Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V1J4V8

Protein Details
Accession A0A4V1J4V8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
52-73AEYRLRKRKDFEDQLRRNRLNIHydrophilic
610-634EESARRIRARMPKIVKRRRQVGDDSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
614-628RRIRARMPKIVKRRR
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto 6.5, cyto_mito 6.5, mito 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR008847  Suf  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02184  HAT  
PF05843  Suf  
Amino Acid Sequences MADSSRRAPQIKNKNAAAIQISAEQLLREANETQEAPAKAPEQTITDADELAEYRLRKRKDFEDQLRRNRLNIGTWMRYAAWEDGQGELARARSIYERALDVEPQNVTLYLKYTEMEMKHRNVNLARNLFDRVVTLLPRVDQFWYKYAYMEEMLGNIAGTRAIFERWMKWEPDESAWSAYIKFEIRYEEMGRARALYERFVHIHPAAKNWLKWVQFEEENGNLDKVRGIFTTAIGALGDDFMDQKLYVAFAKFEIRAKEYERARVIFKYALERLPRAKSQSLYNQYTQFEKQYGEHDGVEEVILAKRRLQYQEEVAKNPHNYDAWFDYTRLEENAGRPELIRDTYERAIAEFPPVNEKRLWRRYIYLWLHYALWEELETQDYERARQIYAECLDLIPHRQFTFGKVWLQYAYFEVRRLNLTAARRALGRAIGMCPKDKLFKGYIELELHLREFDRVRTLYGKYLEFNPANCSTWIEYAKLERMLGETERCRALLDIAVSQPVLDMPEVLWKAYIDFEFEHADSTTDRVRNLYERLLDRTDHIKVWLSFAQTEAALPSLPASTSTPAPSPVERARAVYERAYEHLCQRQLKPERVVLLEAWRDFEEERGSEESARRIRARMPKIVKRRRQVGDDSNACEEYFDYLFPDDQTKKPNLKLLAMAQQWKSKIQQASKEDA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.63
3 0.61
4 0.53
5 0.44
6 0.36
7 0.31
8 0.29
9 0.22
10 0.21
11 0.17
12 0.14
13 0.14
14 0.12
15 0.12
16 0.13
17 0.13
18 0.17
19 0.18
20 0.19
21 0.25
22 0.25
23 0.24
24 0.26
25 0.26
26 0.23
27 0.24
28 0.24
29 0.2
30 0.23
31 0.23
32 0.22
33 0.21
34 0.2
35 0.19
36 0.18
37 0.15
38 0.14
39 0.17
40 0.15
41 0.22
42 0.3
43 0.34
44 0.37
45 0.43
46 0.5
47 0.56
48 0.67
49 0.7
50 0.73
51 0.8
52 0.85
53 0.9
54 0.83
55 0.73
56 0.68
57 0.6
58 0.54
59 0.52
60 0.5
61 0.44
62 0.43
63 0.44
64 0.37
65 0.35
66 0.34
67 0.27
68 0.2
69 0.19
70 0.19
71 0.17
72 0.19
73 0.18
74 0.16
75 0.15
76 0.14
77 0.12
78 0.11
79 0.12
80 0.13
81 0.15
82 0.17
83 0.17
84 0.18
85 0.21
86 0.23
87 0.24
88 0.22
89 0.24
90 0.22
91 0.21
92 0.2
93 0.17
94 0.16
95 0.13
96 0.15
97 0.12
98 0.13
99 0.12
100 0.13
101 0.17
102 0.19
103 0.26
104 0.29
105 0.32
106 0.37
107 0.39
108 0.43
109 0.41
110 0.47
111 0.48
112 0.47
113 0.45
114 0.41
115 0.42
116 0.37
117 0.33
118 0.26
119 0.2
120 0.18
121 0.17
122 0.16
123 0.15
124 0.15
125 0.16
126 0.17
127 0.17
128 0.18
129 0.2
130 0.22
131 0.25
132 0.24
133 0.24
134 0.23
135 0.23
136 0.2
137 0.18
138 0.15
139 0.11
140 0.11
141 0.1
142 0.09
143 0.07
144 0.06
145 0.05
146 0.04
147 0.05
148 0.06
149 0.06
150 0.09
151 0.11
152 0.14
153 0.19
154 0.23
155 0.24
156 0.25
157 0.29
158 0.29
159 0.31
160 0.3
161 0.27
162 0.25
163 0.24
164 0.23
165 0.19
166 0.17
167 0.15
168 0.14
169 0.13
170 0.12
171 0.15
172 0.16
173 0.2
174 0.21
175 0.25
176 0.26
177 0.27
178 0.25
179 0.23
180 0.21
181 0.22
182 0.21
183 0.18
184 0.18
185 0.2
186 0.22
187 0.22
188 0.25
189 0.22
190 0.28
191 0.25
192 0.26
193 0.3
194 0.31
195 0.31
196 0.31
197 0.35
198 0.31
199 0.31
200 0.31
201 0.29
202 0.27
203 0.29
204 0.28
205 0.24
206 0.25
207 0.24
208 0.21
209 0.16
210 0.15
211 0.14
212 0.11
213 0.11
214 0.09
215 0.11
216 0.1
217 0.11
218 0.12
219 0.11
220 0.1
221 0.08
222 0.08
223 0.06
224 0.06
225 0.05
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.05
232 0.05
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.07
237 0.08
238 0.11
239 0.12
240 0.15
241 0.16
242 0.17
243 0.19
244 0.22
245 0.28
246 0.28
247 0.33
248 0.33
249 0.32
250 0.33
251 0.31
252 0.3
253 0.25
254 0.24
255 0.23
256 0.22
257 0.25
258 0.25
259 0.26
260 0.28
261 0.3
262 0.31
263 0.3
264 0.31
265 0.28
266 0.31
267 0.38
268 0.42
269 0.42
270 0.42
271 0.41
272 0.39
273 0.41
274 0.37
275 0.29
276 0.22
277 0.19
278 0.18
279 0.17
280 0.18
281 0.17
282 0.16
283 0.14
284 0.13
285 0.12
286 0.11
287 0.08
288 0.06
289 0.06
290 0.08
291 0.08
292 0.1
293 0.12
294 0.16
295 0.18
296 0.2
297 0.21
298 0.26
299 0.34
300 0.35
301 0.35
302 0.33
303 0.35
304 0.33
305 0.31
306 0.26
307 0.18
308 0.16
309 0.16
310 0.17
311 0.18
312 0.18
313 0.17
314 0.16
315 0.16
316 0.17
317 0.15
318 0.14
319 0.11
320 0.11
321 0.15
322 0.15
323 0.14
324 0.14
325 0.14
326 0.14
327 0.13
328 0.12
329 0.1
330 0.13
331 0.14
332 0.15
333 0.14
334 0.14
335 0.14
336 0.13
337 0.15
338 0.12
339 0.11
340 0.19
341 0.19
342 0.21
343 0.21
344 0.24
345 0.31
346 0.37
347 0.4
348 0.33
349 0.36
350 0.36
351 0.45
352 0.45
353 0.39
354 0.33
355 0.31
356 0.3
357 0.26
358 0.25
359 0.15
360 0.11
361 0.08
362 0.07
363 0.06
364 0.07
365 0.07
366 0.07
367 0.1
368 0.1
369 0.1
370 0.12
371 0.13
372 0.12
373 0.13
374 0.13
375 0.15
376 0.16
377 0.16
378 0.14
379 0.13
380 0.14
381 0.13
382 0.15
383 0.12
384 0.13
385 0.12
386 0.14
387 0.14
388 0.17
389 0.21
390 0.21
391 0.23
392 0.22
393 0.23
394 0.22
395 0.22
396 0.19
397 0.16
398 0.17
399 0.14
400 0.15
401 0.15
402 0.15
403 0.16
404 0.17
405 0.17
406 0.17
407 0.19
408 0.23
409 0.23
410 0.23
411 0.22
412 0.21
413 0.2
414 0.17
415 0.15
416 0.11
417 0.12
418 0.16
419 0.17
420 0.18
421 0.18
422 0.19
423 0.22
424 0.22
425 0.23
426 0.21
427 0.21
428 0.24
429 0.26
430 0.28
431 0.25
432 0.26
433 0.23
434 0.21
435 0.2
436 0.16
437 0.14
438 0.11
439 0.11
440 0.12
441 0.16
442 0.15
443 0.17
444 0.2
445 0.21
446 0.25
447 0.27
448 0.27
449 0.23
450 0.25
451 0.29
452 0.27
453 0.27
454 0.26
455 0.26
456 0.26
457 0.25
458 0.25
459 0.2
460 0.23
461 0.24
462 0.2
463 0.19
464 0.19
465 0.23
466 0.21
467 0.2
468 0.15
469 0.15
470 0.17
471 0.17
472 0.2
473 0.18
474 0.19
475 0.2
476 0.2
477 0.19
478 0.17
479 0.17
480 0.14
481 0.14
482 0.14
483 0.14
484 0.14
485 0.13
486 0.13
487 0.11
488 0.09
489 0.08
490 0.06
491 0.05
492 0.05
493 0.12
494 0.13
495 0.13
496 0.13
497 0.12
498 0.13
499 0.15
500 0.15
501 0.1
502 0.1
503 0.13
504 0.15
505 0.15
506 0.16
507 0.14
508 0.14
509 0.12
510 0.14
511 0.18
512 0.17
513 0.17
514 0.17
515 0.19
516 0.22
517 0.25
518 0.27
519 0.27
520 0.29
521 0.33
522 0.35
523 0.33
524 0.32
525 0.33
526 0.31
527 0.26
528 0.25
529 0.27
530 0.25
531 0.29
532 0.29
533 0.27
534 0.24
535 0.24
536 0.24
537 0.17
538 0.17
539 0.13
540 0.11
541 0.08
542 0.08
543 0.08
544 0.07
545 0.07
546 0.08
547 0.1
548 0.11
549 0.14
550 0.16
551 0.16
552 0.19
553 0.21
554 0.21
555 0.26
556 0.28
557 0.32
558 0.31
559 0.32
560 0.34
561 0.36
562 0.38
563 0.34
564 0.34
565 0.3
566 0.32
567 0.33
568 0.3
569 0.32
570 0.36
571 0.39
572 0.4
573 0.41
574 0.48
575 0.53
576 0.59
577 0.58
578 0.55
579 0.54
580 0.51
581 0.5
582 0.42
583 0.41
584 0.38
585 0.33
586 0.32
587 0.27
588 0.27
589 0.25
590 0.26
591 0.22
592 0.18
593 0.21
594 0.21
595 0.22
596 0.24
597 0.26
598 0.32
599 0.32
600 0.38
601 0.36
602 0.35
603 0.42
604 0.49
605 0.54
606 0.56
607 0.61
608 0.65
609 0.75
610 0.83
611 0.85
612 0.84
613 0.87
614 0.84
615 0.81
616 0.8
617 0.78
618 0.78
619 0.74
620 0.69
621 0.63
622 0.57
623 0.5
624 0.41
625 0.32
626 0.25
627 0.19
628 0.15
629 0.13
630 0.14
631 0.15
632 0.16
633 0.23
634 0.23
635 0.26
636 0.32
637 0.38
638 0.43
639 0.46
640 0.53
641 0.49
642 0.49
643 0.51
644 0.5
645 0.52
646 0.51
647 0.53
648 0.5
649 0.52
650 0.5
651 0.48
652 0.46
653 0.44
654 0.47
655 0.48
656 0.53