Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q0A1U3

Protein Details
Accession A0A4Q0A1U3    Localization Confidence High Confidence Score 22.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
89-121KPRSSRKSGSSSRKSRHSRRSSHQSRRSRSRSVHydrophilic
134-181RSRSPDSRYGRRHRHSRRHRHHSPSRSQHGRRRPSRRHRDKSCSPSSSBasic
217-264LSSRSPSPDHHHRRPRRDWSYSRSPDKRRRSRSPAQRHSSRRQPRSPSBasic
278-316SRSVSRSRSPPPPAKRSRRSHRRRSRSRSRSGESRPSSRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
89-120KPRSSRKSGSSSRKSRHSRRSSHQSRRSRSRS
133-175SRSRSPDSRYGRRHRHSRRHRHHSPSRSQHGRRRPSRRHRDKS
183-210SRSRSRSPNPSRSNSHSRNHQSKRAKAS
219-317SRSPSPDHHHRRPRRDWSYSRSPDKRRRSRSPAQRHSSRRQPRSPSVGERDAPVASRAVSRSVSRSRSPPPPAKRSRRSHRRRSRSRSRSGESRPSSRS
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF13917  zf-CCHC_3  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MEPNRGLEAFERLVKANDAQAALDRGSCKKCGGAGHLTFECRNFITLKTRRAPPASSTIPSAPVSTIPPPPAVAAVVVKAEKVSVSADKPRSSRKSGSSSRKSRHSRRSSHQSRRSRSRSVSSASSSSLSSPSRSRSPDSRYGRRHRHSRRHRHHSPSRSQHGRRRPSRRHRDKSCSPSSSSSRSRSRSPNPSRSNSHSRNHQSKRAKASSLDKESLSSRSPSPDHHHRRPRRDWSYSRSPDKRRRSRSPAQRHSSRRQPRSPSVGERDAPVASRAVSRSVSRSRSPPPPAKRSRRSHRRRSRSRSRSGESRPSSRSEGRPTSTRLREPHPDNYLANDLDI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.26
3 0.24
4 0.24
5 0.21
6 0.2
7 0.21
8 0.22
9 0.21
10 0.22
11 0.21
12 0.23
13 0.25
14 0.27
15 0.25
16 0.24
17 0.27
18 0.28
19 0.32
20 0.36
21 0.36
22 0.41
23 0.43
24 0.44
25 0.42
26 0.38
27 0.34
28 0.26
29 0.24
30 0.19
31 0.19
32 0.27
33 0.33
34 0.4
35 0.45
36 0.5
37 0.55
38 0.58
39 0.57
40 0.51
41 0.53
42 0.5
43 0.45
44 0.43
45 0.38
46 0.37
47 0.35
48 0.31
49 0.23
50 0.19
51 0.21
52 0.2
53 0.22
54 0.2
55 0.2
56 0.2
57 0.19
58 0.18
59 0.15
60 0.13
61 0.11
62 0.1
63 0.11
64 0.11
65 0.1
66 0.09
67 0.09
68 0.08
69 0.08
70 0.09
71 0.1
72 0.14
73 0.22
74 0.27
75 0.31
76 0.34
77 0.42
78 0.46
79 0.49
80 0.51
81 0.5
82 0.55
83 0.61
84 0.69
85 0.7
86 0.73
87 0.73
88 0.78
89 0.8
90 0.81
91 0.82
92 0.81
93 0.79
94 0.79
95 0.85
96 0.85
97 0.87
98 0.87
99 0.86
100 0.85
101 0.87
102 0.84
103 0.8
104 0.74
105 0.69
106 0.64
107 0.58
108 0.54
109 0.46
110 0.41
111 0.35
112 0.31
113 0.25
114 0.21
115 0.2
116 0.16
117 0.15
118 0.16
119 0.18
120 0.22
121 0.25
122 0.28
123 0.31
124 0.37
125 0.45
126 0.51
127 0.57
128 0.61
129 0.68
130 0.74
131 0.76
132 0.79
133 0.8
134 0.83
135 0.84
136 0.87
137 0.88
138 0.88
139 0.89
140 0.89
141 0.88
142 0.86
143 0.85
144 0.83
145 0.82
146 0.81
147 0.79
148 0.77
149 0.77
150 0.78
151 0.77
152 0.78
153 0.79
154 0.81
155 0.86
156 0.89
157 0.9
158 0.88
159 0.88
160 0.87
161 0.86
162 0.83
163 0.74
164 0.66
165 0.61
166 0.56
167 0.54
168 0.5
169 0.48
170 0.47
171 0.47
172 0.49
173 0.52
174 0.56
175 0.59
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177 0.67
178 0.66
179 0.69
180 0.69
181 0.68
182 0.71
183 0.66
184 0.61
185 0.6
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187 0.67
188 0.66
189 0.68
190 0.67
191 0.67
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193 0.66
194 0.6
195 0.54
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198 0.55
199 0.5
200 0.41
201 0.38
202 0.38
203 0.36
204 0.29
205 0.22
206 0.17
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208 0.2
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215 0.68
216 0.77
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218 0.85
219 0.83
220 0.83
221 0.8
222 0.77
223 0.79
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226 0.77
227 0.78
228 0.79
229 0.83
230 0.85
231 0.84
232 0.85
233 0.84
234 0.86
235 0.87
236 0.88
237 0.88
238 0.87
239 0.87
240 0.85
241 0.85
242 0.85
243 0.85
244 0.82
245 0.8
246 0.8
247 0.78
248 0.78
249 0.76
250 0.74
251 0.71
252 0.68
253 0.6
254 0.53
255 0.47
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257 0.33
258 0.26
259 0.19
260 0.14
261 0.16
262 0.15
263 0.16
264 0.17
265 0.18
266 0.24
267 0.3
268 0.35
269 0.36
270 0.4
271 0.44
272 0.51
273 0.58
274 0.61
275 0.63
276 0.69
277 0.76
278 0.81
279 0.85
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282 0.91
283 0.92
284 0.93
285 0.93
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287 0.95
288 0.94
289 0.95
290 0.94
291 0.94
292 0.92
293 0.89
294 0.88
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297 0.81
298 0.79
299 0.72
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301 0.66
302 0.63
303 0.62
304 0.6
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307 0.61
308 0.62
309 0.66
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313 0.61
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316 0.69
317 0.65
318 0.61
319 0.55
320 0.55
321 0.53