13
343 0.14