Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

K1XIF8

Protein Details
Accession K1XIF8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-32LTTTRPTNGRKLRRGTVRRSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
21-60GRKLRRGTVRRSGPAGKAAPIAPAGGIKKNPRTTRGGAKP
174-209KSAAATKTAAPATRGAKTRGRGGRGGGARGTRPAKK
Subcellular Location(s) cyto 9.5, cyto_nucl 9.5, nucl 8.5, mito 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025715  FoP_C  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG mbe:MBM_09545  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13865  FoP_duplication  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSGKLDKSLDEILTTTRPTNGRKLRRGTVRRSGPAGKAAPIAPAGGIKKNPRTTRGGAKPIPTGPSGNGEGKIQVSGFPKDITEAMIKEYFAKTVGAVKRVDLSYGPRGESRGVADITFVRSDSATRAVESCNNIPVDGKPIKVSLILDANRAKSIPAPKGLSERITLPKSQPKSAAATKTAAPATRGAKTRGRGGRGGGARGTRPAKKTAEELDSEMVDYWQTGATATEGAVAGTAQAANGDANMDDEIMVRLTSVLAGTIH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.2
3 0.22
4 0.26
5 0.28
6 0.38
7 0.45
8 0.52
9 0.59
10 0.66
11 0.7
12 0.76
13 0.81
14 0.8
15 0.8
16 0.79
17 0.75
18 0.74
19 0.7
20 0.63
21 0.62
22 0.55
23 0.46
24 0.39
25 0.35
26 0.3
27 0.25
28 0.22
29 0.14
30 0.16
31 0.16
32 0.17
33 0.22
34 0.26
35 0.34
36 0.43
37 0.46
38 0.47
39 0.52
40 0.53
41 0.59
42 0.62
43 0.63
44 0.58
45 0.57
46 0.57
47 0.53
48 0.5
49 0.41
50 0.34
51 0.26
52 0.27
53 0.27
54 0.24
55 0.22
56 0.2
57 0.19
58 0.18
59 0.18
60 0.13
61 0.13
62 0.14
63 0.15
64 0.16
65 0.16
66 0.15
67 0.16
68 0.16
69 0.14
70 0.13
71 0.12
72 0.14
73 0.14
74 0.14
75 0.15
76 0.15
77 0.13
78 0.12
79 0.11
80 0.09
81 0.15
82 0.17
83 0.19
84 0.19
85 0.19
86 0.22
87 0.21
88 0.22
89 0.15
90 0.17
91 0.2
92 0.21
93 0.22
94 0.19
95 0.2
96 0.2
97 0.2
98 0.17
99 0.14
100 0.13
101 0.12
102 0.12
103 0.12
104 0.13
105 0.12
106 0.1
107 0.07
108 0.07
109 0.08
110 0.08
111 0.12
112 0.1
113 0.1
114 0.11
115 0.11
116 0.14
117 0.16
118 0.16
119 0.15
120 0.14
121 0.14
122 0.14
123 0.13
124 0.17
125 0.15
126 0.15
127 0.13
128 0.13
129 0.14
130 0.14
131 0.14
132 0.09
133 0.14
134 0.14
135 0.17
136 0.19
137 0.19
138 0.19
139 0.18
140 0.17
141 0.15
142 0.19
143 0.19
144 0.22
145 0.23
146 0.24
147 0.28
148 0.3
149 0.28
150 0.24
151 0.25
152 0.26
153 0.26
154 0.26
155 0.26
156 0.32
157 0.34
158 0.35
159 0.34
160 0.3
161 0.34
162 0.38
163 0.39
164 0.33
165 0.32
166 0.3
167 0.31
168 0.31
169 0.25
170 0.21
171 0.21
172 0.22
173 0.26
174 0.27
175 0.28
176 0.32
177 0.33
178 0.41
179 0.43
180 0.43
181 0.4
182 0.4
183 0.43
184 0.4
185 0.4
186 0.34
187 0.31
188 0.28
189 0.32
190 0.35
191 0.32
192 0.32
193 0.36
194 0.36
195 0.36
196 0.4
197 0.4
198 0.39
199 0.36
200 0.36
201 0.33
202 0.29
203 0.28
204 0.23
205 0.17
206 0.13
207 0.1
208 0.08
209 0.07
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.08
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.06
224 0.04
225 0.04
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.06
230 0.05
231 0.06
232 0.07
233 0.07
234 0.06
235 0.07
236 0.08
237 0.08
238 0.08
239 0.07
240 0.07
241 0.07
242 0.07
243 0.06