Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

K1X6V8

Protein Details
Accession K1X6V8    Localization Confidence High Confidence Score 22.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
35-70REERGSDRRDDRNRERERRYRSRSPRESRGRDGRDRBasic
149-177RERERGKRDTRSRSRSPRREREREREIRNBasic
227-252EEVKVEKGKKGKKGKKGAKKLVEEDDBasic
288-308VYAVRKEKKTEYRQYMNRVGGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
29-96SAPRGPREERGSDRRDDRNRERERRYRSRSPRESRGRDGRDRGGRRDEGERDSRTGGRRDYGGGRERD
138-174RDRERETRPRERERERGKRDTRSRSRSPRRERERERE
232-246EKGKKGKKGKKGAKK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG mbe:MBM_05687  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MAEPPHKRARRPDSTQMWEESERRAASNSAPRGPREERGSDRRDDRNRERERRYRSRSPRESRGRDGRDRGGRRDEGERDSRTGGRRDYGGGRERDGGRERDYRGDRERGTCAPKTADIAVAFRARSDGASEDGGRDRDRERETRPRERERERGKRDTRSRSRSPRREREREREIRNSIEAEKEYPHHPHPSESESQKARTETPPVSLEVKNSAASGQDHERMDFGEEVKVEKGKKGKKGKKGAKKLVEEDDDDDIVIEDDGMAAMQAMMGFGGFGTTHQQKVEGNDVYAVRKEKKTEYRQYMNRVGGFNRPLSPTRES
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.78
3 0.72
4 0.67
5 0.61
6 0.54
7 0.48
8 0.45
9 0.37
10 0.34
11 0.32
12 0.28
13 0.3
14 0.38
15 0.4
16 0.41
17 0.43
18 0.44
19 0.49
20 0.51
21 0.51
22 0.49
23 0.5
24 0.51
25 0.57
26 0.6
27 0.6
28 0.63
29 0.66
30 0.68
31 0.71
32 0.72
33 0.73
34 0.79
35 0.82
36 0.84
37 0.84
38 0.85
39 0.86
40 0.85
41 0.86
42 0.86
43 0.88
44 0.89
45 0.88
46 0.89
47 0.89
48 0.87
49 0.86
50 0.85
51 0.82
52 0.79
53 0.77
54 0.75
55 0.74
56 0.72
57 0.69
58 0.66
59 0.6
60 0.55
61 0.56
62 0.51
63 0.47
64 0.49
65 0.46
66 0.41
67 0.41
68 0.43
69 0.4
70 0.4
71 0.35
72 0.3
73 0.29
74 0.29
75 0.3
76 0.33
77 0.36
78 0.33
79 0.33
80 0.36
81 0.36
82 0.39
83 0.39
84 0.35
85 0.33
86 0.37
87 0.37
88 0.4
89 0.42
90 0.43
91 0.44
92 0.48
93 0.45
94 0.43
95 0.45
96 0.4
97 0.43
98 0.38
99 0.35
100 0.3
101 0.28
102 0.27
103 0.24
104 0.22
105 0.17
106 0.17
107 0.17
108 0.17
109 0.16
110 0.14
111 0.14
112 0.11
113 0.1
114 0.1
115 0.09
116 0.09
117 0.1
118 0.1
119 0.11
120 0.13
121 0.14
122 0.13
123 0.14
124 0.13
125 0.18
126 0.21
127 0.24
128 0.29
129 0.38
130 0.45
131 0.54
132 0.61
133 0.64
134 0.69
135 0.71
136 0.74
137 0.74
138 0.78
139 0.75
140 0.77
141 0.74
142 0.76
143 0.78
144 0.79
145 0.78
146 0.75
147 0.77
148 0.78
149 0.83
150 0.83
151 0.85
152 0.85
153 0.85
154 0.87
155 0.87
156 0.85
157 0.85
158 0.83
159 0.79
160 0.77
161 0.7
162 0.61
163 0.54
164 0.47
165 0.37
166 0.31
167 0.25
168 0.19
169 0.17
170 0.16
171 0.17
172 0.18
173 0.2
174 0.23
175 0.23
176 0.24
177 0.26
178 0.29
179 0.33
180 0.31
181 0.35
182 0.32
183 0.34
184 0.34
185 0.33
186 0.31
187 0.28
188 0.31
189 0.26
190 0.27
191 0.26
192 0.25
193 0.28
194 0.26
195 0.24
196 0.22
197 0.22
198 0.19
199 0.17
200 0.15
201 0.13
202 0.13
203 0.15
204 0.15
205 0.19
206 0.19
207 0.19
208 0.19
209 0.18
210 0.19
211 0.17
212 0.15
213 0.12
214 0.12
215 0.13
216 0.15
217 0.17
218 0.16
219 0.18
220 0.26
221 0.3
222 0.39
223 0.49
224 0.56
225 0.63
226 0.74
227 0.8
228 0.83
229 0.88
230 0.89
231 0.87
232 0.85
233 0.8
234 0.77
235 0.7
236 0.61
237 0.53
238 0.46
239 0.36
240 0.29
241 0.24
242 0.16
243 0.13
244 0.1
245 0.07
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.03
250 0.03
251 0.02
252 0.02
253 0.03
254 0.03
255 0.03
256 0.03
257 0.03
258 0.03
259 0.02
260 0.03
261 0.03
262 0.04
263 0.1
264 0.13
265 0.15
266 0.15
267 0.17
268 0.18
269 0.23
270 0.3
271 0.26
272 0.24
273 0.27
274 0.28
275 0.29
276 0.32
277 0.33
278 0.31
279 0.33
280 0.37
281 0.42
282 0.51
283 0.59
284 0.65
285 0.7
286 0.75
287 0.79
288 0.83
289 0.82
290 0.78
291 0.72
292 0.65
293 0.57
294 0.55
295 0.51
296 0.46
297 0.41
298 0.39
299 0.38